MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017243	AAG	2	6	118391	118396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207619
3002	NC_017243	AGA	2	6	118397	118402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207619
3003	NC_017243	ATA	2	6	118444	118449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207619
3004	NC_017243	AT	4	8	118539	118546	50 %	50 %	0 %	0 %	384207619
3005	NC_017243	ATAA	2	8	118626	118633	75 %	25 %	0 %	0 %	384207619
3006	NC_017243	TTG	2	6	118636	118641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207619
3007	NC_017243	CTG	2	6	118720	118725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207619
3008	NC_017243	A	6	6	118727	118732	100 %	0 %	0 %	0 %	384207619
3009	NC_017243	GAA	2	6	118746	118751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207619
3010	NC_017243	AT	3	6	118760	118765	50 %	50 %	0 %	0 %	384207619
3011	NC_017243	AAT	3	9	118766	118774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207619
3012	NC_017243	AACT	2	8	118814	118821	50 %	25 %	0 %	25 %	384207619
3013	NC_017243	GAAA	2	8	118832	118839	75 %	0 %	25 %	0 %	384207619
3014	NC_017243	TAA	2	6	118844	118849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207619
3015	NC_017243	AAT	2	6	118851	118856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207619
3016	NC_017243	CTA	2	6	118867	118872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207619
3017	NC_017243	ATA	3	9	118902	118910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207619
3018	NC_017243	A	6	6	118919	118924	100 %	0 %	0 %	0 %	384207619
3019	NC_017243	TGA	2	6	118925	118930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207619
3020	NC_017243	TAT	2	6	118933	118938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207619
3021	NC_017243	GAA	2	6	118948	118953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207619
3022	NC_017243	A	6	6	118967	118972	100 %	0 %	0 %	0 %	384207619
3023	NC_017243	TATAG	2	10	119052	119061	40 %	40 %	20 %	0 %	384207619
3024	NC_017243	TTTA	2	8	119674	119681	25 %	75 %	0 %	0 %	384207620
3025	NC_017243	A	6	6	119715	119720	100 %	0 %	0 %	0 %	384207620
3026	NC_017243	GAA	2	6	119726	119731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207620
3027	NC_017243	ATA	2	6	119736	119741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207620
3028	NC_017243	AG	3	6	119759	119764	50 %	0 %	50 %	0 %	384207620
3029	NC_017243	ATG	2	6	119778	119783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207620
3030	NC_017243	TAA	2	6	119803	119808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207620
3031	NC_017243	GAT	2	6	119858	119863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207620
3032	NC_017243	GAG	2	6	119946	119951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207620
3033	NC_017243	ATT	2	6	119967	119972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207620
3034	NC_017243	T	6	6	119971	119976	0 %	100 %	0 %	0 %	384207620
3035	NC_017243	AAT	2	6	120014	120019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207620
3036	NC_017243	T	7	7	120028	120034	0 %	100 %	0 %	0 %	384207620
3037	NC_017243	T	7	7	120115	120121	0 %	100 %	0 %	0 %	384207620
3038	NC_017243	CTT	2	6	120207	120212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207620
3039	NC_017243	TGA	2	6	120232	120237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207620
3040	NC_017243	ATG	2	6	120306	120311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207620
3041	NC_017243	TAT	2	6	120319	120324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207620
3042	NC_017243	TTTAGC	2	12	120340	120351	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384207620
3043	NC_017243	ATA	2	6	120447	120452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207620
3044	NC_017243	A	6	6	120469	120474	100 %	0 %	0 %	0 %	384207620
3045	NC_017243	AGG	2	6	120534	120539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207620
3046	NC_017243	CGG	3	9	120571	120579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207620
3047	NC_017243	A	6	6	120609	120614	100 %	0 %	0 %	0 %	384207620
3048	NC_017243	AATG	2	8	120632	120639	50 %	25 %	25 %	0 %	384207620
3049	NC_017243	CTA	2	6	120723	120728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207620
3050	NC_017243	CTT	2	6	120761	120766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207620
3051	NC_017243	TA	3	6	120800	120805	50 %	50 %	0 %	0 %	384207620
3052	NC_017243	AAT	2	6	120806	120811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207620
3053	NC_017243	TTTGA	2	10	120830	120839	20 %	60 %	20 %	0 %	384207620
3054	NC_017243	ATT	2	6	120873	120878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207620
3055	NC_017243	TCAT	2	8	120889	120896	25 %	50 %	0 %	25 %	384207620
3056	NC_017243	AGA	2	6	121096	121101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207621
3057	NC_017243	AAG	2	6	121125	121130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207621
3058	NC_017243	A	7	7	121161	121167	100 %	0 %	0 %	0 %	384207621
3059	NC_017243	AT	3	6	121236	121241	50 %	50 %	0 %	0 %	384207621
3060	NC_017243	A	8	8	121248	121255	100 %	0 %	0 %	0 %	384207621
3061	NC_017243	AT	3	6	121263	121268	50 %	50 %	0 %	0 %	384207621
3062	NC_017243	TAA	2	6	121313	121318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207621
3063	NC_017243	AT	3	6	121352	121357	50 %	50 %	0 %	0 %	384207622
3064	NC_017243	CAT	2	6	121381	121386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207622
3065	NC_017243	ATT	2	6	121389	121394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207622
3066	NC_017243	GAT	2	6	121396	121401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207622
3067	NC_017243	AT	3	6	121437	121442	50 %	50 %	0 %	0 %	384207622
3068	NC_017243	TAT	2	6	121454	121459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207622
3069	NC_017243	ATATT	2	10	121484	121493	40 %	60 %	0 %	0 %	384207622
3070	NC_017243	GAAA	2	8	121527	121534	75 %	0 %	25 %	0 %	384207622
3071	NC_017243	ATA	2	6	121552	121557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207622
3072	NC_017243	TA	3	6	121592	121597	50 %	50 %	0 %	0 %	384207622
3073	NC_017243	AAAAG	2	10	121608	121617	80 %	0 %	20 %	0 %	384207622
3074	NC_017243	T	6	6	121635	121640	0 %	100 %	0 %	0 %	384207622
3075	NC_017243	GAA	2	6	121651	121656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207622
3076	NC_017243	ATC	2	6	121672	121677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207622
3077	NC_017243	ATAA	2	8	121678	121685	75 %	25 %	0 %	0 %	384207622
3078	NC_017243	A	6	6	121703	121708	100 %	0 %	0 %	0 %	384207622
3079	NC_017243	TGT	2	6	121713	121718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207622
3080	NC_017243	GATG	2	8	121809	121816	25 %	25 %	50 %	0 %	384207622
3081	NC_017243	TA	3	6	121828	121833	50 %	50 %	0 %	0 %	384207622
3082	NC_017243	GAT	2	6	121861	121866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207622
3083	NC_017243	TAAT	2	8	121941	121948	50 %	50 %	0 %	0 %	384207622
3084	NC_017243	TA	3	6	122288	122293	50 %	50 %	0 %	0 %	384207623
3085	NC_017243	A	6	6	122302	122307	100 %	0 %	0 %	0 %	384207623
3086	NC_017243	AAACTA	2	12	122319	122330	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384207623
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3088	NC_017243	TTAA	2	8	122360	122367	50 %	50 %	0 %	0 %	384207623
3089	NC_017243	A	6	6	122376	122381	100 %	0 %	0 %	0 %	384207623
3090	NC_017243	AGA	2	6	122416	122421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3091	NC_017243	GAA	2	6	122423	122428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3092	NC_017243	TGA	2	6	122506	122511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207623
3093	NC_017243	A	6	6	122525	122530	100 %	0 %	0 %	0 %	384207623
3094	NC_017243	A	7	7	122560	122566	100 %	0 %	0 %	0 %	384207623
3095	NC_017243	TTTA	2	8	122585	122592	25 %	75 %	0 %	0 %	384207623
3096	NC_017243	TGC	2	6	122620	122625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207623
3097	NC_017243	GAA	2	6	122687	122692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3098	NC_017243	A	6	6	122722	122727	100 %	0 %	0 %	0 %	384207623
3099	NC_017243	ATTA	2	8	122740	122747	50 %	50 %	0 %	0 %	384207623
3100	NC_017243	GAA	2	6	122750	122755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3101	NC_017243	AAG	2	6	122769	122774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3102	NC_017243	GTTT	2	8	122785	122792	0 %	75 %	25 %	0 %	384207623
3103	NC_017243	ATG	2	6	122805	122810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207623
3104	NC_017243	ATT	3	9	122825	122833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207623
3105	NC_017243	GAA	2	6	122845	122850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3106	NC_017243	AGA	2	6	122857	122862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3107	NC_017243	ATA	2	6	122877	122882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207623
3108	NC_017243	CAAA	2	8	122892	122899	75 %	0 %	0 %	25 %	384207623
3109	NC_017243	AAT	2	6	122906	122911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207623
3110	NC_017243	TAA	2	6	122923	122928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207623
3111	NC_017243	AG	3	6	122980	122985	50 %	0 %	50 %	0 %	384207623
3112	NC_017243	TTC	2	6	123004	123009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207623
3113	NC_017243	AGA	2	6	123070	123075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3114	NC_017243	AAT	2	6	123076	123081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207623
3115	NC_017243	TAGGAG	2	12	123111	123122	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384207623
3116	NC_017243	GA	3	6	123126	123131	50 %	0 %	50 %	0 %	384207623
3117	NC_017243	GAA	2	6	123155	123160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207623
3118	NC_017243	TAA	2	6	123464	123469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207624
3119	NC_017243	TGA	2	6	123486	123491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207624
3120	NC_017243	GAT	2	6	123532	123537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207624
3121	NC_017243	T	6	6	123551	123556	0 %	100 %	0 %	0 %	384207624
3122	NC_017243	ATG	2	6	123656	123661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207624
3123	NC_017243	A	6	6	123733	123738	100 %	0 %	0 %	0 %	384207624
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3125	NC_017243	ATG	2	6	123813	123818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207624
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3245	NC_017243	AGA	2	6	129484	129489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207631
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3371	NC_017243	AGA	2	6	134087	134092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207636
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