MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017243	A	6	6	62514	62519	100 %	0 %	0 %	0 %	384207559
1503	NC_017243	TAA	2	6	62556	62561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207559
1504	NC_017243	CAC	2	6	62587	62592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384207559
1505	NC_017243	ATT	2	6	62603	62608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207559
1506	NC_017243	ATAA	2	8	62609	62616	75 %	25 %	0 %	0 %	384207559
1507	NC_017243	TAA	2	6	62668	62673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207559
1508	NC_017243	ATA	2	6	62679	62684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207559
1509	NC_017243	T	6	6	62714	62719	0 %	100 %	0 %	0 %	384207560
1510	NC_017243	TA	3	6	62735	62740	50 %	50 %	0 %	0 %	384207560
1511	NC_017243	T	6	6	62741	62746	0 %	100 %	0 %	0 %	384207560
1512	NC_017243	AT	3	6	62768	62773	50 %	50 %	0 %	0 %	384207560
1513	NC_017243	T	6	6	62777	62782	0 %	100 %	0 %	0 %	384207560
1514	NC_017243	AAATC	2	10	62812	62821	60 %	20 %	0 %	20 %	384207560
1515	NC_017243	AT	3	6	62835	62840	50 %	50 %	0 %	0 %	384207560
1516	NC_017243	ACA	2	6	62841	62846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207560
1517	NC_017243	ATT	2	6	62883	62888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207560
1518	NC_017243	T	6	6	62887	62892	0 %	100 %	0 %	0 %	384207560
1519	NC_017243	GAAA	2	8	62898	62905	75 %	0 %	25 %	0 %	384207560
1520	NC_017243	AAT	2	6	62906	62911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207560
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1522	NC_017243	AAAT	2	8	62980	62987	75 %	25 %	0 %	0 %	384207560
1523	NC_017243	ATT	2	6	63000	63005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207560
1524	NC_017243	AAT	2	6	63006	63011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207560
1525	NC_017243	TAT	2	6	63012	63017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207560
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1528	NC_017243	A	6	6	63081	63086	100 %	0 %	0 %	0 %	384207561
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1531	NC_017243	AT	3	6	63173	63178	50 %	50 %	0 %	0 %	384207561
1532	NC_017243	TATAAT	2	12	63206	63217	50 %	50 %	0 %	0 %	384207561
1533	NC_017243	ATA	2	6	63219	63224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207561
1534	NC_017243	TA	3	6	63223	63228	50 %	50 %	0 %	0 %	384207561
1535	NC_017243	AAGAT	2	10	63229	63238	60 %	20 %	20 %	0 %	384207561
1536	NC_017243	AGA	2	6	63260	63265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207561
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1538	NC_017243	TTA	2	6	63297	63302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207561
1539	NC_017243	AAT	2	6	63312	63317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207561
1540	NC_017243	AGA	2	6	63320	63325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207561
1541	NC_017243	AAG	2	6	63352	63357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207561
1542	NC_017243	A	7	7	63362	63368	100 %	0 %	0 %	0 %	384207561
1543	NC_017243	TAA	2	6	63377	63382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207561
1544	NC_017243	ATA	2	6	63388	63393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207561
1545	NC_017243	AAT	2	6	63396	63401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207561
1546	NC_017243	AT	3	6	63486	63491	50 %	50 %	0 %	0 %	384207562
1547	NC_017243	ACCAT	2	10	63493	63502	40 %	20 %	0 %	40 %	384207562
1548	NC_017243	GCC	2	6	63510	63515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207562
1549	NC_017243	TAA	3	9	63531	63539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207562
1550	NC_017243	TTA	2	6	63560	63565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207562
1551	NC_017243	TAT	2	6	63581	63586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207562
1552	NC_017243	TAA	2	6	63656	63661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207563
1553	NC_017243	A	7	7	63694	63700	100 %	0 %	0 %	0 %	384207563
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1555	NC_017243	AT	3	6	63744	63749	50 %	50 %	0 %	0 %	384207563
1556	NC_017243	A	7	7	63783	63789	100 %	0 %	0 %	0 %	384207563
1557	NC_017243	A	7	7	63820	63826	100 %	0 %	0 %	0 %	384207563
1558	NC_017243	A	6	6	63850	63855	100 %	0 %	0 %	0 %	384207563
1559	NC_017243	GAA	2	6	63934	63939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207563
1560	NC_017243	CAA	2	6	64052	64057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207563
1561	NC_017243	AAT	2	6	64062	64067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207563
1562	NC_017243	A	6	6	64089	64094	100 %	0 %	0 %	0 %	384207563
1563	NC_017243	AGA	2	6	64107	64112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207563
1564	NC_017243	A	6	6	64116	64121	100 %	0 %	0 %	0 %	384207563
1565	NC_017243	TAA	2	6	64155	64160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207563
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1567	NC_017243	TAA	2	6	64224	64229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207563
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1569	NC_017243	ATT	2	6	64290	64295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207564
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1572	NC_017243	CAT	2	6	64378	64383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207564
1573	NC_017243	A	7	7	64388	64394	100 %	0 %	0 %	0 %	384207564
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1587	NC_017243	GGAA	2	8	64782	64789	50 %	0 %	50 %	0 %	384207564
1588	NC_017243	ATT	3	9	64792	64800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207564
1589	NC_017243	ACAA	2	8	64802	64809	75 %	0 %	0 %	25 %	384207564
1590	NC_017243	TGA	2	6	64817	64822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207564
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1598	NC_017243	ATTT	2	8	65281	65288	25 %	75 %	0 %	0 %	384207565
1599	NC_017243	GAA	2	6	65310	65315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207565
1600	NC_017243	GCT	2	6	65327	65332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207565
1601	NC_017243	TAT	2	6	65497	65502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207565
1602	NC_017243	GAT	2	6	65504	65509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207565
1603	NC_017243	T	6	6	65509	65514	0 %	100 %	0 %	0 %	384207565
1604	NC_017243	AT	3	6	65615	65620	50 %	50 %	0 %	0 %	384207565
1605	NC_017243	AT	4	8	65643	65650	50 %	50 %	0 %	0 %	384207565
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1608	NC_017243	T	8	8	65834	65841	0 %	100 %	0 %	0 %	384207566
1609	NC_017243	A	6	6	65849	65854	100 %	0 %	0 %	0 %	384207566
1610	NC_017243	CTTG	2	8	65870	65877	0 %	50 %	25 %	25 %	384207566
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1612	NC_017243	TAA	2	6	66000	66005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207566
1613	NC_017243	CTTT	2	8	66088	66095	0 %	75 %	0 %	25 %	384207566
1614	NC_017243	A	6	6	66127	66132	100 %	0 %	0 %	0 %	384207566
1615	NC_017243	TA	3	6	66170	66175	50 %	50 %	0 %	0 %	384207566
1616	NC_017243	TATT	2	8	66189	66196	25 %	75 %	0 %	0 %	384207566
1617	NC_017243	AATATA	2	12	66290	66301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207566
1618	NC_017243	T	6	6	66313	66318	0 %	100 %	0 %	0 %	384207566
1619	NC_017243	CAG	2	6	66336	66341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207566
1620	NC_017243	TAT	2	6	66405	66410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207566
1621	NC_017243	TAT	2	6	66443	66448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207566
1622	NC_017243	CTT	2	6	66503	66508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207566
1623	NC_017243	GAA	2	6	66574	66579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207566
1624	NC_017243	ACT	2	6	66676	66681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207566
1625	NC_017243	TAA	2	6	66723	66728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207566
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1627	NC_017243	AGA	2	6	66816	66821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207566
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