MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017243	TAT	2	6	41601	41606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207538
1002	NC_017243	T	7	7	41613	41619	0 %	100 %	0 %	0 %	384207538
1003	NC_017243	ATAA	2	8	41640	41647	75 %	25 %	0 %	0 %	384207538
1004	NC_017243	TCT	3	9	41689	41697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207538
1005	NC_017243	A	6	6	41709	41714	100 %	0 %	0 %	0 %	384207538
1006	NC_017243	AGA	2	6	41741	41746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207538
1007	NC_017243	AAAT	2	8	41778	41785	75 %	25 %	0 %	0 %	384207538
1008	NC_017243	AT	5	10	41821	41830	50 %	50 %	0 %	0 %	384207538
1009	NC_017243	A	6	6	41890	41895	100 %	0 %	0 %	0 %	384207538
1010	NC_017243	GAT	2	6	41905	41910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207538
1011	NC_017243	TTA	2	6	41912	41917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207538
1012	NC_017243	TTC	2	6	41940	41945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207538
1013	NC_017243	ATC	2	6	41952	41957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207538
1014	NC_017243	TATT	2	8	41983	41990	25 %	75 %	0 %	0 %	384207538
1015	NC_017243	ATC	3	9	41991	41999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207538
1016	NC_017243	CAC	2	6	42069	42074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384207538
1017	NC_017243	T	6	6	42097	42102	0 %	100 %	0 %	0 %	384207538
1018	NC_017243	TTAAT	2	10	42119	42128	40 %	60 %	0 %	0 %	384207538
1019	NC_017243	CTT	2	6	42131	42136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207538
1020	NC_017243	TTA	3	9	42203	42211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207538
1021	NC_017243	CATT	2	8	42218	42225	25 %	50 %	0 %	25 %	384207538
1022	NC_017243	TTA	2	6	42326	42331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207539
1023	NC_017243	ATC	2	6	42339	42344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207539
1024	NC_017243	T	7	7	42363	42369	0 %	100 %	0 %	0 %	384207539
1025	NC_017243	CTT	2	6	42383	42388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207539
1026	NC_017243	T	6	6	42387	42392	0 %	100 %	0 %	0 %	384207539
1027	NC_017243	T	6	6	42433	42438	0 %	100 %	0 %	0 %	384207539
1028	NC_017243	ATT	2	6	42439	42444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207539
1029	NC_017243	TCAT	2	8	42445	42452	25 %	50 %	0 %	25 %	384207539
1030	NC_017243	T	6	6	42463	42468	0 %	100 %	0 %	0 %	384207539
1031	NC_017243	TTA	2	6	42470	42475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207539
1032	NC_017243	CTT	2	6	42503	42508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207539
1033	NC_017243	GCTTTT	2	12	42523	42534	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384207539
1034	NC_017243	ATA	2	6	42536	42541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207539
1035	NC_017243	TAT	2	6	42585	42590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207539
1036	NC_017243	CCATA	2	10	42654	42663	40 %	20 %	0 %	40 %	384207539
1037	NC_017243	TAT	2	6	42817	42822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207540
1038	NC_017243	ACA	2	6	42824	42829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207540
1039	NC_017243	TCT	2	6	42852	42857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207540
1040	NC_017243	AAT	2	6	42878	42883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207540
1041	NC_017243	AAG	2	6	42889	42894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207540
1042	NC_017243	AAG	2	6	42903	42908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207540
1043	NC_017243	TTATC	2	10	42912	42921	20 %	60 %	0 %	20 %	384207540
1044	NC_017243	T	6	6	43081	43086	0 %	100 %	0 %	0 %	384207540
1045	NC_017243	TA	3	6	43102	43107	50 %	50 %	0 %	0 %	384207540
1046	NC_017243	A	7	7	43124	43130	100 %	0 %	0 %	0 %	384207540
1047	NC_017243	TA	3	6	43189	43194	50 %	50 %	0 %	0 %	384207540
1048	NC_017243	TA	3	6	43223	43228	50 %	50 %	0 %	0 %	384207540
1049	NC_017243	CT	3	6	43319	43324	0 %	50 %	0 %	50 %	384207540
1050	NC_017243	AGT	2	6	43369	43374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207540
1051	NC_017243	T	6	6	43405	43410	0 %	100 %	0 %	0 %	384207540
1052	NC_017243	ATT	2	6	43423	43428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207540
1053	NC_017243	TA	3	6	43431	43436	50 %	50 %	0 %	0 %	384207540
1054	NC_017243	AGGC	2	8	43446	43453	25 %	0 %	50 %	25 %	384207540
1055	NC_017243	ATT	2	6	43454	43459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207540
1056	NC_017243	TTA	2	6	43538	43543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207540
1057	NC_017243	TAT	2	6	43563	43568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207540
1058	NC_017243	TCTATT	2	12	43614	43625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384207541
1059	NC_017243	TCA	4	12	43626	43637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207541
1060	NC_017243	CAG	2	6	43648	43653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207541
1061	NC_017243	AGC	2	6	43697	43702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207541
1062	NC_017243	TAA	2	6	43715	43720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207541
1063	NC_017243	TCC	2	6	43745	43750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207541
1064	NC_017243	TAT	2	6	43775	43780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207541
1065	NC_017243	ATA	2	6	43784	43789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207541
1066	NC_017243	T	6	6	43796	43801	0 %	100 %	0 %	0 %	384207541
1067	NC_017243	ATT	2	6	43895	43900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207541
1068	NC_017243	AAT	2	6	43929	43934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207541
1069	NC_017243	ATA	2	6	43960	43965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207541
1070	NC_017243	TCA	2	6	44019	44024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207541
1071	NC_017243	TATC	2	8	44028	44035	25 %	50 %	0 %	25 %	384207541
1072	NC_017243	TTC	2	6	44065	44070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207541
1073	NC_017243	AAG	2	6	44158	44163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207541
1074	NC_017243	TAT	2	6	44168	44173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207541
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1081	NC_017243	TA	4	8	44365	44372	50 %	50 %	0 %	0 %	384207541
1082	NC_017243	TA	3	6	45106	45111	50 %	50 %	0 %	0 %	384207542
1083	NC_017243	AGC	2	6	45174	45179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207542
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1088	NC_017243	GAA	2	6	45447	45452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207542
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1091	NC_017243	ATG	2	6	45481	45486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207542
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1094	NC_017243	TAT	2	6	45558	45563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207542
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1100	NC_017243	TCA	2	6	45716	45721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207542
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1102	NC_017243	ATAC	2	8	45857	45864	50 %	25 %	0 %	25 %	384207542
1103	NC_017243	GCA	2	6	45886	45891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207542
1104	NC_017243	ATAA	2	8	45919	45926	75 %	25 %	0 %	0 %	384207542
1105	NC_017243	AT	3	6	46028	46033	50 %	50 %	0 %	0 %	384207542
1106	NC_017243	AAG	2	6	46049	46054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207542
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1109	NC_017243	ATA	2	6	46148	46153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207542
1110	NC_017243	ATA	2	6	46195	46200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207542
1111	NC_017243	CTC	2	6	46250	46255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207542
1112	NC_017243	CTA	2	6	46364	46369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207542
1113	NC_017243	TAT	2	6	46370	46375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207542
1114	NC_017243	AG	3	6	46378	46383	50 %	0 %	50 %	0 %	384207542
1115	NC_017243	ATA	2	6	46399	46404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207542
1116	NC_017243	ATA	2	6	46446	46451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207542
1117	NC_017243	TGA	2	6	46461	46466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207542
1118	NC_017243	ACAT	2	8	46472	46479	50 %	25 %	0 %	25 %	384207542
1119	NC_017243	T	6	6	46548	46553	0 %	100 %	0 %	0 %	384207543
1120	NC_017243	T	7	7	46586	46592	0 %	100 %	0 %	0 %	384207543
1121	NC_017243	TAT	3	9	46691	46699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
1122	NC_017243	TTGTC	2	10	46721	46730	0 %	60 %	20 %	20 %	384207543
1123	NC_017243	GAA	2	6	46772	46777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207543
1124	NC_017243	AT	4	8	46821	46828	50 %	50 %	0 %	0 %	384207543
1125	NC_017243	TTC	2	6	46838	46843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207543
1126	NC_017243	AAT	2	6	46902	46907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207543
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1128	NC_017243	GTT	2	6	46941	46946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207543
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1131	NC_017243	TAT	2	6	47042	47047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207543
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1249	NC_017243	TCT	3	9	51245	51253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207546
1250	NC_017243	ATC	3	9	51269	51277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207546
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