MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017243	TCA	2	6	22391	22396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207519
502	NC_017243	TTA	2	6	22397	22402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
503	NC_017243	AT	3	6	22448	22453	50 %	50 %	0 %	0 %	384207519
504	NC_017243	ATT	3	9	22471	22479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
505	NC_017243	T	7	7	22478	22484	0 %	100 %	0 %	0 %	384207519
506	NC_017243	AT	3	6	22497	22502	50 %	50 %	0 %	0 %	384207519
507	NC_017243	TTA	2	6	22514	22519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
508	NC_017243	TCT	2	6	22538	22543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207519
509	NC_017243	AT	4	8	22549	22556	50 %	50 %	0 %	0 %	384207519
510	NC_017243	T	7	7	22556	22562	0 %	100 %	0 %	0 %	384207519
511	NC_017243	CATT	2	8	22568	22575	25 %	50 %	0 %	25 %	384207519
512	NC_017243	ATT	3	9	22660	22668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
513	NC_017243	ATT	2	6	22708	22713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
514	NC_017243	T	8	8	22712	22719	0 %	100 %	0 %	0 %	384207519
515	NC_017243	TAT	2	6	22735	22740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
516	NC_017243	T	6	6	22766	22771	0 %	100 %	0 %	0 %	384207519
517	NC_017243	ATT	2	6	22804	22809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
518	NC_017243	ATT	3	9	22829	22837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207519
519	NC_017243	T	7	7	22836	22842	0 %	100 %	0 %	0 %	384207519
520	NC_017243	TGC	2	6	22857	22862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207519
521	NC_017243	A	6	6	22879	22884	100 %	0 %	0 %	0 %	384207519
522	NC_017243	T	8	8	22896	22903	0 %	100 %	0 %	0 %	384207519
523	NC_017243	AG	3	6	23059	23064	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
524	NC_017243	AAGG	2	8	23068	23075	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
525	NC_017243	GAT	2	6	23126	23131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207520
526	NC_017243	AAG	2	6	23162	23167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207520
527	NC_017243	ACA	2	6	23219	23224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207520
528	NC_017243	T	6	6	23233	23238	0 %	100 %	0 %	0 %	384207520
529	NC_017243	TAAA	2	8	23256	23263	75 %	25 %	0 %	0 %	384207520
530	NC_017243	AAT	2	6	23281	23286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207520
531	NC_017243	AT	3	6	23310	23315	50 %	50 %	0 %	0 %	384207520
532	NC_017243	A	6	6	23321	23326	100 %	0 %	0 %	0 %	384207520
533	NC_017243	GGATGC	2	12	23353	23364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384207520
534	NC_017243	AATA	2	8	23461	23468	75 %	25 %	0 %	0 %	384207520
535	NC_017243	TGT	2	6	23485	23490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207520
536	NC_017243	AGGA	2	8	23494	23501	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
537	NC_017243	AT	3	6	23610	23615	50 %	50 %	0 %	0 %	384207520
538	NC_017243	TCA	2	6	23643	23648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207520
539	NC_017243	AT	3	6	23656	23661	50 %	50 %	0 %	0 %	384207520
540	NC_017243	AGGA	2	8	23664	23671	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
541	NC_017243	TGT	2	6	23674	23679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207520
542	NC_017243	GAG	2	6	23738	23743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207520
543	NC_017243	CTT	2	6	23757	23762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207520
544	NC_017243	A	6	6	23852	23857	100 %	0 %	0 %	0 %	384207520
545	NC_017243	ATT	2	6	23923	23928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207521
546	NC_017243	ATT	2	6	23934	23939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207521
547	NC_017243	ATC	2	6	23940	23945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207521
548	NC_017243	TC	3	6	23956	23961	0 %	50 %	0 %	50 %	384207521
549	NC_017243	AATT	2	8	23994	24001	50 %	50 %	0 %	0 %	384207521
550	NC_017243	TAT	2	6	24027	24032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207521
551	NC_017243	TAA	2	6	24038	24043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207521
552	NC_017243	T	6	6	24059	24064	0 %	100 %	0 %	0 %	384207521
553	NC_017243	A	6	6	24105	24110	100 %	0 %	0 %	0 %	384207521
554	NC_017243	TAT	2	6	24126	24131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207521
555	NC_017243	TAT	2	6	24140	24145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207521
556	NC_017243	T	6	6	24173	24178	0 %	100 %	0 %	0 %	384207521
557	NC_017243	ATA	2	6	24250	24255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207521
558	NC_017243	AGC	2	6	24258	24263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207521
559	NC_017243	ATA	2	6	24334	24339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207521
560	NC_017243	A	6	6	24354	24359	100 %	0 %	0 %	0 %	384207521
561	NC_017243	A	6	6	24907	24912	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
562	NC_017243	TAA	2	6	24915	24920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207522
563	NC_017243	T	7	7	24935	24941	0 %	100 %	0 %	0 %	384207522
564	NC_017243	ATTTTT	2	12	24946	24957	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384207522
565	NC_017243	ATT	2	6	24962	24967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207522
566	NC_017243	A	7	7	24999	25005	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
567	NC_017243	AAAG	2	8	25047	25054	75 %	0 %	25 %	0 %	384207522
568	NC_017243	A	6	6	25075	25080	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
569	NC_017243	CTT	2	6	25120	25125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207522
570	NC_017243	A	6	6	25143	25148	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
571	NC_017243	TAT	2	6	25152	25157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207522
572	NC_017243	TAA	2	6	25188	25193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207522
573	NC_017243	CTG	2	6	25205	25210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207522
574	NC_017243	TGC	2	6	25341	25346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207522
575	NC_017243	ATC	2	6	25353	25358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207522
576	NC_017243	A	6	6	25371	25376	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
577	NC_017243	GCT	2	6	25387	25392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207522
578	NC_017243	TGA	2	6	25404	25409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207522
579	NC_017243	GAT	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207522
580	NC_017243	TTAC	2	8	25462	25469	25 %	50 %	0 %	25 %	384207522
581	NC_017243	TGA	2	6	25479	25484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207522
582	NC_017243	A	6	6	25510	25515	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
583	NC_017243	A	6	6	25545	25550	100 %	0 %	0 %	0 %	384207522
584	NC_017243	AGA	3	9	25578	25586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207522
585	NC_017243	TA	4	8	25662	25669	50 %	50 %	0 %	0 %	384207522
586	NC_017243	T	7	7	25747	25753	0 %	100 %	0 %	0 %	384207522
587	NC_017243	AGC	2	6	25759	25764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207522
588	NC_017243	TTC	2	6	25802	25807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207522
589	NC_017243	AAT	2	6	25860	25865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207522
590	NC_017243	TTTC	2	8	25889	25896	0 %	75 %	0 %	25 %	384207522
591	NC_017243	ATA	2	6	25904	25909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207522
592	NC_017243	CTT	2	6	25919	25924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207522
593	NC_017243	ATTT	2	8	25932	25939	25 %	75 %	0 %	0 %	384207522
594	NC_017243	TTA	2	6	25942	25947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207522
595	NC_017243	ATTG	2	8	25968	25975	25 %	50 %	25 %	0 %	384207522
596	NC_017243	ATG	2	6	26060	26065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207522
597	NC_017243	T	6	6	26097	26102	0 %	100 %	0 %	0 %	384207522
598	NC_017243	AT	3	6	26115	26120	50 %	50 %	0 %	0 %	384207522
599	NC_017243	ATG	2	6	26141	26146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207522
600	NC_017243	ATAA	2	8	26167	26174	75 %	25 %	0 %	0 %	384207522
601	NC_017243	GCA	2	6	26177	26182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207522
602	NC_017243	TAG	2	6	26216	26221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207522
603	NC_017243	TAAA	2	8	26236	26243	75 %	25 %	0 %	0 %	384207522
604	NC_017243	AGA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207523
605	NC_017243	TAG	2	6	26518	26523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207523
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607	NC_017243	ATT	2	6	27172	27177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207524
608	NC_017243	T	6	6	27195	27200	0 %	100 %	0 %	0 %	384207524
609	NC_017243	ATT	2	6	27222	27227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207524
610	NC_017243	AAG	2	6	27230	27235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207524
611	NC_017243	TTC	2	6	27262	27267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207524
612	NC_017243	ATA	2	6	27302	27307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207524
613	NC_017243	AAG	2	6	27582	27587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207524
614	NC_017243	ATG	2	6	27593	27598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207524
615	NC_017243	AAG	2	6	27606	27611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207524
616	NC_017243	TGA	2	6	27623	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207524
617	NC_017243	ATT	2	6	27632	27637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207524
618	NC_017243	GAAT	2	8	27695	27702	50 %	25 %	25 %	0 %	384207524
619	NC_017243	ATG	2	6	27707	27712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207524
620	NC_017243	GAT	2	6	27808	27813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207524
621	NC_017243	ATG	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207524
622	NC_017243	ATA	2	6	27916	27921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207524
623	NC_017243	GAT	2	6	27970	27975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207524
624	NC_017243	ATT	2	6	28082	28087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207524
625	NC_017243	A	6	6	28089	28094	100 %	0 %	0 %	0 %	384207524
626	NC_017243	A	6	6	28392	28397	100 %	0 %	0 %	0 %	384207525
627	NC_017243	TAA	2	6	28486	28491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207525
628	NC_017243	A	6	6	28498	28503	100 %	0 %	0 %	0 %	384207525
629	NC_017243	AGA	2	6	28507	28512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207525
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631	NC_017243	ATA	2	6	28548	28553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207525
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