MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83001	NC_017243	TATCTA	2	12	3271735	3271746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384210344
83002	NC_017243	TAA	2	6	3271792	3271797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210344
83003	NC_017243	AT	3	6	3271831	3271836	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83004	NC_017243	TA	3	6	3271853	3271858	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83005	NC_017243	ATT	2	6	3271889	3271894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83006	NC_017243	TTA	2	6	3271918	3271923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83007	NC_017243	TTA	2	6	3271938	3271943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83008	NC_017243	ATA	2	6	3271976	3271981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210344
83009	NC_017243	AATTT	2	10	3272008	3272017	40 %	60 %	0 %	0 %	384210344
83010	NC_017243	AAT	2	6	3272023	3272028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210344
83011	NC_017243	TTCT	2	8	3272096	3272103	0 %	75 %	0 %	25 %	384210344
83012	NC_017243	TAA	2	6	3272121	3272126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210344
83013	NC_017243	AAAT	2	8	3272149	3272156	75 %	25 %	0 %	0 %	384210344
83014	NC_017243	TA	3	6	3272176	3272181	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83015	NC_017243	AT	4	8	3272190	3272197	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83016	NC_017243	ATA	2	6	3272242	3272247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210344
83017	NC_017243	AT	4	8	3272290	3272297	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83018	NC_017243	AT	3	6	3272335	3272340	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83019	NC_017243	T	7	7	3272362	3272368	0 %	100 %	0 %	0 %	384210344
83020	NC_017243	CTC	2	6	3272375	3272380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384210344
83021	NC_017243	T	6	6	3272396	3272401	0 %	100 %	0 %	0 %	384210344
83022	NC_017243	A	6	6	3272417	3272422	100 %	0 %	0 %	0 %	384210344
83023	NC_017243	CTT	2	6	3272443	3272448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210344
83024	NC_017243	TTA	2	6	3272481	3272486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83025	NC_017243	TCCT	2	8	3272513	3272520	0 %	50 %	0 %	50 %	384210344
83026	NC_017243	TAT	2	6	3272557	3272562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83027	NC_017243	ATC	3	9	3272580	3272588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210344
83028	NC_017243	T	6	6	3272642	3272647	0 %	100 %	0 %	0 %	384210344
83029	NC_017243	AT	3	6	3272648	3272653	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83030	NC_017243	ATT	2	6	3272669	3272674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83031	NC_017243	TTC	3	9	3272741	3272749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210344
83032	NC_017243	TCTT	2	8	3272803	3272810	0 %	75 %	0 %	25 %	384210344
83033	NC_017243	T	6	6	3272835	3272840	0 %	100 %	0 %	0 %	384210344
83034	NC_017243	T	6	6	3272855	3272860	0 %	100 %	0 %	0 %	384210344
83035	NC_017243	AT	3	6	3272866	3272871	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83036	NC_017243	T	6	6	3272871	3272876	0 %	100 %	0 %	0 %	384210344
83037	NC_017243	TAATA	2	10	3272897	3272906	60 %	40 %	0 %	0 %	384210344
83038	NC_017243	TTG	2	6	3272914	3272919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384210344
83039	NC_017243	TAT	2	6	3272921	3272926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210344
83040	NC_017243	AT	3	6	3272928	3272933	50 %	50 %	0 %	0 %	384210344
83041	NC_017243	GTA	2	6	3272937	3272942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210344
83042	NC_017243	ATT	3	9	3273052	3273060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83043	NC_017243	T	6	6	3273064	3273069	0 %	100 %	0 %	0 %	384210345
83044	NC_017243	TTC	2	6	3273105	3273110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210345
83045	NC_017243	TA	3	6	3273132	3273137	50 %	50 %	0 %	0 %	384210345
83046	NC_017243	ATT	2	6	3273138	3273143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83047	NC_017243	ATATAA	2	12	3273230	3273241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210345
83048	NC_017243	T	6	6	3273296	3273301	0 %	100 %	0 %	0 %	384210345
83049	NC_017243	TTTA	2	8	3273318	3273325	25 %	75 %	0 %	0 %	384210345
83050	NC_017243	ATT	2	6	3273342	3273347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83051	NC_017243	ATTT	2	8	3273527	3273534	25 %	75 %	0 %	0 %	384210345
83052	NC_017243	CTA	2	6	3273584	3273589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210345
83053	NC_017243	TAT	2	6	3273596	3273601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83054	NC_017243	TAT	2	6	3273605	3273610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83055	NC_017243	TTA	2	6	3273611	3273616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83056	NC_017243	TCT	2	6	3273622	3273627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210345
83057	NC_017243	AAG	2	6	3273642	3273647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210345
83058	NC_017243	ATC	2	6	3273726	3273731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210345
83059	NC_017243	ATA	2	6	3273807	3273812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210345
83060	NC_017243	A	7	7	3273831	3273837	100 %	0 %	0 %	0 %	384210345
83061	NC_017243	AAAAG	2	10	3273843	3273852	80 %	0 %	20 %	0 %	384210345
83062	NC_017243	TCA	2	6	3273862	3273867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210345
83063	NC_017243	ATT	2	6	3273888	3273893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210345
83064	NC_017243	TG	3	6	3273894	3273899	0 %	50 %	50 %	0 %	384210345
83065	NC_017243	ATC	2	6	3273966	3273971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210345
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83067	NC_017243	TA	3	6	3274044	3274049	50 %	50 %	0 %	0 %	384210345
83068	NC_017243	GCT	2	6	3274064	3274069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384210345
83069	NC_017243	AT	3	6	3274244	3274249	50 %	50 %	0 %	0 %	384210346
83070	NC_017243	T	6	6	3274266	3274271	0 %	100 %	0 %	0 %	384210346
83071	NC_017243	TA	3	6	3274274	3274279	50 %	50 %	0 %	0 %	384210346
83072	NC_017243	A	6	6	3274299	3274304	100 %	0 %	0 %	0 %	384210346
83073	NC_017243	A	7	7	3274307	3274313	100 %	0 %	0 %	0 %	384210346
83074	NC_017243	T	6	6	3274314	3274319	0 %	100 %	0 %	0 %	384210346
83075	NC_017243	T	7	7	3274321	3274327	0 %	100 %	0 %	0 %	384210346
83076	NC_017243	A	7	7	3274328	3274334	100 %	0 %	0 %	0 %	384210346
83077	NC_017243	A	8	8	3274338	3274345	100 %	0 %	0 %	0 %	384210346
83078	NC_017243	A	7	7	3274460	3274466	100 %	0 %	0 %	0 %	384210347
83079	NC_017243	TAA	2	6	3274497	3274502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
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83081	NC_017243	TTCTAT	2	12	3274537	3274548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384210347
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83083	NC_017243	TCT	2	6	3274595	3274600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210347
83084	NC_017243	AT	3	6	3274618	3274623	50 %	50 %	0 %	0 %	384210347
83085	NC_017243	GATA	2	8	3274624	3274631	50 %	25 %	25 %	0 %	384210347
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83088	NC_017243	GAT	2	6	3274709	3274714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210347
83089	NC_017243	A	6	6	3274737	3274742	100 %	0 %	0 %	0 %	384210347
83090	NC_017243	GTA	2	6	3274808	3274813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210347
83091	NC_017243	ATTT	2	8	3274872	3274879	25 %	75 %	0 %	0 %	384210347
83092	NC_017243	TAA	2	6	3274894	3274899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
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83102	NC_017243	TAA	3	9	3275089	3275097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
83103	NC_017243	TAATA	2	10	3275101	3275110	60 %	40 %	0 %	0 %	384210347
83104	NC_017243	ATC	2	6	3275113	3275118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210347
83105	NC_017243	ATA	2	6	3275121	3275126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
83106	NC_017243	ATA	2	6	3275162	3275167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
83107	NC_017243	A	7	7	3275173	3275179	100 %	0 %	0 %	0 %	384210347
83108	NC_017243	ATA	2	6	3275186	3275191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
83109	NC_017243	TGT	2	6	3275266	3275271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384210347
83110	NC_017243	AAATA	2	10	3275304	3275313	80 %	20 %	0 %	0 %	384210347
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83112	NC_017243	TAA	2	6	3275331	3275336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210347
83113	NC_017243	CTTT	2	8	3275508	3275515	0 %	75 %	0 %	25 %	384210347
83114	NC_017243	GA	3	6	3275521	3275526	50 %	0 %	50 %	0 %	384210347
83115	NC_017243	CAG	2	6	3275562	3275567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384210347
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83117	NC_017243	GCA	2	6	3275639	3275644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384210347
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