MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 83831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017243	TAA	2	6	180957	180962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207669
4502	NC_017243	TACTT	2	10	180969	180978	20 %	60 %	0 %	20 %	384207669
4503	NC_017243	TAT	2	6	181017	181022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4504	NC_017243	CTT	2	6	181027	181032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207669
4505	NC_017243	TTA	2	6	181045	181050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4506	NC_017243	TTA	2	6	181088	181093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4507	NC_017243	CTA	2	6	181094	181099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207669
4508	NC_017243	CCT	2	6	181153	181158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207669
4509	NC_017243	AT	3	6	181196	181201	50 %	50 %	0 %	0 %	384207669
4510	NC_017243	TAT	2	6	181223	181228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4511	NC_017243	TTG	2	6	181241	181246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207669
4512	NC_017243	A	6	6	181305	181310	100 %	0 %	0 %	0 %	384207669
4513	NC_017243	TAC	2	6	181395	181400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207669
4514	NC_017243	TTG	3	9	181457	181465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207669
4515	NC_017243	TAT	2	6	181469	181474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4516	NC_017243	ATT	2	6	181485	181490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4517	NC_017243	AT	3	6	181499	181504	50 %	50 %	0 %	0 %	384207669
4518	NC_017243	CTG	2	6	181520	181525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207669
4519	NC_017243	ATT	2	6	181554	181559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4520	NC_017243	ATG	2	6	181561	181566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207669
4521	NC_017243	TATAG	2	10	181648	181657	40 %	40 %	20 %	0 %	384207669
4522	NC_017243	TAT	2	6	181679	181684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4523	NC_017243	AT	3	6	181724	181729	50 %	50 %	0 %	0 %	384207669
4524	NC_017243	ATT	2	6	181731	181736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207669
4525	NC_017243	CTT	2	6	181756	181761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207669
4526	NC_017243	TTAA	2	8	181762	181769	50 %	50 %	0 %	0 %	384207669
4527	NC_017243	ATT	2	6	182035	182040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207670
4528	NC_017243	TTG	2	6	182044	182049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207670
4529	NC_017243	TTTCT	2	10	182078	182087	0 %	80 %	0 %	20 %	384207670
4530	NC_017243	CTTT	2	8	182095	182102	0 %	75 %	0 %	25 %	384207670
4531	NC_017243	GAA	2	6	182106	182111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207670
4532	NC_017243	TCA	2	6	182115	182120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207670
4533	NC_017243	T	8	8	182123	182130	0 %	100 %	0 %	0 %	384207670
4534	NC_017243	AAG	2	6	182144	182149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207670
4535	NC_017243	AGC	2	6	182174	182179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207670
4536	NC_017243	CT	3	6	182240	182245	0 %	50 %	0 %	50 %	384207670
4537	NC_017243	TTC	2	6	182248	182253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207670
4538	NC_017243	AT	4	8	182258	182265	50 %	50 %	0 %	0 %	384207670
4539	NC_017243	ATC	2	6	182315	182320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207670
4540	NC_017243	ACT	2	6	182322	182327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207670
4541	NC_017243	ATA	2	6	182347	182352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207670
4542	NC_017243	T	6	6	182363	182368	0 %	100 %	0 %	0 %	384207670
4543	NC_017243	T	7	7	182377	182383	0 %	100 %	0 %	0 %	384207670
4544	NC_017243	CTT	2	6	182415	182420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207670
4545	NC_017243	GAA	2	6	182470	182475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207670
4546	NC_017243	CTTC	2	8	182481	182488	0 %	50 %	0 %	50 %	384207670
4547	NC_017243	TTC	2	6	182504	182509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207670
4548	NC_017243	T	7	7	182594	182600	0 %	100 %	0 %	0 %	384207670
4549	NC_017243	CTG	2	6	182621	182626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207670
4550	NC_017243	TTC	2	6	182633	182638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207670
4551	NC_017243	CTT	2	6	182644	182649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207670
4552	NC_017243	TAT	2	6	182738	182743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207670
4553	NC_017243	TAT	2	6	182765	182770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207670
4554	NC_017243	ACT	2	6	182811	182816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207670
4555	NC_017243	TAT	2	6	182851	182856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207670
4556	NC_017243	CTTA	2	8	182900	182907	25 %	50 %	0 %	25 %	384207670
4557	NC_017243	TGAA	2	8	182947	182954	50 %	25 %	25 %	0 %	384207670
4558	NC_017243	T	7	7	183002	183008	0 %	100 %	0 %	0 %	384207670
4559	NC_017243	AAG	2	6	183026	183031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207670
4560	NC_017243	ATTG	2	8	183041	183048	25 %	50 %	25 %	0 %	384207670
4561	NC_017243	TCTT	2	8	183056	183063	0 %	75 %	0 %	25 %	384207670
4562	NC_017243	TAA	2	6	183107	183112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207670
4563	NC_017243	T	6	6	183125	183130	0 %	100 %	0 %	0 %	384207670
4564	NC_017243	ATA	2	6	183132	183137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207670
4565	NC_017243	A	7	7	183781	183787	100 %	0 %	0 %	0 %	384207671
4566	NC_017243	TTTA	2	8	183790	183797	25 %	75 %	0 %	0 %	384207671
4567	NC_017243	ATA	2	6	183858	183863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207671
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4570	NC_017243	GGC	2	6	183911	183916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207671
4571	NC_017243	AGG	2	6	183922	183927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207671
4572	NC_017243	CCT	2	6	183950	183955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207671
4573	NC_017243	GGT	2	6	183992	183997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384207671
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4579	NC_017243	TGC	2	6	184255	184260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207671
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4581	NC_017243	ATA	2	6	184332	184337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207671
4582	NC_017243	TTA	2	6	184346	184351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207671
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4587	NC_017243	AAT	2	6	184607	184612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207672
4588	NC_017243	ATG	2	6	184613	184618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207672
4589	NC_017243	TTA	2	6	184646	184651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207672
4590	NC_017243	AGC	2	6	184881	184886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207673
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4592	NC_017243	TTA	2	6	184924	184929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207673
4593	NC_017243	TA	3	6	184984	184989	50 %	50 %	0 %	0 %	384207673
4594	NC_017243	GCGG	2	8	185002	185009	0 %	0 %	75 %	25 %	384207673
4595	NC_017243	TAAATT	2	12	185012	185023	50 %	50 %	0 %	0 %	384207673
4596	NC_017243	AGA	2	6	185037	185042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207673
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4599	NC_017243	CGG	2	6	185076	185081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207673
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4601	NC_017243	TTA	2	6	185193	185198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207673
4602	NC_017243	TAA	2	6	185199	185204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207673
4603	NC_017243	TAA	2	6	185234	185239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207673
4604	NC_017243	A	7	7	185325	185331	100 %	0 %	0 %	0 %	384207673
4605	NC_017243	CAA	2	6	185354	185359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207673
4606	NC_017243	AAT	2	6	185398	185403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207673
4607	NC_017243	TGA	2	6	185430	185435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207673
4608	NC_017243	TGT	2	6	185475	185480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207673
4609	NC_017243	GGA	2	6	185488	185493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207673
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4611	NC_017243	AAT	2	6	185563	185568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207673
4612	NC_017243	A	7	7	185596	185602	100 %	0 %	0 %	0 %	384207673
4613	NC_017243	TTG	3	9	185624	185632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207673
4614	NC_017243	CTG	2	6	185636	185641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207673
4615	NC_017243	TCAT	2	8	185680	185687	25 %	50 %	0 %	25 %	384207673
4616	NC_017243	TGA	2	6	185688	185693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207673
4617	NC_017243	AAG	2	6	185717	185722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207673
4618	NC_017243	GA	3	6	185746	185751	50 %	0 %	50 %	0 %	384207673
4619	NC_017243	ACT	2	6	185771	185776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207673
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4621	NC_017243	AT	3	6	185814	185819	50 %	50 %	0 %	0 %	384207673
4622	NC_017243	ATAA	2	8	185825	185832	75 %	25 %	0 %	0 %	384207673
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4997	NC_017243	TTA	2	6	203262	203267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207689
4998	NC_017243	AT	4	8	203302	203309	50 %	50 %	0 %	0 %	384207689
4999	NC_017243	TTC	2	6	203312	203317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207689
5000	NC_017243	AAG	2	6	203370	203375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207689

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