MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	AGA	3	9	190	198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
2	NC_017239	ATC	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206339
3	NC_017239	GCT	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206339
4	NC_017239	AGA	2	6	346	351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
5	NC_017239	CTT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206339
6	NC_017239	TGG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206339
7	NC_017239	CTC	2	6	513	518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206339
8	NC_017239	TAG	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206339
9	NC_017239	TAT	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206339
10	NC_017239	ACA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206339
11	NC_017239	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
12	NC_017239	TTA	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206339
13	NC_017239	TCA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206339
14	NC_017239	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
15	NC_017239	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206339
16	NC_017239	ATT	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206340
17	NC_017239	AAT	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206340
18	NC_017239	ATT	2	6	1833	1838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206342
19	NC_017239	ACA	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
20	NC_017239	AAG	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
21	NC_017239	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
22	NC_017239	AAC	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
23	NC_017239	ACT	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206343
24	NC_017239	TAA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
25	NC_017239	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
26	NC_017239	ATA	3	9	2803	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
27	NC_017239	GAA	3	9	2820	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
28	NC_017239	CAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
29	NC_017239	TTC	2	6	2899	2904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206343
30	NC_017239	TTA	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
31	NC_017239	AAT	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
32	NC_017239	TAA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
33	NC_017239	TAT	2	6	3158	3163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
34	NC_017239	ATA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
35	NC_017239	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
36	NC_017239	TAA	2	6	3415	3420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
37	NC_017239	AAG	2	6	3448	3453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
38	NC_017239	TAA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
39	NC_017239	ATG	2	6	3591	3596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206344
40	NC_017239	TAA	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
41	NC_017239	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206344
42	NC_017239	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206344
43	NC_017239	GAA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206344
44	NC_017239	GTT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206344
45	NC_017239	ATT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206344
46	NC_017239	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
47	NC_017239	GAG	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206345
48	NC_017239	CTT	2	6	4080	4085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206345
49	NC_017239	AAT	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
50	NC_017239	TAA	2	6	4108	4113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
51	NC_017239	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206345
52	NC_017239	TAA	2	6	4227	4232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
53	NC_017239	TGT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206345
54	NC_017239	AAG	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206345
55	NC_017239	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
56	NC_017239	AGA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206345
57	NC_017239	CTC	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206345
58	NC_017239	ATC	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206345
59	NC_017239	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
60	NC_017239	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
61	NC_017239	ATT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
62	NC_017239	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
63	NC_017239	ATA	3	9	4843	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206346
64	NC_017239	AAG	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
65	NC_017239	GAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
66	NC_017239	GAT	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206346
67	NC_017239	AAG	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
68	NC_017239	TCT	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206346
69	NC_017239	AAC	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206346
70	NC_017239	TCA	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206348
71	NC_017239	TGT	2	6	6533	6538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206349
72	NC_017239	AGA	2	6	6590	6595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206349
73	NC_017239	TTA	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206349
74	NC_017239	ATC	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206350
75	NC_017239	TCT	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206352
76	NC_017239	CTC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206352
77	NC_017239	AGC	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206352
78	NC_017239	CTT	2	6	7158	7163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206353
79	NC_017239	TGG	2	6	7202	7207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206353
80	NC_017239	ATT	2	6	7742	7747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206355
81	NC_017239	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206355
82	NC_017239	ATA	2	6	8548	8553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206356
83	NC_017239	TCC	2	6	8558	8563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206356
84	NC_017239	ATC	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206356
85	NC_017239	TAA	2	6	8675	8680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206356
86	NC_017239	AAT	3	9	8718	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206356
87	NC_017239	CTT	2	6	9051	9056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206357
88	NC_017239	ATC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206357
89	NC_017239	CTT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206357
90	NC_017239	ATA	2	6	9821	9826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
91	NC_017239	TGA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206358
92	NC_017239	ATT	2	6	9932	9937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206358
93	NC_017239	GTG	2	6	10032	10037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206358
94	NC_017239	TAA	2	6	10081	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
95	NC_017239	ATT	2	6	10132	10137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206358
96	NC_017239	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
97	NC_017239	GTT	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206358
98	NC_017239	CTA	2	6	10293	10298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206358
99	NC_017239	TGA	2	6	10300	10305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206358
100	NC_017239	CTT	2	6	10742	10747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206359
101	NC_017239	ATT	2	6	10783	10788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206359
102	NC_017239	ATT	2	6	10856	10861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206359
103	NC_017239	TAT	2	6	10948	10953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206359
104	NC_017239	GTT	2	6	11003	11008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206359
105	NC_017239	AAG	2	6	11015	11020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206359
106	NC_017239	ATT	2	6	11021	11026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206359
107	NC_017239	CTT	2	6	11035	11040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206359
108	NC_017239	ATT	2	6	11521	11526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206360
109	NC_017239	TCC	2	6	11558	11563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206360
110	NC_017239	CTT	2	6	11596	11601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206360
111	NC_017239	TAA	2	6	11623	11628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206360
112	NC_017239	CTT	2	6	11682	11687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206360
113	NC_017239	CTT	2	6	11708	11713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206360
114	NC_017239	TAA	2	6	11785	11790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206360
115	NC_017239	TCA	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206360
116	NC_017239	TTA	2	6	11931	11936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206360
117	NC_017239	TGT	2	6	12522	12527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206361
118	NC_017239	GTT	2	6	12606	12611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206361
119	NC_017239	AAT	2	6	12632	12637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206361
120	NC_017239	TGT	2	6	12649	12654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206361
121	NC_017239	TAT	2	6	12736	12741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206361
122	NC_017239	TAT	2	6	12745	12750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206361
123	NC_017239	CTC	2	6	12758	12763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206361
124	NC_017239	TAT	2	6	12784	12789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206361
125	NC_017239	TAG	2	6	12900	12905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206361
126	NC_017239	GTT	2	6	12944	12949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206361
127	NC_017239	AAT	2	6	12982	12987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206361
128	NC_017239	CTT	2	6	13009	13014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206361
129	NC_017239	TTA	2	6	13086	13091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206361
130	NC_017239	TTA	2	6	13158	13163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206361
131	NC_017239	ATT	2	6	14661	14666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206362
132	NC_017239	TAT	2	6	14702	14707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206362
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.