MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	TGAAA	2	10	110	119	60 %	20 %	20 %	0 %	384206504
2	NC_017238	AATCA	2	10	2606	2615	60 %	20 %	0 %	20 %	384206506
3	NC_017238	AATCC	2	10	3583	3592	40 %	20 %	0 %	40 %	384206507
4	NC_017238	AAAGA	2	10	4076	4085	80 %	0 %	20 %	0 %	384206507
5	NC_017238	TCAAT	2	10	4138	4147	40 %	40 %	0 %	20 %	384206507
6	NC_017238	ATTCC	2	10	5288	5297	20 %	40 %	0 %	40 %	384206508
7	NC_017238	CCTTG	2	10	5356	5365	0 %	40 %	20 %	40 %	384206508
8	NC_017238	GTATT	2	10	6126	6135	20 %	60 %	20 %	0 %	384206508
9	NC_017238	ACAAT	2	10	7324	7333	60 %	20 %	0 %	20 %	384206509
10	NC_017238	ATTCT	2	10	7343	7352	20 %	60 %	0 %	20 %	384206509
11	NC_017238	TAAAT	2	10	8049	8058	60 %	40 %	0 %	0 %	384206510
12	NC_017238	TTTCA	2	10	9295	9304	20 %	60 %	0 %	20 %	384206512
13	NC_017238	TTAAA	2	10	10300	10309	60 %	40 %	0 %	0 %	384206513
14	NC_017238	AATTC	2	10	10803	10812	40 %	40 %	0 %	20 %	384206514
15	NC_017238	TTCAT	2	10	11705	11714	20 %	60 %	0 %	20 %	384206515
16	NC_017238	ACTTA	2	10	12510	12519	40 %	40 %	0 %	20 %	384206516
17	NC_017238	CAAAT	2	10	12662	12671	60 %	20 %	0 %	20 %	384206516
18	NC_017238	TAAAA	2	10	12931	12940	80 %	20 %	0 %	0 %	384206517
19	NC_017238	AACAT	2	10	12981	12990	60 %	20 %	0 %	20 %	384206517
20	NC_017238	AATAT	2	10	14603	14612	60 %	40 %	0 %	0 %	384206517
21	NC_017238	ACAAG	2	10	14652	14661	60 %	0 %	20 %	20 %	384206517
22	NC_017238	AAAAT	2	10	16235	16244	80 %	20 %	0 %	0 %	384206520
23	NC_017238	TTAAA	2	10	16816	16825	60 %	40 %	0 %	0 %	384206520
24	NC_017238	ATTCA	2	10	16863	16872	40 %	40 %	0 %	20 %	384206521
25	NC_017238	TATCA	2	10	17796	17805	40 %	40 %	0 %	20 %	384206521
26	NC_017238	AAAGA	2	10	18116	18125	80 %	0 %	20 %	0 %	384206522
27	NC_017238	CAATC	2	10	18567	18576	40 %	20 %	0 %	40 %	384206523
28	NC_017238	TAAAC	2	10	19901	19910	60 %	20 %	0 %	20 %	384206523
29	NC_017238	AAACA	2	10	21795	21804	80 %	0 %	0 %	20 %	384206525
30	NC_017238	ATTTT	2	10	24122	24131	20 %	80 %	0 %	0 %	384206528
31	NC_017238	TCCCC	2	10	24614	24623	0 %	20 %	0 %	80 %	384206528
32	NC_017238	CAAAA	2	10	26743	26752	80 %	0 %	0 %	20 %	384206531
33	NC_017238	AAAAT	2	10	28945	28954	80 %	20 %	0 %	0 %	384206534
34	NC_017238	TTAAA	2	10	29621	29630	60 %	40 %	0 %	0 %	384206535
35	NC_017238	AAATA	2	10	31480	31489	80 %	20 %	0 %	0 %	384206536
36	NC_017238	TTTGA	2	10	32684	32693	20 %	60 %	20 %	0 %	384206538
37	NC_017238	TCACT	2	10	33231	33240	20 %	40 %	0 %	40 %	384206538
38	NC_017238	ATTTC	2	10	35671	35680	20 %	60 %	0 %	20 %	384206539
39	NC_017238	TAAAT	2	10	35878	35887	60 %	40 %	0 %	0 %	384206540
40	NC_017238	ATTTT	2	10	36863	36872	20 %	80 %	0 %	0 %	384206541
41	NC_017238	AATAA	2	10	36943	36952	80 %	20 %	0 %	0 %	384206541
42	NC_017238	GCAAA	2	10	38184	38193	60 %	0 %	20 %	20 %	384206542
43	NC_017238	ATCAA	2	10	39314	39323	60 %	20 %	0 %	20 %	384206542
44	NC_017238	TATCA	2	10	41444	41453	40 %	40 %	0 %	20 %	384206544
45	NC_017238	ATCTT	2	10	41486	41495	20 %	60 %	0 %	20 %	384206545
46	NC_017238	AAACT	2	10	42870	42879	60 %	20 %	0 %	20 %	384206546
47	NC_017238	GATTT	2	10	44006	44015	20 %	60 %	20 %	0 %	384206547
48	NC_017238	TCTTT	2	10	44330	44339	0 %	80 %	0 %	20 %	384206547
49	NC_017238	TGCAA	2	10	45697	45706	40 %	20 %	20 %	20 %	384206548
50	NC_017238	AAATT	2	10	45725	45734	60 %	40 %	0 %	0 %	384206548
51	NC_017238	TAAAT	2	10	51324	51333	60 %	40 %	0 %	0 %	384206557
52	NC_017238	ATAAA	2	10	56643	56652	80 %	20 %	0 %	0 %	384206561
53	NC_017238	CCCCT	2	10	57071	57080	0 %	20 %	0 %	80 %	384206562
54	NC_017238	TTAAA	2	10	59366	59375	60 %	40 %	0 %	0 %	384206565
55	NC_017238	ATTTT	2	10	59540	59549	20 %	80 %	0 %	0 %	384206565
56	NC_017238	TTTGT	2	10	60445	60454	0 %	80 %	20 %	0 %	384206566
57	NC_017238	TTATT	2	10	60529	60538	20 %	80 %	0 %	0 %	384206567
58	NC_017238	CATTA	2	10	63302	63311	40 %	40 %	0 %	20 %	384206569
59	NC_017238	AGAGA	2	10	63633	63642	60 %	0 %	40 %	0 %	384206569
60	NC_017238	AAAGG	2	10	63747	63756	60 %	0 %	40 %	0 %	384206569
61	NC_017238	TCTTG	2	10	65287	65296	0 %	60 %	20 %	20 %	384206571
62	NC_017238	ATTTT	2	10	69676	69685	20 %	80 %	0 %	0 %	384206574
63	NC_017238	TTTAT	2	10	70034	70043	20 %	80 %	0 %	0 %	384206574
64	NC_017238	TAAAA	2	10	75009	75018	80 %	20 %	0 %	0 %	384206579
65	NC_017238	TCAAA	2	10	76849	76858	60 %	20 %	0 %	20 %	384206581
66	NC_017238	AATAA	2	10	76924	76933	80 %	20 %	0 %	0 %	384206581
67	NC_017238	TAAAC	2	10	78698	78707	60 %	20 %	0 %	20 %	384206582
68	NC_017238	ATTTT	2	10	80399	80408	20 %	80 %	0 %	0 %	384206584
69	NC_017238	AGTAA	2	10	80982	80991	60 %	20 %	20 %	0 %	384206585
70	NC_017238	ATTTA	2	10	81095	81104	40 %	60 %	0 %	0 %	384206585
71	NC_017238	TGATT	2	10	82732	82741	20 %	60 %	20 %	0 %	384206586
72	NC_017238	AATAA	2	10	84649	84658	80 %	20 %	0 %	0 %	384206588
73	NC_017238	TCTTT	2	10	85058	85067	0 %	80 %	0 %	20 %	384206588
74	NC_017238	CTTTT	2	10	88317	88326	0 %	80 %	0 %	20 %	384206591
75	NC_017238	ATCTC	2	10	88520	88529	20 %	40 %	0 %	40 %	384206591
76	NC_017238	AATTT	2	10	89763	89772	40 %	60 %	0 %	0 %	384206592
77	NC_017238	CCCAA	2	10	89871	89880	40 %	0 %	0 %	60 %	384206593
78	NC_017238	TCCCA	2	10	90562	90571	20 %	20 %	0 %	60 %	384206593
79	NC_017238	GTCCT	2	10	90705	90714	0 %	40 %	20 %	40 %	384206593
80	NC_017238	TTATC	2	10	94302	94311	20 %	60 %	0 %	20 %	384206597
81	NC_017238	TTAAA	2	10	94576	94585	60 %	40 %	0 %	0 %	384206598
82	NC_017238	TAATA	2	10	94737	94746	60 %	40 %	0 %	0 %	384206598
83	NC_017238	TTCAA	2	10	96469	96478	40 %	40 %	0 %	20 %	384206598
84	NC_017238	ATTTA	2	10	98346	98355	40 %	60 %	0 %	0 %	384206600
85	NC_017238	TACTT	2	10	98529	98538	20 %	60 %	0 %	20 %	384206600
86	NC_017238	ACCTC	2	10	100953	100962	20 %	20 %	0 %	60 %	384206603
87	NC_017238	ATCAA	2	10	103540	103549	60 %	20 %	0 %	20 %	384206605
88	NC_017238	TTAGT	2	10	103661	103670	20 %	60 %	20 %	0 %	384206605
89	NC_017238	GCATT	2	10	104739	104748	20 %	40 %	20 %	20 %	384206606
90	NC_017238	TTTTA	2	10	105783	105792	20 %	80 %	0 %	0 %	384206608
91	NC_017238	CATAA	2	10	106793	106802	60 %	20 %	0 %	20 %	384206608
92	NC_017238	TGAAT	2	10	107636	107645	40 %	40 %	20 %	0 %	384206609
93	NC_017238	AATCT	2	10	107681	107690	40 %	40 %	0 %	20 %	384206609
94	NC_017238	CTATA	2	10	109954	109963	40 %	40 %	0 %	20 %	384206611
95	NC_017238	GCACT	2	10	113301	113310	20 %	20 %	20 %	40 %	384206616
96	NC_017238	AATAA	2	10	114157	114166	80 %	20 %	0 %	0 %	384206616
97	NC_017238	CAATA	2	10	115627	115636	60 %	20 %	0 %	20 %	384206618
98	NC_017238	TTTCC	2	10	116132	116141	0 %	60 %	0 %	40 %	384206618
99	NC_017238	TAATA	2	10	116232	116241	60 %	40 %	0 %	0 %	384206618
100	NC_017238	AAAAG	2	10	116746	116755	80 %	0 %	20 %	0 %	384206619
101	NC_017238	AAAAT	2	10	116954	116963	80 %	20 %	0 %	0 %	384206619
102	NC_017238	AAAAT	2	10	117479	117488	80 %	20 %	0 %	0 %	384206619
103	NC_017238	AAATT	2	10	117989	117998	60 %	40 %	0 %	0 %	384206620
104	NC_017238	TTTAA	2	10	119207	119216	40 %	60 %	0 %	0 %	384206622
105	NC_017238	TATCA	2	10	120088	120097	40 %	40 %	0 %	20 %	384206623
106	NC_017238	ATTTC	2	10	120362	120371	20 %	60 %	0 %	20 %	384206623
107	NC_017238	TCTCT	2	10	122454	122463	0 %	60 %	0 %	40 %	384206627
108	NC_017238	ACCAT	2	10	123455	123464	40 %	20 %	0 %	40 %	384206627
109	NC_017238	ACTCT	2	10	125225	125234	20 %	40 %	0 %	40 %	384206629
110	NC_017238	AAAAT	2	10	125802	125811	80 %	20 %	0 %	0 %	384206630
111	NC_017238	AATAG	2	10	128120	128129	60 %	20 %	20 %	0 %	384206632
112	NC_017238	TTTGC	2	10	128749	128758	0 %	60 %	20 %	20 %	384206632
113	NC_017238	TAAAA	2	10	129496	129505	80 %	20 %	0 %	0 %	384206632
114	NC_017238	ATTAT	2	10	129888	129897	40 %	60 %	0 %	0 %	384206632
115	NC_017238	TTTTA	2	10	129917	129926	20 %	80 %	0 %	0 %	384206632
116	NC_017238	TATTT	2	10	131676	131685	20 %	80 %	0 %	0 %	384206634
117	NC_017238	ATTTT	2	10	132453	132462	20 %	80 %	0 %	0 %	384206635
118	NC_017238	TAAAA	2	10	133154	133163	80 %	20 %	0 %	0 %	384206635
119	NC_017238	AAATC	2	10	133485	133494	60 %	20 %	0 %	20 %	384206635
120	NC_017238	AAAAG	2	10	134155	134164	80 %	0 %	20 %	0 %	384206636
121	NC_017238	AAATT	2	10	134714	134723	60 %	40 %	0 %	0 %	384206636
122	NC_017238	AAGCA	2	10	135674	135683	60 %	0 %	20 %	20 %	384206636
123	NC_017238	AAATA	2	10	137165	137174	80 %	20 %	0 %	0 %	384206637
124	NC_017238	CAAAA	2	10	138119	138128	80 %	0 %	0 %	20 %	384206639
125	NC_017238	AAAAT	2	10	141581	141590	80 %	20 %	0 %	0 %	384206641
126	NC_017238	AATCA	2	10	141741	141750	60 %	20 %	0 %	20 %	384206642
127	NC_017238	TTTGC	2	10	142145	142154	0 %	60 %	20 %	20 %	384206642
128	NC_017238	AATTT	2	10	142666	142675	40 %	60 %	0 %	0 %	384206643
129	NC_017238	TAACA	2	10	143552	143561	60 %	20 %	0 %	20 %	384206643
130	NC_017238	ATATC	2	10	144524	144533	40 %	40 %	0 %	20 %	384206645
131	NC_017238	AAAAC	2	10	145870	145879	80 %	0 %	0 %	20 %	384206646
132	NC_017238	TCTAG	2	10	148934	148943	20 %	40 %	20 %	20 %	384206649
133	NC_017238	AATTT	2	10	149273	149282	40 %	60 %	0 %	0 %	384206649
134	NC_017238	AATTT	2	10	149681	149690	40 %	60 %	0 %	0 %	384206649
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136	NC_017238	ATTTC	2	10	152060	152069	20 %	60 %	0 %	20 %	384206651
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