MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 12143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	ATA	3	9	78	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206504
2	NC_017238	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206504
3	NC_017238	TTA	3	9	141	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206504
4	NC_017238	CAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206504
5	NC_017238	TTC	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206504
6	NC_017238	ACT	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206504
7	NC_017238	AAC	2	6	533	538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206504
8	NC_017238	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206504
9	NC_017238	CTA	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
10	NC_017238	ATA	2	6	874	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206505
11	NC_017238	ATA	2	6	976	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206505
12	NC_017238	AGC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206505
13	NC_017238	TCC	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206505
14	NC_017238	TCC	2	6	1188	1193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206505
15	NC_017238	CTA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
16	NC_017238	TCA	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
17	NC_017238	CAA	2	6	1424	1429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206505
18	NC_017238	TCG	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206505
19	NC_017238	ATT	2	6	1575	1580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206505
20	NC_017238	TCA	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
21	NC_017238	GCA	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206506
22	NC_017238	TAG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206506
23	NC_017238	ATT	2	6	1865	1870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
24	NC_017238	TAT	2	6	2087	2092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
25	NC_017238	TCA	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206506
26	NC_017238	GAA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206506
27	NC_017238	TCC	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206506
28	NC_017238	CTC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206506
29	NC_017238	AGA	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206506
30	NC_017238	ATT	3	9	2474	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
31	NC_017238	TAT	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
32	NC_017238	ATC	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206506
33	NC_017238	AAG	2	6	2992	2997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206506
34	NC_017238	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206506
35	NC_017238	CTT	2	6	3016	3021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206506
36	NC_017238	TAA	2	6	3547	3552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
37	NC_017238	ATT	2	6	3568	3573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206507
38	NC_017238	ATT	2	6	3636	3641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206507
39	NC_017238	TAA	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
40	NC_017238	TGG	2	6	3821	3826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206507
41	NC_017238	ATA	2	6	3855	3860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
42	NC_017238	ATA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
43	NC_017238	TAA	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
44	NC_017238	TGA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
45	NC_017238	ATA	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
46	NC_017238	AAT	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
47	NC_017238	ATA	2	6	4219	4224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
48	NC_017238	CTA	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
49	NC_017238	ATC	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
50	NC_017238	GTA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
51	NC_017238	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
52	NC_017238	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
53	NC_017238	TAC	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
54	NC_017238	ATT	2	6	4691	4696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206507
55	NC_017238	ACT	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
56	NC_017238	ACA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206507
57	NC_017238	ATC	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
58	NC_017238	AGG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206507
59	NC_017238	TAA	2	6	5027	5032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
60	NC_017238	TTG	2	6	5038	5043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206507
61	NC_017238	TAA	2	6	5080	5085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
62	NC_017238	CTA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
63	NC_017238	TAA	2	6	5144	5149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
64	NC_017238	TAA	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
65	NC_017238	ATA	2	6	5177	5182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
66	NC_017238	TTC	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206508
67	NC_017238	TAC	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206508
68	NC_017238	TCA	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206508
69	NC_017238	TCT	2	6	5422	5427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206508
70	NC_017238	CTT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206508
71	NC_017238	CTT	2	6	5535	5540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206508
72	NC_017238	TCA	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206508
73	NC_017238	CCA	2	6	5730	5735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206508
74	NC_017238	CTT	2	6	5804	5809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206508
75	NC_017238	TTA	2	6	6068	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206508
76	NC_017238	TAA	2	6	6183	6188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206508
77	NC_017238	CTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206508
78	NC_017238	TAC	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206508
79	NC_017238	ACC	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206509
80	NC_017238	CAG	2	6	6569	6574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206509
81	NC_017238	TTA	2	6	6635	6640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206509
82	NC_017238	AGC	2	6	6770	6775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206509
83	NC_017238	ATT	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206509
84	NC_017238	TAG	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206509
85	NC_017238	ACA	3	9	6917	6925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206509
86	NC_017238	ACT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206509
87	NC_017238	AAT	2	6	6957	6962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206509
88	NC_017238	TAA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206509
89	NC_017238	ATA	2	6	7063	7068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206509
90	NC_017238	TAG	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206509
91	NC_017238	TAA	2	6	7123	7128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206509
92	NC_017238	ATA	2	6	7160	7165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206509
93	NC_017238	TAA	2	6	7175	7180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206509
94	NC_017238	ATT	2	6	7617	7622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206510
95	NC_017238	TCT	2	6	7721	7726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206510
96	NC_017238	TTA	2	6	7738	7743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206510
97	NC_017238	ATT	2	6	7965	7970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206510
98	NC_017238	CTT	2	6	7980	7985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206510
99	NC_017238	TCA	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206510
100	NC_017238	TAA	2	6	8015	8020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206510
101	NC_017238	TAT	2	6	8066	8071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206510
102	NC_017238	TCA	2	6	8221	8226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206510
103	NC_017238	TGC	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206510
104	NC_017238	CTA	2	6	8541	8546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206511
105	NC_017238	ATT	2	6	8587	8592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206511
106	NC_017238	TAA	2	6	8686	8691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206511
107	NC_017238	GAA	2	6	8739	8744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206511
108	NC_017238	GTT	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206511
109	NC_017238	ATA	2	6	8847	8852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206511
110	NC_017238	ACG	2	6	8929	8934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206511
111	NC_017238	TAA	2	6	8941	8946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206511
112	NC_017238	GAA	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206511
113	NC_017238	AAT	2	6	9189	9194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
114	NC_017238	ATA	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
115	NC_017238	TGA	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206512
116	NC_017238	AAC	2	6	9321	9326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206512
117	NC_017238	TAA	2	6	9444	9449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
118	NC_017238	AAT	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
119	NC_017238	ATT	2	6	9456	9461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206512
120	NC_017238	TTA	2	6	9691	9696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206512
121	NC_017238	AGT	2	6	9795	9800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206512
122	NC_017238	GTA	2	6	9838	9843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206512
123	NC_017238	AAT	2	6	9879	9884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
124	NC_017238	TAA	2	6	9906	9911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
125	NC_017238	TAA	2	6	9950	9955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
126	NC_017238	ACA	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206512
127	NC_017238	AAT	2	6	10167	10172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206512
128	NC_017238	ATA	2	6	10215	10220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206513
129	NC_017238	GCA	2	6	10315	10320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206513
130	NC_017238	TAA	2	6	10426	10431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206513
131	NC_017238	AGA	2	6	10640	10645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206514
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162	NC_017238	ATA	2	6	12971	12976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206517
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256	NC_017238	TCA	2	6	19127	19132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206523
257	NC_017238	AGC	2	6	19447	19452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206523
258	NC_017238	ATC	2	6	19465	19470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206523
259	NC_017238	ACC	2	6	19471	19476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206523
260	NC_017238	AAT	4	12	19477	19488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206523
261	NC_017238	TAA	2	6	19516	19521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206523
262	NC_017238	TTC	2	6	19557	19562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206523
263	NC_017238	AGA	2	6	19564	19569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206523
264	NC_017238	TCC	2	6	19750	19755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206523
265	NC_017238	CTT	2	6	20140	20145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206524
266	NC_017238	CTT	2	6	20309	20314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206524
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268	NC_017238	GTA	2	6	20355	20360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206524
269	NC_017238	TTC	2	6	20456	20461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206524
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285	NC_017238	GAG	2	6	21467	21472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206525
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