MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	AT	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	384207454
2	NC_017237	AT	4	8	1043	1050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207455
3	NC_017237	AG	3	6	1334	1339	50 %	0 %	50 %	0 %	384207455
4	NC_017237	CA	3	6	3593	3598	50 %	0 %	0 %	50 %	384207456
5	NC_017237	CT	3	6	3768	3773	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
6	NC_017237	TA	3	6	9459	9464	50 %	50 %	0 %	0 %	384207462
7	NC_017237	AT	3	6	10678	10683	50 %	50 %	0 %	0 %	384207463
8	NC_017237	AG	3	6	11598	11603	50 %	0 %	50 %	0 %	384207465
9	NC_017237	AT	3	6	12858	12863	50 %	50 %	0 %	0 %	384207466
10	NC_017237	TG	3	6	13793	13798	0 %	50 %	50 %	0 %	384207467
11	NC_017237	AG	3	6	13958	13963	50 %	0 %	50 %	0 %	384207467
12	NC_017237	TA	4	8	14892	14899	50 %	50 %	0 %	0 %	384207469
13	NC_017237	TC	3	6	15530	15535	0 %	50 %	0 %	50 %	384207470
14	NC_017237	AC	3	6	17473	17478	50 %	0 %	0 %	50 %	384207473
15	NC_017237	TA	3	6	17490	17495	50 %	50 %	0 %	0 %	384207473
16	NC_017237	AT	3	6	17697	17702	50 %	50 %	0 %	0 %	384207473
17	NC_017237	AC	3	6	17938	17943	50 %	0 %	0 %	50 %	384207473
18	NC_017237	TA	3	6	19582	19587	50 %	50 %	0 %	0 %	384207475
19	NC_017237	TA	3	6	19843	19848	50 %	50 %	0 %	0 %	384207475
20	NC_017237	TA	3	6	20226	20231	50 %	50 %	0 %	0 %	384207476
21	NC_017237	TA	3	6	20246	20251	50 %	50 %	0 %	0 %	384207476
22	NC_017237	TA	3	6	20842	20847	50 %	50 %	0 %	0 %	384207477
23	NC_017237	AT	3	6	21257	21262	50 %	50 %	0 %	0 %	384207477
24	NC_017237	GT	3	6	21683	21688	0 %	50 %	50 %	0 %	384207478
25	NC_017237	TA	4	8	21845	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
26	NC_017237	TA	4	8	21867	21874	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
27	NC_017237	TA	4	8	22001	22008	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
28	NC_017237	GT	3	6	24491	24496	0 %	50 %	50 %	0 %	384207480
29	NC_017237	TA	3	6	25166	25171	50 %	50 %	0 %	0 %	384207481
30	NC_017237	TA	4	8	26014	26021	50 %	50 %	0 %	0 %	384207482
31	NC_017237	TA	3	6	26146	26151	50 %	50 %	0 %	0 %	384207482
32	NC_017237	TG	4	8	26420	26427	0 %	50 %	50 %	0 %	384207482
33	NC_017237	AT	3	6	26441	26446	50 %	50 %	0 %	0 %	384207482
34	NC_017237	AG	3	6	26696	26701	50 %	0 %	50 %	0 %	384207482
35	NC_017237	AG	3	6	26756	26761	50 %	0 %	50 %	0 %	384207482
36	NC_017237	AT	3	6	30540	30545	50 %	50 %	0 %	0 %	384207487
37	NC_017237	AT	3	6	31222	31227	50 %	50 %	0 %	0 %	384207489
38	NC_017237	GT	3	6	31228	31233	0 %	50 %	50 %	0 %	384207489
39	NC_017237	AT	3	6	31257	31262	50 %	50 %	0 %	0 %	384207489
40	NC_017237	TC	3	6	32492	32497	0 %	50 %	0 %	50 %	384207490
41	NC_017237	TA	3	6	33486	33491	50 %	50 %	0 %	0 %	384207491

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.