MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-8

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017236	CAA	2	6	498	503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206483
2	NC_017236	CTA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206483
3	NC_017236	TAA	2	6	911	916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206483
4	NC_017236	TCA	2	6	948	953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206483
5	NC_017236	TCT	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206483
6	NC_017236	ACA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206484
7	NC_017236	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206484
8	NC_017236	AAC	2	6	1348	1353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206484
9	NC_017236	TAA	2	6	1354	1359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206484
10	NC_017236	ATT	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206484
11	NC_017236	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206484
12	NC_017236	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206484
13	NC_017236	ATG	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206484
14	NC_017236	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206485
15	NC_017236	TAA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206485
16	NC_017236	ATC	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206485
17	NC_017236	CTT	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206485
18	NC_017236	TTA	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
19	NC_017236	TGC	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206485
20	NC_017236	ATT	2	6	2322	2327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
21	NC_017236	TTA	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
22	NC_017236	TAT	2	6	2459	2464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
23	NC_017236	CTG	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206485
24	NC_017236	AGA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206485
25	NC_017236	TCT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206485
26	NC_017236	CCT	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206485
27	NC_017236	AGA	2	6	2927	2932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206485
28	NC_017236	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206485
29	NC_017236	CAA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206485
30	NC_017236	ATA	2	6	3047	3052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206485
31	NC_017236	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206486
32	NC_017236	ATA	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
33	NC_017236	TTA	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
34	NC_017236	TTA	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
35	NC_017236	CAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206486
36	NC_017236	AAT	2	6	3640	3645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
37	NC_017236	TTA	2	6	3646	3651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
38	NC_017236	GCT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206486
39	NC_017236	ATC	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206486
40	NC_017236	TAT	2	6	3850	3855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
41	NC_017236	AGA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206486
42	NC_017236	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
43	NC_017236	ATA	2	6	4103	4108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
44	NC_017236	ATT	2	6	4115	4120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
45	NC_017236	AGC	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
46	NC_017236	AGC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
47	NC_017236	TGA	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206487
48	NC_017236	AAT	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206487
49	NC_017236	AGA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206487
50	NC_017236	ATT	2	6	4460	4465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206487
51	NC_017236	ATT	2	6	4508	4513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206487
52	NC_017236	CCT	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206487
53	NC_017236	CAG	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
54	NC_017236	ATA	2	6	4631	4636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206487
55	NC_017236	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206487
56	NC_017236	CCA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206487
57	NC_017236	AGC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
58	NC_017236	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206487
59	NC_017236	CTT	2	6	4974	4979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206487
60	NC_017236	ATT	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206487
61	NC_017236	ACA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206488
62	NC_017236	TAA	2	6	5359	5364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206488
63	NC_017236	AAT	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
64	NC_017236	CAT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206489
65	NC_017236	ATC	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206489
66	NC_017236	AAT	2	6	5919	5924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
67	NC_017236	TAA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
68	NC_017236	TTC	2	6	5951	5956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206489
69	NC_017236	AAT	2	6	6048	6053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
70	NC_017236	ATA	2	6	6250	6255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
71	NC_017236	ATT	3	9	6561	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
72	NC_017236	ATT	2	6	6648	6653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
73	NC_017236	TAT	2	6	6743	6748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
74	NC_017236	TAG	3	9	6900	6908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206490
75	NC_017236	ATA	2	6	7032	7037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
76	NC_017236	TTC	2	6	7053	7058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206490
77	NC_017236	ATA	2	6	7081	7086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
78	NC_017236	AAT	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
79	NC_017236	CTT	2	6	7197	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206490
80	NC_017236	AAG	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206490
81	NC_017236	TAA	2	6	7247	7252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
82	NC_017236	TCA	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206490
83	NC_017236	TAC	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206490
84	NC_017236	GCT	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206490
85	NC_017236	ATA	2	6	7369	7374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
86	NC_017236	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
87	NC_017236	ACA	2	6	7418	7423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206490
88	NC_017236	ATT	2	6	7519	7524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206491
89	NC_017236	GAT	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206491
90	NC_017236	CAA	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206491
91	NC_017236	TAA	2	6	7623	7628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206491
92	NC_017236	TAT	2	6	7635	7640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206491
93	NC_017236	CAA	2	6	7719	7724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206491
94	NC_017236	GAT	2	6	7736	7741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206491
95	NC_017236	TCT	2	6	7796	7801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206491
96	NC_017236	AAT	2	6	7816	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206491
97	NC_017236	TAC	2	6	7887	7892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206491
98	NC_017236	AAC	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206491
99	NC_017236	ATA	2	6	8162	8167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206491
100	NC_017236	ATT	2	6	8186	8191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206491
101	NC_017236	TAA	2	6	8224	8229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
102	NC_017236	GAA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206492
103	NC_017236	ATA	2	6	8297	8302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
104	NC_017236	CTG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206492
105	NC_017236	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
106	NC_017236	TAA	2	6	8564	8569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
107	NC_017236	TTA	2	6	8595	8600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
108	NC_017236	ATT	2	6	8717	8722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
109	NC_017236	TCA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206492
110	NC_017236	CTA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206492
111	NC_017236	ATT	2	6	9188	9193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
112	NC_017236	AAT	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
113	NC_017236	AAT	2	6	9424	9429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206493
114	NC_017236	TCT	2	6	9436	9441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206493
115	NC_017236	ATT	2	6	9507	9512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206493
116	NC_017236	TTC	2	6	9513	9518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206493
117	NC_017236	AAT	2	6	9591	9596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206493
118	NC_017236	TCC	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206493
119	NC_017236	TAA	2	6	9765	9770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206493
120	NC_017236	AGT	2	6	9945	9950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206493
121	NC_017236	ACC	2	6	9954	9959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206493
122	NC_017236	TTA	2	6	10057	10062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206493
123	NC_017236	CTT	2	6	10290	10295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206494
124	NC_017236	ATA	2	6	10309	10314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206494
125	NC_017236	CTA	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206494
126	NC_017236	GAA	2	6	10466	10471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206494
127	NC_017236	TTA	2	6	10479	10484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206494
128	NC_017236	AAT	2	6	10515	10520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206494
129	NC_017236	TTA	2	6	10580	10585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206494
130	NC_017236	CAT	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206494
131	NC_017236	AAT	2	6	10662	10667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206494
132	NC_017236	ACT	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206494
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.