MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	TG	3	6	922	927	0 %	50 %	50 %	0 %	384206320
2	NC_017234	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	384206322
3	NC_017234	TA	3	6	5081	5086	50 %	50 %	0 %	0 %	384206322
4	NC_017234	GA	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	384206322
5	NC_017234	TA	3	6	6883	6888	50 %	50 %	0 %	0 %	384206323
6	NC_017234	AC	3	6	7173	7178	50 %	0 %	0 %	50 %	384206324
7	NC_017234	TA	3	6	7830	7835	50 %	50 %	0 %	0 %	384206324
8	NC_017234	TA	3	6	9069	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	384206326
9	NC_017234	AT	3	6	9745	9750	50 %	50 %	0 %	0 %	384206327
10	NC_017234	AT	3	6	9876	9881	50 %	50 %	0 %	0 %	384206327
11	NC_017234	TA	3	6	10674	10679	50 %	50 %	0 %	0 %	384206328
12	NC_017234	AT	3	6	13047	13052	50 %	50 %	0 %	0 %	384206330
13	NC_017234	AT	3	6	15899	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
14	NC_017234	AT	3	6	16176	16181	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
15	NC_017234	TA	4	8	16407	16414	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
16	NC_017234	TA	3	6	16514	16519	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
17	NC_017234	TA	3	6	17791	17796	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
18	NC_017234	AT	3	6	18296	18301	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
19	NC_017234	AT	3	6	18645	18650	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
20	NC_017234	TA	3	6	18967	18972	50 %	50 %	0 %	0 %	384206334
21	NC_017234	TA	3	6	19573	19578	50 %	50 %	0 %	0 %	384206335
22	NC_017234	AT	3	6	20595	20600	50 %	50 %	0 %	0 %	384206336
23	NC_017234	TG	3	6	21901	21906	0 %	50 %	50 %	0 %	384206337
24	NC_017234	AG	3	6	22062	22067	50 %	0 %	50 %	0 %	384206337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.