MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-3

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017233	GTTT	2	8	447	454	0 %	75 %	25 %	0 %	384206298
2	NC_017233	TAAT	2	8	654	661	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
3	NC_017233	AATT	2	8	843	850	50 %	50 %	0 %	0 %	384206298
4	NC_017233	ATAA	2	8	974	981	75 %	25 %	0 %	0 %	384206298
5	NC_017233	AGAT	2	8	1011	1018	50 %	25 %	25 %	0 %	384206298
6	NC_017233	AGAA	3	12	1253	1264	75 %	0 %	25 %	0 %	384206298
7	NC_017233	GATA	2	8	2432	2439	50 %	25 %	25 %	0 %	384206301
8	NC_017233	CTTT	2	8	2500	2507	0 %	75 %	0 %	25 %	384206301
9	NC_017233	TGGG	2	8	3487	3494	0 %	25 %	75 %	0 %	384206302
10	NC_017233	TAAA	2	8	3716	3723	75 %	25 %	0 %	0 %	384206302
11	NC_017233	ACAA	2	8	3890	3897	75 %	0 %	0 %	25 %	384206302
12	NC_017233	ACTA	2	8	4619	4626	50 %	25 %	0 %	25 %	384206304
13	NC_017233	TATT	2	8	5195	5202	25 %	75 %	0 %	0 %	384206305
14	NC_017233	TTTA	2	8	5237	5244	25 %	75 %	0 %	0 %	384206305
15	NC_017233	GCAA	2	8	5250	5257	50 %	0 %	25 %	25 %	384206305
16	NC_017233	TTTA	2	8	8109	8116	25 %	75 %	0 %	0 %	384206307
17	NC_017233	TATC	2	8	8750	8757	25 %	50 %	0 %	25 %	384206307
18	NC_017233	CTTT	2	8	8773	8780	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
19	NC_017233	TCCT	2	8	9636	9643	0 %	50 %	0 %	50 %	384206307
20	NC_017233	TTCT	2	8	9989	9996	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
21	NC_017233	CTTT	2	8	10264	10271	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
22	NC_017233	TTTC	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
23	NC_017233	ATTT	2	8	10931	10938	25 %	75 %	0 %	0 %	384206307
24	NC_017233	GCTA	2	8	11088	11095	25 %	25 %	25 %	25 %	384206307
25	NC_017233	TCTT	2	8	11283	11290	0 %	75 %	0 %	25 %	384206307
26	NC_017233	AAAC	2	8	11312	11319	75 %	0 %	0 %	25 %	384206307
27	NC_017233	TAAG	2	8	11552	11559	50 %	25 %	25 %	0 %	384206307
28	NC_017233	GTTT	2	8	12060	12067	0 %	75 %	25 %	0 %	384206308
29	NC_017233	TTTG	2	8	12073	12080	0 %	75 %	25 %	0 %	384206308
30	NC_017233	ATTT	2	8	12265	12272	25 %	75 %	0 %	0 %	384206308
31	NC_017233	TAAA	2	8	13441	13448	75 %	25 %	0 %	0 %	384206310
32	NC_017233	TTAA	2	8	13473	13480	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
33	NC_017233	TTAC	2	8	13492	13499	25 %	50 %	0 %	25 %	384206310
34	NC_017233	ATTG	2	8	13730	13737	25 %	50 %	25 %	0 %	384206310
35	NC_017233	TTAA	2	8	13767	13774	50 %	50 %	0 %	0 %	384206310
36	NC_017233	TCTT	2	8	13905	13912	0 %	75 %	0 %	25 %	384206310
37	NC_017233	GAAA	2	8	14162	14169	75 %	0 %	25 %	0 %	384206310
38	NC_017233	ATGG	2	8	14525	14532	25 %	25 %	50 %	0 %	384206311
39	NC_017233	TCAA	2	8	14826	14833	50 %	25 %	0 %	25 %	384206312
40	NC_017233	AATG	2	8	15015	15022	50 %	25 %	25 %	0 %	384206312
41	NC_017233	TAGT	2	8	16736	16743	25 %	50 %	25 %	0 %	384206314
42	NC_017233	AAAT	2	8	17777	17784	75 %	25 %	0 %	0 %	384206315
43	NC_017233	CAAA	2	8	18466	18473	75 %	0 %	0 %	25 %	384206316
44	NC_017233	AACA	2	8	19217	19224	75 %	0 %	0 %	25 %	384206316
45	NC_017233	CGAT	2	8	22288	22295	25 %	25 %	25 %	25 %	384206318

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.