MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp17

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017232	TAA	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206381
2	NC_017232	TTG	2	6	838	843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206381
3	NC_017232	TGA	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206381
4	NC_017232	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206381
5	NC_017232	AAT	2	6	1039	1044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206381
6	NC_017232	GAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206381
7	NC_017232	ACT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206381
8	NC_017232	ATC	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206382
9	NC_017232	TAC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206382
10	NC_017232	TAA	2	6	1375	1380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206382
11	NC_017232	TAT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206383
12	NC_017232	TTC	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206383
13	NC_017232	TAA	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206383
14	NC_017232	ATA	2	6	1694	1699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206383
15	NC_017232	TCT	2	6	1962	1967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206384
16	NC_017232	TAA	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206384
17	NC_017232	TAC	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206384
18	NC_017232	AAT	2	6	2090	2095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206384
19	NC_017232	ATT	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206384
20	NC_017232	ATC	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206384
21	NC_017232	TAA	2	6	2264	2269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206384
22	NC_017232	TAT	2	6	2292	2297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206385
23	NC_017232	TTA	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206385
24	NC_017232	TAA	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206385
25	NC_017232	CAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206385
26	NC_017232	TTC	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206385
27	NC_017232	ATA	2	6	2614	2619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206386
28	NC_017232	TCT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206386
29	NC_017232	TAA	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206386
30	NC_017232	AAT	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206386
31	NC_017232	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206386
32	NC_017232	TCT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206386
33	NC_017232	AGA	2	6	3163	3168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206386
34	NC_017232	TAG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206387
35	NC_017232	CTA	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206387
36	NC_017232	CTT	2	6	4923	4928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206388
37	NC_017232	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206388
38	NC_017232	ACA	2	6	5860	5865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206389
39	NC_017232	AAT	2	6	6186	6191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206389
40	NC_017232	ACG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206389
41	NC_017232	ACC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206389
42	NC_017232	TAT	2	6	6247	6252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206389
43	NC_017232	GAA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206389
44	NC_017232	ATA	2	6	6482	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206389
45	NC_017232	AAG	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206389
46	NC_017232	TAA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206390
47	NC_017232	TCA	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206390
48	NC_017232	TAA	2	6	7717	7722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206390
49	NC_017232	TAC	2	6	7843	7848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206390
50	NC_017232	ATA	2	6	7887	7892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206390
51	NC_017232	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206390
52	NC_017232	CCA	2	6	8176	8181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206391
53	NC_017232	GTT	2	6	8183	8188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206391
54	NC_017232	ATC	2	6	8205	8210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206391
55	NC_017232	TTA	2	6	8233	8238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206391
56	NC_017232	CAT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206391
57	NC_017232	TAT	2	6	8288	8293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206391
58	NC_017232	CAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206391
59	NC_017232	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206391
60	NC_017232	TAA	2	6	8425	8430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206391
61	NC_017232	AAT	2	6	8618	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206391
62	NC_017232	ATT	2	6	8996	9001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206392
63	NC_017232	ATT	2	6	9134	9139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206392
64	NC_017232	GAA	2	6	9227	9232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206392
65	NC_017232	ATG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206392
66	NC_017232	CAA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206392
67	NC_017232	TAT	2	6	9379	9384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206392
68	NC_017232	TAA	2	6	9391	9396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206392
69	NC_017232	AAC	2	6	9422	9427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206392
70	NC_017232	TTA	2	6	9443	9448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206392
71	NC_017232	TAA	2	6	9457	9462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206392
72	NC_017232	CAA	2	6	9567	9572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206392
73	NC_017232	TAC	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206392
74	NC_017232	GAA	2	6	9608	9613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206392
75	NC_017232	CAA	2	6	9649	9654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206392
76	NC_017232	AGG	2	6	9709	9714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206392
77	NC_017232	AGA	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206392
78	NC_017232	AGA	2	6	10134	10139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206393
79	NC_017232	AGA	2	6	10233	10238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206393
80	NC_017232	AGA	2	6	10267	10272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206393
81	NC_017232	ATA	2	6	10563	10568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206394
82	NC_017232	AAT	2	6	10578	10583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206394
83	NC_017232	AGA	2	6	10616	10621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206394
84	NC_017232	TAA	2	6	10823	10828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206394
85	NC_017232	TAA	2	6	10906	10911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206394
86	NC_017232	ATT	2	6	10998	11003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206394
87	NC_017232	AAG	2	6	11005	11010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206394
88	NC_017232	GAA	2	6	11019	11024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206394
89	NC_017232	ATA	2	6	11209	11214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206394
90	NC_017232	CAA	2	6	11315	11320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206394
91	NC_017232	ATA	2	6	11374	11379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206394
92	NC_017232	GAT	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206394
93	NC_017232	GTA	2	6	11554	11559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206394
94	NC_017232	TGT	2	6	12654	12659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206395
95	NC_017232	TAA	2	6	12776	12781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206395
96	NC_017232	TTA	2	6	12789	12794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206395
97	NC_017232	TAA	2	6	13012	13017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206396
98	NC_017232	ATC	2	6	13083	13088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206396
99	NC_017232	TAA	2	6	13108	13113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206396
100	NC_017232	GAA	3	9	13145	13153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206396
101	NC_017232	ATT	2	6	13168	13173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206396
102	NC_017232	AGA	2	6	13198	13203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206396
103	NC_017232	GTG	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206396
104	NC_017232	GTG	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206396
105	NC_017232	TGA	2	6	13387	13392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206396
106	NC_017232	AGA	4	12	13396	13407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206396
107	NC_017232	AGA	3	9	13426	13434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206396
108	NC_017232	TTA	3	9	13435	13443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206396
109	NC_017232	TGA	2	6	13444	13449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206396
110	NC_017232	CAA	2	6	13560	13565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206396
111	NC_017232	AGA	2	6	13621	13626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206396
112	NC_017232	AGA	2	6	13645	13650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206396
113	NC_017232	TTA	2	6	13847	13852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206396
114	NC_017232	AAT	2	6	13870	13875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206396
115	NC_017232	ATT	2	6	14880	14885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206397
116	NC_017232	CTT	2	6	14901	14906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206397
117	NC_017232	ATG	2	6	14936	14941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206397
118	NC_017232	GAT	2	6	14956	14961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206397
119	NC_017232	AAT	2	6	15061	15066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206397
120	NC_017232	TTC	2	6	15084	15089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206397
121	NC_017232	ATT	2	6	15557	15562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206398
122	NC_017232	TAA	2	6	15682	15687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206398
123	NC_017232	ATA	2	6	15726	15731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206398
124	NC_017232	CAA	2	6	15810	15815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206398
125	NC_017232	CGT	2	6	15819	15824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206398
126	NC_017232	ACA	2	6	15879	15884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206398
127	NC_017232	TAT	2	6	15975	15980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206398
128	NC_017232	TTC	3	9	16054	16062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206398
129	NC_017232	AGC	2	6	16127	16132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206398
130	NC_017232	CTT	2	6	16161	16166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206398
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132	NC_017232	CTT	2	6	16197	16202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206398
133	NC_017232	CTT	2	6	17369	17374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206399
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.