MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-7

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017231	GAAAA	2	10	1798	1807	80 %	0 %	20 %	0 %	384206265
2	NC_017231	CTGCA	2	10	2452	2461	20 %	20 %	20 %	40 %	384206265
3	NC_017231	AAAAC	2	10	3188	3197	80 %	0 %	0 %	20 %	384206267
4	NC_017231	GAACT	2	10	4364	4373	40 %	20 %	20 %	20 %	384206269
5	NC_017231	ATATT	2	10	6472	6481	40 %	60 %	0 %	0 %	384206271
6	NC_017231	AATTT	2	10	7144	7153	40 %	60 %	0 %	0 %	384206272
7	NC_017231	TAAAA	2	10	7164	7173	80 %	20 %	0 %	0 %	384206272
8	NC_017231	TACTT	2	10	8167	8176	20 %	60 %	0 %	20 %	384206274
9	NC_017231	ACTCA	2	10	8200	8209	40 %	20 %	0 %	40 %	384206274
10	NC_017231	AAAGT	2	10	8267	8276	60 %	20 %	20 %	0 %	384206274
11	NC_017231	GAAAA	2	10	9034	9043	80 %	0 %	20 %	0 %	384206275
12	NC_017231	ATCTT	2	10	9770	9779	20 %	60 %	0 %	20 %	384206276
13	NC_017231	TTATG	2	10	11110	11119	20 %	60 %	20 %	0 %	384206280
14	NC_017231	AAAAT	2	10	12363	12372	80 %	20 %	0 %	0 %	384206282
15	NC_017231	AAAAT	2	10	12816	12825	80 %	20 %	0 %	0 %	384206283
16	NC_017231	CACTT	2	10	13589	13598	20 %	40 %	0 %	40 %	384206284
17	NC_017231	AATTT	2	10	13977	13986	40 %	60 %	0 %	0 %	384206284
18	NC_017231	AATTG	2	10	15299	15308	40 %	40 %	20 %	0 %	384206285
19	NC_017231	AAAAG	2	10	15380	15389	80 %	0 %	20 %	0 %	384206285
20	NC_017231	AAAAG	2	10	15718	15727	80 %	0 %	20 %	0 %	384206286
21	NC_017231	AATTT	2	10	16284	16293	40 %	60 %	0 %	0 %	384206287
22	NC_017231	AAAAC	2	10	20046	20055	80 %	0 %	0 %	20 %	384206291
23	NC_017231	ATTTT	2	10	21138	21147	20 %	80 %	0 %	0 %	384206292
24	NC_017231	ATTCT	2	10	23706	23715	20 %	60 %	0 %	20 %	384206295
25	NC_017231	GAAAA	2	10	24090	24099	80 %	0 %	20 %	0 %	384206296
26	NC_017231	CAAGG	2	10	24656	24665	40 %	0 %	40 %	20 %	384206296

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.