MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	A	7	7	60	66	100 %	0 %	0 %	0 %	384206151
2	NC_017228	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	384206151
3	NC_017228	T	6	6	560	565	0 %	100 %	0 %	0 %	384206151
4	NC_017228	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	384206151
5	NC_017228	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	384206151
6	NC_017228	A	6	6	1794	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	384206152
7	NC_017228	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	384206153
8	NC_017228	A	6	6	2755	2760	100 %	0 %	0 %	0 %	384206154
9	NC_017228	A	6	6	2904	2909	100 %	0 %	0 %	0 %	384206154
10	NC_017228	T	6	6	3499	3504	0 %	100 %	0 %	0 %	384206155
11	NC_017228	G	6	6	3511	3516	0 %	0 %	100 %	0 %	384206155
12	NC_017228	A	6	6	4395	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	384206156
13	NC_017228	A	6	6	4505	4510	100 %	0 %	0 %	0 %	384206156
14	NC_017228	A	6	6	5221	5226	100 %	0 %	0 %	0 %	384206157
15	NC_017228	A	6	6	6068	6073	100 %	0 %	0 %	0 %	384206159
16	NC_017228	A	6	6	6918	6923	100 %	0 %	0 %	0 %	384206161
17	NC_017228	T	6	6	6949	6954	0 %	100 %	0 %	0 %	384206161
18	NC_017228	T	7	7	7144	7150	0 %	100 %	0 %	0 %	384206161
19	NC_017228	A	6	6	7498	7503	100 %	0 %	0 %	0 %	384206161
20	NC_017228	A	6	6	8227	8232	100 %	0 %	0 %	0 %	384206162
21	NC_017228	A	6	6	8571	8576	100 %	0 %	0 %	0 %	384206163
22	NC_017228	A	6	6	8767	8772	100 %	0 %	0 %	0 %	384206164
23	NC_017228	A	6	6	8797	8802	100 %	0 %	0 %	0 %	384206164
24	NC_017228	A	6	6	9008	9013	100 %	0 %	0 %	0 %	384206165
25	NC_017228	A	6	6	9060	9065	100 %	0 %	0 %	0 %	384206165
26	NC_017228	A	6	6	9095	9100	100 %	0 %	0 %	0 %	384206165
27	NC_017228	A	6	6	9117	9122	100 %	0 %	0 %	0 %	384206165
28	NC_017228	T	6	6	9429	9434	0 %	100 %	0 %	0 %	384206165
29	NC_017228	A	6	6	9456	9461	100 %	0 %	0 %	0 %	384206165
30	NC_017228	A	6	6	10310	10315	100 %	0 %	0 %	0 %	384206166
31	NC_017228	T	6	6	10457	10462	0 %	100 %	0 %	0 %	384206166
32	NC_017228	T	6	6	10666	10671	0 %	100 %	0 %	0 %	384206166
33	NC_017228	A	6	6	11186	11191	100 %	0 %	0 %	0 %	384206167
34	NC_017228	A	6	6	11204	11209	100 %	0 %	0 %	0 %	384206167
35	NC_017228	A	6	6	11332	11337	100 %	0 %	0 %	0 %	384206167
36	NC_017228	A	6	6	12554	12559	100 %	0 %	0 %	0 %	384206169
37	NC_017228	T	8	8	12645	12652	0 %	100 %	0 %	0 %	384206169
38	NC_017228	T	7	7	12875	12881	0 %	100 %	0 %	0 %	384206170
39	NC_017228	T	6	6	13370	13375	0 %	100 %	0 %	0 %	384206170
40	NC_017228	T	6	6	13584	13589	0 %	100 %	0 %	0 %	384206171
41	NC_017228	A	6	6	13590	13595	100 %	0 %	0 %	0 %	384206171
42	NC_017228	T	6	6	13751	13756	0 %	100 %	0 %	0 %	384206171
43	NC_017228	T	6	6	13863	13868	0 %	100 %	0 %	0 %	384206171
44	NC_017228	A	6	6	14014	14019	100 %	0 %	0 %	0 %	384206171
45	NC_017228	A	7	7	14348	14354	100 %	0 %	0 %	0 %	384206172
46	NC_017228	A	6	6	14444	14449	100 %	0 %	0 %	0 %	384206172
47	NC_017228	A	6	6	14606	14611	100 %	0 %	0 %	0 %	384206172
48	NC_017228	A	6	6	14948	14953	100 %	0 %	0 %	0 %	384206172
49	NC_017228	A	7	7	15537	15543	100 %	0 %	0 %	0 %	384206174
50	NC_017228	A	8	8	15739	15746	100 %	0 %	0 %	0 %	384206175
51	NC_017228	A	6	6	15881	15886	100 %	0 %	0 %	0 %	384206175
52	NC_017228	T	7	7	16147	16153	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
53	NC_017228	T	6	6	16161	16166	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
54	NC_017228	T	6	6	16291	16296	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
55	NC_017228	T	6	6	16344	16349	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
56	NC_017228	T	6	6	16364	16369	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
57	NC_017228	T	6	6	16397	16402	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
58	NC_017228	T	7	7	16444	16450	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
59	NC_017228	T	8	8	16469	16476	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
60	NC_017228	T	7	7	16482	16488	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
61	NC_017228	T	6	6	16854	16859	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
62	NC_017228	T	7	7	17004	17010	0 %	100 %	0 %	0 %	384206176
63	NC_017228	A	6	6	17429	17434	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
64	NC_017228	A	6	6	17524	17529	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
65	NC_017228	A	7	7	17704	17710	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
66	NC_017228	A	6	6	17746	17751	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
67	NC_017228	A	6	6	17804	17809	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
68	NC_017228	A	7	7	17892	17898	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
69	NC_017228	A	7	7	17931	17937	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
70	NC_017228	A	7	7	18104	18110	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
71	NC_017228	A	8	8	18118	18125	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
72	NC_017228	A	6	6	18267	18272	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
73	NC_017228	A	6	6	18458	18463	100 %	0 %	0 %	0 %	384206177
74	NC_017228	A	7	7	18533	18539	100 %	0 %	0 %	0 %	384206178
75	NC_017228	A	8	8	18663	18670	100 %	0 %	0 %	0 %	384206178
76	NC_017228	T	6	6	18787	18792	0 %	100 %	0 %	0 %	384206178
77	NC_017228	A	6	6	18812	18817	100 %	0 %	0 %	0 %	384206178
78	NC_017228	T	7	7	18910	18916	0 %	100 %	0 %	0 %	384206178
79	NC_017228	A	6	6	19032	19037	100 %	0 %	0 %	0 %	384206178
80	NC_017228	A	6	6	19073	19078	100 %	0 %	0 %	0 %	384206178
81	NC_017228	T	6	6	19219	19224	0 %	100 %	0 %	0 %	384206179
82	NC_017228	A	6	6	19407	19412	100 %	0 %	0 %	0 %	384206179
83	NC_017228	A	6	6	19724	19729	100 %	0 %	0 %	0 %	384206179
84	NC_017228	A	6	6	19784	19789	100 %	0 %	0 %	0 %	384206179
85	NC_017228	A	8	8	20048	20055	100 %	0 %	0 %	0 %	384206180
86	NC_017228	T	6	6	20091	20096	0 %	100 %	0 %	0 %	384206180
87	NC_017228	A	6	6	20204	20209	100 %	0 %	0 %	0 %	384206180
88	NC_017228	A	7	7	20380	20386	100 %	0 %	0 %	0 %	384206180
89	NC_017228	A	6	6	20472	20477	100 %	0 %	0 %	0 %	384206181
90	NC_017228	A	7	7	20690	20696	100 %	0 %	0 %	0 %	384206181
91	NC_017228	T	7	7	21095	21101	0 %	100 %	0 %	0 %	384206182
92	NC_017228	T	7	7	21155	21161	0 %	100 %	0 %	0 %	384206182
93	NC_017228	A	8	8	21162	21169	100 %	0 %	0 %	0 %	384206182
94	NC_017228	A	7	7	21712	21718	100 %	0 %	0 %	0 %	384206183
95	NC_017228	A	6	6	21731	21736	100 %	0 %	0 %	0 %	384206183
96	NC_017228	A	6	6	21823	21828	100 %	0 %	0 %	0 %	384206183
97	NC_017228	A	6	6	21849	21854	100 %	0 %	0 %	0 %	384206183
98	NC_017228	T	6	6	22343	22348	0 %	100 %	0 %	0 %	384206183
99	NC_017228	A	7	7	22791	22797	100 %	0 %	0 %	0 %	384206183
100	NC_017228	T	7	7	23816	23822	0 %	100 %	0 %	0 %	384206185
101	NC_017228	T	7	7	23907	23913	0 %	100 %	0 %	0 %	384206185
102	NC_017228	T	6	6	24145	24150	0 %	100 %	0 %	0 %	384206185
103	NC_017228	T	6	6	24164	24169	0 %	100 %	0 %	0 %	384206185
104	NC_017228	T	6	6	24176	24181	0 %	100 %	0 %	0 %	384206185
105	NC_017228	A	7	7	25297	25303	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
106	NC_017228	T	7	7	25326	25332	0 %	100 %	0 %	0 %	384206187
107	NC_017228	A	6	6	25377	25382	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
108	NC_017228	A	7	7	25428	25434	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
109	NC_017228	A	6	6	25455	25460	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
110	NC_017228	A	9	9	25586	25594	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
111	NC_017228	A	6	6	25626	25631	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
112	NC_017228	A	7	7	25647	25653	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
113	NC_017228	A	6	6	25735	25740	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
114	NC_017228	A	7	7	25839	25845	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
115	NC_017228	A	6	6	25900	25905	100 %	0 %	0 %	0 %	384206187
116	NC_017228	A	7	7	26026	26032	100 %	0 %	0 %	0 %	384206188
117	NC_017228	A	6	6	26183	26188	100 %	0 %	0 %	0 %	384206188
118	NC_017228	T	6	6	26195	26200	0 %	100 %	0 %	0 %	384206188
119	NC_017228	A	6	6	26249	26254	100 %	0 %	0 %	0 %	384206188
120	NC_017228	T	7	7	26258	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	384206188
121	NC_017228	T	6	6	26688	26693	0 %	100 %	0 %	0 %	384206189
122	NC_017228	A	6	6	26856	26861	100 %	0 %	0 %	0 %	384206189
123	NC_017228	T	8	8	27079	27086	0 %	100 %	0 %	0 %	384206189
124	NC_017228	A	6	6	27562	27567	100 %	0 %	0 %	0 %	384206190
125	NC_017228	A	6	6	27790	27795	100 %	0 %	0 %	0 %	384206190
126	NC_017228	A	8	8	27946	27953	100 %	0 %	0 %	0 %	384206190
127	NC_017228	A	8	8	28237	28244	100 %	0 %	0 %	0 %	384206191
128	NC_017228	A	6	6	29245	29250	100 %	0 %	0 %	0 %	384206191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.