MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017223	AGC	2	6	186136	186141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202717
4003	NC_017223	GCC	2	6	186159	186164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202717
4004	NC_017223	CG	3	6	186166	186171	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4005	NC_017223	GCG	3	9	186169	186177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202717
4006	NC_017223	TGG	2	6	186247	186252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202717
4007	NC_017223	GC	4	8	186273	186280	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4008	NC_017223	CGG	2	6	186319	186324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202717
4009	NC_017223	GC	3	6	186373	186378	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4010	NC_017223	GGCGC	2	10	186398	186407	0 %	0 %	60 %	40 %	384202717
4011	NC_017223	CCG	2	6	186435	186440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202717
4012	NC_017223	ACGCC	2	10	186478	186487	20 %	0 %	20 %	60 %	384202717
4013	NC_017223	CGG	2	6	186491	186496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202717
4014	NC_017223	GCC	2	6	186505	186510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202717
4015	NC_017223	CG	3	6	186515	186520	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4016	NC_017223	GGC	2	6	186579	186584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202717
4017	NC_017223	GACC	2	8	186635	186642	25 %	0 %	25 %	50 %	384202717
4018	NC_017223	CTGG	2	8	186647	186654	0 %	25 %	50 %	25 %	384202717
4019	NC_017223	TCG	2	6	186661	186666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202717
4020	NC_017223	CGG	2	6	186683	186688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202717
4021	NC_017223	GC	4	8	186707	186714	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4022	NC_017223	GCTC	2	8	186718	186725	0 %	25 %	25 %	50 %	384202717
4023	NC_017223	GTG	2	6	186774	186779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202717
4024	NC_017223	CGA	2	6	186785	186790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202717
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4026	NC_017223	GC	5	10	186818	186827	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4027	NC_017223	GCCG	2	8	186887	186894	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4028	NC_017223	CG	3	6	186904	186909	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
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4037	NC_017223	CTG	2	6	187299	187304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202717
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4045	NC_017223	GCT	3	9	187625	187633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202717
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4047	NC_017223	GCT	2	6	187649	187654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202717
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4052	NC_017223	TGG	2	6	187807	187812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202717
4053	NC_017223	GC	3	6	187883	187888	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4054	NC_017223	GC	3	6	187902	187907	0 %	0 %	50 %	50 %	384202717
4055	NC_017223	CCG	2	6	188069	188074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202718
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4057	NC_017223	GGC	2	6	188130	188135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202718
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4060	NC_017223	TGCGC	2	10	188179	188188	0 %	20 %	40 %	40 %	384202718
4061	NC_017223	CCA	2	6	188221	188226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202718
4062	NC_017223	TCG	2	6	188227	188232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202718
4063	NC_017223	CGA	2	6	188246	188251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202718
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4068	NC_017223	CAT	2	6	188393	188398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202718
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4101	NC_017223	GC	3	6	190214	190219	0 %	0 %	50 %	50 %	384202721
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4103	NC_017223	CGGGG	2	10	190243	190252	0 %	0 %	80 %	20 %	384202721
4104	NC_017223	ACT	2	6	190257	190262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202721
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4119	NC_017223	GGCG	2	8	190967	190974	0 %	0 %	75 %	25 %	384202722
4120	NC_017223	GC	3	6	191139	191144	0 %	0 %	50 %	50 %	384202722
4121	NC_017223	CAT	2	6	191147	191152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202722
4122	NC_017223	GC	3	6	191160	191165	0 %	0 %	50 %	50 %	384202722
4123	NC_017223	GCC	3	9	191183	191191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202722
4124	NC_017223	TTC	2	6	191193	191198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202722
4125	NC_017223	GCG	2	6	191260	191265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202722
4126	NC_017223	CCA	2	6	191300	191305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202722
4127	NC_017223	TTC	2	6	191307	191312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202722
4128	NC_017223	TGC	2	6	191323	191328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202722
4129	NC_017223	GC	3	6	191327	191332	0 %	0 %	50 %	50 %	384202722
4130	NC_017223	CGA	2	6	191351	191356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202722
4131	NC_017223	GCT	2	6	191366	191371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202722
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4133	NC_017223	CTT	2	6	191438	191443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202722
4134	NC_017223	GTC	2	6	191475	191480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202722
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4141	NC_017223	CG	4	8	191681	191688	0 %	0 %	50 %	50 %	384202722
4142	NC_017223	AAG	2	6	191700	191705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202722
4143	NC_017223	GAT	2	6	191762	191767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202722
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4147	NC_017223	GCT	2	6	191927	191932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202722
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4365	NC_017223	CG	3	6	200018	200023	0 %	0 %	50 %	50 %	384202729
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4485	NC_017223	GCC	3	9	204901	204909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202732
4486	NC_017223	TCC	2	6	204911	204916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202732
4487	NC_017223	TG	3	6	205695	205700	0 %	50 %	50 %	0 %	384202733
4488	NC_017223	GC	3	6	205884	205889	0 %	0 %	50 %	50 %	384202733
4489	NC_017223	CAGC	2	8	205912	205919	25 %	0 %	25 %	50 %	384202733
4490	NC_017223	GCCG	2	8	205973	205980	0 %	0 %	50 %	50 %	384202733
4491	NC_017223	GGT	2	6	205985	205990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202733
4492	NC_017223	CTG	2	6	206019	206024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202733
4493	NC_017223	AAG	2	6	206037	206042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202733
4494	NC_017223	CTTCGT	2	12	206117	206128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384202733
4495	NC_017223	CGA	2	6	206174	206179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202733
4496	NC_017223	CTA	2	6	206222	206227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202733
4497	NC_017223	CGC	2	6	206297	206302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202733
4498	NC_017223	CCA	2	6	206489	206494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202733
4499	NC_017223	GC	3	6	206504	206509	0 %	0 %	50 %	50 %	384202733
4500	NC_017223	AGCT	2	8	206685	206692	25 %	25 %	25 %	25 %	384202734

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