MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017223	CGC	2	6	143700	143705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202682
3002	NC_017223	CGT	2	6	143735	143740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202682
3003	NC_017223	CAGG	2	8	143754	143761	25 %	0 %	50 %	25 %	384202682
3004	NC_017223	TGC	2	6	143869	143874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202682
3005	NC_017223	CTG	2	6	143895	143900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202682
3006	NC_017223	TTG	2	6	143905	143910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202682
3007	NC_017223	GCACG	2	10	143919	143928	20 %	0 %	40 %	40 %	384202682
3008	NC_017223	GGC	2	6	143931	143936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202682
3009	NC_017223	GC	3	6	143967	143972	0 %	0 %	50 %	50 %	384202682
3010	NC_017223	GAT	2	6	143988	143993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202682
3011	NC_017223	CCTT	2	8	144130	144137	0 %	50 %	0 %	50 %	384202682
3012	NC_017223	AGT	2	6	144212	144217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202682
3013	NC_017223	AGC	2	6	144256	144261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202682
3014	NC_017223	CGC	2	6	144284	144289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202682
3015	NC_017223	GC	3	6	144308	144313	0 %	0 %	50 %	50 %	384202682
3016	NC_017223	CCG	3	9	144382	144390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202682
3017	NC_017223	TCA	2	6	144419	144424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202682
3018	NC_017223	GC	3	6	144558	144563	0 %	0 %	50 %	50 %	384202682
3019	NC_017223	GGC	2	6	144696	144701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202682
3020	NC_017223	GGT	2	6	144705	144710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202682
3021	NC_017223	TTC	2	6	144727	144732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202682
3022	NC_017223	CGG	2	6	144738	144743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202682
3023	NC_017223	GTC	2	6	144759	144764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202682
3024	NC_017223	TGA	2	6	144788	144793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202682
3025	NC_017223	GGCC	2	8	144833	144840	0 %	0 %	50 %	50 %	384202682
3026	NC_017223	GC	3	6	144914	144919	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3027	NC_017223	TGAT	2	8	144926	144933	25 %	50 %	25 %	0 %	384202683
3028	NC_017223	GGC	2	6	144955	144960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3029	NC_017223	CGG	2	6	144963	144968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3030	NC_017223	GCG	2	6	144980	144985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3031	NC_017223	CGC	2	6	145038	145043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202683
3032	NC_017223	TGC	2	6	145045	145050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3033	NC_017223	GC	4	8	145052	145059	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3034	NC_017223	CG	3	6	145070	145075	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3035	NC_017223	TCG	2	6	145076	145081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3036	NC_017223	AGC	2	6	145082	145087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3037	NC_017223	AGC	2	6	145112	145117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3038	NC_017223	GGC	2	6	145118	145123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3039	NC_017223	TGC	2	6	145142	145147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3040	NC_017223	CGG	2	6	145155	145160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3041	NC_017223	GC	4	8	145193	145200	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3042	NC_017223	GCA	2	6	145206	145211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3043	NC_017223	GCG	2	6	145307	145312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3044	NC_017223	GCG	2	6	145319	145324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3045	NC_017223	CG	5	10	145326	145335	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3046	NC_017223	AGC	3	9	145346	145354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3047	NC_017223	GC	3	6	145362	145367	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3048	NC_017223	CGG	2	6	145371	145376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3049	NC_017223	CGC	2	6	145380	145385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202683
3050	NC_017223	GGCC	2	8	145416	145423	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3051	NC_017223	GC	3	6	145468	145473	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3052	NC_017223	GCG	2	6	145476	145481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202683
3053	NC_017223	CCGG	2	8	145510	145517	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3054	NC_017223	GCGA	2	8	145551	145558	25 %	0 %	50 %	25 %	384202683
3055	NC_017223	GAC	2	6	145594	145599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202683
3056	NC_017223	CGC	2	6	145647	145652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202683
3057	NC_017223	CG	4	8	145671	145678	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3058	NC_017223	AAAG	2	8	145696	145703	75 %	0 %	25 %	0 %	384202683
3059	NC_017223	CG	3	6	145724	145729	0 %	0 %	50 %	50 %	384202683
3060	NC_017223	CGG	3	9	145823	145831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202684
3061	NC_017223	GC	5	10	145861	145870	0 %	0 %	50 %	50 %	384202684
3062	NC_017223	GC	4	8	146047	146054	0 %	0 %	50 %	50 %	384202684
3063	NC_017223	GAC	2	6	146055	146060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202684
3064	NC_017223	CAGGAA	2	12	146112	146123	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384202684
3065	NC_017223	CCG	2	6	146174	146179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202684
3066	NC_017223	GAA	2	6	146211	146216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202684
3067	NC_017223	CGT	2	6	146219	146224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202684
3068	NC_017223	CGA	2	6	146231	146236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202684
3069	NC_017223	CCA	2	6	146255	146260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202684
3070	NC_017223	CCGC	2	8	146266	146273	0 %	0 %	25 %	75 %	384202684
3071	NC_017223	TCG	2	6	146300	146305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202684
3072	NC_017223	GTA	2	6	146343	146348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202684
3073	NC_017223	TGC	2	6	146387	146392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202684
3074	NC_017223	CCT	2	6	146405	146410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202684
3075	NC_017223	CCG	2	6	146423	146428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202684
3076	NC_017223	AGC	2	6	146515	146520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202684
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3078	NC_017223	GCGG	2	8	146546	146553	0 %	0 %	75 %	25 %	384202684
3079	NC_017223	GC	3	6	146565	146570	0 %	0 %	50 %	50 %	384202684
3080	NC_017223	GCC	2	6	146581	146586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202684
3081	NC_017223	GAT	2	6	147962	147967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202685
3082	NC_017223	GTT	2	6	148043	148048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202685
3083	NC_017223	CGGG	2	8	148132	148139	0 %	0 %	75 %	25 %	384202685
3084	NC_017223	GAA	2	6	148142	148147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202685
3085	NC_017223	TTC	2	6	148173	148178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202685
3086	NC_017223	GGT	2	6	148193	148198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202685
3087	NC_017223	GCA	2	6	148234	148239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3088	NC_017223	GC	3	6	148271	148276	0 %	0 %	50 %	50 %	384202685
3089	NC_017223	CAG	2	6	148331	148336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3090	NC_017223	CGC	2	6	148348	148353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202685
3091	NC_017223	ATG	2	6	148368	148373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202685
3092	NC_017223	GC	3	6	148414	148419	0 %	0 %	50 %	50 %	384202685
3093	NC_017223	TGCCGA	2	12	148423	148434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3094	NC_017223	GTT	2	6	148493	148498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202685
3095	NC_017223	CAG	2	6	148520	148525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3096	NC_017223	GT	3	6	148564	148569	0 %	50 %	50 %	0 %	384202685
3097	NC_017223	CAG	2	6	148631	148636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3098	NC_017223	GAT	2	6	148712	148717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202685
3099	NC_017223	GC	3	6	148760	148765	0 %	0 %	50 %	50 %	384202685
3100	NC_017223	GCC	2	6	148781	148786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202685
3101	NC_017223	CGGC	2	8	148814	148821	0 %	0 %	50 %	50 %	384202685
3102	NC_017223	CGA	2	6	148844	148849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3103	NC_017223	GCC	2	6	148851	148856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202685
3104	NC_017223	GCA	2	6	148885	148890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202685
3105	NC_017223	GC	3	6	149029	149034	0 %	0 %	50 %	50 %	384202686
3106	NC_017223	GGC	2	6	149120	149125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202686
3107	NC_017223	CTACAC	2	12	149186	149197	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384202686
3108	NC_017223	GCT	2	6	149282	149287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202686
3109	NC_017223	GGCTG	2	10	149344	149353	0 %	20 %	60 %	20 %	384202686
3110	NC_017223	CGCT	2	8	149415	149422	0 %	25 %	25 %	50 %	384202686
3111	NC_017223	GC	4	8	149423	149430	0 %	0 %	50 %	50 %	384202686
3112	NC_017223	CAT	2	6	149462	149467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202686
3113	NC_017223	CGC	2	6	149495	149500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202686
3114	NC_017223	GGC	2	6	149608	149613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202686
3115	NC_017223	CCGG	2	8	149642	149649	0 %	0 %	50 %	50 %	384202686
3116	NC_017223	CGT	2	6	149680	149685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202686
3117	NC_017223	CGG	2	6	149687	149692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202686
3118	NC_017223	GCTCG	2	10	149717	149726	0 %	20 %	40 %	40 %	384202686
3119	NC_017223	CTG	2	6	149772	149777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202686
3120	NC_017223	GCA	2	6	150600	150605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202687
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3122	NC_017223	AGCGC	2	10	150702	150711	20 %	0 %	40 %	40 %	384202687
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3241	NC_017223	CG	4	8	154415	154422	0 %	0 %	50 %	50 %	384202691
3242	NC_017223	GAA	2	6	154452	154457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202691
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3244	NC_017223	CGA	2	6	154520	154525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202691
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3350	NC_017223	CG	4	8	157916	157923	0 %	0 %	50 %	50 %	384202695
3351	NC_017223	GC	3	6	157973	157978	0 %	0 %	50 %	50 %	384202695
3352	NC_017223	ATGCCG	2	12	157983	157994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202695
3353	NC_017223	GCGCC	2	10	158028	158037	0 %	0 %	40 %	60 %	384202695
3354	NC_017223	GAT	2	6	158048	158053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202695
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3362	NC_017223	CAG	2	6	158282	158287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202695
3363	NC_017223	GCGCC	2	10	158309	158318	0 %	0 %	40 %	60 %	384202695
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3366	NC_017223	CGGC	2	8	158371	158378	0 %	0 %	50 %	50 %	384202695
3367	NC_017223	GCG	2	6	158419	158424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202695
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3486	NC_017223	GCG	2	6	162531	162536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202699
3487	NC_017223	CG	3	6	162535	162540	0 %	0 %	50 %	50 %	384202699
3488	NC_017223	CGG	2	6	162550	162555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202699
3489	NC_017223	CGG	2	6	162568	162573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202699
3490	NC_017223	TGG	2	6	162624	162629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202699
3491	NC_017223	GCCG	2	8	162630	162637	0 %	0 %	50 %	50 %	384202699
3492	NC_017223	GC	3	6	162695	162700	0 %	0 %	50 %	50 %	384202699
3493	NC_017223	CGG	3	9	162702	162710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202699
3494	NC_017223	GC	3	6	162719	162724	0 %	0 %	50 %	50 %	384202699
3495	NC_017223	GCT	2	6	162780	162785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202700
3496	NC_017223	CTG	2	6	162793	162798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202700
3497	NC_017223	CGA	2	6	162819	162824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202700
3498	NC_017223	ACC	2	6	162845	162850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202700
3499	NC_017223	CTG	2	6	162865	162870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202700
3500	NC_017223	CG	4	8	162896	162903	0 %	0 %	50 %	50 %	384202700

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