MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017223	ACG	2	6	76818	76823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1503	NC_017223	TCG	2	6	76830	76835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1504	NC_017223	CGG	2	6	76839	76844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202627
1505	NC_017223	CGA	2	6	76858	76863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1506	NC_017223	ATG	2	6	76868	76873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202627
1507	NC_017223	CG	3	6	76883	76888	0 %	0 %	50 %	50 %	384202627
1508	NC_017223	CG	3	6	76963	76968	0 %	0 %	50 %	50 %	384202627
1509	NC_017223	GTG	2	6	77000	77005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202627
1510	NC_017223	CG	4	8	77026	77033	0 %	0 %	50 %	50 %	384202627
1511	NC_017223	GCG	3	9	77031	77039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202627
1512	NC_017223	TCG	2	6	77082	77087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1513	NC_017223	AGA	2	6	77190	77195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202627
1514	NC_017223	ACATCG	2	12	77196	77207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384202627
1515	NC_017223	CAA	2	6	77245	77250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202627
1516	NC_017223	AAG	2	6	77291	77296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202627
1517	NC_017223	GCT	2	6	77314	77319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1518	NC_017223	CAG	2	6	77342	77347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1519	NC_017223	GGC	2	6	77366	77371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202627
1520	NC_017223	AGC	2	6	77382	77387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1521	NC_017223	GC	3	6	77431	77436	0 %	0 %	50 %	50 %	384202627
1522	NC_017223	CGC	2	6	77476	77481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202627
1523	NC_017223	CTG	2	6	77516	77521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202627
1524	NC_017223	ATG	2	6	77546	77551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202627
1525	NC_017223	A	6	6	77561	77566	100 %	0 %	0 %	0 %	384202627
1526	NC_017223	GGC	2	6	77567	77572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202627
1527	NC_017223	GAT	2	6	77581	77586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202627
1528	NC_017223	GC	3	6	77587	77592	0 %	0 %	50 %	50 %	384202627
1529	NC_017223	GGC	2	6	77597	77602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202627
1530	NC_017223	GGC	2	6	77624	77629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202627
1531	NC_017223	GC	3	6	77693	77698	0 %	0 %	50 %	50 %	384202628
1532	NC_017223	TGG	2	6	77708	77713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202628
1533	NC_017223	GTG	2	6	77731	77736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202628
1534	NC_017223	GCG	2	6	77900	77905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202628
1535	NC_017223	GTA	2	6	77974	77979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202628
1536	NC_017223	TCG	2	6	78023	78028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202628
1537	NC_017223	ACGAAG	2	12	78074	78085	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384202628
1538	NC_017223	CTT	2	6	78160	78165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202628
1539	NC_017223	GCA	2	6	78177	78182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202628
1540	NC_017223	CAC	2	6	78211	78216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202628
1541	NC_017223	CGGC	2	8	78222	78229	0 %	0 %	50 %	50 %	384202628
1542	NC_017223	GCTG	2	8	78283	78290	0 %	25 %	50 %	25 %	384202628
1543	NC_017223	GC	3	6	78313	78318	0 %	0 %	50 %	50 %	384202628
1544	NC_017223	GCG	2	6	78334	78339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202628
1545	NC_017223	CA	3	6	78502	78507	50 %	0 %	0 %	50 %	384202628
1546	NC_017223	CCG	2	6	79651	79656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202629
1547	NC_017223	GC	3	6	79743	79748	0 %	0 %	50 %	50 %	384202629
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1549	NC_017223	CAG	2	6	79790	79795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
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1551	NC_017223	GCGTGA	2	12	80041	80052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384202629
1552	NC_017223	ACG	2	6	80091	80096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
1553	NC_017223	TGG	2	6	80215	80220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202629
1554	NC_017223	CGCC	2	8	80263	80270	0 %	0 %	25 %	75 %	384202629
1555	NC_017223	CGA	2	6	80341	80346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
1556	NC_017223	CGG	2	6	80365	80370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
1557	NC_017223	GCG	2	6	80421	80426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
1558	NC_017223	GGC	2	6	80566	80571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
1559	NC_017223	GCC	2	6	80591	80596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202629
1560	NC_017223	GAC	2	6	80612	80617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
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1562	NC_017223	TGG	2	6	80716	80721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202629
1563	NC_017223	CGG	2	6	80776	80781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
1564	NC_017223	CGA	2	6	80785	80790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
1565	NC_017223	TGC	2	6	80791	80796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202629
1566	NC_017223	GCG	2	6	80809	80814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202629
1567	NC_017223	CAG	2	6	80831	80836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
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1569	NC_017223	CGGG	2	8	80878	80885	0 %	0 %	75 %	25 %	384202629
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1573	NC_017223	CCCG	2	8	80999	81006	0 %	0 %	25 %	75 %	384202629
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1588	NC_017223	CGA	2	6	81439	81444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202629
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1593	NC_017223	CAG	2	6	83111	83116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202630
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1607	NC_017223	GATG	2	8	83476	83483	25 %	25 %	50 %	0 %	384202630
1608	NC_017223	CAG	2	6	83504	83509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202630
1609	NC_017223	TCA	2	6	83521	83526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202630
1610	NC_017223	CAT	2	6	83584	83589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202631
1611	NC_017223	GCCC	2	8	83630	83637	0 %	0 %	25 %	75 %	384202631
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1618	NC_017223	GCTG	3	12	84018	84029	0 %	25 %	50 %	25 %	384202631
1619	NC_017223	GCCT	2	8	84035	84042	0 %	25 %	25 %	50 %	384202631
1620	NC_017223	AGC	2	6	84044	84049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202631
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1622	NC_017223	TCG	2	6	84170	84175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202631
1623	NC_017223	TGG	2	6	84243	84248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202631
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1998	NC_017223	GCC	2	6	98124	98129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202645
1999	NC_017223	GC	3	6	98130	98135	0 %	0 %	50 %	50 %	384202645
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