MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017223	CAA	2	6	626799	626804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384203100
14503	NC_017223	TGA	2	6	626855	626860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203100
14504	NC_017223	CGC	2	6	626864	626869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203100
14505	NC_017223	GGGCG	2	10	626928	626937	0 %	0 %	80 %	20 %	384203100
14506	NC_017223	ATC	2	6	626956	626961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203100
14507	NC_017223	CCG	2	6	626973	626978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203100
14508	NC_017223	ACC	2	6	627019	627024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203100
14509	NC_017223	GTG	2	6	627040	627045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203100
14510	NC_017223	TGG	2	6	627053	627058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203100
14511	NC_017223	CTG	2	6	627118	627123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203100
14512	NC_017223	CGGG	2	8	627134	627141	0 %	0 %	75 %	25 %	384203100
14513	NC_017223	TTC	2	6	627190	627195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203100
14514	NC_017223	CTT	2	6	627201	627206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384203100
14515	NC_017223	TCA	2	6	627218	627223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203100
14516	NC_017223	GCT	2	6	627231	627236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203100
14517	NC_017223	ATC	2	6	627283	627288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203100
14518	NC_017223	CCG	2	6	627322	627327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203100
14519	NC_017223	ATC	2	6	627400	627405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384203100
14520	NC_017223	ACC	2	6	627415	627420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203100
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14523	NC_017223	GGC	2	6	627517	627522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203100
14524	NC_017223	G	6	6	627564	627569	0 %	0 %	100 %	0 %	384203100
14525	NC_017223	CGG	2	6	627573	627578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203100
14526	NC_017223	ACGCC	2	10	627599	627608	20 %	0 %	20 %	60 %	384203100
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14530	NC_017223	CGAT	2	8	628132	628139	25 %	25 %	25 %	25 %	384203101
14531	NC_017223	CGGC	2	8	628172	628179	0 %	0 %	50 %	50 %	384203101
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14534	NC_017223	GC	3	6	628345	628350	0 %	0 %	50 %	50 %	384203101
14535	NC_017223	CGG	2	6	628403	628408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203101
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14541	NC_017223	GC	3	6	628762	628767	0 %	0 %	50 %	50 %	384203101
14542	NC_017223	CAGC	2	8	628779	628786	25 %	0 %	25 %	50 %	384203101
14543	NC_017223	CTGG	2	8	628791	628798	0 %	25 %	50 %	25 %	384203101
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14552	NC_017223	CG	3	6	628992	628997	0 %	0 %	50 %	50 %	384203101
14553	NC_017223	TGG	2	6	629039	629044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384203101
14554	NC_017223	C	7	7	629090	629096	0 %	0 %	0 %	100 %	384203101
14555	NC_017223	CGG	2	6	629099	629104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203101
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14558	NC_017223	CGC	2	6	629162	629167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203101
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14561	NC_017223	GCGCG	2	10	629277	629286	0 %	0 %	60 %	40 %	384203102
14562	NC_017223	CCAG	2	8	629388	629395	25 %	0 %	25 %	50 %	384203102
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14565	NC_017223	CG	3	6	629424	629429	0 %	0 %	50 %	50 %	384203102
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14605	NC_017223	GCG	2	6	630637	630642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384203103
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14622	NC_017223	CGT	2	6	631052	631057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203104
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14624	NC_017223	GC	3	6	631120	631125	0 %	0 %	50 %	50 %	384203104
14625	NC_017223	GC	3	6	631167	631172	0 %	0 %	50 %	50 %	384203104
14626	NC_017223	GCGCC	2	10	631175	631184	0 %	0 %	40 %	60 %	384203104
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14655	NC_017223	GGCG	2	8	633322	633329	0 %	0 %	75 %	25 %	384203105
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14981	NC_017223	CGC	3	9	648085	648093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203119
14982	NC_017223	CAG	2	6	648101	648106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384203119
14983	NC_017223	GC	3	6	648133	648138	0 %	0 %	50 %	50 %	384203119
14984	NC_017223	ATG	2	6	648150	648155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384203119
14985	NC_017223	GTC	2	6	648161	648166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384203119
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14987	NC_017223	CAC	2	6	648287	648292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384203119
14988	NC_017223	GC	3	6	648308	648313	0 %	0 %	50 %	50 %	384203119
14989	NC_017223	GCCC	2	8	648316	648323	0 %	0 %	25 %	75 %	384203119
14990	NC_017223	GCC	2	6	648326	648331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384203119
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