MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017223	CGC	2	6	49421	49426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202603
1003	NC_017223	GC	3	6	49443	49448	0 %	0 %	50 %	50 %	384202603
1004	NC_017223	CG	3	6	49474	49479	0 %	0 %	50 %	50 %	384202603
1005	NC_017223	GCG	2	6	49495	49500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202603
1006	NC_017223	GC	3	6	49504	49509	0 %	0 %	50 %	50 %	384202603
1007	NC_017223	GCG	2	6	49543	49548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202603
1008	NC_017223	CGA	2	6	49562	49567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202603
1009	NC_017223	GCG	2	6	49594	49599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202603
1010	NC_017223	CAG	2	6	49611	49616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202603
1011	NC_017223	CGA	2	6	49643	49648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202603
1012	NC_017223	CAG	2	6	49650	49655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202603
1013	NC_017223	GTG	2	6	49665	49670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202603
1014	NC_017223	GC	3	6	49734	49739	0 %	0 %	50 %	50 %	384202603
1015	NC_017223	GTG	2	6	49746	49751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202603
1016	NC_017223	ACA	2	6	49840	49845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202603
1017	NC_017223	GC	3	6	49919	49924	0 %	0 %	50 %	50 %	384202603
1018	NC_017223	TG	3	6	50220	50225	0 %	50 %	50 %	0 %	384202604
1019	NC_017223	GC	3	6	50409	50414	0 %	0 %	50 %	50 %	384202604
1020	NC_017223	CAGC	2	8	50437	50444	25 %	0 %	25 %	50 %	384202604
1021	NC_017223	GCCG	2	8	50498	50505	0 %	0 %	50 %	50 %	384202604
1022	NC_017223	GGT	2	6	50510	50515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202604
1023	NC_017223	CTG	2	6	50544	50549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202604
1024	NC_017223	AAG	2	6	50562	50567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202604
1025	NC_017223	CTTCGT	2	12	50642	50653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384202604
1026	NC_017223	C	7	7	50693	50699	0 %	0 %	0 %	100 %	384202604
1027	NC_017223	CTA	2	6	50747	50752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202604
1028	NC_017223	CGC	2	6	50822	50827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202604
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1030	NC_017223	GC	3	6	51029	51034	0 %	0 %	50 %	50 %	384202604
1031	NC_017223	GCT	2	6	51188	51193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
1032	NC_017223	AGC	2	6	51231	51236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202605
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1034	NC_017223	GCC	2	6	51376	51381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202605
1035	NC_017223	TGC	2	6	51391	51396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
1036	NC_017223	TGC	2	6	51406	51411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
1037	NC_017223	GCC	3	9	51414	51422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202605
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1041	NC_017223	TGC	2	6	51544	51549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
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1049	NC_017223	CGC	2	6	51748	51753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202605
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1053	NC_017223	GCG	2	6	51805	51810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202605
1054	NC_017223	TGC	3	9	51820	51828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
1055	NC_017223	GC	3	6	51865	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	384202605
1056	NC_017223	CCA	2	6	51874	51879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202605
1057	NC_017223	CTG	2	6	51885	51890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
1058	NC_017223	CAA	2	6	51929	51934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202605
1059	NC_017223	GCC	2	6	51948	51953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202605
1060	NC_017223	TCG	2	6	51958	51963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
1061	NC_017223	GC	3	6	51964	51969	0 %	0 %	50 %	50 %	384202605
1062	NC_017223	CGG	2	6	51974	51979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202605
1063	NC_017223	CAT	2	6	51983	51988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202605
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1065	NC_017223	CTG	2	6	52029	52034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
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1069	NC_017223	GCC	2	6	52174	52179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202605
1070	NC_017223	GCT	2	6	52205	52210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202605
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1104	NC_017223	GC	3	6	55309	55314	0 %	0 %	50 %	50 %	384202607
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1108	NC_017223	AGA	2	6	55445	55450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202607
1109	NC_017223	CGG	2	6	55493	55498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202607
1110	NC_017223	GGC	2	6	55529	55534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202607
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1120	NC_017223	GCC	2	6	55998	56003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202608
1121	NC_017223	GC	3	6	56037	56042	0 %	0 %	50 %	50 %	384202608
1122	NC_017223	CGA	2	6	56060	56065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202608
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1126	NC_017223	CAG	2	6	56195	56200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202608
1127	NC_017223	GAA	2	6	56213	56218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202608
1128	NC_017223	ACGT	2	8	56223	56230	25 %	25 %	25 %	25 %	384202608
1129	NC_017223	GC	3	6	56243	56248	0 %	0 %	50 %	50 %	384202608
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1134	NC_017223	GCC	2	6	56372	56377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202608
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1167	NC_017223	TGG	2	6	57571	57576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202610
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1235	NC_017223	CAT	3	9	62676	62684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202614
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1240	NC_017223	TTTTG	2	10	62972	62981	0 %	80 %	20 %	0 %	384202614
1241	NC_017223	GTG	2	6	63012	63017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202614
1242	NC_017223	ACC	2	6	63032	63037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202614
1243	NC_017223	CAT	2	6	63159	63164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202614
1244	NC_017223	GCC	2	6	63185	63190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202614
1245	NC_017223	GCT	2	6	63234	63239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202614
1246	NC_017223	C	7	7	63606	63612	0 %	0 %	0 %	100 %	384202615
1247	NC_017223	AC	3	6	63668	63673	50 %	0 %	0 %	50 %	384202615
1248	NC_017223	CAA	2	6	63753	63758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202615
1249	NC_017223	CGT	2	6	63812	63817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202615
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1251	NC_017223	CA	3	6	63949	63954	50 %	0 %	0 %	50 %	384202615
1252	NC_017223	ATTA	2	8	64067	64074	50 %	50 %	0 %	0 %	384202616
1253	NC_017223	CTT	2	6	64097	64102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202616
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1255	NC_017223	GCG	2	6	64138	64143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202616
1256	NC_017223	GAA	2	6	64266	64271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202616
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1260	NC_017223	ATC	2	6	64538	64543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202617
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1267	NC_017223	AT	3	6	64701	64706	50 %	50 %	0 %	0 %	384202617
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1364	NC_017223	GGGGT	2	10	72024	72033	0 %	20 %	80 %	0 %	384202622
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1373	NC_017223	CGA	2	6	72392	72397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202622
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1375	NC_017223	GC	3	6	72543	72548	0 %	0 %	50 %	50 %	384202622
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