MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017223	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	384202580
502	NC_017223	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	384202580
503	NC_017223	GC	4	8	26510	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
504	NC_017223	GCCG	2	8	26540	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
505	NC_017223	CGA	2	6	26608	26613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202581
506	NC_017223	CAT	2	6	26629	26634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202581
507	NC_017223	GCA	2	6	26636	26641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202581
508	NC_017223	TGC	2	6	26643	26648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202581
509	NC_017223	TGAG	2	8	26703	26710	25 %	25 %	50 %	0 %	384202581
510	NC_017223	ACG	2	6	26718	26723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202581
511	NC_017223	TGG	2	6	26769	26774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202581
512	NC_017223	CAT	2	6	26803	26808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202581
513	NC_017223	GGC	2	6	26816	26821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202581
514	NC_017223	CGCC	2	8	26836	26843	0 %	0 %	25 %	75 %	384202581
515	NC_017223	CTGC	2	8	26848	26855	0 %	25 %	25 %	50 %	384202581
516	NC_017223	GCG	2	6	26859	26864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202581
517	NC_017223	GCCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
518	NC_017223	TGC	2	6	26913	26918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202581
519	NC_017223	GGCGC	2	10	26926	26935	0 %	0 %	60 %	40 %	384202581
520	NC_017223	CGA	3	9	26983	26991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202581
521	NC_017223	CGG	2	6	27034	27039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202581
522	NC_017223	GCTGTC	2	12	27046	27057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202581
523	NC_017223	CTG	3	9	27083	27091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202581
524	NC_017223	CGGC	2	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
525	NC_017223	GCTG	2	8	27136	27143	0 %	25 %	50 %	25 %	384202581
526	NC_017223	CGG	2	6	27153	27158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202581
527	NC_017223	GCA	2	6	27177	27182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202581
528	NC_017223	GC	3	6	27341	27346	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
529	NC_017223	TGG	2	6	27356	27361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202582
530	NC_017223	GTG	2	6	27379	27384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202582
531	NC_017223	GCG	2	6	27548	27553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202582
532	NC_017223	GTA	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202582
533	NC_017223	TCG	2	6	27671	27676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202582
534	NC_017223	ACGAAG	2	12	27722	27733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384202582
535	NC_017223	CTT	2	6	27808	27813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202582
536	NC_017223	GCA	2	6	27825	27830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202582
537	NC_017223	CAC	2	6	27859	27864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202582
538	NC_017223	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
539	NC_017223	GCTG	2	8	27931	27938	0 %	25 %	50 %	25 %	384202582
540	NC_017223	GC	3	6	27961	27966	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
541	NC_017223	GCG	2	6	27982	27987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202582
542	NC_017223	CA	3	6	28150	28155	50 %	0 %	0 %	50 %	384202582
543	NC_017223	GC	3	6	28716	28721	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
544	NC_017223	CGAA	2	8	28727	28734	50 %	0 %	25 %	25 %	384202583
545	NC_017223	GGC	2	6	28772	28777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202583
546	NC_017223	CGA	2	6	28818	28823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202583
547	NC_017223	CG	3	6	28869	28874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
548	NC_017223	GGCC	2	8	28963	28970	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
549	NC_017223	GGC	2	6	28980	28985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202583
550	NC_017223	AC	3	6	28991	28996	50 %	0 %	0 %	50 %	384202583
551	NC_017223	CAGC	2	8	29177	29184	25 %	0 %	25 %	50 %	384202584
552	NC_017223	CCG	2	6	29188	29193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202584
553	NC_017223	GCC	2	6	29219	29224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202584
554	NC_017223	GC	3	6	29231	29236	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
555	NC_017223	AGCC	2	8	29320	29327	25 %	0 %	25 %	50 %	384202584
556	NC_017223	TCC	2	6	29419	29424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202584
557	NC_017223	ATG	2	6	29425	29430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202584
558	NC_017223	CCG	2	6	29480	29485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202584
559	NC_017223	GGCG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	75 %	25 %	384202584
560	NC_017223	CGG	2	6	29525	29530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202584
561	NC_017223	GA	3	6	29562	29567	50 %	0 %	50 %	0 %	384202584
562	NC_017223	CGTG	2	8	29612	29619	0 %	25 %	50 %	25 %	384202584
563	NC_017223	ACC	2	6	29686	29691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202584
564	NC_017223	CCG	2	6	29707	29712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202584
565	NC_017223	GCG	2	6	29733	29738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202584
566	NC_017223	AG	3	6	29763	29768	50 %	0 %	50 %	0 %	384202584
567	NC_017223	CG	3	6	29775	29780	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
568	NC_017223	GAT	2	6	29816	29821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202584
569	NC_017223	TCGCGA	2	12	29840	29851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202584
570	NC_017223	TCT	2	6	29863	29868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202584
571	NC_017223	CGC	2	6	29901	29906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202584
572	NC_017223	CAGGG	2	10	29916	29925	20 %	0 %	60 %	20 %	384202584
573	NC_017223	GTCGGC	2	12	29958	29969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384202584
574	NC_017223	CGA	2	6	29993	29998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202584
575	NC_017223	GC	3	6	30038	30043	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
576	NC_017223	GGCC	2	8	30044	30051	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
577	NC_017223	ATC	2	6	30055	30060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202584
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579	NC_017223	AT	3	6	30152	30157	50 %	50 %	0 %	0 %	384202584
580	NC_017223	CGC	2	6	30258	30263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202584
581	NC_017223	TGGAT	2	10	30274	30283	20 %	40 %	40 %	0 %	384202584
582	NC_017223	CGG	2	6	30332	30337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202584
583	NC_017223	CATGGC	2	12	30351	30362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384202584
584	NC_017223	ACTCC	2	10	30437	30446	20 %	20 %	0 %	60 %	384202585
585	NC_017223	CAC	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202585
586	NC_017223	TCCTTC	2	12	30516	30527	0 %	50 %	0 %	50 %	384202585
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589	NC_017223	CAC	2	6	30761	30766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202585
590	NC_017223	GCC	2	6	30788	30793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202585
591	NC_017223	TTG	2	6	30846	30851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202585
592	NC_017223	AGG	2	6	31122	31127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202586
593	NC_017223	CGG	2	6	31141	31146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202586
594	NC_017223	CG	3	6	31153	31158	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
595	NC_017223	AGCA	2	8	31239	31246	50 %	0 %	25 %	25 %	384202586
596	NC_017223	CCT	2	6	31273	31278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202586
597	NC_017223	GCC	2	6	31350	31355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202586
598	NC_017223	CAG	2	6	31403	31408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202586
599	NC_017223	CAC	3	9	31460	31468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202586
600	NC_017223	CGC	2	6	31501	31506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202586
601	NC_017223	GGC	2	6	31577	31582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202586
602	NC_017223	CCA	2	6	31609	31614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202586
603	NC_017223	TA	3	6	31628	31633	50 %	50 %	0 %	0 %	384202586
604	NC_017223	GC	3	6	31673	31678	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
605	NC_017223	GC	3	6	31731	31736	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
606	NC_017223	CAG	2	6	31826	31831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202586
607	NC_017223	CTT	2	6	31924	31929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202586
608	NC_017223	GAA	2	6	31958	31963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202586
609	NC_017223	CTG	2	6	32239	32244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202587
610	NC_017223	GAC	2	6	32257	32262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202587
611	NC_017223	CCA	2	6	32306	32311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202587
612	NC_017223	CGT	2	6	32349	32354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202587
613	NC_017223	ACG	2	6	32357	32362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202587
614	NC_017223	CCGGCG	2	12	32390	32401	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
615	NC_017223	CGG	2	6	32414	32419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202587
616	NC_017223	GCG	2	6	32420	32425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202587
617	NC_017223	CGT	2	6	32433	32438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202587
618	NC_017223	ACC	2	6	32464	32469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202587
619	NC_017223	ACA	2	6	32504	32509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202587
620	NC_017223	ACGGC	2	10	32546	32555	20 %	0 %	40 %	40 %	384202587
621	NC_017223	GCC	2	6	32650	32655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202587
622	NC_017223	ATC	2	6	32656	32661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202587
623	NC_017223	TAC	2	6	32695	32700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202587
624	NC_017223	TGA	2	6	32702	32707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202587
625	NC_017223	TCG	2	6	32717	32722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202587
626	NC_017223	GC	3	6	32762	32767	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
627	NC_017223	CG	3	6	32768	32773	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
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629	NC_017223	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
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