MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017223	GCC	2	6	250305	250310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202773
5503	NC_017223	TTC	2	6	250341	250346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202773
5504	NC_017223	GTC	2	6	250359	250364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202773
5505	NC_017223	CTGG	2	8	250463	250470	0 %	25 %	50 %	25 %	384202773
5506	NC_017223	GC	3	6	250487	250492	0 %	0 %	50 %	50 %	384202773
5507	NC_017223	CGC	2	6	250523	250528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202773
5508	NC_017223	GGC	2	6	250532	250537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202773
5509	NC_017223	CAT	2	6	250538	250543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202773
5510	NC_017223	GC	4	8	250598	250605	0 %	0 %	50 %	50 %	384202773
5511	NC_017223	GCCC	2	8	250608	250615	0 %	0 %	25 %	75 %	384202773
5512	NC_017223	TGC	2	6	250621	250626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202773
5513	NC_017223	GGC	2	6	250656	250661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202773
5514	NC_017223	CAC	2	6	250667	250672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202773
5515	NC_017223	CGCGGC	2	12	250715	250726	0 %	0 %	50 %	50 %	384202773
5516	NC_017223	CTG	3	9	250740	250748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202773
5517	NC_017223	TGG	2	6	250762	250767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202773
5518	NC_017223	GGC	2	6	250782	250787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202773
5519	NC_017223	TGG	2	6	250819	250824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202773
5520	NC_017223	GGC	2	6	250841	250846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202773
5521	NC_017223	CAC	2	6	250875	250880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202773
5522	NC_017223	GCT	2	6	250907	250912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202773
5523	NC_017223	GCG	2	6	250917	250922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202773
5524	NC_017223	GCC	2	6	250937	250942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202773
5525	NC_017223	TGC	2	6	250957	250962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202773
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5529	NC_017223	CGC	2	6	251086	251091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202773
5530	NC_017223	TGG	2	6	251092	251097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202773
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5533	NC_017223	CCTGGC	2	12	251120	251131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384202773
5534	NC_017223	GCT	2	6	251132	251137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202773
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5537	NC_017223	CG	3	6	251192	251197	0 %	0 %	50 %	50 %	384202773
5538	NC_017223	GC	3	6	251418	251423	0 %	0 %	50 %	50 %	384202774
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5541	NC_017223	GGC	2	6	251489	251494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202774
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5543	NC_017223	GCG	2	6	251537	251542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202774
5544	NC_017223	CTT	2	6	251572	251577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202774
5545	NC_017223	GCC	2	6	251594	251599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202774
5546	NC_017223	CGA	2	6	251639	251644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202774
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5550	NC_017223	CGCC	2	8	251881	251888	0 %	0 %	25 %	75 %	384202774
5551	NC_017223	GCC	2	6	251939	251944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202774
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5553	NC_017223	GCGCG	2	10	252058	252067	0 %	0 %	60 %	40 %	384202774
5554	NC_017223	GAA	2	6	252068	252073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202774
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5557	NC_017223	TCGCC	2	10	252121	252130	0 %	20 %	20 %	60 %	384202774
5558	NC_017223	GC	3	6	252177	252182	0 %	0 %	50 %	50 %	384202774
5559	NC_017223	GCC	2	6	252209	252214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202774
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5562	NC_017223	CGAT	2	8	252294	252301	25 %	25 %	25 %	25 %	384202774
5563	NC_017223	GCG	2	6	252336	252341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202774
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5589	NC_017223	GC	6	12	253150	253161	0 %	0 %	50 %	50 %	384202774
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5989	NC_017223	GCC	2	6	268156	268161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202790
5990	NC_017223	GCC	3	9	268184	268192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202790
5991	NC_017223	CGA	2	6	268204	268209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202790
5992	NC_017223	GGCGAC	2	12	268211	268222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384202790
5993	NC_017223	GCC	2	6	268805	268810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202791
5994	NC_017223	AGAT	2	8	268850	268857	50 %	25 %	25 %	0 %	384202791
5995	NC_017223	GGC	2	6	269026	269031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202792
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5999	NC_017223	GC	3	6	269631	269636	0 %	0 %	50 %	50 %	384202793
6000	NC_017223	CAGC	2	8	269659	269666	25 %	0 %	25 %	50 %	384202793

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