MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017223	GTC	2	6	228492	228497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
5002	NC_017223	AGC	2	6	228522	228527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202749
5003	NC_017223	GC	3	6	228526	228531	0 %	0 %	50 %	50 %	384202749
5004	NC_017223	CCG	2	6	228541	228546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
5005	NC_017223	CCG	2	6	228556	228561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
5006	NC_017223	GCC	2	6	228577	228582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
5007	NC_017223	AAC	2	6	228585	228590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202749
5008	NC_017223	CTG	2	6	228606	228611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
5009	NC_017223	CTG	2	6	228618	228623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
5010	NC_017223	ACCTGA	2	12	228670	228681	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384202749
5011	NC_017223	TCA	2	6	228688	228693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5012	NC_017223	CAT	2	6	228707	228712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5013	NC_017223	CTG	2	6	228714	228719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
5014	NC_017223	CAT	2	6	228776	228781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5015	NC_017223	CAT	2	6	228806	228811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5016	NC_017223	CAT	2	6	228815	228820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5017	NC_017223	CAT	2	6	228824	228829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5018	NC_017223	TGG	2	6	228844	228849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202749
5019	NC_017223	CCA	2	6	228850	228855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
5020	NC_017223	TCG	2	6	228868	228873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
5021	NC_017223	TCGCC	2	10	228877	228886	0 %	20 %	20 %	60 %	384202749
5022	NC_017223	TCGT	2	8	228918	228925	0 %	50 %	25 %	25 %	384202749
5023	NC_017223	CTT	2	6	228932	228937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202749
5024	NC_017223	CGGC	2	8	228946	228953	0 %	0 %	50 %	50 %	384202749
5025	NC_017223	CGC	2	6	228989	228994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
5026	NC_017223	GC	3	6	229009	229014	0 %	0 %	50 %	50 %	384202749
5027	NC_017223	ACC	2	6	229023	229028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
5028	NC_017223	GCCC	2	8	229085	229092	0 %	0 %	25 %	75 %	384202749
5029	NC_017223	TCA	2	6	229138	229143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5030	NC_017223	GTC	2	6	229327	229332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202750
5031	NC_017223	CCG	2	6	229352	229357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202750
5032	NC_017223	CGT	2	6	229376	229381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202750
5033	NC_017223	CAA	2	6	229464	229469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202750
5034	NC_017223	CCG	2	6	229493	229498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202750
5035	NC_017223	CGT	2	6	229527	229532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202750
5036	NC_017223	GGC	2	6	229569	229574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202750
5037	NC_017223	GC	3	6	229587	229592	0 %	0 %	50 %	50 %	384202750
5038	NC_017223	CG	4	8	229625	229632	0 %	0 %	50 %	50 %	384202750
5039	NC_017223	GGT	2	6	229653	229658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202750
5040	NC_017223	GC	3	6	229796	229801	0 %	0 %	50 %	50 %	384202750
5041	NC_017223	CGCA	2	8	229804	229811	25 %	0 %	25 %	50 %	384202750
5042	NC_017223	CAT	2	6	229815	229820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202750
5043	NC_017223	GC	4	8	229864	229871	0 %	0 %	50 %	50 %	384202750
5044	NC_017223	TTC	2	6	229879	229884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202750
5045	NC_017223	TG	3	6	229926	229931	0 %	50 %	50 %	0 %	384202750
5046	NC_017223	CGG	2	6	229932	229937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202750
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5049	NC_017223	CGG	2	6	230064	230069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202751
5050	NC_017223	GCA	2	6	230081	230086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
5051	NC_017223	CG	3	6	230093	230098	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
5052	NC_017223	CGCC	2	8	230143	230150	0 %	0 %	25 %	75 %	384202751
5053	NC_017223	CGA	2	6	230156	230161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
5054	NC_017223	CAC	2	6	230202	230207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202751
5055	NC_017223	GC	3	6	230224	230229	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
5056	NC_017223	CGCC	2	8	230231	230238	0 %	0 %	25 %	75 %	384202751
5057	NC_017223	CAG	2	6	230307	230312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
5058	NC_017223	CAG	2	6	230343	230348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
5059	NC_017223	CG	3	6	230483	230488	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
5060	NC_017223	AGGGC	2	10	230513	230522	20 %	0 %	60 %	20 %	384202751
5061	NC_017223	GCG	2	6	230534	230539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202751
5062	NC_017223	GCG	2	6	230576	230581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202751
5063	NC_017223	CAG	2	6	230634	230639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202751
5064	NC_017223	GCG	2	6	230643	230648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202751
5065	NC_017223	GC	3	6	230656	230661	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
5066	NC_017223	GGC	3	9	230673	230681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202751
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5068	NC_017223	CG	3	6	230839	230844	0 %	0 %	50 %	50 %	384202751
5069	NC_017223	GGC	2	6	231069	231074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202752
5070	NC_017223	CCG	2	6	231082	231087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202752
5071	NC_017223	TCA	3	9	231142	231150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202752
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5073	NC_017223	CAC	2	6	231170	231175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202752
5074	NC_017223	GCT	2	6	231188	231193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202752
5075	NC_017223	CGGG	2	8	231200	231207	0 %	0 %	75 %	25 %	384202752
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5081	NC_017223	GC	3	6	231516	231521	0 %	0 %	50 %	50 %	384202752
5082	NC_017223	CAT	2	6	231533	231538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202752
5083	NC_017223	GCGCG	2	10	231544	231553	0 %	0 %	60 %	40 %	384202752
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5088	NC_017223	CG	3	6	231661	231666	0 %	0 %	50 %	50 %	384202752
5089	NC_017223	AGC	2	6	231686	231691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202753
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5092	NC_017223	TGG	2	6	231780	231785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202753
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5103	NC_017223	GC	3	6	232044	232049	0 %	0 %	50 %	50 %	384202753
5104	NC_017223	CCG	2	6	232062	232067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202753
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5106	NC_017223	ATG	2	6	232115	232120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202753
5107	NC_017223	CG	3	6	232197	232202	0 %	0 %	50 %	50 %	384202753
5108	NC_017223	GGCC	2	8	232234	232241	0 %	0 %	50 %	50 %	384202753
5109	NC_017223	GACC	2	8	232252	232259	25 %	0 %	25 %	50 %	384202753
5110	NC_017223	CG	3	6	232275	232280	0 %	0 %	50 %	50 %	384202753
5111	NC_017223	GCC	2	6	232416	232421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202754
5112	NC_017223	GC	3	6	232437	232442	0 %	0 %	50 %	50 %	384202754
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5119	NC_017223	CAT	2	6	232693	232698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202755
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5122	NC_017223	GCG	2	6	232797	232802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202755
5123	NC_017223	GAC	3	9	232811	232819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202755
5124	NC_017223	CGG	3	9	232831	232839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202755
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5126	NC_017223	CCG	3	9	232869	232877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202755
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5241	NC_017223	CCA	2	6	238561	238566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202761
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5244	NC_017223	TCG	2	6	238641	238646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202762
5245	NC_017223	CGGCGC	2	12	238650	238661	0 %	0 %	50 %	50 %	384202762
5246	NC_017223	CCA	2	6	238680	238685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202762
5247	NC_017223	CCA	2	6	238689	238694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202762
5248	NC_017223	CG	3	6	238698	238703	0 %	0 %	50 %	50 %	384202762
5249	NC_017223	GC	3	6	238704	238709	0 %	0 %	50 %	50 %	384202762
5250	NC_017223	CAC	2	6	238714	238719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202762
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5252	NC_017223	GCA	2	6	238770	238775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202762
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5254	NC_017223	CCAGCA	2	12	238782	238793	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384202762
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5257	NC_017223	CAG	2	6	238918	238923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202762
5258	NC_017223	TGA	2	6	238953	238958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202762
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5265	NC_017223	CGC	2	6	239323	239328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202762
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5268	NC_017223	GGCGCC	2	12	239386	239397	0 %	0 %	50 %	50 %	384202762
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5340	NC_017223	GC	3	6	242116	242121	0 %	0 %	50 %	50 %	384202765
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5353	NC_017223	CGG	2	6	242412	242417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202765
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5357	NC_017223	CGG	2	6	242484	242489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202765
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5360	NC_017223	CGCGG	2	10	242648	242657	0 %	0 %	60 %	40 %	384202765
5361	NC_017223	CGAAAC	2	12	242682	242693	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384202765
5362	NC_017223	CGA	2	6	242694	242699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202765
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5365	NC_017223	GC	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	384202765
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5489	NC_017223	GC	3	6	249787	249792	0 %	0 %	50 %	50 %	384202772
5490	NC_017223	CAG	2	6	249826	249831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202772
5491	NC_017223	GC	3	6	249842	249847	0 %	0 %	50 %	50 %	384202772
5492	NC_017223	CCA	2	6	249861	249866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202772
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