MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 95639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017223	TGG	2	6	206760	206765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202734
4503	NC_017223	GTG	2	6	206783	206788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202734
4504	NC_017223	GCG	2	6	206952	206957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202734
4505	NC_017223	GTA	2	6	207026	207031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202734
4506	NC_017223	TCG	2	6	207075	207080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202734
4507	NC_017223	ACGAAG	2	12	207126	207137	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384202734
4508	NC_017223	CTT	2	6	207212	207217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202734
4509	NC_017223	GCA	2	6	207229	207234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202734
4510	NC_017223	CAC	2	6	207263	207268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202734
4511	NC_017223	CGGC	2	8	207274	207281	0 %	0 %	50 %	50 %	384202734
4512	NC_017223	GCTG	2	8	207335	207342	0 %	25 %	50 %	25 %	384202734
4513	NC_017223	GC	3	6	207365	207370	0 %	0 %	50 %	50 %	384202734
4514	NC_017223	GCG	2	6	207386	207391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202734
4515	NC_017223	CA	3	6	207554	207559	50 %	0 %	0 %	50 %	384202734
4516	NC_017223	GC	4	8	207756	207763	0 %	0 %	50 %	50 %	384202735
4517	NC_017223	TCT	2	6	207826	207831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202735
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4521	NC_017223	GCA	2	6	207931	207936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202735
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4523	NC_017223	CCA	2	6	207997	208002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202735
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4526	NC_017223	TGG	2	6	208110	208115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202735
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4529	NC_017223	GCTG	2	8	208186	208193	0 %	25 %	50 %	25 %	384202735
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4543	NC_017223	GGCG	2	8	208576	208583	0 %	0 %	75 %	25 %	384202735
4544	NC_017223	CG	3	6	208587	208592	0 %	0 %	50 %	50 %	384202735
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4554	NC_017223	GCCG	2	8	208886	208893	0 %	0 %	50 %	50 %	384202736
4555	NC_017223	GC	3	6	208897	208902	0 %	0 %	50 %	50 %	384202736
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4560	NC_017223	CGAT	2	8	209019	209026	25 %	25 %	25 %	25 %	384202736
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4622	NC_017223	TGT	2	6	212004	212009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202738
4623	NC_017223	CGA	2	6	212016	212021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202738
4624	NC_017223	GC	3	6	212054	212059	0 %	0 %	50 %	50 %	384202738
4625	NC_017223	ACC	2	6	212150	212155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202738
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4633	NC_017223	GTC	2	6	212476	212481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202738
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4653	NC_017223	CAG	2	6	213230	213235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202739
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4656	NC_017223	TGC	2	6	213367	213372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202739
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4986	NC_017223	CGC	2	6	227696	227701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202748
4987	NC_017223	GCC	2	6	227715	227720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202748
4988	NC_017223	CTG	2	6	228024	228029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749
4989	NC_017223	CAC	2	6	228035	228040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
4990	NC_017223	CGC	2	6	228085	228090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
4991	NC_017223	GACC	2	8	228092	228099	25 %	0 %	25 %	50 %	384202749
4992	NC_017223	CAT	2	6	228146	228151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
4993	NC_017223	CGG	2	6	228167	228172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202749
4994	NC_017223	CGG	2	6	228212	228217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202749
4995	NC_017223	ATC	2	6	228270	228275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
4996	NC_017223	GCC	3	9	228276	228284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202749
4997	NC_017223	GGCCTG	2	12	228306	228317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384202749
4998	NC_017223	CAC	2	6	228341	228346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202749
4999	NC_017223	ATC	2	6	228435	228440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202749
5000	NC_017223	GCT	2	6	228452	228457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202749

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