MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017221	GCATC	2	10	933	942	20 %	20 %	20 %	40 %	384200577
2	NC_017221	CACGT	2	10	3073	3082	20 %	20 %	20 %	40 %	384200577
3	NC_017221	TCGGC	2	10	3173	3182	0 %	20 %	40 %	40 %	384200578
4	NC_017221	ATCGT	2	10	5245	5254	20 %	40 %	20 %	20 %	384200578
5	NC_017221	TTCGT	2	10	7437	7446	0 %	60 %	20 %	20 %	384200580
6	NC_017221	GCCGA	2	10	7861	7870	20 %	0 %	40 %	40 %	384200581
7	NC_017221	ACCTT	2	10	7977	7986	20 %	40 %	0 %	40 %	384200581
8	NC_017221	CTGGT	2	10	13662	13671	0 %	40 %	40 %	20 %	384200586
9	NC_017221	CTGAC	2	10	15152	15161	20 %	20 %	20 %	40 %	384200587
10	NC_017221	AGCCG	2	10	16749	16758	20 %	0 %	40 %	40 %	384200587
11	NC_017221	AAGGC	2	10	17042	17051	40 %	0 %	40 %	20 %	384200587
12	NC_017221	CAGGT	2	10	17730	17739	20 %	20 %	40 %	20 %	384200588
13	NC_017221	GACGA	2	10	18575	18584	40 %	0 %	40 %	20 %	384200589
14	NC_017221	CTCGC	2	10	22777	22786	0 %	20 %	20 %	60 %	384200592
15	NC_017221	CAACG	2	10	23118	23127	40 %	0 %	20 %	40 %	384200592
16	NC_017221	CGTTG	2	10	23316	23325	0 %	40 %	40 %	20 %	384200593
17	NC_017221	CGATG	2	10	25048	25057	20 %	20 %	40 %	20 %	384200593
18	NC_017221	CGAAG	2	10	25058	25067	40 %	0 %	40 %	20 %	384200593
19	NC_017221	GACCA	2	10	27123	27132	40 %	0 %	20 %	40 %	384200594
20	NC_017221	AACAG	2	10	30318	30327	60 %	0 %	20 %	20 %	384200595
21	NC_017221	CTCCG	2	10	31337	31346	0 %	20 %	20 %	60 %	384200596
22	NC_017221	AAGGC	2	10	33220	33229	40 %	0 %	40 %	20 %	384200596
23	NC_017221	CGTGG	2	10	36664	36673	0 %	20 %	60 %	20 %	384200597
24	NC_017221	GTTCG	2	10	37866	37875	0 %	40 %	40 %	20 %	384200597
25	NC_017221	CGGCC	2	10	41735	41744	0 %	0 %	40 %	60 %	384200601
26	NC_017221	ACAGC	2	10	43409	43418	40 %	0 %	20 %	40 %	384200602
27	NC_017221	GCTCG	2	10	44010	44019	0 %	20 %	40 %	40 %	384200603
28	NC_017221	CGATT	2	10	44256	44265	20 %	40 %	20 %	20 %	384200603
29	NC_017221	GGCGC	2	10	44392	44401	0 %	0 %	60 %	40 %	384200603
30	NC_017221	TCCCA	2	10	47369	47378	20 %	20 %	0 %	60 %	384200605
31	NC_017221	GGCGA	2	10	50747	50756	20 %	0 %	60 %	20 %	384200608
32	NC_017221	TGCGA	2	10	54754	54763	20 %	20 %	40 %	20 %	384200610
33	NC_017221	GGTGT	2	10	60608	60617	0 %	40 %	60 %	0 %	384200614
34	NC_017221	GTTCG	2	10	60981	60990	0 %	40 %	40 %	20 %	384200614
35	NC_017221	CGAAT	2	10	61348	61357	40 %	20 %	20 %	20 %	384200614
36	NC_017221	TGGGA	2	10	61819	61828	20 %	20 %	60 %	0 %	384200615
37	NC_017221	CGACC	2	10	62122	62131	20 %	0 %	20 %	60 %	384200615
38	NC_017221	CGACC	2	10	65413	65422	20 %	0 %	20 %	60 %	384200617
39	NC_017221	CGAGA	2	10	68695	68704	40 %	0 %	40 %	20 %	384200619
40	NC_017221	TCGCC	2	10	69627	69636	0 %	20 %	20 %	60 %	384200621
41	NC_017221	TTCTC	2	10	71055	71064	0 %	60 %	0 %	40 %	384200622
42	NC_017221	CTGGT	2	10	71117	71126	0 %	40 %	40 %	20 %	384200622
43	NC_017221	GCTCG	2	10	73968	73977	0 %	20 %	40 %	40 %	384200624
44	NC_017221	GACCA	2	10	76062	76071	40 %	0 %	20 %	40 %	384200626
45	NC_017221	ACGGC	2	10	80511	80520	20 %	0 %	40 %	40 %	384200628
46	NC_017221	CGCCA	2	10	80559	80568	20 %	0 %	20 %	60 %	384200628
47	NC_017221	ATGGT	2	10	84475	84484	20 %	40 %	40 %	0 %	384200632
48	NC_017221	GCCCA	2	10	85935	85944	20 %	0 %	20 %	60 %	384200633
49	NC_017221	CATGG	2	10	87010	87019	20 %	20 %	40 %	20 %	384200633
50	NC_017221	GCCAT	2	10	90115	90124	20 %	20 %	20 %	40 %	384200636
51	NC_017221	AAGAC	2	10	90308	90317	60 %	0 %	20 %	20 %	384200636
52	NC_017221	ATTGC	2	10	93055	93064	20 %	40 %	20 %	20 %	384200638
53	NC_017221	CAAGG	2	10	95585	95594	40 %	0 %	40 %	20 %	384200641
54	NC_017221	TGGAA	2	10	96130	96139	40 %	20 %	40 %	0 %	384200642
55	NC_017221	TCCCC	2	10	96259	96268	0 %	20 %	0 %	80 %	384200642
56	NC_017221	GCCGA	2	10	102937	102946	20 %	0 %	40 %	40 %	384200648
57	NC_017221	CGATT	2	10	104195	104204	20 %	40 %	20 %	20 %	384200649
58	NC_017221	GCGCG	2	10	106102	106111	0 %	0 %	60 %	40 %	384200652
59	NC_017221	GCAGA	2	10	106813	106822	40 %	0 %	40 %	20 %	384200653
60	NC_017221	CCGGA	2	10	107078	107087	20 %	0 %	40 %	40 %	384200653
61	NC_017221	CGCTG	2	10	107666	107675	0 %	20 %	40 %	40 %	384200653
62	NC_017221	TCGAT	2	10	108035	108044	20 %	40 %	20 %	20 %	384200653
63	NC_017221	GCAAG	2	10	109280	109289	40 %	0 %	40 %	20 %	384200654
64	NC_017221	CGAGC	2	10	109601	109610	20 %	0 %	40 %	40 %	384200654
65	NC_017221	GGCGC	2	10	110556	110565	0 %	0 %	60 %	40 %	384200654
66	NC_017221	CGCTG	2	10	111880	111889	0 %	20 %	40 %	40 %	384200655
67	NC_017221	GCCGA	2	10	112017	112026	20 %	0 %	40 %	40 %	384200655
68	NC_017221	GGTAT	2	10	112646	112655	20 %	40 %	40 %	0 %	384200656
69	NC_017221	AGCTG	2	10	113374	113383	20 %	20 %	40 %	20 %	384200656
70	NC_017221	GGATT	2	10	115057	115066	20 %	40 %	40 %	0 %	384200659
71	NC_017221	GTCGC	2	10	115821	115830	0 %	20 %	40 %	40 %	384200661
72	NC_017221	GCGCC	2	10	118513	118522	0 %	0 %	40 %	60 %	384200663
73	NC_017221	GTCGG	2	10	119539	119548	0 %	20 %	60 %	20 %	384200664
74	NC_017221	GCCGC	2	10	119589	119598	0 %	0 %	40 %	60 %	384200664
75	NC_017221	GGCTG	2	10	120143	120152	0 %	20 %	60 %	20 %	384200664
76	NC_017221	TCGGC	2	10	120295	120304	0 %	20 %	40 %	40 %	384200664
77	NC_017221	ACGGC	2	10	122438	122447	20 %	0 %	40 %	40 %	384200665
78	NC_017221	TGGCG	2	10	124917	124926	0 %	20 %	60 %	20 %	384200668
79	NC_017221	GGAAT	2	10	125015	125024	40 %	20 %	40 %	0 %	384200668
80	NC_017221	GTGAC	2	10	127694	127703	20 %	20 %	40 %	20 %	384200671
81	NC_017221	CCCGA	2	10	130615	130624	20 %	0 %	20 %	60 %	384200673
82	NC_017221	ACGTC	2	10	130850	130859	20 %	20 %	20 %	40 %	384200673
83	NC_017221	GTGGC	2	10	131337	131346	0 %	20 %	60 %	20 %	384200674
84	NC_017221	TGCCG	2	10	132438	132447	0 %	20 %	40 %	40 %	384200674
85	NC_017221	GCCGC	2	10	133029	133038	0 %	0 %	40 %	60 %	384200675
86	NC_017221	AGGTC	2	10	134497	134506	20 %	20 %	40 %	20 %	384200676
87	NC_017221	GCCTT	2	10	134565	134574	0 %	40 %	20 %	40 %	384200676
88	NC_017221	GTGGG	2	10	135696	135705	0 %	20 %	80 %	0 %	384200677
89	NC_017221	GATGC	2	10	136473	136482	20 %	20 %	40 %	20 %	384200678
90	NC_017221	CTCGC	2	10	138633	138642	0 %	20 %	20 %	60 %	384200679
91	NC_017221	CCGAC	2	10	141433	141442	20 %	0 %	20 %	60 %	384200681
92	NC_017221	ACCGC	2	10	147156	147165	20 %	0 %	20 %	60 %	384200686
93	NC_017221	CCGTA	2	10	147439	147448	20 %	20 %	20 %	40 %	384200686
94	NC_017221	TTGTG	2	10	148979	148988	0 %	60 %	40 %	0 %	384200687
95	NC_017221	TTGAA	2	10	150307	150316	40 %	40 %	20 %	0 %	384200689
96	NC_017221	CCGCA	2	10	150317	150326	20 %	0 %	20 %	60 %	384200689
97	NC_017221	AGCCG	2	10	150496	150505	20 %	0 %	40 %	40 %	384200689
98	NC_017221	CGCGC	2	10	152179	152188	0 %	0 %	40 %	60 %	384200690
99	NC_017221	GCCGC	2	10	153689	153698	0 %	0 %	40 %	60 %	384200690
100	NC_017221	CCGAC	2	10	157277	157286	20 %	0 %	20 %	60 %	384200693
101	NC_017221	GGTCA	2	10	161608	161617	20 %	20 %	40 %	20 %	384200698
102	NC_017221	CGTAG	2	10	168771	168780	20 %	20 %	40 %	20 %	384200701
103	NC_017221	TTCGA	2	10	176791	176800	20 %	40 %	20 %	20 %	384200707
104	NC_017221	ACCGG	2	10	178244	178253	20 %	0 %	40 %	40 %	384200708
105	NC_017221	CAGAC	2	10	179360	179369	40 %	0 %	20 %	40 %	384200709
106	NC_017221	CCGAC	2	10	181514	181523	20 %	0 %	20 %	60 %	384200709
107	NC_017221	CAGCC	2	10	182551	182560	20 %	0 %	20 %	60 %	384200709
108	NC_017221	CGGCC	2	10	182583	182592	0 %	0 %	40 %	60 %	384200709
109	NC_017221	CCGCT	2	10	183068	183077	0 %	20 %	20 %	60 %	384200709
110	NC_017221	TCCAC	2	10	184025	184034	20 %	20 %	0 %	60 %	384200709
111	NC_017221	GCCGC	2	10	187302	187311	0 %	0 %	40 %	60 %	384200709
112	NC_017221	CGACC	2	10	187356	187365	20 %	0 %	20 %	60 %	384200709
113	NC_017221	CGCGC	2	10	188653	188662	0 %	0 %	40 %	60 %	384200709
114	NC_017221	ATTCC	2	10	193846	193855	20 %	40 %	0 %	40 %	384200713
115	NC_017221	CCATC	2	10	195256	195265	20 %	20 %	0 %	60 %	384200713
116	NC_017221	ACGAT	2	10	195799	195808	40 %	20 %	20 %	20 %	384200713
117	NC_017221	CGTTG	2	10	197127	197136	0 %	40 %	40 %	20 %	384200714
118	NC_017221	TCCGG	2	10	200314	200323	0 %	20 %	40 %	40 %	384200717
119	NC_017221	CGATC	2	10	200525	200534	20 %	20 %	20 %	40 %	384200717
120	NC_017221	GAAGA	2	10	202726	202735	60 %	0 %	40 %	0 %	384200721
121	NC_017221	GTCCG	2	10	203709	203718	0 %	20 %	40 %	40 %	384200721
122	NC_017221	CGGCC	2	10	204243	204252	0 %	0 %	40 %	60 %	384200721
123	NC_017221	ACGGC	2	10	205956	205965	20 %	0 %	40 %	40 %	384200722
124	NC_017221	CCGGC	2	10	207964	207973	0 %	0 %	40 %	60 %	384200723
125	NC_017221	CATCG	2	10	212101	212110	20 %	20 %	20 %	40 %	384200727
126	NC_017221	GCGCC	2	10	213845	213854	0 %	0 %	40 %	60 %	384200727
127	NC_017221	ATCTC	2	10	218876	218885	20 %	40 %	0 %	40 %	384200733
128	NC_017221	CCGGC	2	10	223556	223565	0 %	0 %	40 %	60 %	384200739
129	NC_017221	TTCGT	2	10	224783	224792	0 %	60 %	20 %	20 %	384200739
130	NC_017221	CGCCA	2	10	226143	226152	20 %	0 %	20 %	60 %	384200741
131	NC_017221	CGGTG	2	10	227931	227940	0 %	20 %	60 %	20 %	384200742
132	NC_017221	GCATG	2	10	235120	235129	20 %	20 %	40 %	20 %	384200748
133	NC_017221	CGGTG	2	10	235141	235150	0 %	20 %	60 %	20 %	384200748
134	NC_017221	CCGGC	2	10	235524	235533	0 %	0 %	40 %	60 %	384200748
135	NC_017221	GATGC	2	10	235568	235577	20 %	20 %	40 %	20 %	384200748
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137	NC_017221	GCCGA	2	10	239369	239378	20 %	0 %	40 %	40 %	384200751
138	NC_017221	CACCG	2	10	240520	240529	20 %	0 %	20 %	60 %	384200752
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149	NC_017221	CCGCT	2	10	265203	265212	0 %	20 %	20 %	60 %	384200783
150	NC_017221	TCGTG	2	10	265638	265647	0 %	40 %	40 %	20 %	384200784
151	NC_017221	ATGAG	2	10	272195	272204	40 %	20 %	40 %	0 %	384200792
152	NC_017221	ATTCA	2	10	272466	272475	40 %	40 %	0 %	20 %	384200792
153	NC_017221	TGGCA	2	10	274102	274111	20 %	20 %	40 %	20 %	384200793
154	NC_017221	GAATG	2	10	274710	274719	40 %	20 %	40 %	0 %	384200793
155	NC_017221	GGCGT	2	10	274937	274946	0 %	20 %	60 %	20 %	384200793
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159	NC_017221	TGGCC	2	10	285472	285481	0 %	20 %	40 %	40 %	384200801
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173	NC_017221	GCATG	2	10	309502	309511	20 %	20 %	40 %	20 %	384200820
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253	NC_017221	GCCGA	2	10	436900	436909	20 %	0 %	40 %	40 %	384200932
254	NC_017221	GATCA	2	10	437390	437399	40 %	20 %	20 %	20 %	384200933
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259	NC_017221	ACGCG	2	10	441597	441606	20 %	0 %	40 %	40 %	384200937
260	NC_017221	ATTCA	2	10	441651	441660	40 %	40 %	0 %	20 %	384200937
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388	NC_017221	CGAAC	2	10	651820	651829	40 %	0 %	20 %	40 %	384201102
389	NC_017221	CGCGC	2	10	652898	652907	0 %	0 %	40 %	60 %	384201102
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392	NC_017221	GGCGC	2	10	659663	659672	0 %	0 %	60 %	40 %	384201104
393	NC_017221	GCGTG	2	10	660998	661007	0 %	20 %	60 %	20 %	384201105
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432	NC_017221	CGGTG	2	10	722290	722299	0 %	20 %	60 %	20 %	384201164
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496	NC_017221	GGCCA	2	10	821144	821153	20 %	0 %	40 %	40 %	384201241
497	NC_017221	TGCCG	2	10	822212	822221	0 %	20 %	40 %	40 %	384201242
498	NC_017221	CGGCA	2	10	826268	826277	20 %	0 %	40 %	40 %	384201246
499	NC_017221	AGCAG	2	10	829138	829147	40 %	0 %	40 %	20 %	384201249
500	NC_017221	ATGGC	2	10	833178	833187	20 %	20 %	40 %	20 %	384201253

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