MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017221	ACC	2	6	25250	25255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200593
502	NC_017221	ACCT	2	8	25295	25302	25 %	25 %	0 %	50 %	384200593
503	NC_017221	CTG	2	6	25343	25348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200593
504	NC_017221	CGG	3	9	25372	25380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200593
505	NC_017221	CTG	2	6	25388	25393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200593
506	NC_017221	CTG	2	6	25421	25426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200593
507	NC_017221	GTG	2	6	25427	25432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200593
508	NC_017221	TA	3	6	25445	25450	50 %	50 %	0 %	0 %	384200593
509	NC_017221	CGGC	2	8	25491	25498	0 %	0 %	50 %	50 %	384200593
510	NC_017221	GGCGTG	2	12	25517	25528	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384200593
511	NC_017221	GAG	2	6	25550	25555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200593
512	NC_017221	CGCC	2	8	25566	25573	0 %	0 %	25 %	75 %	384200593
513	NC_017221	CG	3	6	25672	25677	0 %	0 %	50 %	50 %	384200593
514	NC_017221	GCG	2	6	25719	25724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200593
515	NC_017221	ATGACG	2	12	25839	25850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384200593
516	NC_017221	ACC	2	6	25889	25894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200593
517	NC_017221	GCG	2	6	25937	25942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200593
518	NC_017221	TGA	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200593
519	NC_017221	GAT	2	6	26030	26035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200593
520	NC_017221	GGC	2	6	26075	26080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200593
521	NC_017221	CCG	2	6	26121	26126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200593
522	NC_017221	AGC	2	6	26180	26185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200593
523	NC_017221	CGGC	2	8	26274	26281	0 %	0 %	50 %	50 %	384200593
524	NC_017221	CTTCGG	2	12	26292	26303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200593
525	NC_017221	TCG	2	6	26405	26410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200593
526	NC_017221	GCC	2	6	26441	26446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200593
527	NC_017221	GTG	2	6	26474	26479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200593
528	NC_017221	CGG	2	6	26500	26505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200593
529	NC_017221	TGG	2	6	26514	26519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200593
530	NC_017221	GAT	3	9	26629	26637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200593
531	NC_017221	GTG	2	6	26654	26659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200593
532	NC_017221	ACTG	2	8	26695	26702	25 %	25 %	25 %	25 %	384200593
533	NC_017221	GAAGTG	2	12	26732	26743	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384200593
534	NC_017221	GTG	2	6	26768	26773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200593
535	NC_017221	GCT	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200593
536	NC_017221	GCTC	2	8	26844	26851	0 %	25 %	25 %	50 %	384200593
537	NC_017221	TGG	2	6	27074	27079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200594
538	NC_017221	GACCA	2	10	27123	27132	40 %	0 %	20 %	40 %	384200594
539	NC_017221	GGC	2	6	27183	27188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200594
540	NC_017221	TCA	2	6	27277	27282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200594
541	NC_017221	TTC	2	6	27285	27290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200594
542	NC_017221	GC	3	6	27296	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	384200594
543	NC_017221	GAT	2	6	27311	27316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200594
544	NC_017221	CAGC	2	8	27329	27336	25 %	0 %	25 %	50 %	384200594
545	NC_017221	TCA	2	6	27343	27348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200594
546	NC_017221	TCA	2	6	27352	27357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200594
547	NC_017221	TGC	2	6	27418	27423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200594
548	NC_017221	TCA	2	6	27460	27465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200594
549	NC_017221	CTT	2	6	27467	27472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200594
550	NC_017221	GAT	2	6	27596	27601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200594
551	NC_017221	GAT	2	6	27623	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200594
552	NC_017221	CCG	2	6	27634	27639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200594
553	NC_017221	TGATCG	2	12	27646	27657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384200594
554	NC_017221	CG	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	384200594
555	NC_017221	CGG	2	6	27706	27711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200594
556	NC_017221	TTC	2	6	27798	27803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200594
557	NC_017221	GCT	2	6	27812	27817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200594
558	NC_017221	TGC	2	6	27865	27870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200594
559	NC_017221	ATC	2	6	27888	27893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200594
560	NC_017221	TCT	2	6	27907	27912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200594
561	NC_017221	GC	3	6	27919	27924	0 %	0 %	50 %	50 %	384200594
562	NC_017221	CAT	2	6	27932	27937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200594
563	NC_017221	TTC	2	6	28047	28052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200594
564	NC_017221	GTG	2	6	28053	28058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200594
565	NC_017221	CCG	2	6	28063	28068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200594
566	NC_017221	GCT	2	6	28088	28093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200594
567	NC_017221	GCC	2	6	28105	28110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200594
568	NC_017221	CTG	2	6	28221	28226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200594
569	NC_017221	GT	3	6	28252	28257	0 %	50 %	50 %	0 %	384200594
570	NC_017221	TTC	2	6	28419	28424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200594
571	NC_017221	GTT	2	6	28442	28447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200594
572	NC_017221	TGC	2	6	28519	28524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200594
573	NC_017221	TGC	2	6	28942	28947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200595
574	NC_017221	ATC	2	6	28958	28963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200595
575	NC_017221	TGG	2	6	29042	29047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200595
576	NC_017221	TGG	2	6	29173	29178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200595
577	NC_017221	ACG	2	6	29197	29202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200595
578	NC_017221	ATT	2	6	29208	29213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384200595
579	NC_017221	TTC	2	6	29237	29242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200595
580	NC_017221	AC	3	6	29292	29297	50 %	0 %	0 %	50 %	384200595
581	NC_017221	ACT	2	6	29344	29349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200595
582	NC_017221	GAA	2	6	29472	29477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200595
583	NC_017221	TGC	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200595
584	NC_017221	TGC	2	6	29548	29553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200595
585	NC_017221	GAT	2	6	29762	29767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200595
586	NC_017221	TGG	2	6	29779	29784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200595
587	NC_017221	GGT	2	6	29819	29824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200595
588	NC_017221	ATCC	2	8	29849	29856	25 %	25 %	0 %	50 %	384200595
589	NC_017221	AGC	2	6	29971	29976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200595
590	NC_017221	CGA	2	6	30064	30069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200595
591	NC_017221	AACAG	2	10	30318	30327	60 %	0 %	20 %	20 %	384200595
592	NC_017221	TGC	2	6	30740	30745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200596
593	NC_017221	GCG	2	6	30753	30758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200596
594	NC_017221	GAG	2	6	30772	30777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200596
595	NC_017221	CAC	2	6	30932	30937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200596
596	NC_017221	AAGGCT	2	12	30960	30971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384200596
597	NC_017221	TGA	2	6	31022	31027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200596
598	NC_017221	GCG	2	6	31063	31068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200596
599	NC_017221	ACC	2	6	31179	31184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200596
600	NC_017221	AGGC	2	8	31185	31192	25 %	0 %	50 %	25 %	384200596
601	NC_017221	GCTG	2	8	31205	31212	0 %	25 %	50 %	25 %	384200596
602	NC_017221	GAC	2	6	31230	31235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200596
603	NC_017221	CCG	2	6	31258	31263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200596
604	NC_017221	TGG	2	6	31272	31277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200596
605	NC_017221	CTCCG	2	10	31337	31346	0 %	20 %	20 %	60 %	384200596
606	NC_017221	TGG	2	6	31376	31381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200596
607	NC_017221	AAT	2	6	31398	31403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200596
608	NC_017221	ACA	2	6	31567	31572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200596
609	NC_017221	AAC	2	6	31584	31589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200596
610	NC_017221	TAC	2	6	31602	31607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200596
611	NC_017221	GAA	2	6	31649	31654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200596
612	NC_017221	AGG	2	6	31660	31665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200596
613	NC_017221	CAG	4	12	31686	31697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200596
614	NC_017221	ATG	2	6	31732	31737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200596
615	NC_017221	CAT	2	6	31742	31747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200596
616	NC_017221	CG	3	6	31873	31878	0 %	0 %	50 %	50 %	384200596
617	NC_017221	AAG	2	6	31899	31904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200596
618	NC_017221	ATG	2	6	31980	31985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200596
619	NC_017221	GGT	2	6	32042	32047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200596
620	NC_017221	ACA	2	6	32059	32064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200596
621	NC_017221	CCGG	2	8	32088	32095	0 %	0 %	50 %	50 %	384200596
622	NC_017221	TCGACT	2	12	32125	32136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384200596
623	NC_017221	TGGC	2	8	32143	32150	0 %	25 %	50 %	25 %	384200596
624	NC_017221	AAC	3	9	32184	32192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200596
625	NC_017221	ACC	2	6	32199	32204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200596
626	NC_017221	CAA	2	6	32300	32305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200596
627	NC_017221	ACA	3	9	32314	32322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200596
628	NC_017221	CGA	2	6	32336	32341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200596
629	NC_017221	ACC	2	6	32457	32462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200596
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631	NC_017221	TGA	2	6	32557	32562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200596
632	NC_017221	GCCC	2	8	32597	32604	0 %	0 %	25 %	75 %	384200596
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634	NC_017221	TGC	2	6	32654	32659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200596
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642	NC_017221	CTA	2	6	33203	33208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200596
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745	NC_017221	GT	3	6	39898	39903	0 %	50 %	50 %	0 %	384200598
746	NC_017221	TCT	2	6	39927	39932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200598
747	NC_017221	CTT	3	9	40044	40052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200598
748	NC_017221	GCTT	2	8	40202	40209	0 %	50 %	25 %	25 %	384200598
749	NC_017221	GGT	2	6	40306	40311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200598
750	NC_017221	GT	3	6	40310	40315	0 %	50 %	50 %	0 %	384200598
751	NC_017221	TCG	2	6	40352	40357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200598
752	NC_017221	GAATGG	2	12	40704	40715	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384200599
753	NC_017221	CGA	2	6	40785	40790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200599
754	NC_017221	GTC	2	6	40924	40929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200599
755	NC_017221	GCG	2	6	41081	41086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200600
756	NC_017221	CG	3	6	41089	41094	0 %	0 %	50 %	50 %	384200600
757	NC_017221	CAC	2	6	41120	41125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200600
758	NC_017221	AT	3	6	41126	41131	50 %	50 %	0 %	0 %	384200600
759	NC_017221	CTG	2	6	41164	41169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200600
760	NC_017221	GC	3	6	41231	41236	0 %	0 %	50 %	50 %	384200600
761	NC_017221	CAT	2	6	41441	41446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200601
762	NC_017221	TCG	2	6	41500	41505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200601
763	NC_017221	CAC	2	6	41552	41557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200601
764	NC_017221	GGC	2	6	41604	41609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200601
765	NC_017221	TGC	2	6	41614	41619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200601
766	NC_017221	CAT	2	6	41648	41653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200601
767	NC_017221	GC	3	6	41670	41675	0 %	0 %	50 %	50 %	384200601
768	NC_017221	GGC	2	6	41678	41683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200601
769	NC_017221	GCTC	2	8	41704	41711	0 %	25 %	25 %	50 %	384200601
770	NC_017221	CGGCC	2	10	41735	41744	0 %	0 %	40 %	60 %	384200601
771	NC_017221	TCA	2	6	41773	41778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200601
772	NC_017221	CCA	2	6	41785	41790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200601
773	NC_017221	ACG	2	6	41791	41796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200601
774	NC_017221	TCA	2	6	41815	41820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200601
775	NC_017221	CTG	2	6	41934	41939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200601
776	NC_017221	ATG	2	6	41955	41960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200601
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778	NC_017221	GTG	2	6	42048	42053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200601
779	NC_017221	CAA	2	6	42101	42106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200601
780	NC_017221	ATG	2	6	42153	42158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200601
781	NC_017221	TGA	2	6	42163	42168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200601
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783	NC_017221	ACT	2	6	42283	42288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200601
784	NC_017221	TCA	2	6	42298	42303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200601
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809	NC_017221	CGA	2	6	43193	43198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200601
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813	NC_017221	ACAGC	2	10	43409	43418	40 %	0 %	20 %	40 %	384200602
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822	NC_017221	TCG	2	6	43670	43675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200603
823	NC_017221	TGA	2	6	43748	43753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200603
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825	NC_017221	GAT	2	6	43845	43850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200603
826	NC_017221	CAA	2	6	43908	43913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200603
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829	NC_017221	TGA	2	6	44057	44062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200603
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852	NC_017221	GTC	2	6	45027	45032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200603
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862	NC_017221	CGCT	2	8	45335	45342	0 %	25 %	25 %	50 %	384200603
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875	NC_017221	GGC	3	9	45859	45867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200604
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