MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017221	AAG	3	9	281527	281535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200797
5502	NC_017221	TCA	2	6	281570	281575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200797
5503	NC_017221	TGA	2	6	281618	281623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200797
5504	NC_017221	CGA	2	6	281637	281642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200797
5505	NC_017221	ATG	2	6	281690	281695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200797
5506	NC_017221	ATC	2	6	281725	281730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200797
5507	NC_017221	TAC	2	6	281797	281802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200797
5508	NC_017221	GTC	2	6	281875	281880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200797
5509	NC_017221	CTC	2	6	281913	281918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200797
5510	NC_017221	GAC	2	6	282049	282054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200797
5511	NC_017221	AAGG	2	8	282067	282074	50 %	0 %	50 %	0 %	384200797
5512	NC_017221	CAT	2	6	282126	282131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200797
5513	NC_017221	AGT	2	6	282164	282169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200797
5514	NC_017221	AACC	2	8	282327	282334	50 %	0 %	0 %	50 %	384200798
5515	NC_017221	CG	3	6	282335	282340	0 %	0 %	50 %	50 %	384200798
5516	NC_017221	GTC	2	6	282370	282375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200798
5517	NC_017221	CCT	2	6	282377	282382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200798
5518	NC_017221	TCACCG	2	12	282422	282433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384200798
5519	NC_017221	GC	3	6	282519	282524	0 %	0 %	50 %	50 %	384200798
5520	NC_017221	CAG	2	6	282526	282531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200798
5521	NC_017221	TGG	2	6	282566	282571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200798
5522	NC_017221	AAG	2	6	282670	282675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200798
5523	NC_017221	TGA	2	6	282678	282683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200798
5524	NC_017221	GAC	2	6	282745	282750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200798
5525	NC_017221	CGA	2	6	282759	282764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200798
5526	NC_017221	GAC	2	6	282772	282777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200798
5527	NC_017221	GAG	2	6	282784	282789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200798
5528	NC_017221	ACA	2	6	282803	282808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200799
5529	NC_017221	TCA	2	6	282822	282827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200799
5530	NC_017221	CGC	2	6	282865	282870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200799
5531	NC_017221	GCGCG	2	10	282874	282883	0 %	0 %	60 %	40 %	384200799
5532	NC_017221	AAG	2	6	282893	282898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200799
5533	NC_017221	GCCAC	2	10	282957	282966	20 %	0 %	20 %	60 %	384200799
5534	NC_017221	CCA	2	6	283011	283016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200799
5535	NC_017221	CAC	2	6	283033	283038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200799
5536	NC_017221	CGA	2	6	283042	283047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200799
5537	NC_017221	CTGA	2	8	283112	283119	25 %	25 %	25 %	25 %	384200799
5538	NC_017221	GCG	2	6	283131	283136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200799
5539	NC_017221	CCA	2	6	283191	283196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200799
5540	NC_017221	CCCG	2	8	283305	283312	0 %	0 %	25 %	75 %	384200799
5541	NC_017221	CG	3	6	283466	283471	0 %	0 %	50 %	50 %	384200799
5542	NC_017221	CGG	2	6	283504	283509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200799
5543	NC_017221	AGA	2	6	283635	283640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200799
5544	NC_017221	CAA	2	6	283675	283680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200799
5545	NC_017221	GCT	2	6	283732	283737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200799
5546	NC_017221	GAG	2	6	283802	283807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200799
5547	NC_017221	GCC	2	6	283827	283832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200799
5548	NC_017221	GCC	2	6	283862	283867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200799
5549	NC_017221	ATG	2	6	283884	283889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200799
5550	NC_017221	GGC	2	6	283891	283896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200799
5551	NC_017221	TCA	2	6	283918	283923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200799
5552	NC_017221	AAG	2	6	284121	284126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200800
5553	NC_017221	GTG	2	6	284130	284135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200800
5554	NC_017221	TCA	2	6	284168	284173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200800
5555	NC_017221	GTG	2	6	284190	284195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200800
5556	NC_017221	ATG	2	6	284212	284217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200800
5557	NC_017221	GTG	2	6	284226	284231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200800
5558	NC_017221	GAA	2	6	284289	284294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200800
5559	NC_017221	GAT	2	6	284337	284342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200800
5560	NC_017221	TGG	2	6	284383	284388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200800
5561	NC_017221	TTC	2	6	284427	284432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200800
5562	NC_017221	GCC	2	6	284487	284492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200800
5563	NC_017221	GCC	3	9	284538	284546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200800
5564	NC_017221	CG	3	6	284605	284610	0 %	0 %	50 %	50 %	384200800
5565	NC_017221	CCA	2	6	284668	284673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200800
5566	NC_017221	AAG	2	6	284697	284702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200800
5567	NC_017221	GC	3	6	284720	284725	0 %	0 %	50 %	50 %	384200800
5568	NC_017221	CCA	2	6	284734	284739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200800
5569	NC_017221	CTG	2	6	284751	284756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200800
5570	NC_017221	GAG	2	6	284832	284837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200800
5571	NC_017221	GCC	2	6	284952	284957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200800
5572	NC_017221	A	6	6	284989	284994	100 %	0 %	0 %	0 %	384200800
5573	NC_017221	GTG	2	6	285012	285017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200800
5574	NC_017221	GAA	2	6	285036	285041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200800
5575	NC_017221	TCG	2	6	285079	285084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200800
5576	NC_017221	TCG	2	6	285127	285132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200800
5577	NC_017221	GAG	2	6	285153	285158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200800
5578	NC_017221	CCA	2	6	285244	285249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200801
5579	NC_017221	CCG	2	6	285295	285300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200801
5580	NC_017221	GGC	2	6	285422	285427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200801
5581	NC_017221	GCC	2	6	285438	285443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200801
5582	NC_017221	TGGCC	2	10	285472	285481	0 %	20 %	40 %	40 %	384200801
5583	NC_017221	CAG	2	6	285515	285520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200801
5584	NC_017221	ACG	2	6	285593	285598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200801
5585	NC_017221	GCA	2	6	285607	285612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200801
5586	NC_017221	GTG	2	6	285618	285623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200801
5587	NC_017221	CGG	2	6	285742	285747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200801
5588	NC_017221	TCGG	2	8	285801	285808	0 %	25 %	50 %	25 %	384200801
5589	NC_017221	TTC	2	6	285819	285824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200801
5590	NC_017221	GCA	2	6	285832	285837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200801
5591	NC_017221	ACCA	2	8	285938	285945	50 %	0 %	0 %	50 %	384200801
5592	NC_017221	TATC	2	8	285976	285983	25 %	50 %	0 %	25 %	384200801
5593	NC_017221	GC	3	6	285985	285990	0 %	0 %	50 %	50 %	384200801
5594	NC_017221	CCG	2	6	286017	286022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200801
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5596	NC_017221	TGTTC	2	10	286087	286096	0 %	60 %	20 %	20 %	384200801
5597	NC_017221	GGT	2	6	286124	286129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200801
5598	NC_017221	GC	3	6	286173	286178	0 %	0 %	50 %	50 %	384200801
5599	NC_017221	GT	3	6	286232	286237	0 %	50 %	50 %	0 %	384200801
5600	NC_017221	TGA	2	6	286238	286243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200801
5601	NC_017221	GCCCG	2	10	286287	286296	0 %	0 %	40 %	60 %	384200801
5602	NC_017221	CG	4	8	286351	286358	0 %	0 %	50 %	50 %	384200801
5603	NC_017221	GCCG	2	8	286364	286371	0 %	0 %	50 %	50 %	384200801
5604	NC_017221	CAC	2	6	286436	286441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200801
5605	NC_017221	CCG	2	6	286446	286451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200801
5606	NC_017221	GTT	2	6	286541	286546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200801
5607	NC_017221	TGCG	2	8	286563	286570	0 %	25 %	50 %	25 %	384200801
5608	NC_017221	GCC	2	6	286605	286610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200801
5609	NC_017221	ACAT	2	8	286703	286710	50 %	25 %	0 %	25 %	384200801
5610	NC_017221	CTC	2	6	286877	286882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200802
5611	NC_017221	GTG	2	6	286914	286919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200802
5612	NC_017221	TGT	2	6	286931	286936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200802
5613	NC_017221	TG	3	6	286964	286969	0 %	50 %	50 %	0 %	384200802
5614	NC_017221	AGA	2	6	286987	286992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200802
5615	NC_017221	ATG	2	6	286993	286998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200802
5616	NC_017221	ACC	2	6	287010	287015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200802
5617	NC_017221	CAGC	2	8	287021	287028	25 %	0 %	25 %	50 %	384200802
5618	NC_017221	ATC	2	6	287039	287044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200802
5619	NC_017221	GAT	2	6	287085	287090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200802
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5621	NC_017221	ACG	2	6	287160	287165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200802
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5653	NC_017221	CTT	2	6	288592	288597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200803
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5742	NC_017221	TCA	2	6	295170	295175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200809
5743	NC_017221	GCC	2	6	295225	295230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200809
5744	NC_017221	TCG	2	6	295268	295273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200809
5745	NC_017221	CGT	2	6	295323	295328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200809
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5855	NC_017221	CGT	2	6	300655	300660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200812
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5857	NC_017221	CGG	2	6	300679	300684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200812
5858	NC_017221	CGA	2	6	300742	300747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200812
5859	NC_017221	ATC	2	6	300833	300838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200812
5860	NC_017221	GTC	2	6	300845	300850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200812
5861	NC_017221	GCA	2	6	300891	300896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200812
5862	NC_017221	GCG	2	6	300949	300954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200812
5863	NC_017221	GCT	2	6	300976	300981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200812
5864	NC_017221	CAT	2	6	301180	301185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200812
5865	NC_017221	TCA	2	6	301239	301244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200812
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5867	NC_017221	GACG	2	8	301291	301298	25 %	0 %	50 %	25 %	384200812
5868	NC_017221	TGA	2	6	301311	301316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200812
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5870	NC_017221	GC	3	6	301353	301358	0 %	0 %	50 %	50 %	384200812
5871	NC_017221	CGA	3	9	301405	301413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200812
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5874	NC_017221	GCA	2	6	301625	301630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200813
5875	NC_017221	GAT	2	6	301743	301748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200813
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5879	NC_017221	GAT	2	6	301809	301814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200813
5880	NC_017221	CAG	2	6	301824	301829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200813
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5884	NC_017221	GAT	2	6	302085	302090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200813
5885	NC_017221	GTC	2	6	302109	302114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200813
5886	NC_017221	GGT	2	6	302120	302125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200813
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5889	NC_017221	GAT	2	6	302253	302258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200813
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5894	NC_017221	TCG	2	6	302509	302514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200813
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5897	NC_017221	CGATGA	2	12	302570	302581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384200813
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5900	NC_017221	ATTCA	2	10	302894	302903	40 %	40 %	0 %	20 %	384200814
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5978	NC_017221	TATT	2	8	306821	306828	25 %	75 %	0 %	0 %	384200818
5979	NC_017221	CAT	2	6	306834	306839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200818
5980	NC_017221	TATT	2	8	306846	306853	25 %	75 %	0 %	0 %	384200818
5981	NC_017221	CTT	2	6	306858	306863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200818
5982	NC_017221	CAC	2	6	306873	306878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200818
5983	NC_017221	CGG	3	9	306894	306902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200818
5984	NC_017221	TCG	2	6	306920	306925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200818
5985	NC_017221	TTA	2	6	306947	306952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384200818
5986	NC_017221	ATC	2	6	307021	307026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200818
5987	NC_017221	CATC	2	8	307130	307137	25 %	25 %	0 %	50 %	384200818
5988	NC_017221	GCC	2	6	307189	307194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200818
5989	NC_017221	CTT	2	6	307212	307217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200818
5990	NC_017221	ACA	2	6	307277	307282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200818
5991	NC_017221	CGC	2	6	307296	307301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200818
5992	NC_017221	CGCA	2	8	307335	307342	25 %	0 %	25 %	50 %	384200818
5993	NC_017221	CGTG	2	8	307392	307399	0 %	25 %	50 %	25 %	384200818
5994	NC_017221	GCC	2	6	307402	307407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200818
5995	NC_017221	TGC	2	6	307418	307423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200818
5996	NC_017221	TCG	2	6	307430	307435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200818
5997	NC_017221	TCCGA	2	10	307477	307486	20 %	20 %	20 %	40 %	384200818
5998	NC_017221	ATG	3	9	307510	307518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200818
5999	NC_017221	GTG	2	6	307553	307558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200818
6000	NC_017221	AAGG	2	8	307635	307642	50 %	0 %	50 %	0 %	384200818

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