MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017221	GAT	2	6	256993	256998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200768
5002	NC_017221	CGAG	2	8	257028	257035	25 %	0 %	50 %	25 %	384200768
5003	NC_017221	GTC	2	6	257120	257125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5004	NC_017221	CGC	2	6	257211	257216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200768
5005	NC_017221	TCG	2	6	257231	257236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5006	NC_017221	AGC	2	6	257252	257257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5007	NC_017221	CGT	2	6	257278	257283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5008	NC_017221	CAG	2	6	257299	257304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5009	NC_017221	GC	3	6	257313	257318	0 %	0 %	50 %	50 %	384200768
5010	NC_017221	GCC	2	6	257351	257356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200768
5011	NC_017221	CGG	2	6	257358	257363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200768
5012	NC_017221	CTT	2	6	257442	257447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200768
5013	NC_017221	AGC	2	6	257528	257533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5014	NC_017221	CAG	2	6	257539	257544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5015	NC_017221	AAC	2	6	257545	257550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200768
5016	NC_017221	CGT	2	6	257560	257565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200768
5017	NC_017221	CGC	2	6	257575	257580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200768
5018	NC_017221	CCG	2	6	257600	257605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200768
5019	NC_017221	GCC	2	6	257614	257619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200768
5020	NC_017221	CCG	2	6	257642	257647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200768
5021	NC_017221	AGC	2	6	257717	257722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200769
5022	NC_017221	GGC	2	6	257752	257757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200769
5023	NC_017221	CG	3	6	257832	257837	0 %	0 %	50 %	50 %	384200769
5024	NC_017221	GTG	2	6	257864	257869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200769
5025	NC_017221	GGT	2	6	258004	258009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200769
5026	NC_017221	GT	3	6	258008	258013	0 %	50 %	50 %	0 %	384200769
5027	NC_017221	CCG	2	6	258039	258044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200769
5028	NC_017221	GGT	2	6	258091	258096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200769
5029	NC_017221	CTT	2	6	258173	258178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200770
5030	NC_017221	GAA	2	6	258179	258184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200770
5031	NC_017221	GCCG	2	8	258326	258333	0 %	0 %	50 %	50 %	384200770
5032	NC_017221	CGC	2	6	258389	258394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200771
5033	NC_017221	CGT	2	6	258400	258405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200771
5034	NC_017221	TCGAGC	2	12	258435	258446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384200771
5035	NC_017221	ACCC	2	8	258455	258462	25 %	0 %	0 %	75 %	384200771
5036	NC_017221	TCGT	2	8	258477	258484	0 %	50 %	25 %	25 %	384200771
5037	NC_017221	CCA	2	6	258486	258491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200771
5038	NC_017221	ATG	2	6	258507	258512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200771
5039	NC_017221	ACG	2	6	258519	258524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200771
5040	NC_017221	TAT	2	6	258547	258552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384200771
5041	NC_017221	GC	3	6	258607	258612	0 %	0 %	50 %	50 %	384200771
5042	NC_017221	AAGT	2	8	258614	258621	50 %	25 %	25 %	0 %	384200771
5043	NC_017221	CAG	2	6	258720	258725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200772
5044	NC_017221	ACA	2	6	258748	258753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200772
5045	NC_017221	CTC	2	6	258768	258773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200772
5046	NC_017221	CGG	2	6	258788	258793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200772
5047	NC_017221	TCG	2	6	258829	258834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200772
5048	NC_017221	AAG	2	6	258870	258875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200772
5049	NC_017221	GTC	2	6	258897	258902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200772
5050	NC_017221	CCG	2	6	258920	258925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200772
5051	NC_017221	CGA	2	6	258950	258955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200772
5052	NC_017221	CGC	2	6	258959	258964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200772
5053	NC_017221	CGGT	2	8	259015	259022	0 %	25 %	50 %	25 %	384200772
5054	NC_017221	GCG	2	6	259103	259108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200773
5055	NC_017221	AAGG	2	8	259144	259151	50 %	0 %	50 %	0 %	384200773
5056	NC_017221	TCG	2	6	259187	259192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200773
5057	NC_017221	AAG	2	6	259210	259215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200773
5058	NC_017221	CGTG	2	8	259218	259225	0 %	25 %	50 %	25 %	384200773
5059	NC_017221	GCA	2	6	259230	259235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200773
5060	NC_017221	CAG	2	6	259240	259245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200773
5061	NC_017221	AGC	2	6	259313	259318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200773
5062	NC_017221	CGTGCG	2	12	259374	259385	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384200773
5063	NC_017221	AAG	2	6	259393	259398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200773
5064	NC_017221	TAC	2	6	259424	259429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200774
5065	NC_017221	GTC	3	9	259545	259553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200774
5066	NC_017221	AAG	2	6	259656	259661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200774
5067	NC_017221	AGGCC	2	10	259688	259697	20 %	0 %	40 %	40 %	384200774
5068	NC_017221	CTG	2	6	259752	259757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200774
5069	NC_017221	CCA	2	6	259802	259807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200774
5070	NC_017221	GATC	2	8	259865	259872	25 %	25 %	25 %	25 %	384200774
5071	NC_017221	TCGA	2	8	259878	259885	25 %	25 %	25 %	25 %	384200774
5072	NC_017221	CCA	2	6	259921	259926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200774
5073	NC_017221	GAC	2	6	259929	259934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200774
5074	NC_017221	GCT	2	6	259949	259954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200774
5075	NC_017221	GGC	2	6	260016	260021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200775
5076	NC_017221	GTC	2	6	260072	260077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200775
5077	NC_017221	ATGACA	2	12	260265	260276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384200776
5078	NC_017221	TCG	2	6	260519	260524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200776
5079	NC_017221	CAT	2	6	260576	260581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200776
5080	NC_017221	CTT	2	6	260587	260592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200776
5081	NC_017221	CTG	2	6	260598	260603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200776
5082	NC_017221	GGC	2	6	260634	260639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200776
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5084	NC_017221	CTG	2	6	260718	260723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200777
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5086	NC_017221	TGA	2	6	260848	260853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200777
5087	NC_017221	CAT	2	6	260893	260898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200777
5088	NC_017221	TCG	2	6	260949	260954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200777
5089	NC_017221	TTC	2	6	260996	261001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200777
5090	NC_017221	CCCG	2	8	261031	261038	0 %	0 %	25 %	75 %	384200777
5091	NC_017221	GCC	2	6	261116	261121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200777
5092	NC_017221	GC	3	6	261136	261141	0 %	0 %	50 %	50 %	384200777
5093	NC_017221	CAAGGG	2	12	261154	261165	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384200777
5094	NC_017221	AAG	2	6	261249	261254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200778
5095	NC_017221	CG	3	6	261275	261280	0 %	0 %	50 %	50 %	384200778
5096	NC_017221	TGG	2	6	261322	261327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200778
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5099	NC_017221	GCC	2	6	261447	261452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200778
5100	NC_017221	AAG	2	6	261453	261458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200778
5101	NC_017221	CAA	2	6	261527	261532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200778
5102	NC_017221	GTCGC	2	10	261541	261550	0 %	20 %	40 %	40 %	384200778
5103	NC_017221	GAGG	2	8	261573	261580	25 %	0 %	75 %	0 %	384200778
5104	NC_017221	AACGA	2	10	261599	261608	60 %	0 %	20 %	20 %	384200779
5105	NC_017221	GAA	2	6	261626	261631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200779
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5107	NC_017221	GTC	2	6	261678	261683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5108	NC_017221	CGT	2	6	261704	261709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5109	NC_017221	CGT	2	6	261716	261721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5110	NC_017221	CGT	2	6	261725	261730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5111	NC_017221	GAA	2	6	261731	261736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200779
5112	NC_017221	CGA	2	6	261745	261750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5113	NC_017221	GCT	2	6	261751	261756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5114	NC_017221	GTG	2	6	261764	261769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200779
5115	NC_017221	GT	3	6	261780	261785	0 %	50 %	50 %	0 %	384200779
5116	NC_017221	CGC	2	6	261820	261825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200779
5117	NC_017221	ACGGCA	2	12	261843	261854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5118	NC_017221	GCC	2	6	261893	261898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200779
5119	NC_017221	AAG	2	6	261923	261928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200779
5120	NC_017221	CACC	2	8	261964	261971	25 %	0 %	0 %	75 %	384200779
5121	NC_017221	ACG	2	6	261984	261989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5122	NC_017221	CTG	2	6	261990	261995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5123	NC_017221	CTG	2	6	262004	262009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
5124	NC_017221	GCC	2	6	262016	262021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200779
5125	NC_017221	GC	3	6	262054	262059	0 %	0 %	50 %	50 %	384200779
5126	NC_017221	CCG	2	6	262116	262121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200779
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5133	NC_017221	CTG	2	6	262226	262231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200779
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5148	NC_017221	GCG	2	6	262792	262797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200781
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5152	NC_017221	TCA	3	9	263306	263314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200782
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5154	NC_017221	GTG	2	6	263365	263370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200782
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5156	NC_017221	GCT	2	6	263514	263519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200782
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5160	NC_017221	TCA	2	6	263732	263737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200782
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5169	NC_017221	CCG	2	6	264073	264078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200782
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5200	NC_017221	CGA	2	6	266136	266141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200785
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5227	NC_017221	GGTC	2	8	267632	267639	0 %	25 %	50 %	25 %	384200787
5228	NC_017221	GAG	2	6	267654	267659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200787
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5231	NC_017221	AAG	2	6	268041	268046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200788
5232	NC_017221	CAC	3	9	268130	268138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200788
5233	NC_017221	GTG	2	6	268198	268203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200788
5234	NC_017221	CCG	2	6	268214	268219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200788
5235	NC_017221	CAA	2	6	268241	268246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200788
5236	NC_017221	GTG	2	6	268251	268256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200788
5237	NC_017221	AGC	2	6	268291	268296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200788
5238	NC_017221	CG	3	6	268333	268338	0 %	0 %	50 %	50 %	384200788
5239	NC_017221	AAG	2	6	268392	268397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200788
5240	NC_017221	TGT	2	6	268400	268405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200788
5241	NC_017221	GAAG	2	8	268406	268413	50 %	0 %	50 %	0 %	384200788
5242	NC_017221	GCC	3	9	268419	268427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200788
5243	NC_017221	GAA	3	9	268437	268445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200788
5244	NC_017221	TGAGGC	2	12	268457	268468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384200788
5245	NC_017221	GCT	2	6	268476	268481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200788
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5247	NC_017221	CCG	3	9	268510	268518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200788
5248	NC_017221	CTGAGG	2	12	268519	268530	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384200788
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5263	NC_017221	CCTG	2	8	269637	269644	0 %	25 %	25 %	50 %	384200790
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5357	NC_017221	TGG	2	6	274444	274449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200793
5358	NC_017221	GAA	2	6	274494	274499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200793
5359	NC_017221	TAC	2	6	274551	274556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200793
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5361	NC_017221	CGC	2	6	274643	274648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200793
5362	NC_017221	AGCA	2	8	274680	274687	50 %	0 %	25 %	25 %	384200793
5363	NC_017221	GAATG	2	10	274710	274719	40 %	20 %	40 %	0 %	384200793
5364	NC_017221	GCC	2	6	274809	274814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200793
5365	NC_017221	GTG	2	6	274821	274826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200793
5366	NC_017221	TGA	2	6	274837	274842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200793
5367	NC_017221	CGC	2	6	274874	274879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200793
5368	NC_017221	GGCGT	2	10	274937	274946	0 %	20 %	60 %	20 %	384200793
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5370	NC_017221	CGA	2	6	275059	275064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200793
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5372	NC_017221	GAT	2	6	275208	275213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200793
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5380	NC_017221	T	6	6	276117	276122	0 %	100 %	0 %	0 %	384200794
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5383	NC_017221	GGAT	2	8	276244	276251	25 %	25 %	50 %	0 %	384200794
5384	NC_017221	CGC	2	6	276266	276271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200794
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5482	NC_017221	CGC	2	6	280896	280901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200797
5483	NC_017221	CGA	2	6	280902	280907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200797
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