MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 46418

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017221	CG	3	6	232496	232501	0 %	0 %	50 %	50 %	384200746
4502	NC_017221	CCG	2	6	232509	232514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200746
4503	NC_017221	CAT	2	6	232515	232520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200746
4504	NC_017221	GCC	2	6	232532	232537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200746
4505	NC_017221	CGC	2	6	232540	232545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200746
4506	NC_017221	CAT	2	6	232549	232554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200746
4507	NC_017221	CAG	2	6	232607	232612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200746
4508	NC_017221	TGG	2	6	232627	232632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200746
4509	NC_017221	AGG	2	6	232638	232643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200746
4510	NC_017221	GGT	2	6	232678	232683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200746
4511	NC_017221	GAT	2	6	232691	232696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200746
4512	NC_017221	GC	3	6	232698	232703	0 %	0 %	50 %	50 %	384200746
4513	NC_017221	GAG	2	6	232709	232714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200746
4514	NC_017221	GGT	2	6	232741	232746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200746
4515	NC_017221	CAT	2	6	232814	232819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200747
4516	NC_017221	CGA	2	6	232823	232828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200747
4517	NC_017221	ACC	2	6	232833	232838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200747
4518	NC_017221	CAG	2	6	232842	232847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200747
4519	NC_017221	CAG	3	9	232908	232916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200747
4520	NC_017221	GC	3	6	232924	232929	0 %	0 %	50 %	50 %	384200747
4521	NC_017221	CCG	2	6	232945	232950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200747
4522	NC_017221	GGC	2	6	233063	233068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200747
4523	NC_017221	GT	3	6	233134	233139	0 %	50 %	50 %	0 %	384200747
4524	NC_017221	CCGT	2	8	233199	233206	0 %	25 %	25 %	50 %	384200747
4525	NC_017221	GCC	2	6	233220	233225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200747
4526	NC_017221	GAC	2	6	233232	233237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200747
4527	NC_017221	TGCGGA	2	12	233354	233365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384200747
4528	NC_017221	CGG	2	6	233416	233421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200747
4529	NC_017221	TTC	2	6	233426	233431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200747
4530	NC_017221	CCG	2	6	233438	233443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200747
4531	NC_017221	GCC	2	6	233533	233538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200747
4532	NC_017221	TGAG	2	8	233712	233719	25 %	25 %	50 %	0 %	384200748
4533	NC_017221	CCGT	2	8	233746	233753	0 %	25 %	25 %	50 %	384200748
4534	NC_017221	TGG	2	6	233934	233939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200748
4535	NC_017221	CACC	2	8	233940	233947	25 %	0 %	0 %	75 %	384200748
4536	NC_017221	TGC	2	6	233949	233954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200748
4537	NC_017221	CCG	2	6	234135	234140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4538	NC_017221	GGC	2	6	234248	234253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200748
4539	NC_017221	CTC	2	6	234292	234297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200748
4540	NC_017221	TGG	2	6	234342	234347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200748
4541	NC_017221	AGA	2	6	234357	234362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200748
4542	NC_017221	GCC	2	6	234398	234403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4543	NC_017221	GCA	2	6	234603	234608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200748
4544	NC_017221	GGCC	2	8	234637	234644	0 %	0 %	50 %	50 %	384200748
4545	NC_017221	CCG	2	6	234648	234653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4546	NC_017221	GTG	2	6	234718	234723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200748
4547	NC_017221	GAG	2	6	234758	234763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200748
4548	NC_017221	GCTG	2	8	234849	234856	0 %	25 %	50 %	25 %	384200748
4549	NC_017221	GCC	2	6	234866	234871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4550	NC_017221	AGC	2	6	234873	234878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200748
4551	NC_017221	TCC	2	6	234881	234886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200748
4552	NC_017221	GCAT	2	8	234912	234919	25 %	25 %	25 %	25 %	384200748
4553	NC_017221	CAT	2	6	234925	234930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200748
4554	NC_017221	GTG	2	6	234973	234978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200748
4555	NC_017221	CCG	2	6	235019	235024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4556	NC_017221	AGCC	2	8	235055	235062	25 %	0 %	25 %	50 %	384200748
4557	NC_017221	ACC	2	6	235088	235093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200748
4558	NC_017221	GCATG	2	10	235120	235129	20 %	20 %	40 %	20 %	384200748
4559	NC_017221	CGGTG	2	10	235141	235150	0 %	20 %	60 %	20 %	384200748
4560	NC_017221	TGG	2	6	235184	235189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200748
4561	NC_017221	ATGG	2	8	235211	235218	25 %	25 %	50 %	0 %	384200748
4562	NC_017221	TAC	2	6	235229	235234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200748
4563	NC_017221	CAT	2	6	235243	235248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200748
4564	NC_017221	CGG	2	6	235282	235287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200748
4565	NC_017221	GTG	2	6	235313	235318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200748
4566	NC_017221	GCC	2	6	235459	235464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4567	NC_017221	GCC	2	6	235466	235471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4568	NC_017221	CCGGC	2	10	235524	235533	0 %	0 %	40 %	60 %	384200748
4569	NC_017221	GATGC	2	10	235568	235577	20 %	20 %	40 %	20 %	384200748
4570	NC_017221	TCG	2	6	235650	235655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200748
4571	NC_017221	GCT	2	6	235693	235698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200748
4572	NC_017221	CGC	2	6	235699	235704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200748
4573	NC_017221	CAA	2	6	235756	235761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200748
4574	NC_017221	GTG	2	6	236340	236345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200749
4575	NC_017221	CTG	2	6	236376	236381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200749
4576	NC_017221	ATC	3	9	236436	236444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200749
4577	NC_017221	CAA	2	6	236471	236476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200749
4578	NC_017221	GGT	2	6	236514	236519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200749
4579	NC_017221	CGT	2	6	236523	236528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200749
4580	NC_017221	GCT	2	6	236543	236548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200749
4581	NC_017221	GAA	2	6	236552	236557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200749
4582	NC_017221	CAT	2	6	236567	236572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200749
4583	NC_017221	TGC	2	6	236593	236598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200749
4584	NC_017221	GAA	2	6	236600	236605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200749
4585	NC_017221	GCA	2	6	236708	236713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200749
4586	NC_017221	ACC	2	6	236806	236811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200750
4587	NC_017221	CGCTGG	2	12	236820	236831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384200750
4588	NC_017221	CGC	2	6	236872	236877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200750
4589	NC_017221	AGG	2	6	236879	236884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200750
4590	NC_017221	GGA	2	6	236946	236951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200750
4591	NC_017221	GCT	2	6	236967	236972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200750
4592	NC_017221	CGG	3	9	237045	237053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200750
4593	NC_017221	CAC	2	6	237054	237059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200750
4594	NC_017221	ATCG	2	8	237109	237116	25 %	25 %	25 %	25 %	384200750
4595	NC_017221	CGC	2	6	237129	237134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200750
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4597	NC_017221	GGCT	2	8	237144	237151	0 %	25 %	50 %	25 %	384200750
4598	NC_017221	CGT	2	6	237171	237176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200750
4599	NC_017221	AAG	2	6	237184	237189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200750
4600	NC_017221	TCA	2	6	237339	237344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200751
4601	NC_017221	GTC	2	6	237379	237384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200751
4602	NC_017221	ATC	2	6	237403	237408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200751
4603	NC_017221	GCG	2	6	237470	237475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200751
4604	NC_017221	CTT	2	6	237552	237557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200751
4605	NC_017221	TGC	2	6	237596	237601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200751
4606	NC_017221	GGT	2	6	237610	237615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200751
4607	NC_017221	AGTG	2	8	237702	237709	25 %	25 %	50 %	0 %	384200751
4608	NC_017221	GGC	2	6	237713	237718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200751
4609	NC_017221	GTC	2	6	237733	237738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200751
4610	NC_017221	TACG	2	8	237804	237811	25 %	25 %	25 %	25 %	384200751
4611	NC_017221	GAA	2	6	237913	237918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200751
4612	NC_017221	GTG	2	6	237925	237930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200751
4613	NC_017221	CCA	2	6	237957	237962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200751
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4615	NC_017221	CG	3	6	237993	237998	0 %	0 %	50 %	50 %	384200751
4616	NC_017221	TTG	2	6	238001	238006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200751
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4619	NC_017221	CAT	2	6	238108	238113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200751
4620	NC_017221	AGC	3	9	238130	238138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200751
4621	NC_017221	GCC	2	6	238157	238162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200751
4622	NC_017221	ATC	2	6	238189	238194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200751
4623	NC_017221	CGA	2	6	238234	238239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200751
4624	NC_017221	CAT	2	6	238242	238247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200751
4625	NC_017221	CGT	2	6	238314	238319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200751
4626	NC_017221	GCC	2	6	238438	238443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200751
4627	NC_017221	CATTC	2	10	238491	238500	20 %	40 %	0 %	40 %	384200751
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4631	NC_017221	TAG	2	6	238817	238822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200751
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4645	NC_017221	GTG	2	6	239147	239152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200751
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4694	NC_017221	CTG	2	6	241678	241683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200753
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4722	NC_017221	AGC	2	6	242633	242638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200753
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4735	NC_017221	TTGC	2	8	244016	244023	0 %	50 %	25 %	25 %	384200755
4736	NC_017221	GT	3	6	244095	244100	0 %	50 %	50 %	0 %	384200755
4737	NC_017221	TCA	2	6	244122	244127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200755
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4739	NC_017221	CT	3	6	244268	244273	0 %	50 %	0 %	50 %	384200755
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4741	NC_017221	TGC	2	6	244315	244320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200755
4742	NC_017221	CGG	3	9	244399	244407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200755
4743	NC_017221	CCA	2	6	244434	244439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200755
4744	NC_017221	CTG	2	6	244448	244453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200755
4745	NC_017221	TCG	2	6	244455	244460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200755
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4747	NC_017221	GCT	2	6	244536	244541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200755
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4749	NC_017221	TG	3	6	244615	244620	0 %	50 %	50 %	0 %	384200755
4750	NC_017221	GTG	2	6	244625	244630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200755
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4772	NC_017221	GC	3	6	245713	245718	0 %	0 %	50 %	50 %	384200756
4773	NC_017221	TCG	2	6	245773	245778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200756
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4833	NC_017221	CAT	2	6	249883	249888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200759
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4842	NC_017221	CGTG	2	8	250282	250289	0 %	25 %	50 %	25 %	384200759
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4849	NC_017221	AGC	2	6	250599	250604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200759
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4852	NC_017221	CAT	2	6	250666	250671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200759
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4855	NC_017221	GGC	3	9	250766	250774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200759
4856	NC_017221	GATG	2	8	250780	250787	25 %	25 %	50 %	0 %	384200759
4857	NC_017221	GCT	2	6	250804	250809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200759
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4859	NC_017221	GC	3	6	250870	250875	0 %	0 %	50 %	50 %	384200759
4860	NC_017221	CGC	2	6	250887	250892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200759
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4863	NC_017221	CCGT	2	8	251021	251028	0 %	25 %	25 %	50 %	384200759
4864	NC_017221	CGC	2	6	251257	251262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200759
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4981	NC_017221	CGA	2	6	256275	256280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200766
4982	NC_017221	TCA	2	6	256307	256312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200766
4983	NC_017221	CGT	2	6	256324	256329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200766
4984	NC_017221	GAT	2	6	256332	256337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200766
4985	NC_017221	AC	3	6	256356	256361	50 %	0 %	0 %	50 %	384200766
4986	NC_017221	ATG	2	6	256373	256378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200766
4987	NC_017221	TGGT	2	8	256415	256422	0 %	50 %	50 %	0 %	384200766
4988	NC_017221	GAC	2	6	256474	256479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200766
4989	NC_017221	AAG	2	6	256480	256485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200766
4990	NC_017221	TAAGGA	2	12	256495	256506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384200766
4991	NC_017221	CGC	2	6	256551	256556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200767
4992	NC_017221	CGC	2	6	256565	256570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200767
4993	NC_017221	AAG	2	6	256592	256597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200767
4994	NC_017221	GCT	2	6	256805	256810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200767
4995	NC_017221	CAA	2	6	256816	256821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200767
4996	NC_017221	GTC	2	6	256841	256846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200767
4997	NC_017221	AAGG	2	8	256856	256863	50 %	0 %	50 %	0 %	384200767
4998	NC_017221	AGA	2	6	256883	256888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200768
4999	NC_017221	ACC	2	6	256925	256930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200768
5000	NC_017221	CAA	2	6	256953	256958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200768

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