MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 38476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017217	GCG	2	6	25325	25330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194642
502	NC_017217	GC	3	6	25338	25343	0 %	0 %	50 %	50 %	384194642
503	NC_017217	GCG	2	6	25350	25355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194642
504	NC_017217	GGCG	2	8	25373	25380	0 %	0 %	75 %	25 %	384194642
505	NC_017217	ACA	2	6	25390	25395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384194642
506	NC_017217	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	384194642
507	NC_017217	GAA	2	6	25538	25543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384194642
508	NC_017217	GCG	2	6	25625	25630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194642
509	NC_017217	GCG	2	6	25711	25716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194642
510	NC_017217	CG	3	6	25752	25757	0 %	0 %	50 %	50 %	384194642
511	NC_017217	TGTTCG	2	12	25771	25782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384194642
512	NC_017217	CGA	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194642
513	NC_017217	ATC	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194642
514	NC_017217	GGC	3	9	25932	25940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194642
515	NC_017217	CGG	2	6	25946	25951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194642
516	NC_017217	TCG	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194642
517	NC_017217	GAGT	2	8	26034	26041	25 %	25 %	50 %	0 %	384194642
518	NC_017217	GCA	2	6	26496	26501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194643
519	NC_017217	GCG	3	9	26594	26602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194643
520	NC_017217	GCA	2	6	26604	26609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194643
521	NC_017217	GCCGTT	2	12	26742	26753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194643
522	NC_017217	GGC	2	6	26869	26874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194643
523	NC_017217	GAG	2	6	26908	26913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194643
524	NC_017217	ACG	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194643
525	NC_017217	GCT	3	9	26970	26978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194643
526	NC_017217	CGA	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194643
527	NC_017217	CGA	2	6	27015	27020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194643
528	NC_017217	CGG	2	6	27027	27032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194643
529	NC_017217	GC	4	8	27057	27064	0 %	0 %	50 %	50 %	384194643
530	NC_017217	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	384194643
531	NC_017217	ATC	2	6	27304	27309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194644
532	NC_017217	TCT	2	6	27338	27343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194644
533	NC_017217	CATT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	384194644
534	NC_017217	GCC	2	6	27478	27483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194644
535	NC_017217	GTG	2	6	27502	27507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194644
536	NC_017217	GAT	2	6	27522	27527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194644
537	NC_017217	ATT	2	6	27574	27579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384194644
538	NC_017217	TGG	2	6	27656	27661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194644
539	NC_017217	TGG	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194644
540	NC_017217	GTG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194644
541	NC_017217	CCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194644
542	NC_017217	GACG	2	8	27804	27811	25 %	0 %	50 %	25 %	384194644
543	NC_017217	TGA	2	6	27815	27820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194644
544	NC_017217	CT	3	6	27916	27921	0 %	50 %	0 %	50 %	384194644
545	NC_017217	CGA	2	6	27924	27929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194644
546	NC_017217	CTG	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194644
547	NC_017217	GTC	3	9	27946	27954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194644
548	NC_017217	CG	3	6	28039	28044	0 %	0 %	50 %	50 %	384194644
549	NC_017217	ACG	2	6	28476	28481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194645
550	NC_017217	TGA	2	6	28500	28505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194645
551	NC_017217	TCG	2	6	28506	28511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194645
552	NC_017217	CAA	2	6	28534	28539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384194645
553	NC_017217	CG	3	6	28577	28582	0 %	0 %	50 %	50 %	384194645
554	NC_017217	GTCG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	384194645
555	NC_017217	GC	3	6	28664	28669	0 %	0 %	50 %	50 %	384194645
556	NC_017217	GAA	2	6	28741	28746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384194645
557	NC_017217	TGA	2	6	28809	28814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194645
558	NC_017217	GCG	2	6	28821	28826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194645
559	NC_017217	GCCGAG	2	12	29024	29035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384194645
560	NC_017217	TA	5	10	29303	29312	50 %	50 %	0 %	0 %	384194646
561	NC_017217	GGCGAT	2	12	29390	29401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384194646
562	NC_017217	GCAG	2	8	29438	29445	25 %	0 %	50 %	25 %	384194646
563	NC_017217	CAT	2	6	29523	29528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194646
564	NC_017217	TTC	2	6	29530	29535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194646
565	NC_017217	AATC	2	8	29572	29579	50 %	25 %	0 %	25 %	384194646
566	NC_017217	AGC	2	6	29788	29793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194646
567	NC_017217	AGC	2	6	29859	29864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194646
568	NC_017217	CGA	2	6	29918	29923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194646
569	NC_017217	CGT	2	6	29939	29944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194646
570	NC_017217	GACT	2	8	29949	29956	25 %	25 %	25 %	25 %	384194646
571	NC_017217	CGG	2	6	30727	30732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194647
572	NC_017217	GGT	2	6	30734	30739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194647
573	NC_017217	GGT	2	6	30833	30838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194647
574	NC_017217	CGACAT	2	12	30851	30862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384194647
575	NC_017217	GGC	2	6	31122	31127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194648
576	NC_017217	ATC	2	6	31150	31155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194648
577	NC_017217	TGG	2	6	31160	31165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194648
578	NC_017217	GCG	2	6	31248	31253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194648
579	NC_017217	ATC	2	6	31574	31579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194649
580	NC_017217	GC	3	6	31612	31617	0 %	0 %	50 %	50 %	384194649
581	NC_017217	GGT	2	6	31698	31703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194649
582	NC_017217	ACG	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194649
583	NC_017217	GA	3	6	31808	31813	50 %	0 %	50 %	0 %	384194649
584	NC_017217	TAG	2	6	31822	31827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194649
585	NC_017217	GCTT	2	8	31989	31996	0 %	50 %	25 %	25 %	384194650
586	NC_017217	TGC	2	6	32030	32035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194650
587	NC_017217	GAT	2	6	32037	32042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194650
588	NC_017217	TCG	2	6	32044	32049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194650
589	NC_017217	ATC	2	6	32089	32094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194650
590	NC_017217	CTC	2	6	32106	32111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384194650
591	NC_017217	TCG	2	6	32143	32148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194650
592	NC_017217	AGC	2	6	32167	32172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194650
593	NC_017217	TTG	2	6	32223	32228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384194650
594	NC_017217	TGG	2	6	32251	32256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194650
595	NC_017217	AGTATG	2	12	32319	32330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194651
596	NC_017217	CGT	2	6	32338	32343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194651
597	NC_017217	GCA	2	6	32347	32352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194651
598	NC_017217	GAG	2	6	32394	32399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194651
599	NC_017217	CTG	2	6	32443	32448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194651
600	NC_017217	GGT	2	6	32453	32458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194651
601	NC_017217	AG	3	6	32472	32477	50 %	0 %	50 %	0 %	384194651
602	NC_017217	GCA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194651
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604	NC_017217	GGC	2	6	32741	32746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194652
605	NC_017217	CTT	2	6	32754	32759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194652
606	NC_017217	A	7	7	32816	32822	100 %	0 %	0 %	0 %	384194652
607	NC_017217	ATT	2	6	32830	32835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384194652
608	NC_017217	TA	3	6	32848	32853	50 %	50 %	0 %	0 %	384194652
609	NC_017217	TGC	2	6	32899	32904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194652
610	NC_017217	TTTC	2	8	32914	32921	0 %	75 %	0 %	25 %	384194652
611	NC_017217	TGT	3	9	32948	32956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384194652
612	NC_017217	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	384194652
613	NC_017217	TG	4	8	33004	33011	0 %	50 %	50 %	0 %	384194652
614	NC_017217	ATT	2	6	33102	33107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384194652
615	NC_017217	TAT	2	6	33111	33116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384194652
616	NC_017217	A	7	7	33145	33151	100 %	0 %	0 %	0 %	384194652
617	NC_017217	ATTT	2	8	33195	33202	25 %	75 %	0 %	0 %	384194652
618	NC_017217	ACGA	2	8	33211	33218	50 %	0 %	25 %	25 %	384194652
619	NC_017217	CGA	2	6	33334	33339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194652
620	NC_017217	CTTG	2	8	33368	33375	0 %	50 %	25 %	25 %	384194652
621	NC_017217	TTTA	2	8	33384	33391	25 %	75 %	0 %	0 %	384194652
622	NC_017217	A	6	6	33416	33421	100 %	0 %	0 %	0 %	384194652
623	NC_017217	GAA	2	6	33423	33428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384194652
624	NC_017217	CTT	2	6	33447	33452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194652
625	NC_017217	ATA	2	6	33511	33516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384194652
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627	NC_017217	CGT	2	6	33630	33635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194652
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753	NC_017217	CGT	4	12	41684	41695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194658
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