MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 39909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017215	CCG	2	6	190208	190213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191588
4002	NC_017215	CGC	2	6	190220	190225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191588
4003	NC_017215	AGC	2	6	190234	190239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4004	NC_017215	GTG	2	6	190255	190260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4005	NC_017215	CAG	2	6	190290	190295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4006	NC_017215	CAA	2	6	190302	190307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191588
4007	NC_017215	CCA	2	6	190328	190333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191588
4008	NC_017215	GTG	2	6	190406	190411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4009	NC_017215	GGC	2	6	190416	190421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191588
4010	NC_017215	GC	3	6	190425	190430	0 %	0 %	50 %	50 %	384191588
4011	NC_017215	ACC	2	6	190456	190461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191588
4012	NC_017215	CCA	2	6	190466	190471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191588
4013	NC_017215	GCC	2	6	190527	190532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191588
4014	NC_017215	GAG	2	6	190575	190580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191588
4015	NC_017215	GAA	2	6	190635	190640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191588
4016	NC_017215	GCA	2	6	190670	190675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4017	NC_017215	CACG	2	8	190697	190704	25 %	0 %	25 %	50 %	384191588
4018	NC_017215	ATC	2	6	190705	190710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191588
4019	NC_017215	ATG	2	6	190726	190731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191588
4020	NC_017215	CGA	2	6	190739	190744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4021	NC_017215	TCG	2	6	190819	190824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4022	NC_017215	TTG	2	6	190876	190881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191588
4023	NC_017215	GTG	2	6	190924	190929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4024	NC_017215	CGG	2	6	191039	191044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191588
4025	NC_017215	TG	3	6	191047	191052	0 %	50 %	50 %	0 %	384191588
4026	NC_017215	GTG	2	6	191107	191112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4027	NC_017215	CTT	2	6	191133	191138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191588
4028	NC_017215	GGC	2	6	191202	191207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191588
4029	NC_017215	GC	3	6	191206	191211	0 %	0 %	50 %	50 %	384191588
4030	NC_017215	GAT	2	6	191224	191229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191588
4031	NC_017215	GC	3	6	191249	191254	0 %	0 %	50 %	50 %	384191588
4032	NC_017215	GGT	2	6	191256	191261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4033	NC_017215	AGC	2	6	191287	191292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4034	NC_017215	CGGG	2	8	191312	191319	0 %	0 %	75 %	25 %	384191588
4035	NC_017215	TTG	2	6	191377	191382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191588
4036	NC_017215	TGG	2	6	191411	191416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4037	NC_017215	GTTCT	2	10	191430	191439	0 %	60 %	20 %	20 %	384191588
4038	NC_017215	GGT	2	6	191442	191447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191588
4039	NC_017215	CGT	2	6	191462	191467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191588
4040	NC_017215	GAAC	2	8	191526	191533	50 %	0 %	25 %	25 %	384191588
4041	NC_017215	ACGA	2	8	191539	191546	50 %	0 %	25 %	25 %	384191588
4042	NC_017215	GAT	2	6	191565	191570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191588
4043	NC_017215	CTCCAC	2	12	191654	191665	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384191589
4044	NC_017215	GTC	3	9	191681	191689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191589
4045	NC_017215	GTC	2	6	191711	191716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191589
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4050	NC_017215	CGGT	2	8	191893	191900	0 %	25 %	50 %	25 %	384191589
4051	NC_017215	TCG	2	6	191901	191906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191589
4052	NC_017215	GCT	2	6	191956	191961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191589
4053	NC_017215	GCC	2	6	191966	191971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191589
4054	NC_017215	ACC	2	6	192015	192020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191589
4055	NC_017215	GC	3	6	192871	192876	0 %	0 %	50 %	50 %	384191590
4056	NC_017215	CGA	2	6	192910	192915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191590
4057	NC_017215	TCG	2	6	192927	192932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191590
4058	NC_017215	GAA	2	6	192950	192955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191590
4059	NC_017215	CCG	2	6	192989	192994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191590
4060	NC_017215	CGA	2	6	193016	193021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191590
4061	NC_017215	CAGCG	2	10	193041	193050	20 %	0 %	40 %	40 %	384191590
4062	NC_017215	TCT	2	6	193078	193083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191590
4063	NC_017215	CG	3	6	193105	193110	0 %	0 %	50 %	50 %	384191590
4064	NC_017215	GAG	2	6	193194	193199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191590
4065	NC_017215	ATGGC	2	10	193262	193271	20 %	20 %	40 %	20 %	384191590
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4092	NC_017215	CG	3	6	194316	194321	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
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4101	NC_017215	GACG	2	8	194647	194654	25 %	0 %	50 %	25 %	384191591
4102	NC_017215	TCCT	2	8	194738	194745	0 %	50 %	0 %	50 %	384191591
4103	NC_017215	TCGAA	2	10	194760	194769	40 %	20 %	20 %	20 %	384191591
4104	NC_017215	CGA	2	6	194791	194796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
4105	NC_017215	GC	3	6	194876	194881	0 %	0 %	50 %	50 %	384191591
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4107	NC_017215	GCGAG	2	10	194913	194922	20 %	0 %	60 %	20 %	384191591
4108	NC_017215	GGC	2	6	195008	195013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191591
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4110	NC_017215	CGA	2	6	195073	195078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
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4112	NC_017215	CGA	2	6	195150	195155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191591
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4121	NC_017215	CTGC	2	8	195592	195599	0 %	25 %	25 %	50 %	384191592
4122	NC_017215	TGC	2	6	195620	195625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191592
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4242	NC_017215	ACA	2	6	200294	200299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191594
4243	NC_017215	CTG	2	6	200322	200327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191594
4244	NC_017215	TGC	2	6	200348	200353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191594
4245	NC_017215	GTG	3	9	200377	200385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191594
4246	NC_017215	GCA	2	6	200393	200398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191594
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4248	NC_017215	CGT	2	6	200424	200429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191594
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4250	NC_017215	GC	3	6	200523	200528	0 %	0 %	50 %	50 %	384191594
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4262	NC_017215	TGC	2	6	200867	200872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191595
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4273	NC_017215	CGG	2	6	201580	201585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191596
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4342	NC_017215	AGT	2	6	204692	204697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191600
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4346	NC_017215	CCA	2	6	204929	204934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191600
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4348	NC_017215	GCA	2	6	205007	205012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191600
4349	NC_017215	ACC	2	6	205117	205122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191600
4350	NC_017215	AGC	3	9	205123	205131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191600
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4352	NC_017215	GGAA	2	8	205147	205154	50 %	0 %	50 %	0 %	384191600
4353	NC_017215	GCG	2	6	205174	205179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191600
4354	NC_017215	GAG	2	6	205266	205271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191600
4355	NC_017215	TGTT	2	8	205402	205409	0 %	75 %	25 %	0 %	384191600
4356	NC_017215	GAG	2	6	205444	205449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191600
4357	NC_017215	CGC	2	6	205482	205487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191600
4358	NC_017215	TCGTC	2	10	205529	205538	0 %	40 %	20 %	40 %	384191600
4359	NC_017215	CGA	2	6	205554	205559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191600
4360	NC_017215	CGA	2	6	205563	205568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191600
4361	NC_017215	CGT	2	6	205637	205642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191600
4362	NC_017215	GTC	2	6	205680	205685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191600
4363	NC_017215	TGA	2	6	205706	205711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191600
4364	NC_017215	CGG	2	6	205721	205726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191600
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4366	NC_017215	GTT	2	6	205830	205835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191600
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4369	NC_017215	GGC	2	6	205998	206003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191600
4370	NC_017215	GA	3	6	206005	206010	50 %	0 %	50 %	0 %	384191600
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4380	NC_017215	GCGTG	2	10	206354	206363	0 %	20 %	60 %	20 %	384191600
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4389	NC_017215	CCA	2	6	206519	206524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191600
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4432	NC_017215	TG	3	6	208242	208247	0 %	50 %	50 %	0 %	384191601
4433	NC_017215	TGCG	2	8	208339	208346	0 %	25 %	50 %	25 %	384191601
4434	NC_017215	GGT	2	6	208424	208429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191601
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4449	NC_017215	CCACGG	2	12	209353	209364	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384191601
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4451	NC_017215	GAT	2	6	209450	209455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191601
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4453	NC_017215	TGA	3	9	209473	209481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191601
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4460	NC_017215	TGG	2	6	210038	210043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191602
4461	NC_017215	CCTGTT	2	12	210093	210104	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384191602
4462	NC_017215	CTCG	2	8	210126	210133	0 %	25 %	25 %	50 %	384191602
4463	NC_017215	GGC	2	6	210156	210161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191602
4464	NC_017215	GAT	2	6	210264	210269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191602
4465	NC_017215	GCT	2	6	210313	210318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191602
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4467	NC_017215	TGG	2	6	210371	210376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191602
4468	NC_017215	GC	3	6	210389	210394	0 %	0 %	50 %	50 %	384191602
4469	NC_017215	CGG	2	6	210399	210404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191602
4470	NC_017215	GGC	2	6	210444	210449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191602
4471	NC_017215	GGT	2	6	210464	210469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191603
4472	NC_017215	TGC	2	6	210514	210519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191603
4473	NC_017215	CG	3	6	210529	210534	0 %	0 %	50 %	50 %	384191603
4474	NC_017215	TGG	2	6	210553	210558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191603
4475	NC_017215	ATG	3	9	210564	210572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191603
4476	NC_017215	ATG	2	6	210600	210605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191603
4477	NC_017215	TGC	2	6	210610	210615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191603
4478	NC_017215	TGGGCA	2	12	210655	210666	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384191603
4479	NC_017215	CGC	2	6	210707	210712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191603
4480	NC_017215	TGG	2	6	210764	210769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191603
4481	NC_017215	ATG	2	6	210774	210779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191603
4482	NC_017215	TCG	2	6	210835	210840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191603
4483	NC_017215	GGT	2	6	210872	210877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191603
4484	NC_017215	TTC	2	6	210903	210908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191603
4485	NC_017215	CG	3	6	210917	210922	0 %	0 %	50 %	50 %	384191603
4486	NC_017215	GCA	2	6	210943	210948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191603
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4491	NC_017215	TGC	2	6	211164	211169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191603
4492	NC_017215	TCG	2	6	211385	211390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191604
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