MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 39909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017215	TCG	2	6	24600	24605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
502	NC_017215	CGCAC	2	10	24617	24626	20 %	0 %	20 %	60 %	384191433
503	NC_017215	ACTCGG	2	12	24640	24651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384191433
504	NC_017215	CG	3	6	24715	24720	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
505	NC_017215	CGA	2	6	24760	24765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
506	NC_017215	GTC	3	9	24848	24856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
507	NC_017215	TGC	2	6	24873	24878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
508	NC_017215	ATC	2	6	24893	24898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
509	NC_017215	GGC	2	6	24926	24931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
510	NC_017215	GTGA	2	8	24953	24960	25 %	25 %	50 %	0 %	384191433
511	NC_017215	GCGA	2	8	25001	25008	25 %	0 %	50 %	25 %	384191433
512	NC_017215	CGA	2	6	25054	25059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
513	NC_017215	CGC	2	6	25083	25088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191433
514	NC_017215	GC	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
515	NC_017215	GCCT	2	8	25227	25234	0 %	25 %	25 %	50 %	384191433
516	NC_017215	GC	4	8	25243	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
517	NC_017215	GAT	2	6	25279	25284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191433
518	NC_017215	CGACG	2	10	25285	25294	20 %	0 %	40 %	40 %	384191433
519	NC_017215	CGA	2	6	25345	25350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
520	NC_017215	GCG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
521	NC_017215	GC	3	6	25367	25372	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
522	NC_017215	GCG	2	6	25379	25384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
523	NC_017215	GGCG	2	8	25402	25409	0 %	0 %	75 %	25 %	384191433
524	NC_017215	ACA	2	6	25419	25424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191433
525	NC_017215	CGCTG	2	10	25431	25440	0 %	20 %	40 %	40 %	384191433
526	NC_017215	GAA	2	6	25567	25572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191433
527	NC_017215	GCG	2	6	25654	25659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
528	NC_017215	GCG	2	6	25740	25745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
529	NC_017215	CG	3	6	25781	25786	0 %	0 %	50 %	50 %	384191433
530	NC_017215	TGTTCG	2	12	25800	25811	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384191433
531	NC_017215	CGA	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191433
532	NC_017215	ATC	2	6	25943	25948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191433
533	NC_017215	GGC	3	9	25961	25969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
534	NC_017215	CGG	2	6	25975	25980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191433
535	NC_017215	TCG	2	6	25986	25991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191433
536	NC_017215	GAGT	2	8	26063	26070	25 %	25 %	50 %	0 %	384191433
537	NC_017215	ATGC	2	8	26347	26354	25 %	25 %	25 %	25 %	384191434
538	NC_017215	ATG	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191434
539	NC_017215	CGG	2	6	26394	26399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
540	NC_017215	GAA	2	6	26407	26412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191434
541	NC_017215	GCA	2	6	26525	26530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
542	NC_017215	GCG	3	9	26623	26631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
543	NC_017215	GCA	2	6	26633	26638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
544	NC_017215	GCCGTT	2	12	26771	26782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191434
545	NC_017215	GGC	2	6	26898	26903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
546	NC_017215	GAG	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191434
547	NC_017215	ACG	2	6	26980	26985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
548	NC_017215	GCT	3	9	26999	27007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191434
549	NC_017215	CGA	2	6	27008	27013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
550	NC_017215	CGA	2	6	27044	27049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191434
551	NC_017215	CGG	2	6	27056	27061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191434
552	NC_017215	GC	4	8	27086	27093	0 %	0 %	50 %	50 %	384191434
553	NC_017215	GGGGA	2	10	27111	27120	20 %	0 %	80 %	0 %	384191434
554	NC_017215	ATC	2	6	27333	27338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191435
555	NC_017215	TCT	2	6	27367	27372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191435
556	NC_017215	CATT	2	8	27430	27437	25 %	50 %	0 %	25 %	384191435
557	NC_017215	GCC	2	6	27507	27512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191435
558	NC_017215	GTG	2	6	27531	27536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191435
559	NC_017215	GAT	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191435
560	NC_017215	ATT	2	6	27603	27608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384191435
561	NC_017215	TGG	2	6	27685	27690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191435
562	NC_017215	TGG	2	6	27694	27699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191435
563	NC_017215	GTG	2	6	27711	27716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191435
564	NC_017215	CCG	2	6	27730	27735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191435
565	NC_017215	GACG	2	8	27833	27840	25 %	0 %	50 %	25 %	384191435
566	NC_017215	TGA	2	6	27844	27849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191435
567	NC_017215	CT	3	6	27945	27950	0 %	50 %	0 %	50 %	384191435
568	NC_017215	CGA	2	6	27953	27958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191435
569	NC_017215	CTG	2	6	27960	27965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191435
570	NC_017215	GTC	3	9	27975	27983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191435
571	NC_017215	CG	3	6	28068	28073	0 %	0 %	50 %	50 %	384191435
572	NC_017215	ACG	2	6	28505	28510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191436
573	NC_017215	TGA	2	6	28529	28534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191436
574	NC_017215	TCG	2	6	28535	28540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191436
575	NC_017215	CAA	2	6	28563	28568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191436
576	NC_017215	CG	3	6	28606	28611	0 %	0 %	50 %	50 %	384191436
577	NC_017215	GTCG	2	8	28680	28687	0 %	25 %	50 %	25 %	384191436
578	NC_017215	GC	3	6	28693	28698	0 %	0 %	50 %	50 %	384191436
579	NC_017215	GAA	2	6	28770	28775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191436
580	NC_017215	TGA	2	6	28838	28843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191436
581	NC_017215	GCG	2	6	28850	28855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191436
582	NC_017215	GCCGAG	2	12	29053	29064	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384191436
583	NC_017215	TA	5	10	29332	29341	50 %	50 %	0 %	0 %	384191437
584	NC_017215	GGCGAT	2	12	29419	29430	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384191437
585	NC_017215	GCAG	2	8	29467	29474	25 %	0 %	50 %	25 %	384191437
586	NC_017215	CAT	2	6	29552	29557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191437
587	NC_017215	TTC	2	6	29559	29564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191437
588	NC_017215	AATC	2	8	29601	29608	50 %	25 %	0 %	25 %	384191437
589	NC_017215	AGC	2	6	29817	29822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191437
590	NC_017215	AGC	2	6	29888	29893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191437
591	NC_017215	CGA	2	6	29947	29952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191437
592	NC_017215	CGT	2	6	29968	29973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191437
593	NC_017215	GACT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	25 %	25 %	384191437
594	NC_017215	ATT	2	6	30055	30060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384191438
595	NC_017215	AGG	2	6	30081	30086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191438
596	NC_017215	GGC	2	6	30223	30228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191438
597	NC_017215	GTC	2	6	30331	30336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191438
598	NC_017215	TGC	2	6	30412	30417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191438
599	NC_017215	GAC	2	6	30431	30436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191438
600	NC_017215	TGG	2	6	30482	30487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191438
601	NC_017215	CTT	2	6	30540	30545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191438
602	NC_017215	GAC	2	6	30554	30559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191438
603	NC_017215	AG	3	6	30597	30602	50 %	0 %	50 %	0 %	384191438
604	NC_017215	GAG	2	6	30691	30696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191438
605	NC_017215	CGA	2	6	30699	30704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191438
606	NC_017215	CGG	2	6	30756	30761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191438
607	NC_017215	GGT	2	6	30763	30768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191438
608	NC_017215	GGT	2	6	30862	30867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191438
609	NC_017215	CGACAT	2	12	30880	30891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384191438
610	NC_017215	CGG	2	6	30975	30980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191438
611	NC_017215	CTT	2	6	31044	31049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191438
612	NC_017215	GAAGA	2	10	31052	31061	60 %	0 %	40 %	0 %	384191438
613	NC_017215	GGC	2	6	31151	31156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191439
614	NC_017215	ATC	2	6	31179	31184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191439
615	NC_017215	TGG	2	6	31189	31194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191439
616	NC_017215	GCG	2	6	31277	31282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191439
617	NC_017215	ATC	2	6	31603	31608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191440
618	NC_017215	GC	3	6	31641	31646	0 %	0 %	50 %	50 %	384191440
619	NC_017215	GGT	2	6	31727	31732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191440
620	NC_017215	ACG	2	6	31755	31760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191440
621	NC_017215	GA	3	6	31837	31842	50 %	0 %	50 %	0 %	384191440
622	NC_017215	TAG	2	6	31851	31856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191440
623	NC_017215	GCTT	2	8	32018	32025	0 %	50 %	25 %	25 %	384191441
624	NC_017215	TGC	2	6	32059	32064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191441
625	NC_017215	GAT	2	6	32066	32071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191441
626	NC_017215	TCG	2	6	32073	32078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191441
627	NC_017215	ATC	2	6	32118	32123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191441
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632	NC_017215	TGG	2	6	32280	32285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191441
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660	NC_017215	TTTA	2	8	33413	33420	25 %	75 %	0 %	0 %	384191443
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753	NC_017215	AG	3	6	38932	38937	50 %	0 %	50 %	0 %	384191448
754	NC_017215	AAG	2	6	39002	39007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191448
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761	NC_017215	GGC	2	6	39408	39413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191448
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855	NC_017215	GGAT	2	8	45729	45736	25 %	25 %	50 %	0 %	384191455
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871	NC_017215	CG	3	6	46501	46506	0 %	0 %	50 %	50 %	384191456
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877	NC_017215	CGA	3	9	46678	46686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191456
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