MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 39909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017215	CCG	2	6	254946	254951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5502	NC_017215	TCA	2	6	255090	255095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191643
5503	NC_017215	AGG	2	6	255117	255122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191643
5504	NC_017215	CCG	2	6	255123	255128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5505	NC_017215	TCG	2	6	255131	255136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5506	NC_017215	CGC	2	6	255178	255183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5507	NC_017215	CGC	2	6	255190	255195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5508	NC_017215	GTG	2	6	255209	255214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191643
5509	NC_017215	TTC	2	6	255335	255340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191643
5510	NC_017215	CGT	2	6	255345	255350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5511	NC_017215	TCG	2	6	255357	255362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5512	NC_017215	TGT	2	6	255411	255416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191643
5513	NC_017215	CGC	2	6	255438	255443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5514	NC_017215	CAT	2	6	255453	255458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191643
5515	NC_017215	TTC	2	6	255476	255481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191643
5516	NC_017215	CGT	2	6	255604	255609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5517	NC_017215	CGT	2	6	255657	255662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5518	NC_017215	TGC	2	6	255667	255672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5519	NC_017215	TGG	2	6	255696	255701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191643
5520	NC_017215	GTT	2	6	255730	255735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191643
5521	NC_017215	GCC	2	6	255760	255765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5522	NC_017215	TCT	2	6	255789	255794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191643
5523	NC_017215	GCC	2	6	255808	255813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5524	NC_017215	CCGG	2	8	255840	255847	0 %	0 %	50 %	50 %	384191643
5525	NC_017215	TCT	2	6	255870	255875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191643
5526	NC_017215	CCG	2	6	255911	255916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5527	NC_017215	GGT	2	6	255970	255975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191643
5528	NC_017215	CGGCC	2	10	255991	256000	0 %	0 %	40 %	60 %	384191643
5529	NC_017215	ATG	2	6	256085	256090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191643
5530	NC_017215	CG	3	6	256098	256103	0 %	0 %	50 %	50 %	384191643
5531	NC_017215	CCG	2	6	256134	256139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5532	NC_017215	GAT	2	6	256162	256167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191643
5533	NC_017215	ATC	2	6	256175	256180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191643
5534	NC_017215	GCC	2	6	256181	256186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5535	NC_017215	CCT	2	6	256209	256214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384191643
5536	NC_017215	CGC	3	9	256231	256239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5537	NC_017215	CTG	2	6	256297	256302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5538	NC_017215	GGT	2	6	256366	256371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191643
5539	NC_017215	ATA	2	6	256381	256386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384191643
5540	NC_017215	CTG	2	6	256399	256404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5541	NC_017215	GCC	2	6	256417	256422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5542	NC_017215	TTG	2	6	256445	256450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191643
5543	NC_017215	GC	4	8	256457	256464	0 %	0 %	50 %	50 %	384191643
5544	NC_017215	ATG	2	6	256472	256477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191643
5545	NC_017215	GCC	2	6	256483	256488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5546	NC_017215	CGA	2	6	256518	256523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5547	NC_017215	GCA	2	6	256545	256550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191643
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5549	NC_017215	CGT	2	6	256608	256613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5550	NC_017215	GTA	2	6	256615	256620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191643
5551	NC_017215	TCT	2	6	256629	256634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191643
5552	NC_017215	GGT	2	6	256669	256674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191643
5553	NC_017215	AGGT	2	8	256682	256689	25 %	25 %	50 %	0 %	384191643
5554	NC_017215	CAG	2	6	256711	256716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191643
5555	NC_017215	CCG	2	6	256718	256723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191643
5556	NC_017215	CCA	2	6	256744	256749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191643
5557	NC_017215	CTT	2	6	256774	256779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191643
5558	NC_017215	GC	3	6	256812	256817	0 %	0 %	50 %	50 %	384191643
5559	NC_017215	GCGCG	2	10	256839	256848	0 %	0 %	60 %	40 %	384191643
5560	NC_017215	GAGCTT	2	12	256853	256864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384191643
5561	NC_017215	CTGG	2	8	257014	257021	0 %	25 %	50 %	25 %	384191644
5562	NC_017215	TA	3	6	257099	257104	50 %	50 %	0 %	0 %	384191644
5563	NC_017215	TC	3	6	257105	257110	0 %	50 %	0 %	50 %	384191644
5564	NC_017215	AAG	2	6	257129	257134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191644
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5567	NC_017215	CGG	2	6	257317	257322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191644
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5569	NC_017215	TGC	2	6	257463	257468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191644
5570	NC_017215	GACC	2	8	257472	257479	25 %	0 %	25 %	50 %	384191644
5571	NC_017215	ACG	2	6	257481	257486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191644
5572	NC_017215	TAC	2	6	257498	257503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191644
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5574	NC_017215	CGA	2	6	257524	257529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191644
5575	NC_017215	TGC	2	6	257553	257558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191644
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5582	NC_017215	CGCC	2	8	257788	257795	0 %	0 %	25 %	75 %	384191644
5583	NC_017215	GTG	2	6	257808	257813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191644
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5585	NC_017215	TGC	2	6	257871	257876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191644
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5587	NC_017215	CG	3	6	257913	257918	0 %	0 %	50 %	50 %	384191644
5588	NC_017215	GTG	2	6	257930	257935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191644
5589	NC_017215	GTCC	2	8	257970	257977	0 %	25 %	25 %	50 %	384191644
5590	NC_017215	CGA	2	6	257995	258000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191644
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5592	NC_017215	GC	3	6	258121	258126	0 %	0 %	50 %	50 %	384191644
5593	NC_017215	GGCC	2	8	258154	258161	0 %	0 %	50 %	50 %	384191644
5594	NC_017215	TCC	2	6	258176	258181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384191644
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5597	NC_017215	GAG	3	9	258272	258280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191644
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5600	NC_017215	GTG	2	6	258573	258578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191645
5601	NC_017215	C	6	6	258620	258625	0 %	0 %	0 %	100 %	384191645
5602	NC_017215	GCA	2	6	258637	258642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5603	NC_017215	TGG	2	6	258658	258663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191645
5604	NC_017215	GAGC	2	8	258734	258741	25 %	0 %	50 %	25 %	384191645
5605	NC_017215	ACG	2	6	258742	258747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5606	NC_017215	GC	4	8	258767	258774	0 %	0 %	50 %	50 %	384191645
5607	NC_017215	CA	3	6	258806	258811	50 %	0 %	0 %	50 %	384191645
5608	NC_017215	GAC	2	6	258825	258830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5609	NC_017215	AC	3	6	258829	258834	50 %	0 %	0 %	50 %	384191645
5610	NC_017215	TGC	2	6	258844	258849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5611	NC_017215	CGC	2	6	258908	258913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191645
5612	NC_017215	CGC	2	6	258923	258928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191645
5613	NC_017215	CG	4	8	258930	258937	0 %	0 %	50 %	50 %	384191645
5614	NC_017215	GAAAGC	2	12	258957	258968	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384191645
5615	NC_017215	GGA	2	6	258992	258997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191645
5616	NC_017215	CCGC	2	8	259049	259056	0 %	0 %	25 %	75 %	384191645
5617	NC_017215	TG	3	6	259075	259080	0 %	50 %	50 %	0 %	384191645
5618	NC_017215	CGC	2	6	259195	259200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191645
5619	NC_017215	GCT	2	6	259205	259210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5620	NC_017215	TCG	2	6	259285	259290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5621	NC_017215	GCG	2	6	259298	259303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191645
5622	NC_017215	TGG	2	6	259308	259313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191645
5623	NC_017215	TCG	2	6	259327	259332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191645
5624	NC_017215	CGC	2	6	259337	259342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191645
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5740	NC_017215	CGA	2	6	264534	264539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191647
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5985	NC_017215	CAA	2	6	275625	275630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191657
5986	NC_017215	AGA	2	6	275664	275669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191657
5987	NC_017215	TCA	2	6	275672	275677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191657
5988	NC_017215	CA	3	6	275717	275722	50 %	0 %	0 %	50 %	384191657
5989	NC_017215	ACG	2	6	275939	275944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191657
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5993	NC_017215	AAT	2	6	276015	276020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384191657
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5997	NC_017215	CTC	3	9	276333	276341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384191658
5998	NC_017215	GTC	2	6	276393	276398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191658
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