MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT9547

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017212	TCT	2	6	50	55	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189579
2	NC_017212	TAG	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189579
3	NC_017212	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189579
4	NC_017212	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189579
5	NC_017212	A	6	6	379	384	100 %	0 %	0 %	0 %	384189579
6	NC_017212	GT	3	6	396	401	0 %	50 %	50 %	0 %	384189579
7	NC_017212	ATA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189579
8	NC_017212	TATC	2	8	477	484	25 %	50 %	0 %	25 %	384189579
9	NC_017212	ATGA	2	8	488	495	50 %	25 %	25 %	0 %	384189579
10	NC_017212	TAT	2	6	520	525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189579
11	NC_017212	AGG	2	6	538	543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189579
12	NC_017212	AAC	2	6	546	551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189579
13	NC_017212	ATCG	2	8	602	609	25 %	25 %	25 %	25 %	384189579
14	NC_017212	TACAG	2	10	617	626	40 %	20 %	20 %	20 %	384189579
15	NC_017212	TTA	2	6	648	653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189579
16	NC_017212	GTC	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189579
17	NC_017212	TTA	2	6	717	722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189579
18	NC_017212	CTT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189579
19	NC_017212	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189579
20	NC_017212	A	6	6	859	864	100 %	0 %	0 %	0 %	384189579
21	NC_017212	CTGG	2	8	1086	1093	0 %	25 %	50 %	25 %	384189580
22	NC_017212	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
23	NC_017212	TCT	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
24	NC_017212	TTA	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
25	NC_017212	CAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189580
26	NC_017212	AAT	2	6	1310	1315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189580
27	NC_017212	TTC	2	6	1368	1373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
28	NC_017212	TATG	2	8	1378	1385	25 %	50 %	25 %	0 %	384189580
29	NC_017212	AAGCA	2	10	1407	1416	60 %	0 %	20 %	20 %	384189580
30	NC_017212	GTATA	2	10	1435	1444	40 %	40 %	20 %	0 %	384189580
31	NC_017212	A	6	6	1602	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	384189580
32	NC_017212	ATG	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
33	NC_017212	CAAA	2	8	1811	1818	75 %	0 %	0 %	25 %	384189580
34	NC_017212	A	6	6	1823	1828	100 %	0 %	0 %	0 %	384189580
35	NC_017212	AGCA	2	8	1845	1852	50 %	0 %	25 %	25 %	384189580
36	NC_017212	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	384189580
37	NC_017212	TTA	2	6	1887	1892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
38	NC_017212	GAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
39	NC_017212	AAC	2	6	2001	2006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189580
40	NC_017212	TTA	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
41	NC_017212	CGA	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189580
42	NC_017212	TGAAT	2	10	2155	2164	40 %	40 %	20 %	0 %	384189580
43	NC_017212	ATG	3	9	2238	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
44	NC_017212	TAT	2	6	2267	2272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
45	NC_017212	CAT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
46	NC_017212	TGA	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
47	NC_017212	ATG	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
48	NC_017212	TA	3	6	2441	2446	50 %	50 %	0 %	0 %	384189580
49	NC_017212	A	6	6	2491	2496	100 %	0 %	0 %	0 %	384189580
50	NC_017212	AGA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
51	NC_017212	CTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
52	NC_017212	CAAT	2	8	2692	2699	50 %	25 %	0 %	25 %	384189580
53	NC_017212	ATG	3	9	2838	2846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189580
54	NC_017212	ATC	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
55	NC_017212	CTT	3	9	2925	2933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
56	NC_017212	TAC	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
57	NC_017212	CTT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189580
58	NC_017212	CAT	2	6	3113	3118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189580
59	NC_017212	GAA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
60	NC_017212	AC	3	6	3188	3193	50 %	0 %	0 %	50 %	384189580
61	NC_017212	TTG	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189580
62	NC_017212	CTC	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189580
63	NC_017212	T	6	6	3246	3251	0 %	100 %	0 %	0 %	384189580
64	NC_017212	TGG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189580
65	NC_017212	AGA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
66	NC_017212	TAA	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189580
67	NC_017212	TAA	2	6	3496	3501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189580
68	NC_017212	TAAA	2	8	3531	3538	75 %	25 %	0 %	0 %	384189580
69	NC_017212	CAAT	2	8	3546	3553	50 %	25 %	0 %	25 %	384189580
70	NC_017212	T	6	6	3572	3577	0 %	100 %	0 %	0 %	384189580
71	NC_017212	ATT	2	6	3647	3652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189580
72	NC_017212	GT	3	6	3663	3668	0 %	50 %	50 %	0 %	384189580
73	NC_017212	TA	3	6	3678	3683	50 %	50 %	0 %	0 %	384189580
74	NC_017212	AGA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
75	NC_017212	AGA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189580
76	NC_017212	GAACCA	2	12	4157	4168	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384189581
77	NC_017212	T	7	7	4211	4217	0 %	100 %	0 %	0 %	384189581
78	NC_017212	TAAA	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	384189581
79	NC_017212	AGT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189581
80	NC_017212	TTG	2	6	4402	4407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189581
81	NC_017212	CTA	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189581
82	NC_017212	CTG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189581
83	NC_017212	AT	3	6	4509	4514	50 %	50 %	0 %	0 %	384189581
84	NC_017212	TCA	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189581
85	NC_017212	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189581
86	NC_017212	CATT	2	8	4619	4626	25 %	50 %	0 %	25 %	384189581
87	NC_017212	AT	3	6	4672	4677	50 %	50 %	0 %	0 %	384189581
88	NC_017212	TTC	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189581
89	NC_017212	CATT	2	8	4709	4716	25 %	50 %	0 %	25 %	384189581
90	NC_017212	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189581
91	NC_017212	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189581
92	NC_017212	CAG	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189581
93	NC_017212	A	6	6	4828	4833	100 %	0 %	0 %	0 %	384189581
94	NC_017212	TAAT	2	8	4851	4858	50 %	50 %	0 %	0 %	384189581
95	NC_017212	T	6	6	4861	4866	0 %	100 %	0 %	0 %	384189581
96	NC_017212	A	6	6	5435	5440	100 %	0 %	0 %	0 %	384189582
97	NC_017212	T	6	6	5454	5459	0 %	100 %	0 %	0 %	384189582
98	NC_017212	ATAA	2	8	5479	5486	75 %	25 %	0 %	0 %	384189582
99	NC_017212	GTT	2	6	5497	5502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189582
100	NC_017212	ATA	2	6	5530	5535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189582
101	NC_017212	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189582
102	NC_017212	GAAT	2	8	5710	5717	50 %	25 %	25 %	0 %	384189582
103	NC_017212	TACAA	2	10	5724	5733	60 %	20 %	0 %	20 %	384189582
104	NC_017212	TTC	2	6	5781	5786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189582
105	NC_017212	A	6	6	5793	5798	100 %	0 %	0 %	0 %	384189582
106	NC_017212	ACTTT	2	10	5846	5855	20 %	60 %	0 %	20 %	384189582
107	NC_017212	CTT	2	6	7289	7294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
108	NC_017212	TAA	2	6	7356	7361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189583
109	NC_017212	T	6	6	7396	7401	0 %	100 %	0 %	0 %	384189583
110	NC_017212	TTTA	2	8	7483	7490	25 %	75 %	0 %	0 %	384189583
111	NC_017212	CTT	2	6	7491	7496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
112	NC_017212	ATT	2	6	7537	7542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189583
113	NC_017212	TCT	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
114	NC_017212	TAT	2	6	7569	7574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189583
115	NC_017212	TCT	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
116	NC_017212	T	6	6	7633	7638	0 %	100 %	0 %	0 %	384189583
117	NC_017212	TC	3	6	7673	7678	0 %	50 %	0 %	50 %	384189583
118	NC_017212	TCT	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
119	NC_017212	GTT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189583
120	NC_017212	TCT	2	6	7769	7774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
121	NC_017212	TTTCT	2	10	7837	7846	0 %	80 %	0 %	20 %	384189583
122	NC_017212	T	7	7	7851	7857	0 %	100 %	0 %	0 %	384189583
123	NC_017212	TTG	2	6	7873	7878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189583
124	NC_017212	T	6	6	7884	7889	0 %	100 %	0 %	0 %	384189583
125	NC_017212	TGT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189583
126	NC_017212	ACT	2	6	7952	7957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189583
127	NC_017212	ACTTCT	2	12	7997	8008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384189583
128	NC_017212	T	6	6	8047	8052	0 %	100 %	0 %	0 %	384189583
129	NC_017212	TCT	2	6	8171	8176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
130	NC_017212	GTG	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189583
131	NC_017212	TTTG	2	8	8247	8254	0 %	75 %	25 %	0 %	384189583
132	NC_017212	TTC	2	6	8305	8310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189583
133	NC_017212	AATG	2	8	8318	8325	50 %	25 %	25 %	0 %	384189583
134	NC_017212	TAC	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189583
135	NC_017212	T	6	6	8439	8444	0 %	100 %	0 %	0 %	384189583
136	NC_017212	CAA	2	6	8452	8457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189583
137	NC_017212	AAT	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189583

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.