MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8252

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017211	T	7	7	429	435	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
2	NC_017211	AT	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	384183666
3	NC_017211	T	6	6	467	472	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
4	NC_017211	T	7	7	477	483	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
5	NC_017211	T	8	8	510	517	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
6	NC_017211	TTA	2	6	561	566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183666
7	NC_017211	TA	3	6	649	654	50 %	50 %	0 %	0 %	384183666
8	NC_017211	A	6	6	680	685	100 %	0 %	0 %	0 %	384183666
9	NC_017211	AG	3	6	1035	1040	50 %	0 %	50 %	0 %	384183667
10	NC_017211	TC	3	6	1068	1073	0 %	50 %	0 %	50 %	384183667
11	NC_017211	TTA	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183667
12	NC_017211	AATA	2	8	1189	1196	75 %	25 %	0 %	0 %	384183667
13	NC_017211	TTTG	2	8	1204	1211	0 %	75 %	25 %	0 %	384183667
14	NC_017211	T	6	6	1223	1228	0 %	100 %	0 %	0 %	384183667
15	NC_017211	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	384183668
16	NC_017211	AGT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183668
17	NC_017211	GTC	2	6	2079	2084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183668
18	NC_017211	AT	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	384183668
19	NC_017211	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183668
20	NC_017211	AAT	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183668
21	NC_017211	AAAG	2	8	3501	3508	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
22	NC_017211	ATT	2	6	3525	3530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183669
23	NC_017211	GAAC	2	8	3534	3541	50 %	0 %	25 %	25 %	384183669
24	NC_017211	AAAAG	2	10	3570	3579	80 %	0 %	20 %	0 %	384183669
25	NC_017211	AAT	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183669
26	NC_017211	TGT	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183669
27	NC_017211	TTG	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183669
28	NC_017211	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
29	NC_017211	TGTT	2	8	3743	3750	0 %	75 %	25 %	0 %	384183669
30	NC_017211	T	6	6	3749	3754	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
31	NC_017211	GAGAA	2	10	3769	3778	60 %	0 %	40 %	0 %	384183669
32	NC_017211	A	6	6	3808	3813	100 %	0 %	0 %	0 %	384183669
33	NC_017211	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
34	NC_017211	GAAA	2	8	3932	3939	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
35	NC_017211	AG	3	6	3953	3958	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
36	NC_017211	CAA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183669
37	NC_017211	AGAA	2	8	4048	4055	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
38	NC_017211	ATAG	2	8	4056	4063	50 %	25 %	25 %	0 %	384183669
39	NC_017211	GATT	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	384183669
40	NC_017211	AGA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
41	NC_017211	TCT	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183669
42	NC_017211	AAGATT	2	12	4251	4262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183669
43	NC_017211	GAT	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
44	NC_017211	TA	3	6	4282	4287	50 %	50 %	0 %	0 %	384183669
45	NC_017211	T	6	6	4298	4303	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
46	NC_017211	AG	3	6	4329	4334	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
47	NC_017211	GAAG	2	8	4346	4353	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
48	NC_017211	GAT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
49	NC_017211	TGA	3	9	4499	4507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
50	NC_017211	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
51	NC_017211	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183669
52	NC_017211	GAA	2	6	4582	4587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
53	NC_017211	GA	3	6	4617	4622	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
54	NC_017211	ATT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183670
55	NC_017211	ATT	2	6	4661	4666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183670
56	NC_017211	AAT	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183670
57	NC_017211	TGA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183670
58	NC_017211	ATGA	2	8	4831	4838	50 %	25 %	25 %	0 %	384183670
59	NC_017211	GAT	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183670
60	NC_017211	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183670
61	NC_017211	T	7	7	5638	5644	0 %	100 %	0 %	0 %	384183671
62	NC_017211	T	7	7	5648	5654	0 %	100 %	0 %	0 %	384183671
63	NC_017211	TTC	2	6	5672	5677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183671
64	NC_017211	AGT	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183671
65	NC_017211	T	6	6	5788	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	384183671
66	NC_017211	ATGA	2	8	6290	6297	50 %	25 %	25 %	0 %	384183672
67	NC_017211	TTG	2	6	6345	6350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183672
68	NC_017211	AAG	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183672
69	NC_017211	A	6	6	6371	6376	100 %	0 %	0 %	0 %	384183672
70	NC_017211	GAA	2	6	6455	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183672
71	NC_017211	A	6	6	6515	6520	100 %	0 %	0 %	0 %	384183672
72	NC_017211	AATT	2	8	6540	6547	50 %	50 %	0 %	0 %	384183672
73	NC_017211	GATTA	2	10	6556	6565	40 %	40 %	20 %	0 %	384183672
74	NC_017211	GAA	2	6	6586	6591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183672
75	NC_017211	GTTT	2	8	6639	6646	0 %	75 %	25 %	0 %	384183672
76	NC_017211	TGA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183672
77	NC_017211	GA	3	6	6731	6736	50 %	0 %	50 %	0 %	384183672
78	NC_017211	GTT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183672
79	NC_017211	A	6	6	7291	7296	100 %	0 %	0 %	0 %	384183673
80	NC_017211	TGAG	2	8	7297	7304	25 %	25 %	50 %	0 %	384183673
81	NC_017211	GTA	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183673
82	NC_017211	GAT	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183673
83	NC_017211	AAAG	2	8	7493	7500	75 %	0 %	25 %	0 %	384183673
84	NC_017211	T	7	7	7507	7513	0 %	100 %	0 %	0 %	384183673
85	NC_017211	GAC	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183673
86	NC_017211	TAA	2	6	7583	7588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183673
87	NC_017211	ATT	2	6	7589	7594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673
88	NC_017211	GAA	2	6	7677	7682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183673
89	NC_017211	AAT	2	6	7692	7697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183673
90	NC_017211	ATT	2	6	7807	7812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673
91	NC_017211	AAG	2	6	7840	7845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183673
92	NC_017211	TTTA	2	8	8008	8015	25 %	75 %	0 %	0 %	384183673
93	NC_017211	AATT	2	8	8032	8039	50 %	50 %	0 %	0 %	384183673
94	NC_017211	TGG	2	6	8045	8050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183673
95	NC_017211	A	6	6	8070	8075	100 %	0 %	0 %	0 %	384183673
96	NC_017211	TAT	3	9	8124	8132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673
97	NC_017211	TGAT	2	8	8227	8234	25 %	50 %	25 %	0 %	384183673

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.