MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 chromosome

Total Repeats: 3862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017208	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	384184089
2	NC_017208	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	384184090
3	NC_017208	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	384184090
4	NC_017208	ATTAA	2	10	5082	5091	60 %	40 %	0 %	0 %	384184093
5	NC_017208	CCAGC	2	10	6159	6168	20 %	0 %	20 %	60 %	384184093
6	NC_017208	AAAAC	2	10	7521	7530	80 %	0 %	0 %	20 %	384184094
7	NC_017208	TAGGT	2	10	14254	14263	20 %	40 %	40 %	0 %	384184095
8	NC_017208	TAAAG	2	10	15613	15622	60 %	20 %	20 %	0 %	384184096
9	NC_017208	ATGCT	2	10	16050	16059	20 %	40 %	20 %	20 %	384184096
10	NC_017208	AAATT	2	10	23364	23373	60 %	40 %	0 %	0 %	384184103
11	NC_017208	ATTTT	2	10	23780	23789	20 %	80 %	0 %	0 %	384184104
12	NC_017208	AAGCG	2	10	26683	26692	40 %	0 %	40 %	20 %	384184106
13	NC_017208	TGAAG	2	10	27273	27282	40 %	20 %	40 %	0 %	384184107
14	NC_017208	TTGGC	2	10	36230	36239	0 %	40 %	40 %	20 %	384184113
15	NC_017208	GTATT	2	10	36353	36362	20 %	60 %	20 %	0 %	384184113
16	NC_017208	ATTGT	2	10	40294	40303	20 %	60 %	20 %	0 %	384184119
17	NC_017208	TGGAT	2	10	42372	42381	20 %	40 %	40 %	0 %	384184121
18	NC_017208	TGACA	2	10	43741	43750	40 %	20 %	20 %	20 %	384184122
19	NC_017208	GAAAC	2	10	47670	47679	60 %	0 %	20 %	20 %	384184127
20	NC_017208	AAGAC	2	10	47941	47950	60 %	0 %	20 %	20 %	384184128
21	NC_017208	GATTT	2	10	59268	59277	20 %	60 %	20 %	0 %	384184138
22	NC_017208	TATTT	2	10	59827	59836	20 %	80 %	0 %	0 %	384184138
23	NC_017208	TTGGA	2	10	62508	62517	20 %	40 %	40 %	0 %	384184142
24	NC_017208	TTATG	2	10	64830	64839	20 %	60 %	20 %	0 %	384184145
25	NC_017208	GGAAA	3	15	65154	65168	60 %	0 %	40 %	0 %	384184145
26	NC_017208	TCAAT	2	10	66608	66617	40 %	40 %	0 %	20 %	384184145
27	NC_017208	AATGA	2	10	68736	68745	60 %	20 %	20 %	0 %	384184147
28	NC_017208	GATTA	2	10	69211	69220	40 %	40 %	20 %	0 %	384184147
29	NC_017208	GGAAC	2	10	72605	72614	40 %	0 %	40 %	20 %	384184150
30	NC_017208	AAGGG	2	10	74597	74606	40 %	0 %	60 %	0 %	384184152
31	NC_017208	AAAAG	2	10	74862	74871	80 %	0 %	20 %	0 %	384184152
32	NC_017208	AGAGC	2	10	75352	75361	40 %	0 %	40 %	20 %	384184152
33	NC_017208	ATTTA	2	10	75875	75884	40 %	60 %	0 %	0 %	384184153
34	NC_017208	TGATG	2	10	76621	76630	20 %	40 %	40 %	0 %	384184154
35	NC_017208	GGTAA	2	10	78119	78128	40 %	20 %	40 %	0 %	384184155
36	NC_017208	AAAAC	2	10	78895	78904	80 %	0 %	0 %	20 %	384184157
37	NC_017208	AAATA	2	10	79541	79550	80 %	20 %	0 %	0 %	384184159
38	NC_017208	GTTAT	2	10	81767	81776	20 %	60 %	20 %	0 %	384184160
39	NC_017208	TCCAT	2	10	88132	88141	20 %	40 %	0 %	40 %	384184161
40	NC_017208	TCAAA	2	10	98199	98208	60 %	20 %	0 %	20 %	384184165
41	NC_017208	GAACA	2	10	98705	98714	60 %	0 %	20 %	20 %	384184166
42	NC_017208	GAACA	2	10	98927	98936	60 %	0 %	20 %	20 %	384184166
43	NC_017208	TGAAG	2	10	99867	99876	40 %	20 %	40 %	0 %	384184166
44	NC_017208	GAAAA	2	10	99890	99899	80 %	0 %	20 %	0 %	384184166
45	NC_017208	GAAAA	2	10	100013	100022	80 %	0 %	20 %	0 %	384184166
46	NC_017208	CGTAT	2	10	101887	101896	20 %	40 %	20 %	20 %	384184167
47	NC_017208	TGAAA	2	10	101948	101957	60 %	20 %	20 %	0 %	384184167
48	NC_017208	GTAAT	2	10	102913	102922	40 %	40 %	20 %	0 %	384184168
49	NC_017208	CATTC	2	10	106771	106780	20 %	40 %	0 %	40 %	384184172
50	NC_017208	GAAAA	2	10	107659	107668	80 %	0 %	20 %	0 %	384184172
51	NC_017208	GAAAA	2	10	113348	113357	80 %	0 %	20 %	0 %	384184181
52	NC_017208	GAAAA	2	10	113364	113373	80 %	0 %	20 %	0 %	384184181
53	NC_017208	AGAAA	2	10	116983	116992	80 %	0 %	20 %	0 %	384184186
54	NC_017208	TAACG	2	10	122525	122534	40 %	20 %	20 %	20 %	384184188
55	NC_017208	CAATC	2	10	123059	123068	40 %	20 %	0 %	40 %	384184188
56	NC_017208	AACAT	2	10	124767	124776	60 %	20 %	0 %	20 %	384184189
57	NC_017208	ACGTG	2	10	125457	125466	20 %	20 %	40 %	20 %	384184191
58	NC_017208	TCGTA	2	10	126493	126502	20 %	40 %	20 %	20 %	384184192
59	NC_017208	TGGTA	2	10	133581	133590	20 %	40 %	40 %	0 %	384184202
60	NC_017208	GTGCG	2	10	140820	140829	0 %	20 %	60 %	20 %	384184217
61	NC_017208	GAAAT	2	10	145445	145454	60 %	20 %	20 %	0 %	384184225
62	NC_017208	GAGCA	2	10	148459	148468	40 %	0 %	40 %	20 %	384184229
63	NC_017208	AAAAG	2	10	149123	149132	80 %	0 %	20 %	0 %	384184231
64	NC_017208	GATAA	2	10	150942	150951	60 %	20 %	20 %	0 %	384184233
65	NC_017208	CTTGG	2	10	151777	151786	0 %	40 %	40 %	20 %	384184234
66	NC_017208	ATGTG	2	10	161051	161060	20 %	40 %	40 %	0 %	384184238
67	NC_017208	CAAAA	2	10	165010	165019	80 %	0 %	0 %	20 %	384184241
68	NC_017208	ATTAC	2	10	166272	166281	40 %	40 %	0 %	20 %	384184243
69	NC_017208	AAGTA	2	10	167342	167351	60 %	20 %	20 %	0 %	384184244
70	NC_017208	ACAGC	2	10	168312	168321	40 %	0 %	20 %	40 %	384184244
71	NC_017208	CGTAG	2	10	168507	168516	20 %	20 %	40 %	20 %	384184244
72	NC_017208	AGAAT	2	10	176256	176265	60 %	20 %	20 %	0 %	384184251
73	NC_017208	TTCAC	2	10	177033	177042	20 %	40 %	0 %	40 %	384184252
74	NC_017208	TGCTT	2	10	181467	181476	0 %	60 %	20 %	20 %	384184256
75	NC_017208	TCTAT	2	10	181712	181721	20 %	60 %	0 %	20 %	384184256
76	NC_017208	AAAGG	2	10	182747	182756	60 %	0 %	40 %	0 %	384184257
77	NC_017208	AAAAG	2	10	185900	185909	80 %	0 %	20 %	0 %	384184260
78	NC_017208	TTTTA	2	10	187263	187272	20 %	80 %	0 %	0 %	384184262
79	NC_017208	ATCTT	2	10	188743	188752	20 %	60 %	0 %	20 %	384184263
80	NC_017208	AACGT	2	10	188758	188767	40 %	20 %	20 %	20 %	384184263
81	NC_017208	ATGGG	2	10	191830	191839	20 %	20 %	60 %	0 %	384184266
82	NC_017208	TATTT	2	10	192164	192173	20 %	80 %	0 %	0 %	384184267
83	NC_017208	AGTTT	2	10	192483	192492	20 %	60 %	20 %	0 %	384184267
84	NC_017208	TATTG	2	10	192925	192934	20 %	60 %	20 %	0 %	384184268
85	NC_017208	TAAAT	2	10	194063	194072	60 %	40 %	0 %	0 %	384184269
86	NC_017208	TTTGT	2	10	195834	195843	0 %	80 %	20 %	0 %	384184270
87	NC_017208	AAACC	2	10	197907	197916	60 %	0 %	0 %	40 %	384184271
88	NC_017208	TTGAT	2	10	198501	198510	20 %	60 %	20 %	0 %	384184272
89	NC_017208	TTTTA	2	10	199310	199319	20 %	80 %	0 %	0 %	384184273
90	NC_017208	GTTTT	2	10	199760	199769	0 %	80 %	20 %	0 %	384184274
91	NC_017208	GATAT	2	10	203356	203365	40 %	40 %	20 %	0 %	384184278
92	NC_017208	TACCT	2	10	203957	203966	20 %	40 %	0 %	40 %	384184279
93	NC_017208	TAATT	2	10	204609	204618	40 %	60 %	0 %	0 %	384184279
94	NC_017208	ATTTT	2	10	204923	204932	20 %	80 %	0 %	0 %	384184280
95	NC_017208	ATTGT	2	10	204969	204978	20 %	60 %	20 %	0 %	384184280
96	NC_017208	AGCTG	2	10	205898	205907	20 %	20 %	40 %	20 %	384184281
97	NC_017208	AATCA	2	10	207029	207038	60 %	20 %	0 %	20 %	384184282
98	NC_017208	AAAAG	2	10	207612	207621	80 %	0 %	20 %	0 %	384184283
99	NC_017208	AAAAC	2	10	207852	207861	80 %	0 %	0 %	20 %	384184283
100	NC_017208	GTTAA	2	10	209844	209853	40 %	40 %	20 %	0 %	384184284
101	NC_017208	GAAGA	2	10	211219	211228	60 %	0 %	40 %	0 %	384184287
102	NC_017208	GTTTC	2	10	213425	213434	0 %	60 %	20 %	20 %	384184288
103	NC_017208	TTTTA	2	10	217533	217542	20 %	80 %	0 %	0 %	384184292
104	NC_017208	AAAAG	2	10	219178	219187	80 %	0 %	20 %	0 %	384184293
105	NC_017208	TGGAT	2	10	219500	219509	20 %	40 %	40 %	0 %	384184293
106	NC_017208	TTATT	2	10	220624	220633	20 %	80 %	0 %	0 %	384184293
107	NC_017208	AATTA	2	10	221297	221306	60 %	40 %	0 %	0 %	384184294
108	NC_017208	ATTAC	2	10	221580	221589	40 %	40 %	0 %	20 %	384184294
109	NC_017208	TATTC	2	10	223561	223570	20 %	60 %	0 %	20 %	384184296
110	NC_017208	GAAGT	2	10	223944	223953	40 %	20 %	40 %	0 %	384184297
111	NC_017208	TATTC	2	10	226428	226437	20 %	60 %	0 %	20 %	384184300
112	NC_017208	GAAAG	2	10	228623	228632	60 %	0 %	40 %	0 %	384184302
113	NC_017208	GACGT	2	10	228810	228819	20 %	20 %	40 %	20 %	384184302
114	NC_017208	GGATG	2	10	229696	229705	20 %	20 %	60 %	0 %	384184303
115	NC_017208	AAATT	2	10	233437	233446	60 %	40 %	0 %	0 %	384184307
116	NC_017208	CTGCA	2	10	234850	234859	20 %	20 %	20 %	40 %	384184308
117	NC_017208	AAGAA	2	10	236928	236937	80 %	0 %	20 %	0 %	384184309
118	NC_017208	GACAT	2	10	238125	238134	40 %	20 %	20 %	20 %	384184310
119	NC_017208	CTTTA	2	10	240812	240821	20 %	60 %	0 %	20 %	384184313
120	NC_017208	ACGTT	2	10	241782	241791	20 %	40 %	20 %	20 %	384184314
121	NC_017208	GATAT	2	10	254222	254231	40 %	40 %	20 %	0 %	384184322
122	NC_017208	TAATT	2	10	256395	256404	40 %	60 %	0 %	0 %	384184324
123	NC_017208	CATTT	2	10	256481	256490	20 %	60 %	0 %	20 %	384184324
124	NC_017208	AACTC	2	10	261789	261798	40 %	20 %	0 %	40 %	384184329
125	NC_017208	AAGAG	2	10	263778	263787	60 %	0 %	40 %	0 %	384184331
126	NC_017208	AACTT	2	10	264361	264370	40 %	40 %	0 %	20 %	384184332
127	NC_017208	GCGTA	2	10	266489	266498	20 %	20 %	40 %	20 %	384184333
128	NC_017208	GGCGT	2	10	267801	267810	0 %	20 %	60 %	20 %	384184334
129	NC_017208	TTATT	2	10	277995	278004	20 %	80 %	0 %	0 %	384184338
130	NC_017208	GAACA	2	10	284835	284844	60 %	0 %	20 %	20 %	384184340
131	NC_017208	TTATT	2	10	285842	285851	20 %	80 %	0 %	0 %	384184341
132	NC_017208	ACTTT	2	10	287640	287649	20 %	60 %	0 %	20 %	384184343
133	NC_017208	GATAA	2	10	290796	290805	60 %	20 %	20 %	0 %	384184346
134	NC_017208	GAATT	2	10	290811	290820	40 %	40 %	20 %	0 %	384184346
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