MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	ATTTTT	2	12	1392	1403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384189675
2	NC_017206	TGTATA	2	12	3527	3538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189676
3	NC_017206	GAAAAT	2	12	8870	8881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384189682
4	NC_017206	CAAGAG	2	12	9927	9938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384189683
5	NC_017206	TATTAA	2	12	13902	13913	50 %	50 %	0 %	0 %	384189687
6	NC_017206	ATTTTC	2	12	18052	18063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384189693
7	NC_017206	AATTTA	2	12	18635	18646	50 %	50 %	0 %	0 %	384189695
8	NC_017206	TAAACA	2	12	19410	19421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384189697
9	NC_017206	AAGAAA	2	12	24406	24417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384189703
10	NC_017206	CAGTAT	2	12	29214	29225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384189707
11	NC_017206	AATTCA	2	12	33188	33199	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384189712
12	NC_017206	TTAAAA	2	12	36856	36867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189718
13	NC_017206	AAGTTA	2	12	38040	38051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384189719
14	NC_017206	TATCTG	2	12	38274	38285	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384189719
15	NC_017206	TTAGAA	2	12	40520	40531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384189719
16	NC_017206	ATCCCA	2	12	44575	44586	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384189725
17	NC_017206	CCATAT	2	12	48431	48442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189729
18	NC_017206	CCTAAT	2	12	52691	52702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189734
19	NC_017206	GATATT	2	12	53072	53083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189734
20	NC_017206	TTATAT	2	12	54117	54128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189736
21	NC_017206	TATTTA	2	12	59828	59839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189743
22	NC_017206	TTTATC	2	12	59913	59924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384189743
23	NC_017206	TCAAAT	2	12	60091	60102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384189743
24	NC_017206	ACTTGT	2	12	60343	60354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384189743
25	NC_017206	TTTCTT	2	12	64549	64560	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384189750
26	NC_017206	CTTCCT	2	12	66176	66187	0 %	50 %	0 %	50 %	384189752
27	NC_017206	ATGAAC	2	12	67850	67861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384189753
28	NC_017206	TTCCAT	2	12	76614	76625	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384189763
29	NC_017206	AATCCA	2	12	77937	77948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384189764

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.