MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	AATT	2	8	1178	1185	50 %	50 %	0 %	0 %	384183358
2	NC_017201	AGTG	2	8	1323	1330	25 %	25 %	50 %	0 %	384183358
3	NC_017201	TCTT	2	8	2625	2632	0 %	75 %	0 %	25 %	384183362
4	NC_017201	TCCA	2	8	4475	4482	25 %	25 %	0 %	50 %	384183364
5	NC_017201	ATTA	2	8	5433	5440	50 %	50 %	0 %	0 %	384183365
6	NC_017201	AAAC	2	8	5563	5570	75 %	0 %	0 %	25 %	384183365
7	NC_017201	TCAT	2	8	6664	6671	25 %	50 %	0 %	25 %	384183366
8	NC_017201	TACT	2	8	10708	10715	25 %	50 %	0 %	25 %	384183369
9	NC_017201	GATA	2	8	10768	10775	50 %	25 %	25 %	0 %	384183369
10	NC_017201	TCAT	2	8	12022	12029	25 %	50 %	0 %	25 %	384183370
11	NC_017201	ATTT	2	8	12207	12214	25 %	75 %	0 %	0 %	384183370
12	NC_017201	GCAA	2	8	13439	13446	50 %	0 %	25 %	25 %	384183373
13	NC_017201	AAGA	2	8	13495	13502	75 %	0 %	25 %	0 %	384183373
14	NC_017201	ATTT	2	8	13899	13906	25 %	75 %	0 %	0 %	384183373
15	NC_017201	AGTA	2	8	14888	14895	50 %	25 %	25 %	0 %	384183375
16	NC_017201	GAAG	2	8	14946	14953	50 %	0 %	50 %	0 %	384183375
17	NC_017201	CCTT	2	8	14976	14983	0 %	50 %	0 %	50 %	384183375
18	NC_017201	AAAT	2	8	15129	15136	75 %	25 %	0 %	0 %	384183375
19	NC_017201	TATC	2	8	16179	16186	25 %	50 %	0 %	25 %	384183376
20	NC_017201	CTCC	2	8	16353	16360	0 %	25 %	0 %	75 %	384183376
21	NC_017201	ATTT	2	8	17380	17387	25 %	75 %	0 %	0 %	384183377
22	NC_017201	ATTA	2	8	17433	17440	50 %	50 %	0 %	0 %	384183377
23	NC_017201	CATT	2	8	17583	17590	25 %	50 %	0 %	25 %	384183378
24	NC_017201	TTAT	2	8	17613	17620	25 %	75 %	0 %	0 %	384183378
25	NC_017201	AGAT	2	8	17627	17634	50 %	25 %	25 %	0 %	384183378
26	NC_017201	AATT	2	8	18083	18090	50 %	50 %	0 %	0 %	384183378
27	NC_017201	AAGC	2	8	18133	18140	50 %	0 %	25 %	25 %	384183378
28	NC_017201	AATA	2	8	19166	19173	75 %	25 %	0 %	0 %	384183379
29	NC_017201	AATT	2	8	19368	19375	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
30	NC_017201	TTAA	2	8	20527	20534	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
31	NC_017201	TGTC	2	8	21732	21739	0 %	50 %	25 %	25 %	384183380
32	NC_017201	TCTT	2	8	22097	22104	0 %	75 %	0 %	25 %	384183380
33	NC_017201	TTTA	2	8	22730	22737	25 %	75 %	0 %	0 %	384183381
34	NC_017201	TTTA	2	8	22862	22869	25 %	75 %	0 %	0 %	384183381
35	NC_017201	ATAA	2	8	23231	23238	75 %	25 %	0 %	0 %	384183382
36	NC_017201	CATT	2	8	23300	23307	25 %	50 %	0 %	25 %	384183382
37	NC_017201	ACTT	2	8	23923	23930	25 %	50 %	0 %	25 %	384183383
38	NC_017201	CATC	2	8	23947	23954	25 %	25 %	0 %	50 %	384183383
39	NC_017201	TCTT	2	8	24971	24978	0 %	75 %	0 %	25 %	384183384
40	NC_017201	TTAA	2	8	25009	25016	50 %	50 %	0 %	0 %	384183384
41	NC_017201	TCAT	2	8	25045	25052	25 %	50 %	0 %	25 %	384183384
42	NC_017201	TATT	2	8	25319	25326	25 %	75 %	0 %	0 %	384183385
43	NC_017201	GGAG	2	8	26654	26661	25 %	0 %	75 %	0 %	384183388
44	NC_017201	AGAC	2	8	27080	27087	50 %	0 %	25 %	25 %	384183388
45	NC_017201	TTAC	2	8	27876	27883	25 %	50 %	0 %	25 %	384183390
46	NC_017201	TATT	2	8	28093	28100	25 %	75 %	0 %	0 %	384183390
47	NC_017201	AAAT	2	8	28932	28939	75 %	25 %	0 %	0 %	384183392
48	NC_017201	ATGA	2	8	29266	29273	50 %	25 %	25 %	0 %	384183393
49	NC_017201	TTTG	2	8	30135	30142	0 %	75 %	25 %	0 %	384183395
50	NC_017201	ACTT	2	8	30311	30318	25 %	50 %	0 %	25 %	384183395
51	NC_017201	TCTT	2	8	30511	30518	0 %	75 %	0 %	25 %	384183395
52	NC_017201	TTCA	2	8	30781	30788	25 %	50 %	0 %	25 %	384183396
53	NC_017201	CTGT	2	8	30791	30798	0 %	50 %	25 %	25 %	384183396
54	NC_017201	TATC	2	8	30861	30868	25 %	50 %	0 %	25 %	384183396
55	NC_017201	TTTA	2	8	31054	31061	25 %	75 %	0 %	0 %	384183396
56	NC_017201	CAAC	2	8	31151	31158	50 %	0 %	0 %	50 %	384183396
57	NC_017201	AATT	2	8	31408	31415	50 %	50 %	0 %	0 %	384183397
58	NC_017201	AAGT	2	8	31516	31523	50 %	25 %	25 %	0 %	384183397
59	NC_017201	AAAT	2	8	32192	32199	75 %	25 %	0 %	0 %	384183398
60	NC_017201	TAAA	2	8	34488	34495	75 %	25 %	0 %	0 %	384183402
61	NC_017201	GTTC	2	8	35000	35007	0 %	50 %	25 %	25 %	384183404
62	NC_017201	TTTG	2	8	35244	35251	0 %	75 %	25 %	0 %	384183404
63	NC_017201	ATTT	2	8	35685	35692	25 %	75 %	0 %	0 %	384183405
64	NC_017201	TAAT	2	8	36344	36351	50 %	50 %	0 %	0 %	384183406
65	NC_017201	GACA	2	8	37310	37317	50 %	0 %	25 %	25 %	384183407
66	NC_017201	CTAC	2	8	39287	39294	25 %	25 %	0 %	50 %	384183410
67	NC_017201	ATAA	2	8	39301	39308	75 %	25 %	0 %	0 %	384183410
68	NC_017201	ATTT	2	8	39438	39445	25 %	75 %	0 %	0 %	384183410
69	NC_017201	GAAA	2	8	39579	39586	75 %	0 %	25 %	0 %	384183410
70	NC_017201	TTCT	2	8	39711	39718	0 %	75 %	0 %	25 %	384183410
71	NC_017201	ATTT	2	8	40003	40010	25 %	75 %	0 %	0 %	384183411
72	NC_017201	ACAT	2	8	40230	40237	50 %	25 %	0 %	25 %	384183411
73	NC_017201	CGAT	2	8	40273	40280	25 %	25 %	25 %	25 %	384183411
74	NC_017201	TTTA	2	8	40303	40310	25 %	75 %	0 %	0 %	384183411
75	NC_017201	AAAG	2	8	40349	40356	75 %	0 %	25 %	0 %	384183411
76	NC_017201	TGAA	2	8	41247	41254	50 %	25 %	25 %	0 %	384183413
77	NC_017201	TCAA	2	8	41804	41811	50 %	25 %	0 %	25 %	384183413
78	NC_017201	TGAA	2	8	42237	42244	50 %	25 %	25 %	0 %	384183414
79	NC_017201	GTTA	2	8	42656	42663	25 %	50 %	25 %	0 %	384183414
80	NC_017201	TATT	2	8	43511	43518	25 %	75 %	0 %	0 %	384183414
81	NC_017201	GAAT	2	8	44698	44705	50 %	25 %	25 %	0 %	384183414
82	NC_017201	TCGT	2	8	44780	44787	0 %	50 %	25 %	25 %	384183414
83	NC_017201	TTTC	2	8	44878	44885	0 %	75 %	0 %	25 %	384183414
84	NC_017201	AAGC	2	8	45108	45115	50 %	0 %	25 %	25 %	384183414
85	NC_017201	ATTA	2	8	45730	45737	50 %	50 %	0 %	0 %	384183414
86	NC_017201	ATCA	2	8	45935	45942	50 %	25 %	0 %	25 %	384183415
87	NC_017201	AAAT	2	8	46391	46398	75 %	25 %	0 %	0 %	384183415
88	NC_017201	TTAA	2	8	46413	46420	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
89	NC_017201	TAAA	2	8	46441	46448	75 %	25 %	0 %	0 %	384183415
90	NC_017201	TCGT	2	8	47113	47120	0 %	50 %	25 %	25 %	384183415
91	NC_017201	ATGA	2	8	47939	47946	50 %	25 %	25 %	0 %	384183415
92	NC_017201	GGAA	2	8	48144	48151	50 %	0 %	50 %	0 %	384183415
93	NC_017201	CGAG	2	8	48306	48313	25 %	0 %	50 %	25 %	384183415
94	NC_017201	TTAA	2	8	48405	48412	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
95	NC_017201	TAAA	2	8	48945	48952	75 %	25 %	0 %	0 %	384183416
96	NC_017201	ATTT	2	8	49968	49975	25 %	75 %	0 %	0 %	384183417
97	NC_017201	ACAT	2	8	50195	50202	50 %	25 %	0 %	25 %	384183417
98	NC_017201	CGAT	2	8	50238	50245	25 %	25 %	25 %	25 %	384183417
99	NC_017201	TTTA	2	8	50268	50275	25 %	75 %	0 %	0 %	384183417
100	NC_017201	AAAG	2	8	50314	50321	75 %	0 %	25 %	0 %	384183417
101	NC_017201	GATT	2	8	51588	51595	25 %	50 %	25 %	0 %	384183419
102	NC_017201	AGCC	2	8	51656	51663	25 %	0 %	25 %	50 %	384183419
103	NC_017201	TTCT	2	8	51664	51671	0 %	75 %	0 %	25 %	384183419
104	NC_017201	CTTA	2	8	52241	52248	25 %	50 %	0 %	25 %	384183419
105	NC_017201	CAAT	2	8	53518	53525	50 %	25 %	0 %	25 %	384183419
106	NC_017201	TAAT	2	8	53906	53913	50 %	50 %	0 %	0 %	384183420
107	NC_017201	CTAT	2	8	53977	53984	25 %	50 %	0 %	25 %	384183420
108	NC_017201	TCTT	2	8	54054	54061	0 %	75 %	0 %	25 %	384183420
109	NC_017201	CTTT	2	8	54083	54090	0 %	75 %	0 %	25 %	384183420
110	NC_017201	TTTA	2	8	54177	54184	25 %	75 %	0 %	0 %	384183420
111	NC_017201	GTTT	2	8	54271	54278	0 %	75 %	25 %	0 %	384183420
112	NC_017201	TATT	2	8	54346	54353	25 %	75 %	0 %	0 %	384183420
113	NC_017201	ACTT	2	8	54398	54405	25 %	50 %	0 %	25 %	384183420
114	NC_017201	TCTT	2	8	54723	54730	0 %	75 %	0 %	25 %	384183420
115	NC_017201	CGAT	2	8	54763	54770	25 %	25 %	25 %	25 %	384183420
116	NC_017201	TCCT	2	8	55005	55012	0 %	50 %	0 %	50 %	384183420
117	NC_017201	TAAA	2	8	55034	55041	75 %	25 %	0 %	0 %	384183420
118	NC_017201	CCTA	2	8	55506	55513	25 %	25 %	0 %	50 %	384183421
119	NC_017201	ATCT	2	8	56274	56281	25 %	50 %	0 %	25 %	384183421
120	NC_017201	AAAG	2	8	56761	56768	75 %	0 %	25 %	0 %	384183421
121	NC_017201	AATT	2	8	57170	57177	50 %	50 %	0 %	0 %	384183422
122	NC_017201	AAAT	2	8	57192	57199	75 %	25 %	0 %	0 %	384183422
123	NC_017201	ATAA	2	8	57409	57416	75 %	25 %	0 %	0 %	384183422
124	NC_017201	TAAT	2	8	57429	57436	50 %	50 %	0 %	0 %	384183422
125	NC_017201	AATA	2	8	57710	57717	75 %	25 %	0 %	0 %	384183423
126	NC_017201	TCTT	2	8	58190	58197	0 %	75 %	0 %	25 %	384183424
127	NC_017201	TTTC	2	8	59739	59746	0 %	75 %	0 %	25 %	384183426
128	NC_017201	ACAA	2	8	61016	61023	75 %	0 %	0 %	25 %	384183428
129	NC_017201	CATT	2	8	61839	61846	25 %	50 %	0 %	25 %	384183428
130	NC_017201	TTTA	2	8	62162	62169	25 %	75 %	0 %	0 %	384183428
131	NC_017201	CTAT	2	8	62466	62473	25 %	50 %	0 %	25 %	384183428
132	NC_017201	TGAT	2	8	62616	62623	25 %	50 %	25 %	0 %	384183428
133	NC_017201	TAAA	2	8	62880	62887	75 %	25 %	0 %	0 %	384183429
134	NC_017201	TTCC	2	8	64489	64496	0 %	50 %	0 %	50 %	384183431
135	NC_017201	GCTT	2	8	64951	64958	0 %	50 %	25 %	25 %	384183432
136	NC_017201	AAGA	2	8	66229	66236	75 %	0 %	25 %	0 %	384183434
137	NC_017201	GTTA	2	8	66357	66364	25 %	50 %	25 %	0 %	384183434
138	NC_017201	TCTG	2	8	67097	67104	0 %	50 %	25 %	25 %	384183435
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410	NC_017201	TTTG	2	8	186249	186256	0 %	75 %	25 %	0 %	384183547
411	NC_017201	CAAA	2	8	186493	186500	75 %	0 %	0 %	25 %	384183547
412	NC_017201	GAAT	2	8	186693	186700	50 %	25 %	25 %	0 %	384183547

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.