MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 chromosome

Total Repeats: 2141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017200	AAAGGC	2	12	1268	1279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384177911
2	NC_017200	TCTTTG	2	12	3656	3667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384177914
3	NC_017200	TGAAGA	2	12	8083	8094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384177916
4	NC_017200	ATTCTT	2	12	8431	8442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384177916
5	NC_017200	CATTTG	2	12	14818	14829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384177917
6	NC_017200	GGCAAT	2	12	17419	17430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177919
7	NC_017200	GAACTG	2	12	17749	17760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177919
8	NC_017200	CAGGAA	2	12	18977	18988	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384177920
9	NC_017200	GACAGG	2	12	20958	20969	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384177922
10	NC_017200	ATGCAC	2	12	35092	35103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384177935
11	NC_017200	TGTAGA	2	12	37924	37935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177938
12	NC_017200	GAAAAT	2	12	38590	38601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177939
13	NC_017200	TTGAAA	2	12	40087	40098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177942
14	NC_017200	GCACGT	2	12	52473	52484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384177955
15	NC_017200	ATTAAC	2	12	56866	56877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384177959
16	NC_017200	TATTGA	2	12	66467	66478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384177968
17	NC_017200	CAGGTA	2	12	70236	70247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177971
18	NC_017200	CTGGTG	2	12	74074	74085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384177974
19	NC_017200	AGCGGG	2	12	75954	75965	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384177975
20	NC_017200	GTATCT	2	12	79276	79287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384177981
21	NC_017200	AGCGGT	2	12	79913	79924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384177982
22	NC_017200	TTTAAT	2	12	100890	100901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177990
23	NC_017200	GAAAAA	2	12	101043	101054	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384177990
24	NC_017200	GCAGTA	2	12	103685	103696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177993
25	NC_017200	GAACAA	2	12	104159	104170	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384177993
26	NC_017200	GTAGAA	2	12	110164	110175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178002
27	NC_017200	TCTGGT	2	12	110994	111005	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384178003
28	NC_017200	GAAGCT	2	12	111594	111605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178004
29	NC_017200	GCAAGA	2	12	123109	123120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178013
30	NC_017200	AGTAGA	2	12	123214	123225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178013
31	NC_017200	AGCATT	2	12	123874	123885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178013
32	NC_017200	AGCGTG	2	12	123987	123998	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384178013
33	NC_017200	ATTCGA	2	12	124507	124518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178013
34	NC_017200	AAGTTG	2	12	124761	124772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178013
35	NC_017200	GCTAAA	2	12	125147	125158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178014
36	NC_017200	GAAACT	2	12	125354	125365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178014
37	NC_017200	CAAGCT	2	12	125948	125959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384178014
38	NC_017200	AACTGA	2	12	127194	127205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178017
39	NC_017200	TAAAGG	2	12	127416	127427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178017
40	NC_017200	GAAATC	2	12	128620	128631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178019
41	NC_017200	ACAAGC	2	12	130969	130980	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384178024
42	NC_017200	TTGAAG	2	12	134148	134159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178032
43	NC_017200	AAAGGT	2	12	134258	134269	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178032
44	NC_017200	TAGTTG	2	12	134845	134856	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384178034
45	NC_017200	CTGAAA	2	12	137388	137399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178038
46	NC_017200	TAAACA	2	12	139075	139086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178041
47	NC_017200	TTAGGT	2	12	140996	141007	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384178044
48	NC_017200	ATTTTT	2	12	143348	143359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384178048
49	NC_017200	ATATCC	2	12	144415	144426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384178049
50	NC_017200	TGCAAT	2	12	147451	147462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178054
51	NC_017200	TACAAG	2	12	148973	148984	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178055
52	NC_017200	TTAGAT	2	12	159043	159054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178060
53	NC_017200	CCTGAA	2	12	161677	161688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384178062
54	NC_017200	GAAAAG	3	18	161704	161721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384178062
55	NC_017200	ATAAAG	2	12	161741	161752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178062
56	NC_017200	GATGGT	2	12	162530	162541	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384178063
57	NC_017200	CGCATC	2	12	163894	163905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384178065
58	NC_017200	ATTGTA	2	12	164274	164285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178065
59	NC_017200	AAAAGA	2	12	165565	165576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384178066
60	NC_017200	CAAAGA	2	12	185537	185548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384178085
61	NC_017200	AGTGGA	2	12	189648	189659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178088
62	NC_017200	CGGTAT	2	12	190844	190855	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178089
63	NC_017200	CCATCT	2	12	192095	192106	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384178091
64	NC_017200	ATTTTG	2	12	192918	192929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384178092
65	NC_017200	CAAATT	2	12	196158	196169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384178095
66	NC_017200	GTGGTT	2	12	202034	202045	0 %	50 %	50 %	0 %	384178102
67	NC_017200	GTGGTT	2	12	204061	204072	0 %	50 %	50 %	0 %	384178103
68	NC_017200	AAGTTA	2	12	205727	205738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178104
69	NC_017200	TCTGGA	2	12	205739	205750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178104
70	NC_017200	TTCTTT	2	12	210709	210720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384178110
71	NC_017200	TATGAA	2	12	218975	218986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178125
72	NC_017200	CGCTTG	2	12	222718	222729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384178129
73	NC_017200	AGAGGT	2	12	224501	224512	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178130
74	NC_017200	TAGTGA	2	12	230267	230278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178136
75	NC_017200	TTACGT	2	12	232935	232946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384178138
76	NC_017200	ATTGAA	2	12	233925	233936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178139
77	NC_017200	GAAAGA	2	12	238735	238746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384178144
78	NC_017200	GAGAAT	2	12	239796	239807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178145
79	NC_017200	CAACGT	2	12	239950	239961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384178145
80	NC_017200	AAAAGA	2	12	240437	240448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384178145
81	NC_017200	GCTGTT	2	12	247947	247958	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384178158
82	NC_017200	AGACGA	2	12	248168	248179	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178158
83	NC_017200	TGAAAA	2	12	253956	253967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178162
84	NC_017200	AAGGTC	2	12	254291	254302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178162
85	NC_017200	ATAAAG	2	12	254938	254949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178163
86	NC_017200	GTTTCC	2	12	256843	256854	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384178166
87	NC_017200	AAAACA	2	12	256971	256982	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384178166
88	NC_017200	GTAGAC	2	12	263074	263085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178172
89	NC_017200	AGCTGA	2	12	272354	272365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178176
90	NC_017200	TAATTG	2	12	275828	275839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178179
91	NC_017200	GGATAT	2	12	276594	276605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178180
92	NC_017200	GGCATG	2	12	280331	280342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384178184
93	NC_017200	CCCATT	2	12	286900	286911	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384178190
94	NC_017200	TTATAT	2	12	304925	304936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384178197
95	NC_017200	GTATTT	2	12	315869	315880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384178201
96	NC_017200	TGTACG	2	12	335857	335868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178210
97	NC_017200	ACAAAT	2	12	336620	336631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178210
98	NC_017200	TTATGA	2	12	338094	338105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178211
99	NC_017200	ATATTG	2	12	340249	340260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178214
100	NC_017200	GATGCA	2	12	340641	340652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178214
101	NC_017200	ATTGAT	2	12	341671	341682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178215
102	NC_017200	TAAAAT	2	12	343815	343826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384178217
103	NC_017200	GCAGGC	2	12	345589	345600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384178220
104	NC_017200	CAGAAG	2	12	345743	345754	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178220
105	NC_017200	ACAACT	2	12	347515	347526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384178220
106	NC_017200	AGGTGA	2	12	347655	347666	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178220
107	NC_017200	CAAATC	2	12	348515	348526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384178221
108	NC_017200	TTGCAA	2	12	353315	353326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178224
109	NC_017200	AAACAA	2	12	353868	353879	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384178225
110	NC_017200	CAGGGG	2	12	356931	356942	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384178229
111	NC_017200	AATTAA	2	12	357028	357039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384178229
112	NC_017200	AAAGAT	2	12	357566	357577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178229
113	NC_017200	ATTTTT	2	12	358555	358566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384178230
114	NC_017200	GCGAAA	2	12	362978	362989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178237
115	NC_017200	ATTGAA	2	12	364606	364617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178238
116	NC_017200	ATTAAC	2	12	365241	365252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384178238
117	NC_017200	GTAGAC	2	12	368295	368306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178241
118	NC_017200	AATGAC	2	12	370729	370740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178243
119	NC_017200	AGAATT	2	12	378587	378598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178249
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121	NC_017200	TATCGA	2	12	379952	379963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178250
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343	NC_017200	TAACTG	2	12	903700	903711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178756
344	NC_017200	AGGCAT	2	12	905999	906010	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178757
345	NC_017200	ACCAGA	2	12	907123	907134	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384178758
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457	NC_017200	TAAAGA	2	12	1193833	1193844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384179084
458	NC_017200	ATTTTA	2	12	1194166	1194177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384179085
459	NC_017200	ACTTTT	2	12	1194179	1194190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384179085
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