MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens XH7 chromosome

Total Repeats: 46005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017191	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166625
2	NC_017191	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166625
3	NC_017191	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166625
4	NC_017191	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166625
5	NC_017191	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384166625
6	NC_017191	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166625
7	NC_017191	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166625
8	NC_017191	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166625
9	NC_017191	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166625
10	NC_017191	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384166625
11	NC_017191	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384166625
12	NC_017191	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166625
13	NC_017191	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166625
14	NC_017191	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166625
15	NC_017191	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166625
16	NC_017191	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166625
17	NC_017191	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166625
18	NC_017191	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166625
19	NC_017191	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166625
20	NC_017191	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166625
21	NC_017191	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384166625
22	NC_017191	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166626
23	NC_017191	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166626
24	NC_017191	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166626
25	NC_017191	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166626
26	NC_017191	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166626
27	NC_017191	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166626
28	NC_017191	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166626
29	NC_017191	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166626
30	NC_017191	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166626
31	NC_017191	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166626
32	NC_017191	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166626
33	NC_017191	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166626
34	NC_017191	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166626
35	NC_017191	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166626
36	NC_017191	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166626
37	NC_017191	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166626
38	NC_017191	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166626
39	NC_017191	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384166627
40	NC_017191	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166627
41	NC_017191	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384166627
42	NC_017191	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166627
43	NC_017191	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166628
44	NC_017191	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166628
45	NC_017191	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166628
46	NC_017191	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384166628
47	NC_017191	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166628
48	NC_017191	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166628
49	NC_017191	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166628
50	NC_017191	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166628
51	NC_017191	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166628
52	NC_017191	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166628
53	NC_017191	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166628
54	NC_017191	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166628
55	NC_017191	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384166628
56	NC_017191	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166629
57	NC_017191	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166629
58	NC_017191	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166629
59	NC_017191	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166629
60	NC_017191	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166629
61	NC_017191	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166630
62	NC_017191	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166630
63	NC_017191	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166630
64	NC_017191	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166630
65	NC_017191	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166630
66	NC_017191	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166630
67	NC_017191	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384166630
68	NC_017191	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166630
69	NC_017191	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384166630
70	NC_017191	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166630
71	NC_017191	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166630
72	NC_017191	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166630
73	NC_017191	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166630
74	NC_017191	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166630
75	NC_017191	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384166630
76	NC_017191	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166630
77	NC_017191	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166630
78	NC_017191	TTC	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166630
79	NC_017191	ATT	2	6	6446	6451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166630
80	NC_017191	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384166630
81	NC_017191	GCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166630
82	NC_017191	AGC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166630
83	NC_017191	TGA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166630
84	NC_017191	TCG	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166631
85	NC_017191	ACC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384166631
86	NC_017191	TTG	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384166631
87	NC_017191	TCC	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384166631
88	NC_017191	CAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166631
89	NC_017191	GTC	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166631
90	NC_017191	CCG	2	6	7930	7935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384166631
91	NC_017191	CTG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166631
92	NC_017191	GAA	3	9	8330	8338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
93	NC_017191	TTG	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384166631
94	NC_017191	GAA	2	6	8390	8395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
95	NC_017191	ATC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166631
96	NC_017191	GAA	2	6	8417	8422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
97	NC_017191	ATG	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166631
98	NC_017191	TCA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166631
99	NC_017191	TTC	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166631
100	NC_017191	TAA	2	6	8692	8697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384166631
101	NC_017191	ATT	2	6	8765	8770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166631
102	NC_017191	ATT	2	6	8810	8815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166631
103	NC_017191	TGA	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166631
104	NC_017191	CTT	2	6	8848	8853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166631
105	NC_017191	ATC	3	9	8990	8998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166631
106	NC_017191	GAA	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
107	NC_017191	GAA	2	6	9032	9037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
108	NC_017191	GAT	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166631
109	NC_017191	GAA	2	6	9125	9130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
110	NC_017191	GAA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
111	NC_017191	GCG	2	6	9312	9317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384166631
112	NC_017191	GAA	2	6	9437	9442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
113	NC_017191	GAA	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
114	NC_017191	GAA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166631
115	NC_017191	AGA	2	6	10690	10695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166632
116	NC_017191	ACA	2	6	10727	10732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166632
117	NC_017191	TGA	2	6	10793	10798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166632
118	NC_017191	TTC	2	6	10842	10847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166632
119	NC_017191	AAG	2	6	11083	11088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166633
120	NC_017191	GAT	2	6	11100	11105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166633
121	NC_017191	TCA	2	6	11197	11202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166633
122	NC_017191	GGC	2	6	11259	11264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384166633
123	NC_017191	ATT	2	6	11271	11276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166633
124	NC_017191	CAG	2	6	11298	11303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166633
125	NC_017191	TTA	2	6	11344	11349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166633
126	NC_017191	CTT	2	6	11357	11362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166633
127	NC_017191	ATC	2	6	11374	11379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166633
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129	NC_017191	ATT	2	6	11503	11508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166633
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162	NC_017191	CGA	2	6	14399	14404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166635
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164	NC_017191	CTG	2	6	14534	14539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166635
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239	NC_017191	CGT	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166643
240	NC_017191	ATC	2	6	21905	21910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384166643
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246	NC_017191	ATT	2	6	22124	22129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384166643
247	NC_017191	TGT	2	6	22156	22161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384166643
248	NC_017191	GAA	2	6	22298	22303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166644
249	NC_017191	CGT	2	6	22520	22525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166644
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500	NC_017191	TGC	2	6	47359	47364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166670

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