MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 46328

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
2	NC_017190	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
3	NC_017190	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
4	NC_017190	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
5	NC_017190	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162405
6	NC_017190	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162405
7	NC_017190	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162405
8	NC_017190	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162405
9	NC_017190	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
10	NC_017190	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162405
11	NC_017190	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162405
12	NC_017190	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162405
13	NC_017190	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162405
14	NC_017190	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
15	NC_017190	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162405
16	NC_017190	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162405
17	NC_017190	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162405
18	NC_017190	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162405
19	NC_017190	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
20	NC_017190	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162405
21	NC_017190	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162405
22	NC_017190	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162406
23	NC_017190	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162406
24	NC_017190	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
25	NC_017190	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
26	NC_017190	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162406
27	NC_017190	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162406
28	NC_017190	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
29	NC_017190	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
30	NC_017190	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162406
31	NC_017190	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
32	NC_017190	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
33	NC_017190	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162406
34	NC_017190	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162406
35	NC_017190	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162406
36	NC_017190	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162406
37	NC_017190	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
38	NC_017190	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162406
39	NC_017190	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162407
40	NC_017190	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162407
41	NC_017190	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162407
42	NC_017190	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162407
43	NC_017190	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162408
44	NC_017190	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
45	NC_017190	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
46	NC_017190	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162408
47	NC_017190	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
48	NC_017190	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162408
49	NC_017190	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
50	NC_017190	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
51	NC_017190	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162408
52	NC_017190	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162408
53	NC_017190	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
54	NC_017190	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162408
55	NC_017190	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384162408
56	NC_017190	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162409
57	NC_017190	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162409
58	NC_017190	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162409
59	NC_017190	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162409
60	NC_017190	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162409
61	NC_017190	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
62	NC_017190	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
63	NC_017190	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162410
64	NC_017190	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162410
65	NC_017190	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162410
66	NC_017190	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
67	NC_017190	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
68	NC_017190	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162410
69	NC_017190	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
70	NC_017190	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162410
71	NC_017190	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
72	NC_017190	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162410
73	NC_017190	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
74	NC_017190	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
75	NC_017190	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162410
76	NC_017190	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
77	NC_017190	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162410
78	NC_017190	TTC	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162410
79	NC_017190	ATT	2	6	6446	6451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162410
80	NC_017190	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162410
81	NC_017190	GCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
82	NC_017190	AGC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162410
83	NC_017190	TGA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162410
84	NC_017190	TCG	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162411
85	NC_017190	ACC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384162411
86	NC_017190	TTG	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162411
87	NC_017190	TCC	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162411
88	NC_017190	CAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162411
89	NC_017190	GTC	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162411
90	NC_017190	CCG	2	6	7930	7935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162411
91	NC_017190	CTG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162411
92	NC_017190	GAA	3	9	8330	8338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
93	NC_017190	TTG	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162411
94	NC_017190	GAA	2	6	8390	8395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
95	NC_017190	ATC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162411
96	NC_017190	GAA	2	6	8417	8422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
97	NC_017190	ATG	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162411
98	NC_017190	TCA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162411
99	NC_017190	TTC	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162411
100	NC_017190	TAA	2	6	8692	8697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162411
101	NC_017190	ATT	2	6	8765	8770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162411
102	NC_017190	ATT	2	6	8810	8815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162411
103	NC_017190	TGA	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162411
104	NC_017190	CTT	2	6	8848	8853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162411
105	NC_017190	ATC	3	9	8990	8998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162411
106	NC_017190	GAA	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
107	NC_017190	GAA	2	6	9032	9037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
108	NC_017190	GAT	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162411
109	NC_017190	GAA	2	6	9125	9130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
110	NC_017190	GAA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
111	NC_017190	GCG	2	6	9312	9317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162411
112	NC_017190	GAA	2	6	9437	9442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
113	NC_017190	GAA	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
114	NC_017190	GAA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162411
115	NC_017190	GTA	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162412
116	NC_017190	CCG	2	6	14873	14878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162412
117	NC_017190	ATC	2	6	14891	14896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162412
118	NC_017190	TGC	2	6	14904	14909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162412
119	NC_017190	CAG	2	6	14912	14917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162412
120	NC_017190	ACC	2	6	14923	14928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384162412
121	NC_017190	AAT	2	6	14981	14986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162412
122	NC_017190	ATT	2	6	15038	15043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162412
123	NC_017190	TGA	2	6	15150	15155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162412
124	NC_017190	TTC	2	6	15332	15337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162412
125	NC_017190	TCA	2	6	15367	15372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162412
126	NC_017190	AGA	2	6	15507	15512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162412
127	NC_017190	ACA	2	6	15544	15549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162412
128	NC_017190	TGA	2	6	15610	15615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162412
129	NC_017190	TTC	2	6	15659	15664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162412
130	NC_017190	AAG	2	6	15900	15905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162413
131	NC_017190	GAT	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162413
132	NC_017190	TCA	2	6	16014	16019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162413
133	NC_017190	GGC	2	6	16076	16081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162413
134	NC_017190	ATT	2	6	16088	16093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162413
135	NC_017190	CAG	2	6	16115	16120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162413
136	NC_017190	TTA	2	6	16161	16166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162413
137	NC_017190	CTT	2	6	16174	16179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162413
138	NC_017190	ATC	2	6	16191	16196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162413
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150	NC_017190	AGA	2	6	17161	17166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162413
151	NC_017190	CGG	2	6	17185	17190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162413
152	NC_017190	AGA	2	6	17242	17247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162413
153	NC_017190	ATG	2	6	17298	17303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162413
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157	NC_017190	TGA	2	6	17781	17786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162414
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159	NC_017190	AGA	2	6	18069	18074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162414
160	NC_017190	CTT	2	6	18103	18108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162414
161	NC_017190	ACA	2	6	18148	18153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162414
162	NC_017190	GAT	2	6	18187	18192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162414
163	NC_017190	TCA	2	6	18332	18337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162414
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166	NC_017190	GAT	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162414
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170	NC_017190	TCA	2	6	19087	19092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162415
171	NC_017190	CGG	2	6	19190	19195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162415
172	NC_017190	CGA	2	6	19216	19221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162415
173	NC_017190	GAA	2	6	19227	19232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162415
174	NC_017190	CTG	2	6	19351	19356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162415
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247	NC_017190	CGT	2	6	26586	26591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162422
248	NC_017190	ATC	2	6	26722	26727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162422
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250	NC_017190	TGC	2	6	26772	26777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162422
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499	NC_017190	CTG	2	6	51600	51605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162447
500	NC_017190	ATG	2	6	51696	51701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162447

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