MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 73592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017190	CGG	2	6	183603	183608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162581
3003	NC_017190	AT	3	6	183890	183895	50 %	50 %	0 %	0 %	384162582
3004	NC_017190	TCG	2	6	183948	183953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162582
3005	NC_017190	CTGAG	2	10	184065	184074	20 %	20 %	40 %	20 %	384162582
3006	NC_017190	GGA	2	6	184132	184137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162582
3007	NC_017190	CGC	2	6	184193	184198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162582
3008	NC_017190	CGC	2	6	184317	184322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384162582
3009	NC_017190	GCT	2	6	184364	184369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162582
3010	NC_017190	AGTGA	2	10	184448	184457	40 %	20 %	40 %	0 %	384162582
3011	NC_017190	GAA	2	6	184541	184546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162582
3012	NC_017190	GAAA	2	8	184552	184559	75 %	0 %	25 %	0 %	384162582
3013	NC_017190	CTT	2	6	184596	184601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162582
3014	NC_017190	CTG	2	6	184606	184611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162582
3015	NC_017190	AAC	2	6	184647	184652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162583
3016	NC_017190	CATTG	2	10	184670	184679	20 %	40 %	20 %	20 %	384162583
3017	NC_017190	AAC	3	9	184710	184718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162583
3018	NC_017190	T	6	6	184752	184757	0 %	100 %	0 %	0 %	384162583
3019	NC_017190	ATG	2	6	184813	184818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162583
3020	NC_017190	GAA	2	6	184907	184912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162583
3021	NC_017190	CGGA	2	8	184987	184994	25 %	0 %	50 %	25 %	384162583
3022	NC_017190	GTCA	2	8	185015	185022	25 %	25 %	25 %	25 %	384162583
3023	NC_017190	A	6	6	185041	185046	100 %	0 %	0 %	0 %	384162583
3024	NC_017190	GTTGAA	2	12	185064	185075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162583
3025	NC_017190	TAC	2	6	185076	185081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162583
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3028	NC_017190	TGTTGA	2	12	185279	185290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384162583
3029	NC_017190	GTCA	2	8	185294	185301	25 %	25 %	25 %	25 %	384162583
3030	NC_017190	GGAAG	2	10	185359	185368	40 %	0 %	60 %	0 %	384162583
3031	NC_017190	CGG	2	6	185897	185902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162583
3032	NC_017190	AGACAA	2	12	185945	185956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384162583
3033	NC_017190	GGAG	2	8	186247	186254	25 %	0 %	75 %	0 %	384162584
3034	NC_017190	ATCG	2	8	186274	186281	25 %	25 %	25 %	25 %	384162584
3035	NC_017190	GATG	2	8	186343	186350	25 %	25 %	50 %	0 %	384162584
3036	NC_017190	GGCG	2	8	186355	186362	0 %	0 %	75 %	25 %	384162584
3037	NC_017190	GGA	2	6	186416	186421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162584
3038	NC_017190	AGG	2	6	186447	186452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384162584
3039	NC_017190	CGAC	2	8	186497	186504	25 %	0 %	25 %	50 %	384162584
3040	NC_017190	ATT	2	6	186531	186536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162584
3041	NC_017190	CGG	2	6	186576	186581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162584
3042	NC_017190	AC	3	6	186647	186652	50 %	0 %	0 %	50 %	384162584
3043	NC_017190	AC	3	6	186734	186739	50 %	0 %	0 %	50 %	384162584
3044	NC_017190	A	7	7	186768	186774	100 %	0 %	0 %	0 %	384162584
3045	NC_017190	TGA	2	6	186826	186831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162584
3046	NC_017190	GATCA	2	10	186854	186863	40 %	20 %	20 %	20 %	384162584
3047	NC_017190	GAT	2	6	186908	186913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162584
3048	NC_017190	TGA	2	6	186930	186935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162584
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3051	NC_017190	CGG	2	6	187045	187050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162584
3052	NC_017190	ACA	2	6	187083	187088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162584
3053	NC_017190	TGAAA	2	10	187171	187180	60 %	20 %	20 %	0 %	384162584
3054	NC_017190	A	6	6	187178	187183	100 %	0 %	0 %	0 %	384162584
3055	NC_017190	AGA	2	6	187231	187236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162584
3056	NC_017190	AG	3	6	187441	187446	50 %	0 %	50 %	0 %	384162585
3057	NC_017190	ACAAG	2	10	187450	187459	60 %	0 %	20 %	20 %	384162585
3058	NC_017190	ATG	2	6	187486	187491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162585
3059	NC_017190	A	7	7	187501	187507	100 %	0 %	0 %	0 %	384162585
3060	NC_017190	TGT	2	6	187529	187534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162585
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3062	NC_017190	CGG	2	6	187669	187674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162586
3063	NC_017190	A	6	6	187852	187857	100 %	0 %	0 %	0 %	384162587
3064	NC_017190	TG	3	6	187858	187863	0 %	50 %	50 %	0 %	384162587
3065	NC_017190	TTG	2	6	187867	187872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162587
3066	NC_017190	GTG	2	6	188025	188030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162587
3067	NC_017190	AGT	2	6	188231	188236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162587
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3069	NC_017190	AGA	2	6	188279	188284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162587
3070	NC_017190	ATT	2	6	188333	188338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162587
3071	NC_017190	A	6	6	188372	188377	100 %	0 %	0 %	0 %	384162587
3072	NC_017190	CGT	2	6	188417	188422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162587
3073	NC_017190	GAAT	2	8	188456	188463	50 %	25 %	25 %	0 %	384162587
3074	NC_017190	AGC	2	6	188629	188634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162587
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3080	NC_017190	GAAATG	2	12	189198	189209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162587
3081	NC_017190	CG	3	6	189212	189217	0 %	0 %	50 %	50 %	384162587
3082	NC_017190	TTC	2	6	189246	189251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162587
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3087	NC_017190	CAT	2	6	189476	189481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162587
3088	NC_017190	AGA	2	6	189497	189502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162587
3089	NC_017190	GAC	2	6	189507	189512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162587
3090	NC_017190	TGT	2	6	189560	189565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162587
3091	NC_017190	TAC	2	6	189585	189590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162587
3092	NC_017190	CTGCA	2	10	189592	189601	20 %	20 %	20 %	40 %	384162587
3093	NC_017190	AT	3	6	189659	189664	50 %	50 %	0 %	0 %	384162587
3094	NC_017190	AAT	2	6	189825	189830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162588
3095	NC_017190	GTTT	2	8	189852	189859	0 %	75 %	25 %	0 %	384162588
3096	NC_017190	AC	3	6	189895	189900	50 %	0 %	0 %	50 %	384162588
3097	NC_017190	ACTT	2	8	189922	189929	25 %	50 %	0 %	25 %	384162588
3098	NC_017190	GA	4	8	189971	189978	50 %	0 %	50 %	0 %	384162588
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3102	NC_017190	TGA	2	6	190244	190249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162588
3103	NC_017190	TAT	2	6	190281	190286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162588
3104	NC_017190	CAT	2	6	190294	190299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162588
3105	NC_017190	AGATGA	2	12	190328	190339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162588
3106	NC_017190	ATT	2	6	190354	190359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162588
3107	NC_017190	AT	3	6	190377	190382	50 %	50 %	0 %	0 %	384162588
3108	NC_017190	AT	3	6	190406	190411	50 %	50 %	0 %	0 %	384162588
3109	NC_017190	A	6	6	190414	190419	100 %	0 %	0 %	0 %	384162588
3110	NC_017190	ATT	2	6	190437	190442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162588
3111	NC_017190	A	6	6	190473	190478	100 %	0 %	0 %	0 %	384162588
3112	NC_017190	ATT	2	6	190516	190521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162588
3113	NC_017190	TGA	2	6	190526	190531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162588
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3118	NC_017190	AT	4	8	196322	196329	50 %	50 %	0 %	0 %	384162589
3119	NC_017190	TTATA	2	10	196341	196350	40 %	60 %	0 %	0 %	384162589
3120	NC_017190	T	6	6	196360	196365	0 %	100 %	0 %	0 %	384162589
3121	NC_017190	CTAT	2	8	196377	196384	25 %	50 %	0 %	25 %	384162589
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3123	NC_017190	ACA	2	6	196400	196405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162589
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3140	NC_017190	A	6	6	197527	197532	100 %	0 %	0 %	0 %	384162591
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3162	NC_017190	CG	3	6	198769	198774	0 %	0 %	50 %	50 %	384162592
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3232	NC_017190	CGG	2	6	202454	202459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162596
3233	NC_017190	A	6	6	202478	202483	100 %	0 %	0 %	0 %	384162596
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3236	NC_017190	GTTT	2	8	202599	202606	0 %	75 %	25 %	0 %	384162596
3237	NC_017190	CGGC	2	8	202637	202644	0 %	0 %	50 %	50 %	384162596
3238	NC_017190	TGT	2	6	202656	202661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162596
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3240	NC_017190	TTC	2	6	202767	202772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162596
3241	NC_017190	GTC	2	6	202828	202833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162596
3242	NC_017190	TGTCTA	2	12	202863	202874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384162596
3243	NC_017190	AGA	2	6	202939	202944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162596
3244	NC_017190	GTC	2	6	203077	203082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162596
3245	NC_017190	TAT	2	6	203116	203121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162596
3246	NC_017190	TGA	2	6	203148	203153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162596
3247	NC_017190	AGA	2	6	203166	203171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162596
3248	NC_017190	TTA	2	6	203291	203296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162597
3249	NC_017190	GCT	2	6	203314	203319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162597
3250	NC_017190	GTG	2	6	203468	203473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162597
3251	NC_017190	TGA	2	6	203529	203534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162597
3252	NC_017190	AGA	2	6	203557	203562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162597
3253	NC_017190	GAT	2	6	203572	203577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162597
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3255	NC_017190	TGTT	2	8	203706	203713	0 %	75 %	25 %	0 %	384162597
3256	NC_017190	TTA	2	6	203802	203807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162597
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3264	NC_017190	G	6	6	204085	204090	0 %	0 %	100 %	0 %	384162598
3265	NC_017190	T	7	7	204100	204106	0 %	100 %	0 %	0 %	384162598
3266	NC_017190	GTG	2	6	204117	204122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384162598
3267	NC_017190	CTG	2	6	204123	204128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162598
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3269	NC_017190	AT	3	6	204177	204182	50 %	50 %	0 %	0 %	384162598
3270	NC_017190	TCT	2	6	204194	204199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162598
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3275	NC_017190	TGC	2	6	204385	204390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162598
3276	NC_017190	TCA	2	6	204397	204402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162598
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3281	NC_017190	GCT	2	6	204704	204709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162598
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3283	NC_017190	GGC	2	6	204821	204826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162598
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3285	NC_017190	ATA	2	6	204958	204963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162598
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3351	NC_017190	GCCT	2	8	207842	207849	0 %	25 %	25 %	50 %	384162601
3352	NC_017190	CGG	2	6	207944	207949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384162601
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3358	NC_017190	CTTTTC	2	12	208133	208144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162602
3359	NC_017190	CAG	2	6	208158	208163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162602
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3481	NC_017190	AACA	2	8	215871	215878	75 %	0 %	0 %	25 %	384162611
3482	NC_017190	CGTC	2	8	215991	215998	0 %	25 %	25 %	50 %	384162611
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3489	NC_017190	TGA	2	6	216256	216261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162611
3490	NC_017190	ATA	2	6	216297	216302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162611
3491	NC_017190	ATC	2	6	216375	216380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162611
3492	NC_017190	TC	3	6	216384	216389	0 %	50 %	0 %	50 %	384162611
3493	NC_017190	CAT	2	6	216420	216425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384162611
3494	NC_017190	TCC	2	6	216427	216432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162612
3495	NC_017190	ATG	2	6	216452	216457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162612
3496	NC_017190	TATG	2	8	216458	216465	25 %	50 %	25 %	0 %	384162612
3497	NC_017190	TCCTT	2	10	216468	216477	0 %	60 %	0 %	40 %	384162612
3498	NC_017190	CTC	2	6	216534	216539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384162612
3499	NC_017190	TCCA	2	8	216543	216550	25 %	25 %	0 %	50 %	384162612
3500	NC_017190	ATT	2	6	216554	216559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384162612

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