MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017139	CATT	2	8	2711	2718	25 %	50 %	0 %	25 %	384044107
2	NC_017139	GAAA	2	8	2777	2784	75 %	0 %	25 %	0 %	384044107
3	NC_017139	GAAG	2	8	3059	3066	50 %	0 %	50 %	0 %	384044107
4	NC_017139	AAGC	2	8	3656	3663	50 %	0 %	25 %	25 %	384044109
5	NC_017139	GATT	2	8	4206	4213	25 %	50 %	25 %	0 %	384044110
6	NC_017139	TTAA	2	8	5823	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	384044111
7	NC_017139	AAAT	2	8	6179	6186	75 %	25 %	0 %	0 %	384044112
8	NC_017139	AACT	2	8	6217	6224	50 %	25 %	0 %	25 %	384044112
9	NC_017139	TATT	2	8	6436	6443	25 %	75 %	0 %	0 %	384044112
10	NC_017139	AATT	2	8	6563	6570	50 %	50 %	0 %	0 %	384044112
11	NC_017139	TCAT	2	8	7422	7429	25 %	50 %	0 %	25 %	384044113
12	NC_017139	TATT	2	8	7443	7450	25 %	75 %	0 %	0 %	384044113
13	NC_017139	TGGA	2	8	7722	7729	25 %	25 %	50 %	0 %	384044114
14	NC_017139	CAAT	2	8	8658	8665	50 %	25 %	0 %	25 %	384044115
15	NC_017139	GGGT	2	8	8846	8853	0 %	25 %	75 %	0 %	384044115
16	NC_017139	AAAG	2	8	11127	11134	75 %	0 %	25 %	0 %	384044122
17	NC_017139	ATTA	2	8	11266	11273	50 %	50 %	0 %	0 %	384044122
18	NC_017139	ATTT	2	8	11420	11427	25 %	75 %	0 %	0 %	384044123
19	NC_017139	TTTC	2	8	11653	11660	0 %	75 %	0 %	25 %	384044123
20	NC_017139	CAAT	2	8	11733	11740	50 %	25 %	0 %	25 %	384044123
21	NC_017139	TTGA	2	8	13000	13007	25 %	50 %	25 %	0 %	384044124
22	NC_017139	TTTA	2	8	14543	14550	25 %	75 %	0 %	0 %	384044125
23	NC_017139	AAAT	2	8	14593	14600	75 %	25 %	0 %	0 %	384044125
24	NC_017139	TTTC	2	8	15944	15951	0 %	75 %	0 %	25 %	384044126
25	NC_017139	GATT	2	8	16064	16071	25 %	50 %	25 %	0 %	384044126
26	NC_017139	TTTG	2	8	16553	16560	0 %	75 %	25 %	0 %	384044126
27	NC_017139	TAAG	2	8	16582	16589	50 %	25 %	25 %	0 %	384044126
28	NC_017139	ATCA	2	8	17899	17906	50 %	25 %	0 %	25 %	384044127
29	NC_017139	ATCG	2	8	18081	18088	25 %	25 %	25 %	25 %	384044127
30	NC_017139	TAAA	2	8	18343	18350	75 %	25 %	0 %	0 %	384044127
31	NC_017139	AAGC	2	8	18962	18969	50 %	0 %	25 %	25 %	384044128
32	NC_017139	CAGG	2	8	19322	19329	25 %	0 %	50 %	25 %	384044128
33	NC_017139	CAGT	2	8	19536	19543	25 %	25 %	25 %	25 %	384044128
34	NC_017139	AAGT	2	8	19974	19981	50 %	25 %	25 %	0 %	384044128
35	NC_017139	ACTT	2	8	20658	20665	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
36	NC_017139	TGGA	2	8	20922	20929	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
37	NC_017139	AATC	2	8	21169	21176	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
38	NC_017139	TGGA	2	8	21468	21475	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
39	NC_017139	AATC	2	8	21715	21722	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
40	NC_017139	TGGA	2	8	22014	22021	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
41	NC_017139	AATC	2	8	22261	22268	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
42	NC_017139	TGGA	2	8	22560	22567	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
43	NC_017139	AATC	2	8	22807	22814	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
44	NC_017139	TGGA	2	8	23106	23113	25 %	25 %	50 %	0 %	384044128
45	NC_017139	AGAT	2	8	23593	23600	50 %	25 %	25 %	0 %	384044128
46	NC_017139	CATT	2	8	23730	23737	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
47	NC_017139	AATC	2	8	26912	26919	50 %	25 %	0 %	25 %	384044128
48	NC_017139	ATTT	2	8	27063	27070	25 %	75 %	0 %	0 %	384044128
49	NC_017139	AACC	2	8	27413	27420	50 %	0 %	0 %	50 %	384044128
50	NC_017139	ATTC	2	8	27609	27616	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
51	NC_017139	AAGT	2	8	28020	28027	50 %	25 %	25 %	0 %	384044128
52	NC_017139	GTTT	2	8	28663	28670	0 %	75 %	25 %	0 %	384044128
53	NC_017139	TCCA	2	8	28897	28904	25 %	25 %	0 %	50 %	384044128
54	NC_017139	GTCA	2	8	29280	29287	25 %	25 %	25 %	25 %	384044128
55	NC_017139	GCAA	2	8	29591	29598	50 %	0 %	25 %	25 %	384044128
56	NC_017139	TGGT	2	8	29652	29659	0 %	50 %	50 %	0 %	384044128
57	NC_017139	ACTT	2	8	30121	30128	25 %	50 %	0 %	25 %	384044128
58	NC_017139	ACCT	2	8	30321	30328	25 %	25 %	0 %	50 %	384044128
59	NC_017139	TTTA	2	8	30395	30402	25 %	75 %	0 %	0 %	384044128
60	NC_017139	TAGT	2	8	30450	30457	25 %	50 %	25 %	0 %	384044128
61	NC_017139	AAAG	2	8	30806	30813	75 %	0 %	25 %	0 %	384044129
62	NC_017139	CTTT	2	8	32069	32076	0 %	75 %	0 %	25 %	384044130
63	NC_017139	ACGT	2	8	32455	32462	25 %	25 %	25 %	25 %	384044131
64	NC_017139	TTAT	2	8	33014	33021	25 %	75 %	0 %	0 %	384044132
65	NC_017139	ATTA	2	8	33120	33127	50 %	50 %	0 %	0 %	384044132
66	NC_017139	ACTA	2	8	34116	34123	50 %	25 %	0 %	25 %	384044134
67	NC_017139	TAAT	2	8	34306	34313	50 %	50 %	0 %	0 %	384044135
68	NC_017139	ATGG	2	8	34617	34624	25 %	25 %	50 %	0 %	384044135
69	NC_017139	AATT	2	8	35652	35659	50 %	50 %	0 %	0 %	384044136
70	NC_017139	AACT	2	8	35810	35817	50 %	25 %	0 %	25 %	384044136
71	NC_017139	ATTT	2	8	36975	36982	25 %	75 %	0 %	0 %	384044138
72	NC_017139	GTTT	2	8	37754	37761	0 %	75 %	25 %	0 %	384044139
73	NC_017139	CAAT	2	8	37920	37927	50 %	25 %	0 %	25 %	384044139
74	NC_017139	GAAA	2	8	38032	38039	75 %	0 %	25 %	0 %	384044139
75	NC_017139	TTAA	2	8	38061	38068	50 %	50 %	0 %	0 %	384044139
76	NC_017139	CATA	2	8	38644	38651	50 %	25 %	0 %	25 %	384044139
77	NC_017139	ATTG	2	8	39216	39223	25 %	50 %	25 %	0 %	384044140
78	NC_017139	TTTC	2	8	39331	39338	0 %	75 %	0 %	25 %	384044140
79	NC_017139	CTAT	2	8	39416	39423	25 %	50 %	0 %	25 %	384044140
80	NC_017139	TTAA	2	8	39629	39636	50 %	50 %	0 %	0 %	384044140
81	NC_017139	ATTG	2	8	40123	40130	25 %	50 %	25 %	0 %	384044141
82	NC_017139	TTTA	2	8	40153	40160	25 %	75 %	0 %	0 %	384044141
83	NC_017139	CCAC	2	8	40946	40953	25 %	0 %	0 %	75 %	384044141
84	NC_017139	TAAT	2	8	41390	41397	50 %	50 %	0 %	0 %	384044142
85	NC_017139	TTTC	2	8	41534	41541	0 %	75 %	0 %	25 %	384044142
86	NC_017139	TAAT	2	8	41903	41910	50 %	50 %	0 %	0 %	384044142
87	NC_017139	GAAA	2	8	42408	42415	75 %	0 %	25 %	0 %	384044144
88	NC_017139	TTAT	2	8	42620	42627	25 %	75 %	0 %	0 %	384044144
89	NC_017139	AGGG	2	8	43277	43284	25 %	0 %	75 %	0 %	384044145
90	NC_017139	TGGG	2	8	43640	43647	0 %	25 %	75 %	0 %	384044145
91	NC_017139	GCTG	2	8	43890	43897	0 %	25 %	50 %	25 %	384044145
92	NC_017139	ATCC	2	8	43936	43943	25 %	25 %	0 %	50 %	384044145
93	NC_017139	ACAA	2	8	44541	44548	75 %	0 %	0 %	25 %	384044146
94	NC_017139	GTTA	2	8	44703	44710	25 %	50 %	25 %	0 %	384044147
95	NC_017139	CTTT	2	8	44926	44933	0 %	75 %	0 %	25 %	384044147
96	NC_017139	AATT	2	8	44954	44961	50 %	50 %	0 %	0 %	384044147
97	NC_017139	CAAA	2	8	45133	45140	75 %	0 %	0 %	25 %	384044147
98	NC_017139	TTAA	2	8	45267	45274	50 %	50 %	0 %	0 %	384044147
99	NC_017139	GAAA	2	8	45302	45309	75 %	0 %	25 %	0 %	384044148
100	NC_017139	ACTT	2	8	46817	46824	25 %	50 %	0 %	25 %	384044150
101	NC_017139	CTAT	2	8	47113	47120	25 %	50 %	0 %	25 %	384044150
102	NC_017139	TCCT	2	8	48154	48161	0 %	50 %	0 %	50 %	384044152
103	NC_017139	GTTA	2	8	48554	48561	25 %	50 %	25 %	0 %	384044152
104	NC_017139	ATTA	2	8	48885	48892	50 %	50 %	0 %	0 %	384044153
105	NC_017139	ATTT	2	8	49145	49152	25 %	75 %	0 %	0 %	384044153
106	NC_017139	TTGC	2	8	49322	49329	0 %	50 %	25 %	25 %	384044153
107	NC_017139	AGAA	2	8	49819	49826	75 %	0 %	25 %	0 %	384044154
108	NC_017139	ACTA	2	8	50053	50060	50 %	25 %	0 %	25 %	384044154
109	NC_017139	ATTA	2	8	50364	50371	50 %	50 %	0 %	0 %	384044154
110	NC_017139	AGTA	2	8	50776	50783	50 %	25 %	25 %	0 %	384044154
111	NC_017139	GCAA	2	8	50961	50968	50 %	0 %	25 %	25 %	384044155
112	NC_017139	ATGA	2	8	51524	51531	50 %	25 %	25 %	0 %	384044155
113	NC_017139	GAAG	2	8	51840	51847	50 %	0 %	50 %	0 %	384044155
114	NC_017139	ATTT	2	8	51925	51932	25 %	75 %	0 %	0 %	384044155
115	NC_017139	GGTA	2	8	52201	52208	25 %	25 %	50 %	0 %	384044156
116	NC_017139	ATGT	2	8	52277	52284	25 %	50 %	25 %	0 %	384044156
117	NC_017139	TATT	2	8	53156	53163	25 %	75 %	0 %	0 %	384044157
118	NC_017139	GTTG	2	8	53692	53699	0 %	50 %	50 %	0 %	384044158
119	NC_017139	AAGT	2	8	54231	54238	50 %	25 %	25 %	0 %	384044158
120	NC_017139	AGAT	2	8	54375	54382	50 %	25 %	25 %	0 %	384044158
121	NC_017139	TGCT	2	8	54759	54766	0 %	50 %	25 %	25 %	384044159
122	NC_017139	AAAT	2	8	54877	54884	75 %	25 %	0 %	0 %	384044159
123	NC_017139	CAAA	2	8	56257	56264	75 %	0 %	0 %	25 %	384044160
124	NC_017139	GGTA	2	8	56407	56414	25 %	25 %	50 %	0 %	384044160
125	NC_017139	AATT	2	8	56463	56470	50 %	50 %	0 %	0 %	384044160
126	NC_017139	AGCT	2	8	56517	56524	25 %	25 %	25 %	25 %	384044160
127	NC_017139	TAAA	2	8	57668	57675	75 %	25 %	0 %	0 %	384044161
128	NC_017139	AATT	2	8	58704	58711	50 %	50 %	0 %	0 %	384044163
129	NC_017139	AATT	2	8	58981	58988	50 %	50 %	0 %	0 %	384044163
130	NC_017139	GCAT	2	8	59051	59058	25 %	25 %	25 %	25 %	384044163
131	NC_017139	AGTT	2	8	59151	59158	25 %	50 %	25 %	0 %	384044163
132	NC_017139	TAAA	2	8	59294	59301	75 %	25 %	0 %	0 %	384044164
133	NC_017139	ACAA	2	8	59800	59807	75 %	0 %	0 %	25 %	384044164
134	NC_017139	TCTT	2	8	60085	60092	0 %	75 %	0 %	25 %	384044164
135	NC_017139	AAAC	2	8	60491	60498	75 %	0 %	0 %	25 %	384044165
136	NC_017139	CTGT	2	8	60522	60529	0 %	50 %	25 %	25 %	384044165
137	NC_017139	ATGA	2	8	61022	61029	50 %	25 %	25 %	0 %	384044165
138	NC_017139	TTCT	2	8	61042	61049	0 %	75 %	0 %	25 %	384044165
139	NC_017139	CATA	2	8	62678	62685	50 %	25 %	0 %	25 %	384044167
140	NC_017139	ATAG	2	8	64184	64191	50 %	25 %	25 %	0 %	384044168
141	NC_017139	TTAA	2	8	64394	64401	50 %	50 %	0 %	0 %	384044168
142	NC_017139	ATTT	2	8	67555	67562	25 %	75 %	0 %	0 %	384044175
143	NC_017139	TCGT	2	8	67982	67989	0 %	50 %	25 %	25 %	384044175
144	NC_017139	TTAC	2	8	68430	68437	25 %	50 %	0 %	25 %	384044175

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.