MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 1319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017061	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384263635
2	NC_017061	TCCGGA	2	12	5386	5397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263637
3	NC_017061	TGAAGA	2	12	8487	8498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384263638
4	NC_017061	ACTGGC	2	12	17533	17544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263641
5	NC_017061	GAAGGT	2	12	28948	28959	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384263651
6	NC_017061	TTAAAT	2	12	29454	29465	50 %	50 %	0 %	0 %	384263651
7	NC_017061	CAGGCG	2	12	37800	37811	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384263657
8	NC_017061	AATGTG	2	12	42703	42714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263662
9	NC_017061	GAACTC	2	12	45499	45510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384263667
10	NC_017061	GAAAAA	2	12	48081	48092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384263669
11	NC_017061	AGCGGA	2	12	55346	55357	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384263677
12	NC_017061	TTGCCA	2	12	58757	58768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384263681
13	NC_017061	GAATCG	2	12	60962	60973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384263684
14	NC_017061	ATGATC	2	12	75465	75476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384263697
15	NC_017061	AGCTGC	2	12	76962	76973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263698
16	NC_017061	TGTCGG	2	12	78703	78714	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384263700
17	NC_017061	AACACC	2	12	80094	80105	50 %	0 %	0 %	50 %	384263701
18	NC_017061	ATGAGG	2	12	84264	84275	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384263705
19	NC_017061	TCAAAT	2	12	89969	89980	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384263712
20	NC_017061	GTATCG	2	12	91111	91122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384263712
21	NC_017061	TGGCAC	2	12	104622	104633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263716
22	NC_017061	ACTCGG	2	12	104737	104748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263716
23	NC_017061	TGCCGA	2	12	109398	109409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263718
24	NC_017061	GTCATT	2	12	110260	110271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384263719
25	NC_017061	CCAAGC	2	12	110756	110767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384263719
26	NC_017061	CATTTA	2	12	119786	119797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384263732
27	NC_017061	TCTGGT	2	12	119851	119862	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384263732
28	NC_017061	GAAGCT	2	12	120368	120379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384263733
29	NC_017061	CTTGCA	2	12	121513	121524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384263734
30	NC_017061	CTGTAG	2	12	121720	121731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384263735
31	NC_017061	AGTTGA	2	12	131944	131955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263742
32	NC_017061	TAAAGG	2	12	137073	137084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384263746
33	NC_017061	GTCGGT	2	12	143692	143703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384263761
34	NC_017061	ATCGAA	2	12	143785	143796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384263761
35	NC_017061	AATAAA	2	12	145072	145083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384263764
36	NC_017061	GCGATT	2	12	146209	146220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384263766
37	NC_017061	CATTAA	2	12	147226	147237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384263767
38	NC_017061	GAAAAG	2	12	148925	148936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263770
39	NC_017061	AAACAA	2	12	148966	148977	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384263770
40	NC_017061	AAAAAG	2	12	150694	150705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384263773
41	NC_017061	TTAACT	2	12	155491	155502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384263780
42	NC_017061	CGGTTG	2	12	155935	155946	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384263781
43	NC_017061	ACGGAT	2	12	184430	184441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384263793
44	NC_017061	TCCGGC	3	18	187678	187695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384263796
45	NC_017061	ATAAAT	2	12	189333	189344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384263798
46	NC_017061	TCTGAT	2	12	189354	189365	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384263798
47	NC_017061	ATCGTC	2	12	192297	192308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384263800
48	NC_017061	TTCTTT	2	12	197797	197808	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384263804
49	NC_017061	TGTTGA	2	12	203414	203425	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384263810
50	NC_017061	AAATAA	2	12	204020	204031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384263810
51	NC_017061	AGACAA	2	12	204080	204091	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384263810
52	NC_017061	GACGGC	2	12	204941	204952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384263811
53	NC_017061	TGGCCG	2	12	206831	206842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384263812
54	NC_017061	GAAATG	2	12	207343	207354	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384263812
55	NC_017061	TTAAAC	2	12	208866	208877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384263813
56	NC_017061	AGGCTG	2	12	214395	214406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384263816
57	NC_017061	ATCAGA	2	12	215024	215035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384263817
58	NC_017061	TGCGGA	2	12	216952	216963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384263819
59	NC_017061	TATCTT	2	12	219053	219064	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384263822
60	NC_017061	GTGAAC	2	12	224497	224508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384263827
61	NC_017061	CTTTTC	2	12	225256	225267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263828
62	NC_017061	AAGCGA	2	12	230028	230039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384263834
63	NC_017061	GATAAA	2	12	231370	231381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384263835
64	NC_017061	GAAAAG	2	12	231630	231641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263836
65	NC_017061	GAACAT	2	12	237947	237958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384263841
66	NC_017061	TGAGGC	2	12	243062	243073	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384263845
67	NC_017061	TTTTAT	2	12	246302	246313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384263848
68	NC_017061	ACCATC	2	12	249271	249282	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384263852
69	NC_017061	CTGCCG	2	12	249652	249663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384263852
70	NC_017061	GAGACG	2	12	251613	251624	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384263854
71	NC_017061	ATGCCG	2	12	255450	255461	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263857
72	NC_017061	CGAGGA	2	12	257936	257947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384263859
73	NC_017061	GCGGAA	2	12	261225	261236	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384263864
74	NC_017061	CGTTTG	2	12	262380	262391	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384263866
75	NC_017061	AGCGGG	2	12	263100	263111	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384263866
76	NC_017061	CAGGAT	2	12	268291	268302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384263872
77	NC_017061	TGAGAT	2	12	277912	277923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263881
78	NC_017061	TTTTCA	2	12	280592	280603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384263883
79	NC_017061	TCATTG	2	12	281646	281657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384263884
80	NC_017061	GAAGAG	2	12	282011	282022	50 %	0 %	50 %	0 %	384263884
81	NC_017061	CCACAG	2	12	282046	282057	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384263884
82	NC_017061	TTCTGC	2	12	284051	284062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384263886
83	NC_017061	GAAGCG	2	12	286404	286415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384263889
84	NC_017061	GGGCGA	2	12	286924	286935	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384263890
85	NC_017061	TTTATC	2	12	287530	287541	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384263891
86	NC_017061	AAAATC	2	12	289778	289789	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384263893
87	NC_017061	CATTGA	2	12	290700	290711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384263893
88	NC_017061	AAACAG	2	12	293507	293518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384263895
89	NC_017061	TTTCGG	2	12	295925	295936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384263898
90	NC_017061	AGAGTG	2	12	298403	298414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384263900
91	NC_017061	GAAAGA	2	12	298416	298427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263900
92	NC_017061	ACGCTG	2	12	300908	300919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263901
93	NC_017061	GGAAAA	2	12	304797	304808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263905
94	NC_017061	AGGATG	2	12	308397	308408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384263909
95	NC_017061	AGAATG	2	12	308552	308563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384263909
96	NC_017061	ATTGAT	2	12	312672	312683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384263914
97	NC_017061	GATCTC	2	12	315563	315574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384263917
98	NC_017061	ATGGGG	2	12	320023	320034	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384263920
99	NC_017061	TGTGCG	2	12	327655	327666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384263925
100	NC_017061	ATCAAT	2	12	331660	331671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384263927
101	NC_017061	TTTGAG	2	12	333024	333035	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384263928
102	NC_017061	GAGCAG	2	12	333327	333338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384263928
103	NC_017061	GCCTGA	2	12	338649	338660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384263935
104	NC_017061	AAATGC	2	12	348049	348060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384263938
105	NC_017061	CGGCGA	2	12	349321	349332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384263938
106	NC_017061	TCTGGA	2	12	350419	350430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384263938
107	NC_017061	AATGTC	2	12	353625	353636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384263939
108	NC_017061	TCCTCT	2	12	358214	358225	0 %	50 %	0 %	50 %	384263942
109	NC_017061	ATGAAA	2	12	363383	363394	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384263949
110	NC_017061	ATCAAA	2	12	363907	363918	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384263949
111	NC_017061	ATCCAG	2	12	365637	365648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384263952
112	NC_017061	TGCTCG	2	12	372849	372860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263957
113	NC_017061	GGATGC	2	12	374293	374304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384263958
114	NC_017061	CGGAAA	2	12	375243	375254	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384263960
115	NC_017061	TTTTGT	2	12	381399	381410	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384263966
116	NC_017061	ATTTTG	2	12	383110	383121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384263968
117	NC_017061	TGATCT	2	12	383238	383249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384263968
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342	NC_017061	TCCGTT	2	12	1144830	1144841	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384264714
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452	NC_017061	AGCTCA	2	12	1517727	1517738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384265052
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