MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus F837/76 plasmid pF837_10

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016780	AAT	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269860
2	NC_016780	GAA	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269860
3	NC_016780	T	7	7	408	414	0 %	100 %	0 %	0 %	376269860
4	NC_016780	GAA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269860
5	NC_016780	TCT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269860
6	NC_016780	A	7	7	1008	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	376269861
7	NC_016780	AGA	4	12	1167	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269861
8	NC_016780	GAAA	2	8	1191	1198	75 %	0 %	25 %	0 %	376269861
9	NC_016780	AG	3	6	1203	1208	50 %	0 %	50 %	0 %	376269861
10	NC_016780	AAC	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269861
11	NC_016780	ATT	2	6	1278	1283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269861
12	NC_016780	ATA	2	6	1806	1811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269862
13	NC_016780	TC	3	6	1812	1817	0 %	50 %	0 %	50 %	376269862
14	NC_016780	CAA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269862
15	NC_016780	A	6	6	1992	1997	100 %	0 %	0 %	0 %	376269862
16	NC_016780	TCC	2	6	2012	2017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376269862
17	NC_016780	TAG	3	9	2049	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269862
18	NC_016780	TGA	3	9	2071	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269862
19	NC_016780	TTG	2	6	2120	2125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269862
20	NC_016780	AAT	2	6	2171	2176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269862
21	NC_016780	TTC	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269862
22	NC_016780	TGC	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376269862
23	NC_016780	TGC	2	6	2210	2215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376269862
24	NC_016780	CAG	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269862
25	NC_016780	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	376269862
26	NC_016780	AAAT	2	8	2329	2336	75 %	25 %	0 %	0 %	376269862
27	NC_016780	TCAT	2	8	2415	2422	25 %	50 %	0 %	25 %	376269862
28	NC_016780	GTCCTA	2	12	2461	2472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376269862
29	NC_016780	T	7	7	2552	2558	0 %	100 %	0 %	0 %	376269862
30	NC_016780	T	6	6	2586	2591	0 %	100 %	0 %	0 %	376269862
31	NC_016780	TC	4	8	2599	2606	0 %	50 %	0 %	50 %	376269862
32	NC_016780	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	376269862
33	NC_016780	CAT	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376269862
34	NC_016780	T	6	6	2717	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	376269862
35	NC_016780	AT	3	6	2727	2732	50 %	50 %	0 %	0 %	376269862
36	NC_016780	TA	3	6	2810	2815	50 %	50 %	0 %	0 %	376269863
37	NC_016780	TTC	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269863
38	NC_016780	TTTTG	2	10	2886	2895	0 %	80 %	20 %	0 %	376269863
39	NC_016780	TTGCC	2	10	3322	3331	0 %	40 %	20 %	40 %	376269864
40	NC_016780	GGA	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376269864
41	NC_016780	AAT	3	9	3365	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269864
42	NC_016780	T	6	6	3381	3386	0 %	100 %	0 %	0 %	376269864
43	NC_016780	AAG	2	6	3434	3439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269864
44	NC_016780	ACAGA	2	10	3530	3539	60 %	0 %	20 %	20 %	376269864
45	NC_016780	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269864
46	NC_016780	CAA	2	6	3608	3613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269864
47	NC_016780	ATA	2	6	3647	3652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269864
48	NC_016780	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269864
49	NC_016780	AGC	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269864
50	NC_016780	GTC	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376269864
51	NC_016780	TAAA	2	8	3766	3773	75 %	25 %	0 %	0 %	376269864
52	NC_016780	TA	3	6	3968	3973	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
53	NC_016780	T	6	6	3974	3979	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
54	NC_016780	TTTAA	2	10	3988	3997	40 %	60 %	0 %	0 %	376269865
55	NC_016780	TTG	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269865
56	NC_016780	TTA	2	6	4067	4072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
57	NC_016780	T	6	6	4074	4079	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
58	NC_016780	TATTTT	2	12	4130	4141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	376269865
59	NC_016780	TAT	2	6	4149	4154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
60	NC_016780	CATT	2	8	4178	4185	25 %	50 %	0 %	25 %	376269865
61	NC_016780	TTAA	2	8	4258	4265	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
62	NC_016780	TA	3	6	4362	4367	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
63	NC_016780	T	6	6	4420	4425	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
64	NC_016780	TAG	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269865
65	NC_016780	TGT	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269865
66	NC_016780	T	6	6	4531	4536	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
67	NC_016780	TAT	3	9	4559	4567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
68	NC_016780	AT	3	6	4614	4619	50 %	50 %	0 %	0 %	376269865
69	NC_016780	CCT	2	6	4624	4629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376269865
70	NC_016780	TAT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269865
71	NC_016780	T	6	6	4675	4680	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
72	NC_016780	AAG	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269865
73	NC_016780	TTTTC	2	10	4753	4762	0 %	80 %	0 %	20 %	376269865
74	NC_016780	ACTTGA	2	12	4795	4806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	376269865
75	NC_016780	T	8	8	4812	4819	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
76	NC_016780	GA	3	6	4826	4831	50 %	0 %	50 %	0 %	376269865
77	NC_016780	TTG	2	6	4835	4840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376269865
78	NC_016780	TATTT	2	10	4845	4854	20 %	80 %	0 %	0 %	376269865
79	NC_016780	T	6	6	4852	4857	0 %	100 %	0 %	0 %	376269865
80	NC_016780	ATC	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376269865
81	NC_016780	AAT	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269865
82	NC_016780	AGC	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269865
83	NC_016780	TTC	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376269865
84	NC_016780	TAT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269866
85	NC_016780	AAT	3	9	5307	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269866
86	NC_016780	T	6	6	5401	5406	0 %	100 %	0 %	0 %	376269867
87	NC_016780	TAT	2	6	5434	5439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269867
88	NC_016780	ATT	2	6	5498	5503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269867
89	NC_016780	TAA	2	6	5508	5513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269867
90	NC_016780	T	6	6	5519	5524	0 %	100 %	0 %	0 %	376269867
91	NC_016780	AAG	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269868
92	NC_016780	TAA	2	6	6057	6062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269868
93	NC_016780	TGA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269868
94	NC_016780	TAA	2	6	6128	6133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269868
95	NC_016780	AG	3	6	6151	6156	50 %	0 %	50 %	0 %	376269868
96	NC_016780	GAT	3	9	6190	6198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269868
97	NC_016780	T	6	6	6217	6222	0 %	100 %	0 %	0 %	376269868
98	NC_016780	TTTA	2	8	6276	6283	25 %	75 %	0 %	0 %	376269868
99	NC_016780	TAA	2	6	6302	6307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376269868
100	NC_016780	A	6	6	6328	6333	100 %	0 %	0 %	0 %	376269868
101	NC_016780	ATT	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269868
102	NC_016780	TAAAA	2	10	6351	6360	80 %	20 %	0 %	0 %	376269868
103	NC_016780	AGA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269868
104	NC_016780	AATC	2	8	7706	7713	50 %	25 %	0 %	25 %	376269869
105	NC_016780	AG	3	6	7742	7747	50 %	0 %	50 %	0 %	376269869
106	NC_016780	AAG	2	6	7845	7850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269869
107	NC_016780	TGA	2	6	7897	7902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269869
108	NC_016780	TTA	2	6	7903	7908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269869
109	NC_016780	GAT	2	6	7925	7930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269869
110	NC_016780	GAC	2	6	7979	7984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376269869
111	NC_016780	A	6	6	8002	8007	100 %	0 %	0 %	0 %	376269869
112	NC_016780	AG	3	6	8041	8046	50 %	0 %	50 %	0 %	376269869
113	NC_016780	ATG	3	9	8082	8090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269869
114	NC_016780	ATTA	2	8	8111	8118	50 %	50 %	0 %	0 %	376269869
115	NC_016780	AGT	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269869
116	NC_016780	CAA	3	9	8180	8188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269869
117	NC_016780	GAA	2	6	8205	8210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269869
118	NC_016780	GA	3	6	8227	8232	50 %	0 %	50 %	0 %	376269869
119	NC_016780	AT	3	6	8269	8274	50 %	50 %	0 %	0 %	376269869
120	NC_016780	ATT	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269869
121	NC_016780	A	6	6	8416	8421	100 %	0 %	0 %	0 %	376269869
122	NC_016780	AAAC	2	8	8433	8440	75 %	0 %	0 %	25 %	376269869
123	NC_016780	CAA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376269869
124	NC_016780	AG	3	6	8521	8526	50 %	0 %	50 %	0 %	376269869
125	NC_016780	TGAAAA	2	12	8527	8538	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	376269869
126	NC_016780	A	6	6	8574	8579	100 %	0 %	0 %	0 %	376269869
127	NC_016780	AGA	2	6	8662	8667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269869
128	NC_016780	AGT	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376269869
129	NC_016780	GAA	2	6	8713	8718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269869
130	NC_016780	AAG	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269869
131	NC_016780	AACAA	2	10	8764	8773	80 %	0 %	0 %	20 %	376269869
132	NC_016780	GATG	2	8	8868	8875	25 %	25 %	50 %	0 %	376269869
133	NC_016780	A	6	6	8901	8906	100 %	0 %	0 %	0 %	376269869
134	NC_016780	AAG	2	6	8919	8924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376269869
135	NC_016780	TGTA	2	8	8997	9004	25 %	50 %	25 %	0 %	376269869
136	NC_016780	A	6	6	9011	9016	100 %	0 %	0 %	0 %	376269869
137	NC_016780	ATT	2	6	9050	9055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376269869
138	NC_016780	A	6	6	9107	9112	100 %	0 %	0 %	0 %	376269869
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.