MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNC2

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016773	ATT	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287576
2	NC_016773	TGA	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287576
3	NC_016773	TAA	2	6	117	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287576
4	NC_016773	AAG	2	6	158	163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287576
5	NC_016773	TGA	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287576
6	NC_016773	TAT	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287576
7	NC_016773	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	375287576
8	NC_016773	ATTTC	2	10	305	314	20 %	60 %	0 %	20 %	375287576
9	NC_016773	TCAT	2	8	407	414	25 %	50 %	0 %	25 %	375287576
10	NC_016773	ACA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287576
11	NC_016773	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287576
12	NC_016773	AAG	2	6	569	574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287576
13	NC_016773	A	6	6	587	592	100 %	0 %	0 %	0 %	375287576
14	NC_016773	A	6	6	597	602	100 %	0 %	0 %	0 %	375287576
15	NC_016773	AAT	2	6	634	639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287576
16	NC_016773	TGAA	2	8	650	657	50 %	25 %	25 %	0 %	375287576
17	NC_016773	A	7	7	665	671	100 %	0 %	0 %	0 %	375287576
18	NC_016773	TTCT	2	8	689	696	0 %	75 %	0 %	25 %	375287576
19	NC_016773	GAAAA	2	10	715	724	80 %	0 %	20 %	0 %	375287576
20	NC_016773	GAAC	2	8	741	748	50 %	0 %	25 %	25 %	375287576
21	NC_016773	GA	4	8	778	785	50 %	0 %	50 %	0 %	375287576
22	NC_016773	TTA	2	6	800	805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287576
23	NC_016773	T	6	6	813	818	0 %	100 %	0 %	0 %	375287576
24	NC_016773	A	7	7	819	825	100 %	0 %	0 %	0 %	375287576
25	NC_016773	TTG	2	6	857	862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287576
26	NC_016773	A	7	7	916	922	100 %	0 %	0 %	0 %	375287576
27	NC_016773	TGGTT	2	10	1000	1009	0 %	60 %	40 %	0 %	375287577
28	NC_016773	A	6	6	1133	1138	100 %	0 %	0 %	0 %	375287577
29	NC_016773	CAAT	2	8	1207	1214	50 %	25 %	0 %	25 %	375287577
30	NC_016773	AAG	2	6	1229	1234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287577
31	NC_016773	AAC	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287577
32	NC_016773	GACAT	2	10	1257	1266	40 %	20 %	20 %	20 %	375287577
33	NC_016773	A	6	6	1519	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	375287578
34	NC_016773	ATT	2	6	1526	1531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287578
35	NC_016773	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287578
36	NC_016773	CAT	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287578
37	NC_016773	GGAT	2	8	1611	1618	25 %	25 %	50 %	0 %	375287578
38	NC_016773	TGG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287578
39	NC_016773	TCAA	2	8	1723	1730	50 %	25 %	0 %	25 %	375287578
40	NC_016773	T	7	7	1788	1794	0 %	100 %	0 %	0 %	375287578
41	NC_016773	AAT	2	6	1801	1806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287578
42	NC_016773	ATTGT	2	10	1830	1839	20 %	60 %	20 %	0 %	375287578
43	NC_016773	A	6	6	1946	1951	100 %	0 %	0 %	0 %	375287578
44	NC_016773	TTTA	2	8	1957	1964	25 %	75 %	0 %	0 %	375287578
45	NC_016773	AAT	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287578
46	NC_016773	TATT	2	8	2010	2017	25 %	75 %	0 %	0 %	375287578
47	NC_016773	TAA	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287578
48	NC_016773	T	7	7	2126	2132	0 %	100 %	0 %	0 %	375287578
49	NC_016773	T	6	6	2262	2267	0 %	100 %	0 %	0 %	375287579
50	NC_016773	TC	4	8	2281	2288	0 %	50 %	0 %	50 %	375287579
51	NC_016773	TA	4	8	2298	2305	50 %	50 %	0 %	0 %	375287579
52	NC_016773	GTA	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287579
53	NC_016773	T	6	6	2337	2342	0 %	100 %	0 %	0 %	375287579
54	NC_016773	A	6	6	2356	2361	100 %	0 %	0 %	0 %	375287579
55	NC_016773	CTCC	2	8	2382	2389	0 %	25 %	0 %	75 %	375287579
56	NC_016773	T	6	6	2399	2404	0 %	100 %	0 %	0 %	375287579
57	NC_016773	ACC	2	6	2492	2497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287579
58	NC_016773	ATT	2	6	2517	2522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287580
59	NC_016773	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	375287580
60	NC_016773	TAA	2	6	2632	2637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287580
61	NC_016773	TAT	2	6	3220	3225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287581
62	NC_016773	GTT	2	6	3231	3236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375287581
63	NC_016773	AC	3	6	3256	3261	50 %	0 %	0 %	50 %	375287581
64	NC_016773	TTCTT	2	10	3360	3369	0 %	80 %	0 %	20 %	375287581
65	NC_016773	ATT	2	6	3413	3418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287581
66	NC_016773	TGGT	2	8	3860	3867	0 %	50 %	50 %	0 %	375287582
67	NC_016773	T	6	6	3906	3911	0 %	100 %	0 %	0 %	375287582
68	NC_016773	TA	3	6	3953	3958	50 %	50 %	0 %	0 %	375287582
69	NC_016773	T	6	6	3988	3993	0 %	100 %	0 %	0 %	375287582
70	NC_016773	GAT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287583
71	NC_016773	AGG	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287583
72	NC_016773	AT	3	6	4106	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	375287583
73	NC_016773	ATT	2	6	4176	4181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287583
74	NC_016773	ATC	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287583
75	NC_016773	TTGTT	2	10	4380	4389	0 %	80 %	20 %	0 %	375287583
76	NC_016773	AAC	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287583
77	NC_016773	TTC	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287583
78	NC_016773	ATTGGT	2	12	4548	4559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375287583
79	NC_016773	ATA	2	6	4568	4573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287583
80	NC_016773	AT	4	8	4589	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	375287583
81	NC_016773	TCT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287584
82	NC_016773	TAT	2	6	4834	4839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287584
83	NC_016773	T	6	6	4882	4887	0 %	100 %	0 %	0 %	375287584
84	NC_016773	GTTTT	2	10	5265	5274	0 %	80 %	20 %	0 %	375287585
85	NC_016773	T	6	6	5271	5276	0 %	100 %	0 %	0 %	375287585

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.