MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p

Total Repeats: 6211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016591	CAGG	2	8	178372	178379	25 %	0 %	50 %	25 %	377807211
3002	NC_016591	GCG	2	6	178394	178399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807211
3003	NC_016591	GTT	2	6	178412	178417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807211
3004	NC_016591	GAA	2	6	178464	178469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807212
3005	NC_016591	GAG	2	6	178477	178482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807212
3006	NC_016591	CGTG	2	8	178488	178495	0 %	25 %	50 %	25 %	377807212
3007	NC_016591	CGGA	2	8	178610	178617	25 %	0 %	50 %	25 %	377807212
3008	NC_016591	TCG	2	6	178840	178845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807213
3009	NC_016591	TCG	2	6	178859	178864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807213
3010	NC_016591	CGC	2	6	178928	178933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807213
3011	NC_016591	GCG	2	6	179015	179020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807213
3012	NC_016591	TTTC	2	8	179233	179240	0 %	75 %	0 %	25 %	377807213
3013	NC_016591	GGC	2	6	179247	179252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807213
3014	NC_016591	ATCA	2	8	179770	179777	50 %	25 %	0 %	25 %	377807214
3015	NC_016591	CGA	2	6	179785	179790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807214
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3017	NC_016591	GGC	2	6	179895	179900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807214
3018	NC_016591	GAC	2	6	179940	179945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807214
3019	NC_016591	GGC	2	6	179949	179954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807214
3020	NC_016591	CG	3	6	180038	180043	0 %	0 %	50 %	50 %	377807214
3021	NC_016591	ACG	2	6	180097	180102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807214
3022	NC_016591	GAA	2	6	180125	180130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807214
3023	NC_016591	TGC	2	6	180200	180205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807215
3024	NC_016591	TGG	3	9	180382	180390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807215
3025	NC_016591	GGT	2	6	180407	180412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807215
3026	NC_016591	TGC	2	6	180468	180473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807215
3027	NC_016591	GGCGGA	2	12	180577	180588	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	377807216
3028	NC_016591	TAG	2	6	180676	180681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807216
3029	NC_016591	CG	3	6	180712	180717	0 %	0 %	50 %	50 %	377807216
3030	NC_016591	CGA	2	6	180805	180810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807216
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3032	NC_016591	TGGC	2	8	180874	180881	0 %	25 %	50 %	25 %	377807216
3033	NC_016591	CAA	2	6	180980	180985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377807217
3034	NC_016591	TCG	2	6	180989	180994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807217
3035	NC_016591	CGC	2	6	180998	181003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807217
3036	NC_016591	CATT	2	8	181006	181013	25 %	50 %	0 %	25 %	377807217
3037	NC_016591	CGA	2	6	181049	181054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807217
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3039	NC_016591	GCAT	2	8	181120	181127	25 %	25 %	25 %	25 %	377807217
3040	NC_016591	CT	3	6	181183	181188	0 %	50 %	0 %	50 %	377807217
3041	NC_016591	TCCA	2	8	181252	181259	25 %	25 %	0 %	50 %	377807217
3042	NC_016591	CCG	2	6	181323	181328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807217
3043	NC_016591	GGC	2	6	181380	181385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807217
3044	NC_016591	TCTT	2	8	181750	181757	0 %	75 %	0 %	25 %	377807217
3045	NC_016591	GGC	2	6	181767	181772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807217
3046	NC_016591	GCG	2	6	181800	181805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807217
3047	NC_016591	TC	3	6	182119	182124	0 %	50 %	0 %	50 %	377807218
3048	NC_016591	GCC	2	6	182159	182164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807218
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3053	NC_016591	TGGT	2	8	182538	182545	0 %	50 %	50 %	0 %	377807219
3054	NC_016591	CGA	2	6	182571	182576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807219
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3057	NC_016591	GTGGA	2	10	182894	182903	20 %	20 %	60 %	0 %	377807219
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3060	NC_016591	CACG	2	8	183066	183073	25 %	0 %	25 %	50 %	377807219
3061	NC_016591	CGC	2	6	183081	183086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807219
3062	NC_016591	GC	3	6	183085	183090	0 %	0 %	50 %	50 %	377807219
3063	NC_016591	GGT	2	6	183488	183493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807220
3064	NC_016591	CAAG	2	8	183524	183531	50 %	0 %	25 %	25 %	377807220
3065	NC_016591	ATCC	2	8	183610	183617	25 %	25 %	0 %	50 %	377807220
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3069	NC_016591	CAGG	2	8	183793	183800	25 %	0 %	50 %	25 %	377807220
3070	NC_016591	TCG	2	6	183801	183806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807220
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3074	NC_016591	CTG	2	6	183992	183997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807221
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3081	NC_016591	GTGG	2	8	184192	184199	0 %	25 %	75 %	0 %	377807221
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3089	NC_016591	TGC	2	6	184524	184529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807221
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3092	NC_016591	TGC	2	6	184606	184611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807221
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3101	NC_016591	TCT	2	6	185353	185358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807222
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3104	NC_016591	GAGC	2	8	185492	185499	25 %	0 %	50 %	25 %	377807222
3105	NC_016591	CAA	2	6	185571	185576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377807222
3106	NC_016591	GA	3	6	185655	185660	50 %	0 %	50 %	0 %	377807222
3107	NC_016591	CCT	2	6	185703	185708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377807222
3108	NC_016591	TGG	2	6	185744	185749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807222
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3110	NC_016591	CG	3	6	185912	185917	0 %	0 %	50 %	50 %	377807222
3111	NC_016591	ACG	2	6	185932	185937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807222
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3119	NC_016591	GA	3	6	186472	186477	50 %	0 %	50 %	0 %	377807222
3120	NC_016591	CGG	2	6	186488	186493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807222
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3122	NC_016591	TGAC	2	8	186796	186803	25 %	25 %	25 %	25 %	377807223
3123	NC_016591	GGACGC	2	12	186830	186841	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	377807223
3124	NC_016591	GCG	2	6	186895	186900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807223
3125	NC_016591	TTC	2	6	186904	186909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807223
3126	NC_016591	TCGC	2	8	186967	186974	0 %	25 %	25 %	50 %	377807223
3127	NC_016591	GTC	2	6	187033	187038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807223
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3131	NC_016591	TGCTGG	2	12	187239	187250	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	377807223
3132	NC_016591	ATG	2	6	187404	187409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807224
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3135	NC_016591	ACC	2	6	187463	187468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807224
3136	NC_016591	CCCG	2	8	187483	187490	0 %	0 %	25 %	75 %	377807224
3137	NC_016591	GCC	2	6	187494	187499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807224
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3149	NC_016591	GCA	2	6	188109	188114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807224
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3154	NC_016591	GCA	2	6	188658	188663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807225
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3233	NC_016591	TGC	2	6	194856	194861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807232
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3235	NC_016591	CGA	2	6	194916	194921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807232
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3237	NC_016591	GTCGA	2	10	194963	194972	20 %	20 %	40 %	20 %	377807232
3238	NC_016591	TGC	2	6	194989	194994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807232
3239	NC_016591	CCTT	2	8	195000	195007	0 %	50 %	0 %	50 %	377807232
3240	NC_016591	CCA	2	6	195048	195053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807232
3241	NC_016591	GC	3	6	195054	195059	0 %	0 %	50 %	50 %	377807232
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3243	NC_016591	GCG	2	6	195138	195143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807232
3244	NC_016591	GTT	2	6	195966	195971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807233
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3363	NC_016591	CTG	2	6	202384	202389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807241
3364	NC_016591	CAT	2	6	202452	202457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807241
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3367	NC_016591	GCC	2	6	202548	202553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807241
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3375	NC_016591	TGG	2	6	203174	203179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807241
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3453	NC_016591	AC	3	6	207267	207272	50 %	0 %	0 %	50 %	377807242
3454	NC_016591	GGCG	2	8	207352	207359	0 %	0 %	75 %	25 %	377807242
3455	NC_016591	CCAG	2	8	207399	207406	25 %	0 %	25 %	50 %	377807242
3456	NC_016591	CGGTT	2	10	207665	207674	0 %	40 %	40 %	20 %	377807242
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3461	NC_016591	CCGG	2	8	207840	207847	0 %	0 %	50 %	50 %	377807242
3462	NC_016591	CCG	2	6	207976	207981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807242
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3465	NC_016591	GAG	2	6	208268	208273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807243
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3473	NC_016591	GTGGC	2	10	208456	208465	0 %	20 %	60 %	20 %	377807243
3474	NC_016591	GC	3	6	208479	208484	0 %	0 %	50 %	50 %	377807243
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3478	NC_016591	CGGCA	2	10	208661	208670	20 %	0 %	40 %	40 %	377807243
3479	NC_016591	TGC	2	6	208720	208725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3480	NC_016591	GCG	2	6	208763	208768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807243
3481	NC_016591	GCT	2	6	208805	208810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3482	NC_016591	CGA	2	6	208811	208816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3483	NC_016591	GCT	2	6	208844	208849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3484	NC_016591	GCG	2	6	208900	208905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807243
3485	NC_016591	TGC	2	6	208966	208971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3486	NC_016591	ACG	2	6	209092	209097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3487	NC_016591	TCA	2	6	209188	209193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807243
3488	NC_016591	TGG	2	6	209211	209216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807243
3489	NC_016591	GCT	2	6	209249	209254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3490	NC_016591	TCT	2	6	209260	209265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807243
3491	NC_016591	CTG	2	6	209277	209282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807243
3492	NC_016591	GCC	2	6	209308	209313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807244
3493	NC_016591	GCGT	2	8	209337	209344	0 %	25 %	50 %	25 %	377807244
3494	NC_016591	GGC	2	6	209490	209495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807244
3495	NC_016591	GCC	3	9	209554	209562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807244
3496	NC_016591	GTA	2	6	209563	209568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807244
3497	NC_016591	CGGCA	2	10	209569	209578	20 %	0 %	40 %	40 %	377807244
3498	NC_016591	CG	3	6	209605	209610	0 %	0 %	50 %	50 %	377807244
3499	NC_016591	CAG	2	6	209617	209622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807244
3500	NC_016591	GCC	2	6	209623	209628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807244

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