MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. spizizenii TU-B-10 chromosome

Total Repeats: 75801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016047	TGG	2	6	38354	38359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350264127
502	NC_016047	TTTTG	2	10	38379	38388	0 %	80 %	20 %	0 %	350264127
503	NC_016047	TGT	3	9	38430	38438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264127
504	NC_016047	CTGC	2	8	38458	38465	0 %	25 %	25 %	50 %	350264127
505	NC_016047	CAG	2	6	38496	38501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264127
506	NC_016047	AGC	3	9	38551	38559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264127
507	NC_016047	AGA	2	6	38619	38624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264127
508	NC_016047	AAAC	2	8	38665	38672	75 %	0 %	0 %	25 %	350264127
509	NC_016047	GAT	2	6	38721	38726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264127
510	NC_016047	TGA	2	6	38826	38831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264127
511	NC_016047	TTC	2	6	38849	38854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264127
512	NC_016047	GGA	2	6	38860	38865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264127
513	NC_016047	TGA	2	6	38901	38906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264127
514	NC_016047	A	6	6	38915	38920	100 %	0 %	0 %	0 %	350264127
515	NC_016047	TGTT	2	8	38936	38943	0 %	75 %	25 %	0 %	350264127
516	NC_016047	A	7	7	38987	38993	100 %	0 %	0 %	0 %	350264127
517	NC_016047	AAGA	2	8	39010	39017	75 %	0 %	25 %	0 %	350264127
518	NC_016047	TGA	2	6	39030	39035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264127
519	NC_016047	AGC	2	6	39036	39041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264127
520	NC_016047	ATC	2	6	39064	39069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264127
521	NC_016047	TCC	2	6	39075	39080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350264127
522	NC_016047	GAT	2	6	39090	39095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264127
523	NC_016047	AAAG	2	8	39118	39125	75 %	0 %	25 %	0 %	350264127
524	NC_016047	ACT	2	6	39198	39203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264127
525	NC_016047	TA	3	6	39208	39213	50 %	50 %	0 %	0 %	350264127
526	NC_016047	TTTA	2	8	39236	39243	25 %	75 %	0 %	0 %	350264128
527	NC_016047	AAC	2	6	39396	39401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350264128
528	NC_016047	CT	3	6	39427	39432	0 %	50 %	0 %	50 %	350264128
529	NC_016047	TGT	2	6	39497	39502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264128
530	NC_016047	TCGC	2	8	39528	39535	0 %	25 %	25 %	50 %	350264128
531	NC_016047	TGA	2	6	39566	39571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264128
532	NC_016047	ATG	2	6	39606	39611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264128
533	NC_016047	GAA	2	6	39645	39650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264128
534	NC_016047	TGA	2	6	39751	39756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264128
535	NC_016047	GCCA	2	8	39789	39796	25 %	0 %	25 %	50 %	350264128
536	NC_016047	TCG	2	6	39808	39813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264128
537	NC_016047	A	7	7	39849	39855	100 %	0 %	0 %	0 %	350264128
538	NC_016047	ACG	2	6	40034	40039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264129
539	NC_016047	GGA	2	6	40040	40045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264129
540	NC_016047	GAT	2	6	40147	40152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264129
541	NC_016047	GAAGTT	2	12	40208	40219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264129
542	NC_016047	TCA	2	6	40258	40263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264129
543	NC_016047	TAA	2	6	40291	40296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350264130
544	NC_016047	ATA	2	6	40317	40322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350264130
545	NC_016047	AGC	2	6	40323	40328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264130
546	NC_016047	CGT	2	6	40359	40364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264130
547	NC_016047	AGC	2	6	40388	40393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264130
548	NC_016047	AAG	2	6	40518	40523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264130
549	NC_016047	CAG	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264130
550	NC_016047	GAT	2	6	40639	40644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264130
551	NC_016047	AG	3	6	40722	40727	50 %	0 %	50 %	0 %	350264130
552	NC_016047	GGAA	2	8	40748	40755	50 %	0 %	50 %	0 %	350264131
553	NC_016047	TGA	2	6	40778	40783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264131
554	NC_016047	TA	3	6	40790	40795	50 %	50 %	0 %	0 %	350264131
555	NC_016047	TTTG	2	8	40830	40837	0 %	75 %	25 %	0 %	350264131
556	NC_016047	A	6	6	40843	40848	100 %	0 %	0 %	0 %	350264131
557	NC_016047	GCT	2	6	40872	40877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264131
558	NC_016047	T	8	8	40890	40897	0 %	100 %	0 %	0 %	350264131
559	NC_016047	AAG	2	6	41030	41035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264131
560	NC_016047	TAT	2	6	41076	41081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264131
561	NC_016047	CGCA	2	8	41084	41091	25 %	0 %	25 %	50 %	350264131
562	NC_016047	CTG	2	6	41122	41127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264131
563	NC_016047	AGA	2	6	41136	41141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264131
564	NC_016047	TCA	2	6	41168	41173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264131
565	NC_016047	AGC	2	6	41177	41182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264131
566	NC_016047	CCTT	2	8	41223	41230	0 %	50 %	0 %	50 %	350264131
567	NC_016047	AGAC	2	8	41259	41266	50 %	0 %	25 %	25 %	350264131
568	NC_016047	CAA	2	6	41319	41324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350264131
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571	NC_016047	A	6	6	41468	41473	100 %	0 %	0 %	0 %	350264131
572	NC_016047	AT	3	6	41509	41514	50 %	50 %	0 %	0 %	350264131
573	NC_016047	TGT	2	6	41522	41527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264131
574	NC_016047	CAAT	2	8	41575	41582	50 %	25 %	0 %	25 %	350264131
575	NC_016047	CAACA	2	10	41603	41612	60 %	0 %	0 %	40 %	350264131
576	NC_016047	AGG	2	6	41714	41719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264131
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582	NC_016047	AAAG	2	8	41996	42003	75 %	0 %	25 %	0 %	350264132
583	NC_016047	T	6	6	42070	42075	0 %	100 %	0 %	0 %	350264132
584	NC_016047	CTG	2	6	42082	42087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264132
585	NC_016047	AG	3	6	42105	42110	50 %	0 %	50 %	0 %	350264132
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592	NC_016047	GAT	2	6	42667	42672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264133
593	NC_016047	GAA	2	6	42674	42679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264133
594	NC_016047	ATC	2	6	42681	42686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264133
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597	NC_016047	A	6	6	42764	42769	100 %	0 %	0 %	0 %	350264133
598	NC_016047	AGA	2	6	42783	42788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264133
599	NC_016047	AAG	2	6	42840	42845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264133
600	NC_016047	AGA	2	6	42886	42891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264133
601	NC_016047	TCTG	2	8	42900	42907	0 %	50 %	25 %	25 %	350264133
602	NC_016047	TAAA	2	8	42915	42922	75 %	25 %	0 %	0 %	350264133
603	NC_016047	A	6	6	42920	42925	100 %	0 %	0 %	0 %	350264133
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606	NC_016047	GCT	3	9	43166	43174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264134
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609	NC_016047	TCAGAT	2	12	43271	43282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	350264134
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611	NC_016047	ATG	2	6	43333	43338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264134
612	NC_016047	AAAC	2	8	43374	43381	75 %	0 %	0 %	25 %	350264134
613	NC_016047	ATGA	2	8	43392	43399	50 %	25 %	25 %	0 %	350264134
614	NC_016047	GGA	2	6	43439	43444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264134
615	NC_016047	TCAG	2	8	43452	43459	25 %	25 %	25 %	25 %	350264134
616	NC_016047	GCT	2	6	43466	43471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264134
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618	NC_016047	TGA	2	6	43534	43539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264134
619	NC_016047	AAG	2	6	43594	43599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264134
620	NC_016047	GGCG	2	8	43629	43636	0 %	0 %	75 %	25 %	350264134
621	NC_016047	TTC	2	6	43651	43656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264134
622	NC_016047	CTC	2	6	43657	43662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350264134
623	NC_016047	TCT	2	6	43736	43741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264135
624	NC_016047	CGT	2	6	43743	43748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264135
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626	NC_016047	AC	3	6	43810	43815	50 %	0 %	0 %	50 %	350264135
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757	NC_016047	TCA	2	6	50309	50314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264141
758	NC_016047	GA	3	6	50339	50344	50 %	0 %	50 %	0 %	350264141
759	NC_016047	GCAT	2	8	50385	50392	25 %	25 %	25 %	25 %	350264141
760	NC_016047	GAAGC	2	10	50500	50509	40 %	0 %	40 %	20 %	350264141
761	NC_016047	A	7	7	50659	50665	100 %	0 %	0 %	0 %	350264141
762	NC_016047	GGA	2	6	50700	50705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264141
763	NC_016047	GAAT	2	8	50709	50716	50 %	25 %	25 %	0 %	350264141
764	NC_016047	GAAA	2	8	50743	50750	75 %	0 %	25 %	0 %	350264142
765	NC_016047	GAA	2	6	50755	50760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264142
766	NC_016047	ATT	2	6	50953	50958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264142
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768	NC_016047	GAA	2	6	51047	51052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264142
769	NC_016047	TGA	2	6	51067	51072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264142
770	NC_016047	TTA	2	6	51097	51102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264142
771	NC_016047	GAA	2	6	51134	51139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264142
772	NC_016047	TGC	2	6	51168	51173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264142
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774	NC_016047	GGC	2	6	51196	51201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350264142
775	NC_016047	TGA	2	6	51270	51275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264142
776	NC_016047	TGTT	2	8	51291	51298	0 %	75 %	25 %	0 %	350264142
777	NC_016047	TTTC	2	8	51379	51386	0 %	75 %	0 %	25 %	350264142
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782	NC_016047	TGTTT	2	10	51800	51809	0 %	80 %	20 %	0 %	350264143
783	NC_016047	TGA	2	6	51866	51871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264143
784	NC_016047	A	6	6	51918	51923	100 %	0 %	0 %	0 %	350264143
785	NC_016047	GAT	2	6	51932	51937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264143
786	NC_016047	AAAG	2	8	51944	51951	75 %	0 %	25 %	0 %	350264143
787	NC_016047	GAAT	3	12	51961	51972	50 %	25 %	25 %	0 %	350264143
788	NC_016047	GCT	2	6	52001	52006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264143
789	NC_016047	TAC	2	6	52023	52028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264143
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791	NC_016047	TGA	2	6	52097	52102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264143
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793	NC_016047	A	7	7	52134	52140	100 %	0 %	0 %	0 %	350264143
794	NC_016047	GAAAA	2	10	52173	52182	80 %	0 %	20 %	0 %	350264143
795	NC_016047	GAA	2	6	52197	52202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264143
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811	NC_016047	CGGAT	2	10	53698	53707	20 %	20 %	40 %	20 %	350264146
812	NC_016047	TCC	2	6	53745	53750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350264146
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832	NC_016047	T	7	7	55323	55329	0 %	100 %	0 %	0 %	350264147
833	NC_016047	GA	3	6	55352	55357	50 %	0 %	50 %	0 %	350264147
834	NC_016047	CA	3	6	55380	55385	50 %	0 %	0 %	50 %	350264148
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867	NC_016047	AGC	2	6	58738	58743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264151
868	NC_016047	TCAG	2	8	58746	58753	25 %	25 %	25 %	25 %	350264151
869	NC_016047	AGAA	2	8	58875	58882	75 %	0 %	25 %	0 %	350264152
870	NC_016047	TCGT	2	8	58893	58900	0 %	50 %	25 %	25 %	350264152
871	NC_016047	AT	3	6	58942	58947	50 %	50 %	0 %	0 %	350264152
872	NC_016047	AAAC	2	8	58962	58969	75 %	0 %	0 %	25 %	350264152
873	NC_016047	TCA	2	6	59030	59035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264152
874	NC_016047	GGA	2	6	59203	59208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264152
875	NC_016047	GCA	2	6	59214	59219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264152
876	NC_016047	CACT	2	8	59231	59238	25 %	25 %	0 %	50 %	350264152
877	NC_016047	CTG	2	6	59330	59335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264152
878	NC_016047	ACT	2	6	59342	59347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264152
879	NC_016047	TCCT	2	8	59384	59391	0 %	50 %	0 %	50 %	350264152
880	NC_016047	AGC	2	6	59406	59411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264152
881	NC_016047	AAT	2	6	59468	59473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350264152
882	NC_016047	GAA	2	6	59612	59617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264153
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884	NC_016047	AAAT	2	8	59696	59703	75 %	25 %	0 %	0 %	350264153
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