MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 12001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015921	TAA	3	9	108	116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127325
2	NC_015921	TTC	2	6	443	448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127325
3	NC_015921	ACC	2	6	479	484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127325
4	NC_015921	AAC	2	6	499	504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127325
5	NC_015921	AAT	2	6	532	537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127325
6	NC_015921	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127325
7	NC_015921	CTT	2	6	600	605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127325
8	NC_015921	CTT	2	6	846	851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127326
9	NC_015921	TCA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127326
10	NC_015921	ATA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127326
11	NC_015921	AGC	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127326
12	NC_015921	ATT	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127326
13	NC_015921	GTT	2	6	1092	1097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127326
14	NC_015921	CCT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127326
15	NC_015921	TCC	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127326
16	NC_015921	CTA	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127326
17	NC_015921	TCA	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127326
18	NC_015921	ATC	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127326
19	NC_015921	TTG	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127326
20	NC_015921	TCT	2	6	1832	1837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127327
21	NC_015921	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127327
22	NC_015921	GAA	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127327
23	NC_015921	TCT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127327
24	NC_015921	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127327
25	NC_015921	TCA	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127327
26	NC_015921	AAC	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127327
27	NC_015921	GAA	2	6	2204	2209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127327
28	NC_015921	AGA	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127327
29	NC_015921	TAT	2	6	2496	2501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127327
30	NC_015921	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127327
31	NC_015921	TTG	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127327
32	NC_015921	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127327
33	NC_015921	CTT	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127327
34	NC_015921	AAT	2	6	3041	3046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127327
35	NC_015921	ATT	2	6	3181	3186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127327
36	NC_015921	TCA	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127327
37	NC_015921	GAT	2	6	3455	3460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
38	NC_015921	TAA	2	6	3559	3564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
39	NC_015921	ATT	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127328
40	NC_015921	ATT	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127328
41	NC_015921	TAA	2	6	3673	3678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
42	NC_015921	ACA	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127328
43	NC_015921	TGG	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127328
44	NC_015921	ATA	2	6	3864	3869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
45	NC_015921	TAA	2	6	3904	3909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
46	NC_015921	TGA	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
47	NC_015921	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
48	NC_015921	AAT	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
49	NC_015921	ATT	2	6	4233	4238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127328
50	NC_015921	GCT	2	6	4271	4276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127328
51	NC_015921	ATC	2	6	4386	4391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127328
52	NC_015921	GTA	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
53	NC_015921	ATG	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
54	NC_015921	GAT	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
55	NC_015921	TAC	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127328
56	NC_015921	ATT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127328
57	NC_015921	ACA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127328
58	NC_015921	ATC	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127328
59	NC_015921	AGT	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127328
60	NC_015921	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127328
61	NC_015921	GGA	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127328
62	NC_015921	TTG	2	6	5047	5052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127328
63	NC_015921	ACT	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127328
64	NC_015921	TAA	2	6	5164	5169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
65	NC_015921	AAT	2	6	5187	5192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127328
66	NC_015921	TAC	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127329
67	NC_015921	CAA	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127329
68	NC_015921	TCA	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127329
69	NC_015921	CTT	2	6	5427	5432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127329
70	NC_015921	CTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127329
71	NC_015921	TAA	2	6	5660	5665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127329
72	NC_015921	ATT	2	6	5693	5698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127329
73	NC_015921	CCA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127329
74	NC_015921	CTT	2	6	5808	5813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127329
75	NC_015921	TAA	2	6	6187	6192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127329
76	NC_015921	CTT	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127329
77	NC_015921	TAC	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127329
78	NC_015921	ACC	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127330
79	NC_015921	TAT	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127330
80	NC_015921	TTA	2	6	6636	6641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127330
81	NC_015921	AGC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127330
82	NC_015921	ATT	2	6	6814	6819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127330
83	NC_015921	TAG	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127330
84	NC_015921	ACA	3	9	6918	6926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127330
85	NC_015921	ACT	3	9	6932	6940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127330
86	NC_015921	AAT	2	6	6958	6963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
87	NC_015921	TAA	2	6	7020	7025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
88	NC_015921	ATA	2	6	7064	7069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
89	NC_015921	ATA	2	6	7087	7092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
90	NC_015921	TAA	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
91	NC_015921	ATA	2	6	7161	7166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
92	NC_015921	ATA	2	6	7175	7180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127330
93	NC_015921	ATT	2	6	7621	7626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127331
94	NC_015921	TCT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127331
95	NC_015921	GCT	2	6	7798	7803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127331
96	NC_015921	ATC	2	6	7828	7833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127331
97	NC_015921	ATT	2	6	7969	7974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127331
98	NC_015921	TCA	2	6	8006	8011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127331
99	NC_015921	TAT	2	6	8070	8075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127331
100	NC_015921	CTT	2	6	8190	8195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127331
101	NC_015921	TCA	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127331
102	NC_015921	TGC	2	6	8240	8245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127331
103	NC_015921	TAT	2	6	8265	8270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127331
104	NC_015921	TAC	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127332
105	NC_015921	ATT	2	6	8595	8600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127332
106	NC_015921	GCT	2	6	8623	8628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127332
107	NC_015921	TAA	2	6	8694	8699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127332
108	NC_015921	GAA	2	6	8747	8752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127332
109	NC_015921	ATA	2	6	8855	8860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127332
110	NC_015921	CTC	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127332
111	NC_015921	ACG	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127332
112	NC_015921	TAA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127332
113	NC_015921	GAA	2	6	9095	9100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127332
114	NC_015921	AAT	2	6	9197	9202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
115	NC_015921	TAA	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
116	NC_015921	ATA	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
117	NC_015921	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127333
118	NC_015921	AAC	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127333
119	NC_015921	TAA	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
120	NC_015921	AAT	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
121	NC_015921	ATT	2	6	9464	9469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127333
122	NC_015921	TTA	2	6	9699	9704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127333
123	NC_015921	AGT	2	6	9803	9808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127333
124	NC_015921	CCA	2	6	9810	9815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127333
125	NC_015921	GTA	2	6	9846	9851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127333
126	NC_015921	ACA	2	6	9885	9890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127333
127	NC_015921	TAA	2	6	9914	9919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
128	NC_015921	TAA	2	6	9958	9963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
129	NC_015921	AAT	2	6	10175	10180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127333
130	NC_015921	ATA	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127334
131	NC_015921	GCA	2	6	10323	10328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127334
132	NC_015921	TAA	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127334
133	NC_015921	TAG	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127334
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245	NC_015921	TCA	2	6	18524	18529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127344
246	NC_015921	CTC	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127344
247	NC_015921	AAC	2	6	18627	18632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127344
248	NC_015921	AAT	2	6	18656	18661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127344
249	NC_015921	CTT	2	6	18935	18940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127344
250	NC_015921	TCA	2	6	19114	19119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127344
251	NC_015921	AGC	2	6	19434	19439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127344
252	NC_015921	ATC	2	6	19452	19457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127344
253	NC_015921	ACC	2	6	19458	19463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127344
254	NC_015921	AAT	4	12	19464	19475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127344
255	NC_015921	CAA	2	6	19499	19504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127344
256	NC_015921	TTC	2	6	19524	19529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127344
257	NC_015921	AGA	2	6	19551	19556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127344
258	NC_015921	CTT	2	6	20119	20124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127345
259	NC_015921	AGT	2	6	20233	20238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127345
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261	NC_015921	TTA	2	6	20298	20303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127345
262	NC_015921	GTA	2	6	20334	20339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127345
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265	NC_015921	ATT	2	6	20510	20515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127345
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378	NC_015921	ATA	3	9	29141	29149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127355
379	NC_015921	AAT	2	6	29186	29191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127355
380	NC_015921	TTA	2	6	29307	29312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127355
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